内含子
- 山东农业大学揭示内含子miRNA作为“信号转换器”调控植物抗逆的新机制
。该研究阐明了内含子剪切是调控内含子miRNA加工的关键步骤，内含子miRNA可以作为“信号转换器”在增强植物抗逆性中发挥重要作用。为详细研究内含子miRNA的加工剪切过程，课题组构建并创制了能够观察内含子miR400剪切的含荧光素酶报告基因的遗传材料。通过大范围的筛选发现，重金属镉离子处理会特异诱导miR400的内含子发生保留，成熟miR400的产生受到抑制；过表达miR400降低了拟南芥镉胁迫抗性，敲低miR400表达则增强了拟南芥镉胁迫抗性。进一步研
蔬菜 2023年9期2023-12-21
- 猪嵌合RNA BCL2L2-PABPN1剪接调控、表达与亚细胞定位分析
录通读，再通过内含子剪接将不同基因外显子连接成一个嵌合RNA 过程[4]。内含子剪接是真核生物基因表达调控重要手段，cis-SAGe 和经典内含子剪接机制相同，均由剪接位点（Splice sites，SS）、小分子核糖核蛋白等共同参与完成。剪接时，在剪接增强子、沉默子等剪接调控元件（Splicing regulatorycis-elements，SRE）调控下，pre-mRNA 上 SSs 与小分子核糖核蛋白共同装配成RNA 剪接复合体，形成套索结构，切除
东北农业大学学报 2023年1期2023-02-07
- 中国家驴MSTN 基因第1 内含子多态性分析
外显子和2 个内含子组成，其中外显子序列在不同物种之间属于高保守性[9-10]，但是基因中外显子序列约占10%，大部分为内含子序列。虽然哺乳动物的基因表达普遍不需要内含子，但是内含子中含有具备启动子、增强子和抑制子作用和功能的序列以及多种顺势作用元件，对转录和表达量有重要的调控作用[11-12]。内含子中碱基发生突变可能会引起这些序列功能的改变，影响正常的转录和翻译过程。本研究对中国14 个品种家驴542 个个体的MSTN基因第1 内含子进行多态性分析，以
中国畜牧杂志 2022年11期2022-11-17
- TGF-β1基因g.8666_8667delAC位点突变与大白猪繁殖性能的关系
突变位点[第4内含子32核苷酸(nt)处C>T突变,第6内含子179 nt处 G>A 突变和1 043 nt处C>T突变,3′-UTR 2 490 nt处G>A突变和2 494 nt处G>A突变],共形成2种单倍型CGCAA(记为A)和TATGG(记为K),关联分析发现大白猪群体中KK型母猪的初产总产仔数显著高于AA型,两者平均每胎相差1.02头。为了进一步研究TGF-β1基因多态性与母猪繁殖性能的关系,本文采用PCR和测序技术鉴定大白猪TGF-β1基因第
南京农业大学学报 2022年2期2022-04-06
- 小儿支气管哮喘与信号传导及转录激活因子3等位基因相关性分析
足25 μl。内含子11 rs2293152位点扩增条件：94℃预变性5 min，94℃变性30 s连续8个循环，60℃退火45 s，73℃延伸45 s；94℃变性30 s连续25个循环，52℃退火45 s，73℃延伸45 s，73℃延伸5 min。内含子23 rs957970位点扩增条件：94℃预变性5 min，94℃变性30 s连续35个循环，50℃退火45 s，73℃延伸45 s，73℃延伸5 min。1.3.3 琼脂糖凝胶电泳 琼脂糖凝胶(15 g
临床军医杂志 2021年12期2022-01-04
- PPR蛋白在植物细胞器组分转录后调控中的作用机制
NA剪接是指把内含子从前体mRNA (pre- mRNA)上移除，并将外显子连接起来的过程。与细胞核基因不同，叶绿体和线粒体基因的外显子并非连续分布在环状基因组上，而是包含多个多顺反子结构，需要顺式剪切和反式剪切形成多个转录中间产物，并分别去除内含子，才能将外显子连接起来形成成熟mRNA。发生在一条前体mRNA之间的剪接，称为顺式剪接(-splicing)，多见于真核生物细胞核基因的剪接；发生在不同前体mRNA之间的剪接，称为反式剪接(-splicing)
遗传 2021年11期2021-11-27
- 线粒体核糖体蛋白基因中内含子序列间匹配特性分析
010022)内含子是真核生物基因组的重要组成部分[1-2],在真核生物体内普遍存在。内含子作为一类特殊的非编码序列,与基因表达、细胞骨架构建和动态变化密切相关[3-4]。例如,内含子可以通过剪接来提高mRNA稳定性、促进mRNA的输出、增强mRNA的翻译,进而提高基因的表达[5]。许多研究表明内含子中存在基因表达的重要调控元件[6]。且内含子不仅参与基因的转录调控、前体mRNA的加工(主要是选择性剪接),也参与多种非编码RNA的功能活动[7-8]。内含子
内蒙古师范大学学报(自然科学汉文版) 2021年3期2021-06-01
- 探讨嵌合内含子对非小细胞肺癌细胞系PC-9上皮间质转化的影响
7,8]。嵌合内含子(chimeric intron)是由人β-球蛋白第一个内含子5'端剪切序列与人免疫球蛋白IgG重链可变区中内含子3'端剪切序列组合而成[9]。有研究表明，嵌合内含子能够提高蛋白在体外的表达[10-12]以及能显著促进氯霉素乙酰转移酶基因(chloramphenicol acetyltransferase,CAT)在小鼠体内的表达[10]。还有研究证实，它能提高绿色荧光蛋白(green fluorescent protein,GFP)在
海南医学院学报 2021年2期2021-01-27
- 老年高血压病人血浆蛋白Z水平变化及蛋白Z内含子FG79A基因多态性的临床意义
平变化及蛋白Z内含子FG79A基因多态性的临床意义。1 资料与方法1.1 一般资料 选取2018年1月—2019年1月在我院治疗的老年高血压病人220例作为观察组，其中高血压1级65例，高血压2级110例，高血压3级45例。纳入标准：符合世界卫生组织制定的原发性高血压诊断标准；年龄≥60岁，汉族；病人及家属知情同意。排除标准：合并恶性肿瘤、肝肾功能障碍、甲状腺疾病、自身免疫性疾病等其他基础性疾病；近3个月内有出血史或手术史。选取同期健康体检者220名作为对
中西医结合心脑血管病杂志 2020年24期2021-01-20
- 基因内含子遗传变异与鸭蛋壳品质关联性分析
位点，分别处于内含子10的g128643840 G>A、g128643903 G>A和g128643906 G>A，以及内含子14的g128659401 T>G，4个SNP位点中g128643840 G>A和g128643903 G>A 位点三穗鸭群体中基因型分布均显著偏离哈代温伯格平衡（Hardy-Weinberg平衡）（PA、g128643903 G>A及g128659401 T>G位点能显著提高蛋壳强度（PA位点显著影响蛋黄色泽（P关键词：ITPR2
山地农业生物学报 2020年2期2020-11-09
- 内含子编码蛋白Mg2+结合位点功能分析及验证
004）II型内含子（Group II intron）是一类反转录转座子（Retrotransposon），在细菌、古细菌以及真核生物叶绿体和线粒体基因组中广泛存在，尤其以细菌中最为普遍［1-4］。目前，通过现代基因组测序已鉴定了数千种细菌II型内含子，在鉴定的细菌II型内含子中，研究最为详细的主要包括两类，第一类是来源于乳酸乳球菌（Lactococcus lactis，Ll.LtrB）的嗜中温II型内含子［5-9］，另一类是来源于Thermosynech
生物技术通报 2020年10期2020-11-02
- mRNA序列与相应内含子序列匹配的普适性分析
研究都开始重视内含子对基因表达的影响[1]。大量研究表明，内含子是一类具有生物学功能的序列。许多基因表达调控元件，例如基因转录和mRNA加工(尤其是可变剪接)，都属于内含子序列的一部分。各种非编码RNA，例如microRNA和snoRNA，也属于内含子[2]。对内含子序列而言，它的丢失和获得对非编码RNA变异和基因重组有影响，这是关系到真核基因进化的主要方面[3-7]。许多疾病的发生是由于内含子的突变造成的[8-9]。内含子两端和中间序列的突变，都是因为激
生物信息学 2020年3期2020-11-02
- 苹果ANR基因沉默的原因分析
顺式作用元件、内含子序列、外显子序列等的变异。结果表明，其ANR基因沉默可能是由內含子产生的变异引起，上述研究结果为今后的进一步研究打下了基础。关键词 苹果;ANR基因;内含子;基因沉默中图分类号 S661.1 文献标识码 A文章编号 1007-5739（2020）15-0057-03
现代农业科技 2020年15期2020-08-16
- 环状RNA在缺氧窒息死亡原因推断中的意义
胞质中，而少量内含子衍生的circRNA位于细胞核中［2］；（5） 大多数circRNA包含外显子序列，而其中少数是通过内含子环化形成的［6］；（6）一些circRNA富含来自外显子的miRNA应答元件（MRE）；（7）circRNA在转录或转录后水平发挥调控作用。2 CircRNA的形成机制环状RNA来源于其亲本基因的转录，由前体mRNA通过非经典的选择性剪接产生，根据其来源分为以下三类。2.1 外显子来源的circRNA（exonic circRNA，
广东公安科技 2020年1期2020-03-12
- 青萝卜晚抽薹性状回交转育及FLC2第1内含子PCR扩增检测
现FLC基因的内含子区存在变异，其中在内含子1和内含子2中存在与植株材料抽薹特性显著相关的插入-缺失型差异区域，与晚抽薹性状密切相关，但没有报道序列及序列长度。白菜中鉴定了4个FLC基因[10-11]，在萝卜中有2个FLC[12]。越来越多的研究证实FLC2成为抽薹开花时期的关键基因[12-13]。FLC蛋白不仅会对拟南芥的开花产生抑制作用，而且在其他开花植物成花的过程中也起到关键的调控作用[14]。如白菜[15]、花椰菜、油菜[16]中FLC功能也已得到
华北农学报 2019年5期2019-11-05
- 绵羊GH基因的Pvu Ⅱ 位点的多态性与其生长性状的关联分析
个外显子和4个内含子构成。刘士力等[5]研究表明，翘嘴鲌生长激素基因全长5 966 bp，其中转录单元长1 648 bp，由5个外显子和4个内含子组成。牛志刚等[6]研究表明，GH基因的AhⅠ位点在新疆褐牛群体中表现为VV、LV和LL三种基因型，而且14月龄的LV和LL基因型个体的体质量、体长均比VV基因型的高，且差异显著(P许锋[8]在4个蛋用品系鸡中发现GH基因内含子3中存在2个AvaⅠ酶切位点，该酶切位点与蛋型指标关联显著(P1 材料与方法1.1 基
浙江农业学报 2019年9期2019-09-25
- N端无半胱氨酸断裂蛋白质内含子的构建
10]。蛋白质内含子(intein)是具有自我催化活性的蛋白质。翻译成熟后，内含子会自我切除，然后将两侧的外显子(extein)以肽键的形式连接起来[11]。而断裂蛋白质内含子(split intein)的N端和C端可以相互识别，形成有活性的蛋白构象，然后发生反式剪接反应(trans-splicing)[12]。在某些情况下，split intein的某一端可以发生断裂反应(cleavage)：当N端外显子缺失时，会催化inetin的C端发生断裂，在蛋白的
生物学杂志 2019年4期2019-08-21
- 小麦抗逆相关基因TaSAP1的5′非翻译区内含子功能分析
机制尚不明确。内含子是断裂基因中的非编码序列,通过选择性剪接丰富蛋白质的多样性[9],还可以影响宿主基因的表达[10],这种现象在植物中受到广泛关注,已报道了大量相关基因,例如玉米Hsp82、Sh1、Adh1、GapA1和Ub1[11-15],水稻OsPB-73、rubi3和OsTub6[16-18],拟南芥MHX、PUX7、PYM和PhADF1[19-21]。拟南芥UBQ10基因启动子与其第一内含子融合后使大麦中荧光素酶报告基因的表达量增加3 倍[22]
作物学报 2019年9期2019-08-20
- 大肠杆菌Targetron基因打靶载体构建及应用*
0004)Ⅱ型内含子(group II introns)是一类具有自我剪接功能、可在染色体不同位置移动的反转录转座子，广泛存在于细菌、古细菌和植物的细胞器基因组中[1-2]。来源于乳酸乳球菌(lactococcuslactis)的Ll.LtrB内含子由内含子RNA和内含子编码蛋白(intron-encoded protein，IEP)两部分组成，其中内含子编码蛋白IEP由反转录结构域、成熟酶结构域、DNA结合域和核酸内切酶结构域等多个功能结构域组成[2-6
贵州医科大学学报 2019年7期2019-08-02
- 高效严谨型大肠杆菌Targetron基因打靶系统的构建
004）II型内含子（Group II Intron）是在细菌、古细菌及高等植物细胞器（线粒体、叶绿体）中发现的一类核酶，由内含子RNA和内含子编码蛋白（Intron Encoded Protein，IEP）组成［1-4]。其中，内含子RNA具有核酶活性，通过碱基互补配对原则识别双链DNA；IEP具有反转录酶和DNA核酸内切酶活性，与内含子RNA组装为核糖核蛋白复合体，维持内含子RNA的空间结构，辅助内含子RNA识别靶位点，并发挥核酸内切酶活性切割靶位点，
生物技术通报 2019年6期2019-07-26
- 不同方向内含子对重组CHO细胞中神经生长因子表达的影响
王芳不同方向内含子对重组CHO细胞中神经生长因子表达的影响董卫华1,2，李翠萍1，杨赟1，王天云1,2，王芳11 新乡医学院 基础医学院 生物化学与分子生物学教研室，河南 新乡 453003 2 河南省分子诊断与医学检验技术协同创新中心，河南 新乡 453003为了研究不同方向的嵌合体内含子对重组神经生长因子 (Nerve growth factor，NGF) 基因表达的影响，以人β-珠蛋白第一内含子5ʹ端剪接序列和人免疫球蛋白重链可变区内含子3ʹ端剪接
生物工程学报 2019年6期2019-07-10
- 翘嘴鲌胰岛素样生长因子-Ⅰ的克隆及序列分析
Ⅰ基因具有4个内含子, 其中第2内含子较长[4, 5]。基因的内含子在调节基因的表达过程中具有重要作用[6], 其中经常包含一些微卫星和单核苷酸多态性位点(Single nucleotide polymorphism, SNP), 有时与生产性状密切相关。阮瑞霞等[4]在吉富罗非鱼(Oreochromis niloticus)内含子1和内含子3中发现与增重有关的2个SNP; 鲤(Cyprinus carpio)内含子1和2中也存在2个微卫星位点与体质量有关
水生生物学报 2019年2期2019-03-11
- 真核生物基因组长内含子递归剪接事件的分子机制
核生物基因组长内含子递归剪接事件的分子机制魏金川1，徐添翼1，吴静1,2，宋晓峰11. 南京航空航天大学自动化学院，南京 211106 2. 南京医科大学生物医学工程与信息学院，南京 211166在高等真核生物基因组转录过程中，一次剪接可完成短内含子的去除，而较长内含子(>10 kb)则需通过多次剪接方可去除。多次剪接去除长内含子的过程通常被称为递归性剪接。已有研究表明，递归性剪接事件与诸多生物学过程及疾病的发生发展有着密切的联系。近年来，关于递归性剪接的
遗传 2019年2期2019-02-28
- ATP7A基因内含子突变致Menkes病1家系2例报告
72 号编码区内含子c.2172+5＿2172+6insTGAAT表型正常的携带者(图3MD)，胎儿出生后发育正常。2 文献复习本文2例患儿的ATP7A基因突变为内含子突变(c.2172+5_2172+6 insTGAAT)，在万方、中国知网、PubMed和EBSCO数据库中检索类似病例，检索时间为建库至2018年12月1日。中文数据库以“万方医学网”为例，检索式为((Menkes病) ANDATP7A) AND 内含子突变。英文数据库以PubMed为例，
中国循证儿科杂志 2018年6期2019-01-25
- “垃圾DNA”不“垃圾”
现，这些被称为内含子的片段有助于酵母在艰难时期存活。这项研究揭示了DNA的另一种可能的功能，科学家曾认为这种功能是无用的。未参与该研究的美国加州旧金山州立大学进化分子生物学家Scott Roy说：“这些结果非常令人信服，也非常令人兴奋。”这项研究开启了了解“内含子作用的全新范式”。加州大学洛杉矶分校酵母微生物学家Guillaume Chanfreau说，这也回答了一个长期存在的问题：为什么酵母保留了以前被认为是“垃圾DNA”的东西。内含子普遍存在于植物和真
医药前沿 2019年18期2019-01-04
- 猪Nramp1基因内含子6的SNP多态性分析
外显子和14个内含子，编码氨基酸数539[1-3]，表达于网状内皮细胞器官的巨噬细胞中，如猪的脾脏、大脑、肺脏的免疫器官，用于抵抗外来病原微生物的作用[4]。其作用机制为存在于巨噬细胞中的内吞小体通过消耗含有病原微生物吞噬体中的Fe2+和Mn2+等二价金属离子，使病原微生物缺乏合成的酶系从而使动物免受细菌等病原体的侵害[5]。由于猪Nramp1基因具有良好的特异性，因此可作为研究猪免疫疾病的候选基因之一。前人已对猪Nramp1基因内含子6做了大量研究，杨军
现代畜牧兽医 2018年10期2018-12-03
- 人SLC25A13基因内含子突变IVS6-11A>G导致转录子剪接异常
变居多，而位于内含子以内导致剪接异常的突变有多种，多位于与内含子相邻的5个内含子碱基内[13-14].位于内含子较深内部的突变，目前仅发现1例IVS6-11A>G报道，且文献未能确切证实该突变会引起异常剪接及剪接异常形式[15].本研究通过pSPL3外显子捕获质粒设计实验，确认SLC25A13基因IVS6-11A>G (c.615-11A>G) 会导致出现新的剪接位点.1 材料与方法1.1 材料胎牛血清，DMEM培养基购自美国Gibco公司；TRIzolT
暨南大学学报（自然科学与医学版） 2018年5期2018-10-29
- 定向进化后Cne PRP8蛋白质内含子的剪接机理研究
620)蛋白质内含子(intein)是在前体蛋白质中的一段多肽序列，其能够借助自身发生的催化反应由前体蛋白质中成功地剪切出来，同时将两侧的蛋白质序列(蛋白质外显子，extein)以天然肽键连接，形成成熟蛋白质[1-2]，这一过程被称为蛋白质内含子介导的蛋白质剪接。蛋白质内含子根据其结构特征可分为3类，即标准蛋白质内含子(canonical intein)，微小蛋白质内含子(mini-intein)和断裂蛋白质内含子(split-intein)[3]。由标准
生物学杂志 2018年5期2018-10-15
- HaV01 Pol内部半胱氨酸对其剪接活性的影响
620)蛋白质内含子(intein)是位于蛋白质前体中的一段多肽序列。通过蛋白质剪接，它可以从前体蛋白中自我切除，同时将两端的外显子以肽键的形式连接起来，形成成熟的蛋白质。蛋白质内含子根据其结构特点可分为3种类型：标准蛋白质内含子、微小蛋白质内含子和断裂蛋白质内含子[1-2]。每一类蛋白质内含子都有3个区域，N端剪接结构域、中间归巢核酸内切酶区域或中间连接子(Linker)和C端剪接结构域[3-4]。根据蛋白质内含子剪接过程的不同，将内含子又分为3种类型，
生物学杂志 2018年5期2018-10-15
- 内含子的特异性识别与选择性剪切*
0108）1 内含子的分类对于大部分真核生物来说， 其基因通常是不连续的， 即在编码序列间存在至少一个以上的间插序列，编码序列称为外显子（exon），间插序列称为内含子（intron）。 DNA 编码链转录形成前体RNA时，前体RNA 中包含大量内含子，这些内含子必须通过剪切反应去除， 并且将外显子部分连成一条链，前体mRNA（precursor mRNA）才能形成成熟的mRNA， 翻译成相关蛋白， 这个过程称为RNA剪接。 在RNA 剪接过程中，剪接复合
生物学通报 2018年12期2018-10-10
- 环状RNA及其生物学功能概述
质中，但少部分内含子来源的circRNA则存在于核内，具有一定的组织、时序和疾病特异性；②广泛存在于真核细胞中，部分基因的circRNA表达水平甚至比mRNA高10倍以上；③与传统的线性RNA (linear RNA)不同，circRNA分子呈封闭环状结构，不具有5′末端帽子和3′末端poly(A)尾巴，比线性RNA更稳定，不易被核酸外切酶(RNase R)降解，其半衰期可超过48h，而mRNA平均只有10h[4]。1.3 circRNA的类别 理论上，c
生物学教学 2018年12期2018-08-15
- 陆地棉GhDHN1基因结构及内含子生物信息学分析
个90 bp的内含子，响应低温胁迫，在细胞膜附近起作用[4]；其启动子含有多个响应非生物逆境胁迫的顺式作用元件[5]。内含子是真核生物基因组中的独特成分，在基因演变过程中起着重要的作用[6]。基因的内含子在调控基因表达方面的研究也越来越受到科研人员的重视[7]。本研究在前期研究的基础上，对陆地棉脱水素基因GhDHN1的结构和内含子进行生物信息学分析，旨在揭示棉花脱水素基因响应非生物胁迫的机制。1 材料与方法1.1 供试数据库陆地棉基因组数据库（http:/
中国棉花 2018年6期2018-07-06
- 千屈菜科中rpl2基因内含子缺失现象探析
薇叶绿体基因组内含子的研究较少，而在植物进化过程中基因的内含子丢失现象广泛发生。对鼠耳芥Arabidopsis thaliana的研究发现内含子丢失与植物基因突变率有明显相关性[7]，这为紫薇叶绿体基因组内含子研究及紫薇育种在分子水平上提供了参考。真核生物细胞基因 DNA中把编码区域间隔开来的序列为内含子（Intron），在基因转录后剪接去除[8]，内含子作为真核生物基因组的组成部分，与基因表达过程关系密切，内含子极大的丰富了转录产物的数量和种类，并在mR
浙江林业科技 2018年2期2018-06-20
- 环状RNA研究进展
cRNAs）、内含子circRNA（IntroniccircRNAs, ciRNAs）外显子-内含子 circRNA（Exon-intron circRNAs，EIciRNAs）、基因间 circRNA（IntergeniccircRNA）[3]。关于circRNA的生物发生，目前已经提出两种假说，分别是“内含子配对驱动环化”（直接反向剪接）和“套索驱动环化”（外显子跳读），当前主流观点认为反向剪接机制在circRNA的生物发生过程中起重要的调控作用[4]
生物化工 2018年6期2018-04-02
- 棉花GhFAD2-1基因5’UTR内含子的克隆与序列分析
上游5'UTR内含子序列，对研究GhFAD2-1时空表达特性及调控的分子机制具有重要的意义。【前人研究进展】包括陆地棉(G.hirsutum)、海岛棉(G.barbadense)、雷蒙德氏棉(G.raimondii)以及鲁宾逊氏棉(G.robinsonii)等棉属的FAD2-1基因的上游序列都含有一个位于5'非翻译区(5'UTR)的内含子[2]；GhFAD2-1的启动子序列则位于该5'UTR内含子的上游，由于GhFAD2-1的上游区域含有内含子，所以增加了
新疆农业科学 2018年1期2018-03-13
- 环状RNA及其在畜禽中的研究进展
r RNA)、内含子来源的circRNA(intronic circular RNA)及由外显子和内含子共同组成的circRNA(exonic -intronic circular RNA, ElciRNA)。1.1 外显子来源circRNA和ElciRNA的形成机制关于exonic circRNA 和ElciRNA的形成机制主要有3种：直接反式剪接、外显子跳跃和内含子配对驱动的环化。直接反式剪接是由同一个外显子下游的3′端和上游的5′端相结合，使下游的供
西北农业学报 2018年3期2018-01-29
- 5种鸟类FoxP2的分子进化分析
列进行外显子和内含子分区。以家鸡FoxP2的外显子和内含子序号为参照进行基因区域的编号。使用BioEdit 7.1.3统计基因的碱基组成；碱基偏选使用的公式为：AT skew = (A-T)/(A+T), GC skew=(G-C)/(G+C)。1.2.2 基因序列的比对及碱基替代模型的分析通过MAFFT 7 在线分析平台(mafft.cbrc.jp/alignment/software/)对核苷酸和氨基酸进行序列比对。使用ModelGenerator V
生物学杂志 2017年5期2017-10-16
- 猪IGF2基因多态性研究
IGF2）基因内含子3的3 072位点在大白、长白、杜洛克3个品种中的多态性，并分析不同基因型与100 kg体重日龄和背膘厚的关系。结果表明，在3个品种中均存在A、G基因型，且A基因型为优势基因型。3个品种中A基因型个体背膘厚显著低于G基因型个体（P＜0.05），而不同基因型间100 kg体重日龄无显著差异。结果提示IGF2可作为脂肪沉积的候选基因应用于标记辅助选择。猪；IGF2基因；多态性；背膘厚胰岛素样生长因子2基因（Insulinlike Growt
猪业科学 2017年2期2017-03-30
- 甘蓝型油菜BnFAD2-C5基因启动子及内含子在表达水平的功能分析
5基因启动子及内含子在表达水平的功能分析刘睿洋**刘 芳**张振乾 官春云*湖南农业大学农学院 / 国家油料改良中心湖南分中心， 湖南长沙 410128富含油酸的菜籽油具有重要的经济价值， 使得高油酸育种及油酸形成机制成为热点。油酸脱氢酶基因（FAD2基因）是控制油酸含量的关键酶基因。本文针对BnFAD2-C5基因展开研究， 根据油菜和甘蓝的同源性， 克隆了1257 bp启动子序列， 利用 GUS和 GFP作为报告基因分别构建含有不同片段长度的启动子和内含
作物学报 2016年10期2016-10-19
- 泥蚶HDAC1基因cDNA全长、内含子克隆及时空表达特征分析
cDNA全长、内含子克隆及时空表达特征分析任付真1，2，姚韩韩2，董迎辉2，周小龙1，林志华2*(1. 上海海洋大学 水产与生命学院，上海 201306；2.浙江万里学院 生物与环境学院 浙江省水产种质资源高效利用技术研究重点实验室，浙江 宁波 315100)摘要：HDAC1作为HDACs家族中重要成员，可使组蛋白去乙酰化进而调节基因表达，在细胞分化和胚胎早期发育中起重要作用。本文利用SMART RACE技术克隆得到泥蚶HDAC1(Tg-HDAC1)基因的
海洋学报 2016年8期2016-08-09
- CYP3A4*1G依赖的CYP3A4内含子10启动的真核表达载体的构建*
的CYP3A4内含子10启动的真核表达载体的构建*赵云龙1)，杨卫红1)，闫良2)，魏璐嫚2)，王沛3)， 张卫4)，曾昭书1)#，张莉蓉2)#1)郑州大学基础医学院法医学教研室 郑州 4500012)郑州大学基础医学院药理学教研室 郑州 4500013)郑州大学药学院药理学系 郑州 4500014)郑州大学第一附属医院麻醉科 郑州 450052关键词CYP3A4；真核表达载体；启动子；内含子摘要目的：构建CYP3A4*1G依赖的CYP3A4内含子10启动
郑州大学学报（医学版） 2016年2期2016-04-19
- 真菌线粒体基因组大小变化
守的，但基因内内含子的数目和分布是多样的，且各基因间的顺序也是可变的[5]。下面笔者将对真菌线粒体基因组的大小变化作相应描述，并且对其影响因素进行分析。1真菌线粒体基因组大小变化真菌线粒体基因组大小变化是线粒体进化研究的一个重要方面。Bullerwell等[2]365对已测序、公布的真菌类群的线粒体基因组进行分析，发现真菌类群线粒体基因组尺寸变化很大。其中，以物种间和物种内线粒体基因组变化较典型。1.1物种间线粒体基因组大小变化日益增加的真菌线粒体基因组测
安徽农业科学 2016年1期2016-03-19
- 庄河大骨鸡生长激素受体基因内含子2多态性的研究
长激素受体基因内含子2多态性的研究谢明欣，许 红，毕 雪，朱弘焱，苏玉虹，田玉民⋆（辽宁医学院畜牧兽医学院，辽宁 锦州 121001）为研究庄河大骨鸡生长激素受体（GHR）基因内含子2特点，本试验从200只大骨鸡血液中提取DNA，PCR扩增GHR内含子2后进行HindⅢ酶切和琼脂糖凝胶电泳。研究结果表明，所选取的200只庄河大骨鸡GHR基因内含子2片段均能得到PCR扩增，产物大小为914 bp；扩增产物中具有2个HindⅢ酶切位点，均能获得3个酶切片段（5
现代畜牧兽医 2015年5期2015-01-04
- 昆虫JHE 基因结构及与甲基化相关的CpG O/E 值分析
基因的外显子或内含子区域中(Huang et al.，2006)。目前已经克隆出多种昆虫的JHE 基因，但多数报道的是保幼激素酯酶蛋白质编码序列，对该基因的外显子和内含子等序列结构进行进一步分析的则很少。本研究在NCBI数据库中下载了已公布的4种昆虫的全基因组序列和完整的JHE 基因序列，通过序列比对分析确定各JHE 基因的外显子和内含子等结构区域，然后对各个区域的CpG 位点进行统计并计算出CpG O/E 值，分析这些区域可能的甲基化情况，为进一步明确J
环境昆虫学报 2014年5期2014-12-16
- 吉林松原地区CD36基因单体型与2型糖尿病的相关性研究
)患者CD36内含子3(intron 3)［TG］重复序列基因多态性分布情况进行研究, 探讨该基因多态性与2型糖尿病的相关性。方法 应用 PCR和直接测序法对40例正常组和193例2型糖尿病患者CD36内含子3 ［TG］重复序列基因多态性进行分析。结果 ①CD36内含子3 ［TG］重复序列有5种单体型, 即［TG］重复次数为11、12、13、15、16次。②正常组与2型糖尿病患者之间CD36内含子3 ［TG］重复序列各种单体型及基因型分布差异无统计学意义(
中国实用医药 2014年11期2014-09-04
- 鳡肌肉生长抑制素基因内含子和部分启动子序列的克隆与分析
了该基因的两个内含子和启动子区，为其结构和表达特点的研究打下基础.1 材料与方法1.1 实验动物及总DNA提取鳡由江苏省苏州市长江特色水产工程中心提供，取其肌肉，采用酚、氯仿法提取基因组DNA，保存于-80℃冰箱.1.2 鳡MSTN内含子的扩增通过鳡MSTN的cDNA序列和鲤鱼（Cyprinus carpio）MSTN的基因序列（GU014395.1）的比对，分别在鳡MSTN 两个内含子上 下游的外显子上 设计引 物 gynhza5：5′-AACATGCC
常熟理工学院学报 2014年2期2014-06-17
- 甘蔗SoNIN1基因结构及其内含子信息分析
1基因结构及其内含子信息分析牛俊奇1吴朝兴1杨丽涛1，2李杨瑞1，2（1. 广西大学农学院 亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室，南宁 530005；2. 中国农业科学院甘蔗研究中心 广西农业科学院甘蔗研究所 农业部广西甘蔗生物技术与遗传改良重点实验室 广西甘蔗遗传改良重点实验室广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室，南宁 530007）根据前期克隆得到的SoNIN1基因的全长cDNA和部分启动子序列设计引物，应用PCR技术从甘蔗叶片gDNA中克隆S
生物技术通报 2014年12期2014-03-22
- 人多巴胺D2受体基因内含子区51103 T/C多态性对基因转录活性的影响
RD2基因第3内含子区51 103 bp位点的rs2075652多态性可能与PTSD的易患性相关，然而截至目前该位点的具体生物学机制还不十分清楚。鉴于此，本研究拟构建含单核苷酸多态性(SNP)rs2075652位点的DRD2基因荧光素酶表达载体，为今后探索其生物学功能奠定基础。1 材料与方法1.1 材料 pmirGlo质粒、海肾荧光素酶表达质粒pRL-SV40、DNA纯化试剂盒和双荧光素酶报道基因试剂盒均为Promega公司产品;质粒提取试剂盒、基因组DN
解放军医药杂志 2014年11期2014-03-06
- 决明查尔酮合成酶全长基因序列的克隆与分析
们被一个或多个内含子所间隔，这些内含子在转录后被除去以形成具有完整读码框的mRNA。尽管真核生物基因翻译后获得的蛋白质序列中不含有内含子的信息，但是内含子的存在对基因表达有着积极的作用，能够促进基因转录、促进mRNA的翻译、参与基因的差异表达，是真核生物基因表达调控的重要元件之一。黄酮类化合物是一类重要的植物次级代谢产物，在植物花色形成、植物育种、低抗紫外线辐射、防止病原微生物侵染中都发挥了重要作用。并且，黄酮类化合物还具有预防心血管疾病、抗癌、调节免疫、
生物技术通报 2013年5期2013-12-23
- 应用基因测序方法检测哮喘儿童的PTEN基因突变
TEN基因第8内含子的第32个碱基发生突变，T→G，突变率为83.3%（25／30）。对照组物基因突变。突变位点见图1所示。2.2 外周血EOS计数结果2.2.1 哮喘组儿童外周血EOS计数明显高于对照组儿童，差异有统计学意义（P＜0.05），见表2所示。2.2.2 哮喘患儿中，根据有无发生PTEN基因第8内含子突变，分为基因突变组和基因正常组，组间性别、年龄差异均无统计学意义。PTEN基因发生突变的哮喘患儿外周血EOS计数高于无突变的哮喘儿童，差异显著（
中国实验诊断学 2013年5期2013-11-24
- 含内含子的核糖体蛋白基因转录起始位点情况分析
55011）含内含子的核糖体蛋白基因转录起始位点情况分析丁雪梅（曲靖师范学院 数学与信息科学学院，云南 曲靖 655011）选取69个含内含子的核糖体蛋白基因，抽取其中每个基因转录起始位点附近长度为100个碱基的序列，发现转录起始位点为碱基A的占92.8%，给出由位点状态转移到位点后与位点相邻状态的一步转移概率矩阵P以及由位点前与位点相邻状态转移到位点状态的一步转移概率矩阵 .含内含子的核糖体蛋白基因中富含碱基A，T的序列可能有利于基因的转录.内含子；核糖
赤峰学院学报·自然科学版 2013年4期2013-07-31
- 利用β-纤维蛋白原第7内含子分析三种鹤的亲缘关系
。细胞核基因的内含子是普遍存在的，并且相邻的外显子的核苷酸序列是保守的，能独立快速发展的DNA，内含子序列的研究成为动物分子系统学的基础[5]。β-纤维蛋白原第7内含子是一个富含AT的内含子，其碱基组成的变化代表着鸟类的进化[6]。β-纤维蛋白原核苷酸的多态性检测曾被用于猫科[7]等哺乳动物[8]及某些鸟类[6，9]的系统进化树分析。本文以三种鹤类为研究对象，以火烈鸟为对照，通过聚合酶链式反应以及测序实验，分析β-纤维蛋白原第七内含子的核苷酸多态性，从DN
黑龙江八一农垦大学学报 2013年3期2013-07-04
- 杜仲MEP途径系列基因的基因结构预测
10-13]。内含子（intron）为真核细胞基因DNA中的间插序列，这些序列被转录成RNA，但随即被剪辑除去而不翻译。大约80%～85%的高等植物含有内含子，不同基因的内含子数目各异。长期以来，人们普遍认为内含子没有功能作用，随着分子生物技术的发展，人们发现内含子在基因表达调控中有很重要的作用，内含子会影响基因表达模式，可以增强基因表达水平，还能驱动基因表达[14]。随着对内含子功能认识的逐步深入，内含子将会成为精确地调控目的基因表达的有力工具，在基因工
经济林研究 2013年4期2013-04-03
- 应用EST－ILPs分子标记技术快速鉴定菟丝子属种子
来源于编码区，内含子位置通常较为保守；而不同种或地理亚种间的内含子长度又存在差异，故用它建立的ILPs分子标记在种间鉴定上具有优越性。采用ILPs（intron length polymorphisms）分子标记在菟丝子属的分类鉴定上国内外均未见报道。因此本研究利用旋花科（Convolvulaceae）番薯属（Ipomoea）的EST（expressed sequence tags，Tags，表达序列标签）序列，通过网站（http：∥ibi.zju.edu
植物保护 2012年6期2012-09-28
- 蛋白质剪接在蛋白质研究和蛋白质工程中的应用
g）是由蛋白质内含子介导的在蛋白质水平上翻译后的加工过程。蛋白质内含子（intein）是指前体蛋白中的一段插入序列，它在蛋白质翻译后的成熟过程中能自我催化，使自身从前体蛋白中切除，并将其两侧的多肽片段以肽键连接，形成成熟的蛋白质。蛋白质内含子的发现丰富了基因表达和蛋白质翻译成熟过程的理论，而且在蛋白质研究和蛋白质工程中有广泛的应用。本文试图综述蛋白质剪接在蛋白质特异位点标记、蛋白质片段化标记同位素、蛋白质环化、蛋白质芯片、基因治疗等研究中的应用。蛋白质内含
自然杂志 2012年1期2012-01-24
- 松江鲈Myostatin基因内含子和线粒体D-loop DNA序列分析
个外显子和两个内含子组成[3-5]，我们对松江鲈MSTN基因的全长cDNA和组织表达特异性作了研究[6]，但目前对松江鲈MSTN基因的内含子序列尚未有报道.mtDNA是独立于细胞核基因组外的环状双链DNA分子，在mtDNA上存在一个独特的D-loop结构，是整个线粒体基因组序列和长度变异最大的区域，其进化速度最快.线粒体DNA的D-loop区可用于研究物种起源和进化以及种内种群的系统进化分析，探讨物种在进化过程中可能发生的变异情况.鱼类mtDNA是一个相对
常熟理工学院学报 2011年2期2011-02-08
- 新疆锁阳线粒体nad 1基因第2内含子序列居群间变异分析△
d 1基因第2内含子序列居群间变异分析△王果平1，王川易2，贾新岳1，郭宝林2*（1.新疆中药民族药研究所，新疆 乌鲁木齐 830002；2.中国医学科学院中国协和医科大学药用植物研究所，北京 100193）目的：对分布于新疆的锁阳Cynomorium songaricum4个居群22个个体进行了线粒体nad1基因第2内含子序列的比较研究，分析序列居群差异。方法：提取锁阳DNA，用通用引物扩增线粒体nad1基因第2内含子序列，ClustalW软件比较分析序
中国现代中药 2010年10期2010-10-16
- Htra2基因内含子5-59A/G位点多态性与帕金森病的相关性研究
1977年发现内含子以来,内含子功能的研究一直受到人们的关注。在许多基因的内含子中均发现基因表达的调控元件,其中大多为增强元件,可以调控转录的起始来增强基因的表达;此外,一些内含子在基因的表达中起抑制作用;一些基因的内含子突变会引起基因表达效应的变化。单核苷酸多态性是一种重要的遗传标记。已经发现Htra2基因多个单核苷酸多态性位点与帕金森病相关[4-5]。Htra2基因内含子5-59A/G(rs2241027)位点的多态性(等位基因为A和G)与帕金森病关系
中国康复理论与实践 2010年7期2010-08-09
- 血友病A的基因诊断研究
I-PCR检测内含子22倒位 引物设计和反应条件参照文献[3,4],根据扩增产物的片段长度进行判断。正常人的I-PCR产物片段为487 bp,内含子22倒位者产物片段为559 bp,倒位携带者产物片段为487 bp和559 bp 2条带。1.3.2 PCR检测内含子1倒位 对内含子22倒位阴性者,进一步检测内含子1倒位。按文献[5]方法操作,分别扩增F8基因内含子1中的Int1h-1片段及F8基因外的Int1h-2片段,产物经琼脂糖凝胶电泳后观察电泳条带。
中国产前诊断杂志(电子版) 2010年2期2010-08-04