糖链
- 用于N-连接完整糖肽鉴定的糖基化蛋白质组学数据处理方法最新研究亮点
白质上位点特异性糖链修饰的主要手段,其主要优势在于分析过程中可以同时揭示蛋白位点与糖链修饰的信息,从而在组学层次实现规模化的蛋白糖基化分析。但是,与其他翻译后修饰相比,糖基化具有组成复杂、相对分子质量分布范围广的特点,因此完整糖肽的数据库检索空间较大。同时完整糖肽的质谱谱图较为复杂。在碰撞诱导碎裂的完整糖肽质谱谱图中,糖链产生的碎片离子强度较高,而肽段骨架碎裂不完全,产生的碎片离子强度较低,给完整糖肽的谱图解析带来了困难。因此,发展具有高灵敏度与可信度的质
色谱 2022年6期2023-01-17
- 血清IgG糖基化修饰特征与自身免疫性疾病关系及其检测方法的研究进展
连接的寡糖类型,糖链分为G0型糖链、G1型糖链、G2型糖链。G1型较G0型在糖链末端多一个半乳糖;根据半乳糖连接的N-乙酰葡萄糖胺的不同,G1型又分为G1a型、G1b型;G2型糖链末端有两个半乳糖。2 IgG糖基化修饰及其功能IgG-Fc段的N-糖基化可影响其理化性质。AOYAGI等[11]报道IgG-Fc段的寡糖链可维持抗体四级结构以及Fc段的热稳定性,在一定程度上调节抗体效能。末端糖基与IgG-Fc段的溶解性相关,糖链末端半乳糖能使氨基酸残基的水溶性减
浙江临床医学 2022年1期2022-11-23
- 基于FFPE组织切片的膀胱癌N-连接糖链原位酶解及分析*
-5]。N-连接糖链是在肽序列Asn-X-Ser/Thr(其中X代表除脯氨酸以外的任何氨基酸)处共价连接到天冬酰胺的低聚糖,具有共同的五糖核心结构,经过一系列糖基化相关酶的催化,可产生多种N-连接糖链结构变异,并被分为3种类型:高甘露糖型、杂合型和复杂型[6]。有研究发现,肿瘤的发生和发展与机体(组织、血清、尿液、腹水等)的N-连接糖基化异常密切相关[7]。更值得注意的是,N-连接糖基化修饰是在细胞器中一系列有组织的酶反应控制下进行的,具有很高的特异性,且
生物化学与生物物理进展 2022年10期2022-10-25
- 多天线N-糖链对双表型肝细胞癌的辅助诊断价值
0%糖蛋白中N-糖链的形成。N-糖链根据天线(或分支)的数量可分为二天线、三天线、四天线及四天线以上N-糖链结构,其中三天线、四天线及四天线以上N-糖链结构称为多天线N-糖链结构(Multi-glycan)[4]。研究[5]发现血清N-糖链表达水平(量)与糖链结构(质)的改变可以成为HCC潜在诊断标志物或治疗靶标,特别是血清中Multi-glycan表达水平的变化与肿瘤的复发、转移等密切相关。Huang等[6]研究发现,HCC患者血清三天线N-糖链结构丰度
临床肝胆病杂志 2022年6期2022-06-23
- 冠状病毒的糖基化研究进展*
糖基化位点分布、糖链结构与生物学功能及糖生物学研究技术等,有助于对冠状病毒相关的诊断、治疗和疫苗开发等工作。1 冠状病毒S蛋白的糖基化修饰冠状病毒同源三聚体S 蛋白是Ⅰ型膜蛋白,其氨基酸数目从1 150到1 450个不等,序列相似性在属间和种间差异较大,但被描述为倒锥状或丁香状(clove)三维结构单元组成相同[22-23]。S 蛋白由S1和S2 亚 基 组 成[24]。S1 亚 基 包 含N 端 结 构 域(N-terminal domain,NTD)
生物化学与生物物理进展 2022年3期2022-03-31
- Core 3 O-型糖链参与大肠杆菌对肠上皮细胞黏附和侵袭的影响
20黏蛋白O-型糖链根据在丝氨酸/苏氨酸(Ser/Thr)分子上不同连接,可分为Core 1~8八种不同O-型糖链[1]。不同类型的O-型糖链由不同的糖基转移酶催化合成,Core 3 O-型糖链由β-1,3-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶6(β3gnT6)催化合成。肠致病性大肠杆菌(EPEC)和肠出血性大肠杆菌(EHEC O157∶H7)可引起患者从轻度腹泻到严重疾病的发生,如出血性肠炎[2];O-型糖链可能与肠道共生菌群的选择相关,同时可以作为不同细菌的黏附位
中国医药科学 2022年3期2022-03-16
- 一种具有方向性微结构的聚乙烯醇-琼脂糖水凝胶的制备方法及应用
形成琼脂糖大分子糖链,依靠前驱液的流动引导琼脂糖大分子链在前驱液内产生方向性,在冷冻循环的过程中聚乙烯醇围绕琼脂糖的糖链结晶,形成具有方向性的纤维状微结构的水凝胶。该制备方法无需借助外加物理场的作用,制备的水凝胶具有各向异性,而且制备流程简单,可重复性高,对设备要求低。制备的水凝胶具有均匀方向性的纤维状微结构,提升了材料的抗拉伸性能,并通过注射器制得任意形状的具有方向性的水凝胶,得到的水凝胶有望应用于人造组织/器官修复材料领域。公开号 CN 1149209
合成树脂及塑料 2022年6期2022-03-14
- 免疫球蛋白G糖基化修饰的质谱分析方法及其应用
蛋白质合成相比,糖链合成没有固定的模板,并且糖链具有复杂的分支结构、连接方式和空间构型,这使得糖基化修饰分析成为蛋白质结构表征中最具挑战性的任务之一。随着基质辅助激光解吸电离(MALDI)和电喷雾电离(ESI)技术的发展,质谱技术已成为蛋白质糖基化修饰研究中广泛应用的分析手段。然而,糖蛋白的高动态范围、糖基化修饰固有的低丰度、与无糖基化修饰肽段的共存等所导致的离子抑制以及糖链结构的高度异质性等因素,使得质谱技术表征蛋白糖基化修饰面临挑战[2]。2019年,
质谱学报 2021年5期2021-09-24
- 糖生物学或解开疾病关键密码
学研究回答人体的糖链(多糖或聚糖)在细胞的什么地方、怎样形成;从分子水平揭示它的结构、它和什么分子结合并蕴含了怎样的信息;又如何发挥生物学功能等问题。叶新山认为,蛋白质和核酸研究发展很快,人们对生命的认识和理解想再向前一步,还需对糖类展开研究。“糖的绝大多数功能还是未知的奥秘,如果打开了这一扇大门,人类与疾病的斗争势必更有把握。”他说。多数疾病背后都能找到“糖”的影子糖链与人类健康息息相关,几乎涉及所有疾病种类。目前,人们已经知道,糖链与传染性疾病、免疫性
中国科学探险 2021年2期2021-06-01
- 甲型流感病毒血凝素糖基化的生物学效应
将“劫持”的细胞糖链以N-糖苷键形式连接到HA的N-连接糖基化基序(N-linked glycosylation sequon,NGS)——N-X-S/T-Y(X和Y是除P以外的任何氨基酸)[2],从而实现自身蛋白的糖基化。当HA从内质网向高尔基体转运时,糖苷酶和甘露糖苷酶会对HA的糖链进行修剪和重塑等再加工。需要指出的是,HA的NGS并非都要进行糖基化修饰,具体是哪个(些)NGS会被糖基化,加载何种类型的糖链,以及糖链的加工程度,要取决于IAV感染的特定
中国兽医学报 2021年4期2021-04-16
- 异常糖链糖蛋白在胆道良恶性肿瘤鉴别诊断中的价值
戴映,张腾腾异常糖链糖蛋白(TAP)是蛋白质糖基化异常,糖基化修饰不完全或新的糖基转移酶被激活产生新的糖基化而形成的。细胞癌变时发生特异性糖链变化,促使多种异常糖链糖蛋白形成,临床可以使用特殊技术检测这些异常蛋白来区分疾病良恶性,使肿瘤早期检测成为可能[1]。近年来,有多项研究发现,在肺癌、鼻咽癌、乳腺癌等多种原发性恶性肿瘤中可检测到异常糖链糖蛋白的表达,为异常糖链糖蛋白辅助恶性肿瘤诊断提供依据。TAP对于多种恶性肿瘤的早期诊断具有较高的敏感度与特异度,具
疑难病杂志 2020年12期2020-12-29
- 精准捕获“糖链”有助揭示病毒侵染机制
,实现了对唾液酸糖链的精确捕获,这为后续揭示病毒侵染机制、发现新的疾病生物标记物和药物靶点,以及开发抗病毒药物或疫苗打下基础。该成果发表在《美国化学会志》上。唾液酸糖链的异常表达是恶性肿瘤发生、发展的标志。唾液酸通常位于糖链的最外端,这种特殊的位置及其广泛分布的特点,使得唾液酸糖链在病毒感染、免疫响应和癌症的发生、发展等过程中起着至关重要的作用。糖链在细胞膜表面分布众多,如同一层“糖被”覆盖在细胞表面,参与并调节一系列生物过程,包括细胞信号传导和细胞增殖等
医药前沿 2020年18期2020-12-03
- 鲫鱼籽唾液酸糖蛋白的N-糖链结构及生物活性
在于细胞表面复合糖链末端,主要以糖蛋白或糖脂形式存在[2]。由于其独特的位置特点和结构特性,唾液酸参与调节大量生理及病理进程,例如在一些癌症细胞中,唾液酸往往过量表达[3]。在受精过程中,唾液酸也在卵细胞与精子结合过程中扮演着重要作用[4]。此外,在一些特殊细胞表面还有聚唾液酸,主要存在于新生婴儿、精子和部分肿瘤细胞上[5]。唾液酸糖蛋白(SGP)是指一类富含唾液酸的糖蛋白,大部分含有分支型、复杂型的末端唾液酸化的寡糖链。SGP具有良好的抗结合作用,主要表
生物加工过程 2020年5期2020-10-15
- 哺乳动物细胞中糖链结构的改造
数分泌蛋白质具有糖链,为了维持蛋白质的稳定性和功能以及抵御免疫反应,适当的糖链是非常必要的。使用哺乳动物细胞生产生物药物分子依然有几个缺点,包括高成本和糖链的不均一性。 为了确保用作为生物药物分子的蛋白质质量和稳定性,糖链的不均一性是一个必须要解决的问题。 举例来说,红细胞生成素和粒细胞集落刺激因子(G-CSF)之类的细胞因子在体外必须具有含唾液酸的复合型糖链才具有活性[6-9]。 同时,对蛋白质的糖链结构进行改造可以提高蛋白质的功能活性。 举例来说,具有
食品与生物技术学报 2020年2期2020-05-11
- 离线二维色谱结合糖苷外切酶酶解用于IgG与人血清糖蛋白中N-糖链的结构表征
过程,糖蛋白中的糖链结构不仅影响蛋白质的性质,如折叠、稳定性和溶解性等,还在细胞识别、信号转导、细胞粘合以及免疫应答等多种细胞过程中具有重要作用[1]。在这些糖蛋白中,N-糖链的还原端通过糖肽键连接到肽链的天冬酰胺(Asn)残基上,而O-糖链连接到肽链的丝氨酸(Ser)或苏氨酸(Thr)残基上。免疫球蛋白是血清中高丰度的糖蛋白,也是一类重要的免疫效应分子。人体血清中抗体的主要成分——免疫球蛋白G(Immunoglobulin G,IgG)由两条重链和两条轻
分析测试学报 2020年2期2020-03-19
- 宿主抗病毒因子MARCH8 具有广谱抗病毒囊膜糖蛋白成熟功能
初步高甘露糖N-糖链修饰。经此修饰的病毒囊膜糖蛋白,进入到高尔基体内(一般在反式高尔基体)进行复合型N-糖链修饰、杂合型N-糖链修饰和O-糖链修饰,完成病毒囊膜的糖基化修饰成熟。糖基化修饰成熟的病毒囊膜糖蛋白对于病毒毒力和逃避宿主免疫系统攻击有重要作用。I-型病毒囊膜糖蛋白(如埃博拉病毒和人艾滋病病毒)在高尔基体内完成糖基化成熟后,需要被宿主细胞蛋白裂解酶Furin(或者类似于Furin 的细胞蛋白裂解酶)切割成两个单体。两个单体以二硫键连接形成异二聚体,
中国预防兽医学报 2020年10期2020-01-15
- 微量样本中N-糖组分析技术的发展与应用
备要求起始量高、糖链标准品缺少等原因,限制了糖组学的发展和应用。现阶段,N-糖组学样品制备的常规过程,需经过蛋白的提取、变性、还原烷基化、蛋白消化、N-糖链的释放及N-糖链的富集等多个步骤,容易造成糖链组分的损失。2014年Kulak等[9]研发了一种In-Stage Tip方法,用于在单个封闭空间内中进行蛋白样品处理,该方法将样品制备的多步骤合并成单一步骤用于蛋白质组学的研究,在一定程度上降低了蛋白样品制备的起始量。2016年Chen等介绍了一种简单和集
分析测试学报 2019年12期2020-01-08
- 质谱技术在蛋白质糖基化研究中的应用
基化位点的鉴定、糖链组成的解析及定量分析等方面。蛋白质糖基化;质谱技术;糖链;定性定量分析1 引言蛋白质糖基化指单糖或寡糖与蛋白质之间通过共价结合形成糖蛋白的过程,50%以上的蛋白质存在糖基化现象[1]。根据蛋白质被糖类修饰形式的不同可以把蛋白质糖基化分为四类:O位糖基化、N位糖基化、C位糖基化及糖基磷脂酰肌醇(GPI)锚定连接。糖基化可改变分子结构的特异性,影响细胞间的识别、黏附、代谢及免疫等过程,从而影响疾病的发生发展过程。例如N-聚糖上的末端残基、唾
科技与创新 2019年15期2019-11-29
- 蛋白N-糖基化分析方法研究进展
蛋白[6]。N-糖链在整个糖蛋白中只占很小的一部分,但是对整个糖蛋白的性质影响巨大。关于N-糖基化的研究通常可以从三个方面考量:①研究整体糖蛋白的糖链;②糖蛋白经过酶切后,糖肽水平的研究;③经过化学手段或酶切释放寡糖链,对游离N-糖的研究,其中对酶切游离后N-糖链的研究也是最简单、高效的方法[7,8]。目前,N-糖链主要是用肽N-糖苷酶F(PNGase F)酶解[9],得到游离的N-糖链,再结合毛细管电泳(capillary electrophoresis
生物技术进展 2019年3期2019-05-28
- Ogataea minuta来源的内切-β-N-乙酰氨基葡糖苷酶的异源表达和纯化
译后修饰[1],糖链对糖蛋白的生化性质具有重要的作用。随着糖组学的发展,对糖链结构和功能的研究越来越多。然而,天然糖肽和糖蛋白上的糖链结构复杂,并呈现多样性,因而很难从中纯化出带有均一糖链的糖肽或糖蛋白[2]。目前,化学酶合成法尤其是利用内切-β-N-乙酰氨基葡糖苷酶(ENGase)来合成此类糖肽或糖蛋白是发展较快且具有实践意义的方法[3]。ENGase(EC 3.2.1.96)是一类糖苷酶,其可以水解N糖链上两个N-乙酰葡糖胺 (GlcNAc)之间的β-
食品与生物技术学报 2018年12期2019-01-03
- 人血浆N-糖链超高效液相色谱检测方法的优化
5)人体血浆N-糖链结构和含量会因人体健康状况而异,因此血浆中N-糖链成为临床上诊断和监测多种疾病发生和发展的新的重要标志物。研究表明,N-糖链结构和含量的改变与疾病,例如炎症反应和癌症等密切相关[1 - 3]。人血浆中的N-糖链结构具有多样性,以复杂型N-糖链为主,也含有少量高甘露糖型和杂合型糖链。人血浆样品中的N-糖链富含末端唾液酸修饰。但唾液酸的性质不稳定,容易在酸碱条件下解离[4]。目前除了直接使用质谱分析,国内外糖蛋白N-糖链的分析多采用液相色谱
分析科学学报 2018年6期2018-12-25
- 植物N-糖链检测技术研究进展
T)过程中,N-糖链合成异常可影响胚胎的发育[4];唾液酸化的N-糖基化对于脑发育和乳腺癌的发生发展具有重要影响[4]。植物N-糖基化的研究相对较少,但近年来也得到了研究人员的重视。在植物中,N-糖基化对于细胞壁的形成[5]、生殖发育[6]和抵御病原菌入侵[7]等诸多生理过程具有重要意义。如拟南芥突变体lew3(leafwilting3)中编码α-1,2-甘露糖基转移酶ALG11的LEW3基因缺失会导致纤维素合成受损进而影响细胞壁的形成[8];拟南芥N-糖
生物技术进展 2018年6期2018-11-28
- 基于Endo-M N175Q糖链转移反应与丙酮富集糖肽的LC-MS分析糖蛋白N-糖链
生和发展均与N-糖链结构和表达量的改变有关[5-6]。因此,建立糖蛋白中N-糖链的分析方法对寻求疾病中有效的生物信息具有重要的现实意义。糖蛋白N-糖链的常用分析过程为:首先用蛋白酶(如N-糖苷酶F)释放糖蛋白的糖链,获得糖链与蛋白混合物,然后对糖链进行富集纯化,最后对其结构进行分析。生物质谱可对各种糖链进行结构分析,是解决糖链结构的有效手段。糖链结构研究中,采用电喷雾离子化-质谱(ESI-MS)技术无需衍生化即能确定糖链的组成和结构,但易受样品盒溶剂中干扰
分析测试学报 2018年11期2018-11-21
- 膀胱癌细胞YTS-1的条件培养基诱导膀胱上皮细胞HCV29发生上皮间质转化和糖链表达变化
变。黏蛋白类O-糖链的大量表达会导致结肠癌病人的不良预后并且使细胞发生EMT转化[4]。本实验室前期的研究发现了小鼠乳腺上皮细胞NMuMG经过转化生长因子β(transforming growth factor-β,TGF-β)的诱导能发生EMT过程,从而导致细胞高表达高甘露糖型以及唾液酸型N-糖链[5]。癌症的发生通常受到肿瘤细胞与正常细胞间信息传递的影响,肿瘤细胞能够通过传递DNA,microRNA,mRNA,脂质以及与侵袭相关的蛋白等来改变正常细胞的
生物学杂志 2018年5期2018-10-15
- 骨髓基质细胞中MGAT3催化的平分型N-糖链对血液细胞黏附和迁移的影响
AT3,是与N-糖链合成或分解代谢相关的基因。前期研究表明,HS5比HS27a中表达高水平的MGAT3,MGAT3能催化生成以β-1,4 键连接于N-糖链β-Man上的平分型GlcNAc[10](图1)。推测HS5比HS27a表达更多的平分型N-糖链。蛋白质上的平分型N-糖链糖基化修饰对细胞内信号转导、细胞黏附、细胞迁移等生物过程都有重要影响[11]。MGAT3 催化生成的平分型N-糖链能够抑制细胞生长因子途径,如Ras 信号途径,从而抑制肿瘤的增长和迁移
生物学杂志 2018年5期2018-10-15
- 布氏锥虫来源内切-β-N-乙酰氨基葡糖苷酶的异源表达和活性鉴定
修饰的重要环节,糖链对于蛋白质的结构和功能具有重要的影响[1]。目前在医药用的蛋白中,70%以上都是糖蛋白。药用糖蛋白表面的糖链具有改善药物在体内的稳定性,增强药物的靶向性等功能[2]。然而,目前生产出来的重组药用糖蛋白糖链结构的非均一性造成了药效下降及批次间不一致,甚至产生免疫副反应,这些都严重影响了药用糖蛋白的临床应用[3]。因此,如何生产糖链结构均一的糖蛋白十分重要[4]。目前糖苷内切酶催化的转糖基作用对于生产均一糖链的糖蛋白是一种重要的手段。ENG
食品与发酵工业 2018年8期2018-09-06
- 基于生物质谱技术解析食源性糖蛋白糖基化位点的研究进展
白是蛋白质分子和糖链通过糖苷键相连的一类复合物[1],广泛存在于动物的体细胞和植物的细胞壁、细胞膜和细胞质中。糖蛋白因具有多糖和蛋白质的部分性质,部分糖蛋白可以溶于水、酸、碱、盐溶液和有机溶剂中。随着对糖蛋白研究不断深入,糖蛋白被定义为由比较短并且一般带有分支的寡糖链和多肽在糖苷转移酶的作用下,通过糖苷键共价连接所形成的结合蛋白[2]。糖蛋白是生物体内重要的生物大分子,可以参与细胞膜的形成,作为识别位点参与细胞间信息交流,同时还是抗体的重要组成成分[3]。
食品工业科技 2018年14期2018-08-04
- 双重衍生化-质谱法同时分析检测人血清中酸性与中性N-糖链
互作用等。因此,糖链分析至关重要[3 - 4]。根据糖基化位点以及糖类物质与蛋白质之间连接方式的不同,可将糖蛋白中糖链的构成类型主要分为两大类:N-糖链与O-糖链。目前已发现N-糖基化异常与许多重大疾病,如癌症、心血管疾病等均有密切关系[5 - 6],研究N-糖链的结构变化对于阐明糖链在疾病发生与发展中的作用,寻找疾病标志物进而实现疾病的早期诊断治疗乃至药物的研发具有重要意义。复杂生物基质中糖链相对丰度较低,且由于糖链本身结构复杂、无法扩增、离子化效率低[
分析科学学报 2018年2期2018-05-05
- 唾液糖蛋白糖链和肿瘤
变化的唾液糖蛋白糖链中找到的与疾病相关的生物标志物,也预示着基于唾液检测的新技术和新方法会逐渐成为今后非侵袭性临床诊断发展的一个方向[8-11]。1 唾液作为诊断介质的优势和可行性人体唾液由腮腺、下颌下腺、舌下腺和其他一些小腺体分泌,正常人分泌唾液中水分占九成以上,此外还包含黏多糖、脂类、矿物质和其他小分子物质与黏蛋白、球蛋白、抑制和消灭细菌和病毒的免疫球蛋白等蛋白质。唾液能起到维持口腔内环境稳定、润滑口腔壁、方便咀嚼、发声和吞咽的作用。唾液总量和组成上的
中南医学科学杂志 2018年1期2018-01-16
- 糖链能使肿瘤增大
分子PECAM的糖链“α2,6-唾液酸”可以调节肿瘤血管生成,从而促使肿瘤增大。肿瘤会释放血管内皮生长因子(VEGF),在肿瘤内部形成新的血管,从而获得氧和营养成分,增加细胞数量,使肿瘤进一步增大。迄今为止,虽然开发了以血管内皮生长因子及其受体路径为目标的血管新生抑制剂作为抗癌药物,但仅对原发癌有效,对癌转移没有效果。血管新生抑制剂难以获得疗效的原因之一,是低氧微环境下肿瘤的代谢经过再编程适应低氧低糖的新环境,使得肿瘤继续增大。血管内皮细胞是构成血管内腔侧
医药前沿 2018年30期2018-01-16
- 膀胱癌临床血清样本N-连接糖链的表达分析
血清样本N-连接糖链的表达分析王雯雯1,孙承文2,杨刚龙1,关 锋1(1. 江南大学 生物工程学院 糖化学与生物技术教育部重点实验室, 无锡 214122; 2. 江南大学 附属医学院泌尿科, 无锡 214122)膀胱癌是发生在膀胱黏膜上的恶性肿瘤,是最常见的泌尿系统肿瘤之一。国内外研究表明糖链表达的异常改变与肿瘤的发生、发展和转移紧密关联。分析膀胱癌临床样本糖链的表达变化可以为膀胱癌研究提供有效的分析手段,有助于发现潜在的临床早期诊断标志物。首先利用乙酰
生物学杂志 2017年5期2017-10-16
- 低氧诱导引发乳腺肿瘤细胞MDA-MB-231 N-糖链表达差异研究
B-231 N-糖链表达差异研究王晨星, 郭 佳, 杨刚龙, 刘昌梅, 关 锋(江南大学 生物工程学院 糖化学与生物技术教育部重点实验室, 无锡 214122)低氧是肿瘤组织中常见的病理现象之一,低氧微环境能改变细胞内葡萄糖代谢途径,增加胞内葡萄糖摄取,提高核苷酸糖含量。以人源恶性乳腺肿瘤细胞MDA-MB-231为研究对象,发现低氧培养较常氧培养的细胞形态呈纤维化,细胞迁移能力提高,上皮细胞标志物β-catenin表达下调,间质细胞标志物fibronect
生物学杂志 2017年5期2017-10-16
- 基于结构糖组学的食源性糖蛋白研究进展
的重要化合物,其糖链结构复杂,功能多样,在生物体内参与多种细胞活动。糖组学是继基因组学和蛋白质组学后又一新兴领域,而结构糖组学作为糖组学的重要组成部分,主要用于分析糖蛋白的结构。本文介绍利用结构糖组学相关技术在食源性糖蛋白糖链结构以及糖基化位点研究中的应用,旨在为结构糖组学在糖蛋白结构解析中的广泛应用提供依据。糖蛋白,糖链,糖组学,结构糖组学聚糖是第三类生物信息大分子,其较高的复杂性取决于组成聚糖的单糖种类繁多并且每种单糖都有各种形式的异构体以及不同的糖苷
食品工业科技 2017年12期2017-07-05
- 食源性糖蛋白糖链结构的研究进展
2)食源性糖蛋白糖链结构的研究进展赵文竹1,张宏玲1,陈月皎1,于志鹏1,*,马 勇1,刘静波2,励建荣1,*(1.渤海大学食品科学与工程学院,生鲜农产品贮藏加工及安全控制技术国家地方联合工程研究中心,辽宁锦州 121013;2.吉林大学营养与功能食品研究室,吉林长春 130062)糖蛋白作为一种结合蛋白质,是由寡糖链与蛋白质共价相连构成的分子,具有多种生物活性。糖链作为糖蛋白的组成部分,发挥重要生理活性,影响糖蛋白的构象并且参与糖蛋白生理功能。文章综述了
食品工业科技 2017年6期2017-04-14
- 多肿瘤标志物蛋白芯片在卵巢癌诊断中的应用
果。结果 观察组糖链抗原125(CA125)、糖链抗原242(CA242)、人附睾蛋白4(HE4)、癌胚抗原(CEA)、和糖链抗原199(CA199)的检测水平均高于对照组,两组之间差异显著具有统计学意义(P<0.05);多肿瘤标志物进行联合诊断的卵巢癌准确度均高于单项指标。结论 多肿瘤标志物蛋白芯片检测对于卵巢癌患者的诊断具有一定的临床价值,能够有效的避免以及减少卵巢癌的临床误诊及漏诊率,帮助患者得到快速确诊。多肿瘤标志物蛋白芯片;卵巢癌;诊断价值1 资
临床医药文献杂志(电子版) 2017年6期2017-03-07
- 舌癌临床样本N-连接糖链的表达分析
临床样本N-连接糖链的表达分析郭 辉1,张 健3,杨刚龙2,黄如今2,郭 佳2(1.江南大学 无锡医学院,无锡 214122; 2.江南大学 糖化学与生物技术教育部重点实验室,无锡 214122; 3.南京医科大学附属无锡二院 口腔科,无锡 214122)从糖组学角度分析健康志愿者和舌癌患者血清中差异表达的N-连接糖链,找出与舌癌密切相关的N-连接糖链结构,为舌癌早期诊断、治疗及预后提供参考依据。以临床血清样品为研究材料,采用滤膜分离全糖蛋白N-连接糖链法
生物学杂志 2016年6期2016-12-22
- 糖类化合物PMP衍生分析进展
析以及在N/O-糖链的释放和定量分析等方面的应用进展进行了综述。1-苯基-3-甲基-5-吡唑啉酮(PMP);衍生化方法;糖类分析;综述生物体内的糖类物质已被证明具有抗肿瘤、抗炎、免疫调节等重要的生物活性,对糖类进行定性定量分析研究有助于探索糖类生物学功能以及相关疾病的发病机理[1]。然而由于糖类物质极性大,缺乏光学吸收基团,无法满足高灵敏度分析手段的检测要求,糖类分析手段成为制约整个糖类研究领域发展的瓶颈[2]。衍生化可使糖链带上紫外或荧光基团,在满足高灵
分析测试学报 2016年3期2016-12-20
- 植物蛋白质N-糖基化修饰研究进展*
的糖基化修饰是指糖链与蛋白质上特定氨基酸残基共价结合的过程.根据连接方式,主要分为N-糖基化、O-糖基化、C-糖基化及糖基磷脂酰肌醇锚定连接4种类型[3-5].N-糖基化是指内质网(endoplasmic reticulum,ER)上糖基转移酶催化转移至新生肽Asn-X-Ser/Thr(X是除脯氨酸Pro外的任一氨基酸;Asn为天冬酰胺;Ser为丝氨酸;Thr为苏氨酸)基序的Asn残基,是蛋白质糖基化修饰的重要形式,胞外分泌蛋白、膜整合蛋白及构成内膜系统的
浙江师范大学学报(自然科学版) 2016年1期2016-12-02
- 花生致敏糖蛋白Ara h1糖链决定簇的质谱分析
蛋白Ara h1糖链决定簇的质谱分析彭艺芳, 王承健, 王晶晶, 李玲梅, 晋万军, 强珊, 师红丹,张英, 黄琳娟, 王仲孚(西部资源生物与现代生物技术教育部重点实验室, 陕西省生物技术重点实验室,西北大学生命科学学院, 西安 710069)以花生种子总蛋白及其主要致敏糖蛋白Ara h1为研究对象, 采用“一釜法”对蛋白上的糖链进行释放并同时进行衍生化标记, 通过C18固相萃取柱纯化, 以电喷雾质谱(ESI-MS)、 多级串联质谱(MSn)和亲水性液相色
高等学校化学学报 2016年9期2016-11-03
- 微量生物样品中糖蛋白N-糖链电喷雾电离质谱分析前处理方法的建立
样品中糖蛋白N-糖链电喷雾电离质谱分析前处理方法的建立张 英 刘 影 刘 洋 强 珊 杨冰莹 黄琳娟 王仲孚*(西北大学生命科学学院,西安 710069)基于电喷雾电离质谱检测技术,建立了一种可靠、高效、简单,适合于微量糖蛋白N-糖链解离、富集纯化的方法。以糖蛋白牛胰核糖核酸酶(Rib B)和卵清白蛋白(OVA)为模型蛋白直接酶解,比较了4种方法纯化酶解样品的效果。比较了直接酶解和经过聚偏氟乙烯(PVDF)膜富集后酶解微量复杂生物来源样品胎牛血清的酶解效果
分析化学 2016年2期2016-11-01
- 甾体糖苷抗肿瘤活性构效关系研究
甾体糖苷的苷元和糖链结构对其抗肿瘤活性的影响,采用噻唑蓝(MTT)比色法测定了五种结构相关的甾体糖苷薯蓣皂苷、纤细皂苷、边缘茄碱、澳洲茄碱和查茄碱对人宫颈癌细胞(Hela细胞)、人肝癌细胞(H7402细胞)和小鼠成纤维细胞(L929细胞)增殖的影响,随后测定了化学修饰的6-O-双硫酸茄碱、6-O-硫酸查茄碱和全乙酰化查茄碱对人结肠癌细胞(HCT-8细胞)增殖的影响。结果发现,以查茄三糖为糖链的薯蓣皂苷、边缘茄碱和查茄碱抗增殖活性明显高于以其它三糖为糖链的纤
食品工业科技 2016年11期2016-09-10
- N-糖链切除对重组抗狂犬病毒单克隆抗体中和活性的影响
50015N-糖链切除对重组抗狂犬病毒单克隆抗体中和活性的影响吕若芸§,王辉§,陈忱,张世雄,张晓楠,曹晨华,魏敬双*华北制药集团新药研究开发有限责任公司, 抗体药物研制国家重点实验室, 石家庄 050015重组抗狂犬病毒单克隆抗体是一种全人源的抗病毒感染单抗,主要用于狂犬病毒暴露后预防。采用糖苷酶处理2种重组抗狂犬病毒单克隆抗体Mab1、Mab2水解切除N-糖链,通过糖染色和毛细管电泳检测确定N-糖链酶解程度,利用快速荧光灶抑制试验检测其中和活性,分析
生物技术进展 2016年4期2016-08-15
- 新型核壳型亲水聚合物-硅胶杂化填料的合成及其在蛋白质N-糖链富集中的应用
2]。蛋白质N-糖链的组成和结构对糖基化蛋白质的构象、功能以及与其他生物分子的相互作用都具有巨大的影响。大量研究表明,多种疾病的发生发展过程中都伴随着蛋白质N-糖链组成和结构的改变,如肿瘤、自身免疫疾病、糖尿病等[3,4]。因此,发展高通量、高灵敏度的蛋白质N-糖链鉴定技术对于阐明糖链在各个生理过程和疾病发生发展过程中的作用以及筛选临床诊断标志物尤为重要。但是N-糖链本身含量有限,并具有高度微不均一性,同时质谱分析信号易受高丰度蛋白质、肽段、核酸及盐类等的
色谱 2015年3期2015-12-26
- 新型N-糖链受体氘代MPDPZ-Boc-Asn-GlcNAc的合成及其受体性能
02 )新型N-糖链受体氘代MPDPZ-Boc-Asn-GlcNAc的合成及其受体性能于田, 金东日*( 延边大学长白山生物资源与功能分子教育部重点实验室, 吉林 延吉 133002 )为利用糖链转移酶反应定量分析糖蛋白N-糖链,首先用d8-1-甲基-4-[2,4-二硝基-5-(1-哌嗪基)苯基]哌嗪(d8-PDPZ)与Nω-(2-乙酰氨基-2-脱氧-β-D-吡喃葡萄糖基)-Nα-(叔丁氧羰基)-L-天冬酰胺(Boc-Asn-GlcNAc)缩合反应生成d8
延边大学学报(自然科学版) 2015年1期2015-12-26
- 铁过载引发人肝细胞HH4 N-糖链表达差异研究
细胞HH4 N-糖链表达差异研究李士伟1,2,关 锋1,2,李 想3(1.江南大学糖化学与生物技术教育部重点实验室,江苏无锡214122 2.江南大学生物工程学院,江苏无锡214122 3.江南大学无锡医学院,江苏无锡214122)肝脏铁过载是血液系统疾病患者进行骨髓移植后的典型并发症之一,长期铁过载可引发肝脏细胞凋亡和器官损坏,然而铁过载的分子调控机理迄今仍不清楚。以培养的枸橼酸铁铵过载人肝细胞HH4和正常人肝细胞HH4为研究对象,细胞裂解提取总蛋白,分
生物学杂志 2015年3期2015-06-09
- 糖蛋白糖基化位点及糖型的多重质谱分析
为SRNLTK、糖链结构为(HexNAc)2(Hex)5(HexNAc)2(Hex)9及糖基化位点为第34位氨基酸残基。本方法为糖蛋白结构的全面解析提供了一种快速、有效、全面的研究思路。关键词 基质辅助激光解吸电离串联飞行时间质谱; 傅里叶变换离子回旋共振质谱; 碰撞活化解离; 电子捕获解离; 核糖核酸酶B1 引 言蛋白质的糖基化是糖链在糖基转移酶作用下结合到蛋白质特定氨基酸残基上[1],是蛋白质的一种重要的翻译后修饰方式[2]。目前, 已知哺乳动物蛋白质
分析化学 2015年4期2015-06-08
- 异常糖链糖蛋白在肿瘤发生发展中的作用及检测进展
)·综述·异常糖链糖蛋白在肿瘤发生发展中的作用及检测进展邴振,卢愿,孙立荣,仲任(青岛大学医学院附属医院血液儿科,山东 青岛 266003)异常糖链糖蛋白是蛋白质糖基化异常——糖蛋白糖链结构或糖基转移酶活性的变化而形成的,蛋白质翻译后加工修饰异常与疾病发生、发展存在密切关系,而在多种多样的蛋白质翻译后加工中,糖基化修饰是最普遍的一种,糖基化生物合成状态比蛋白质的改变能更有效地提示疾病状态。因此,异常糖链糖蛋白检测使肿瘤在发生早期即可作出诊断,并为疾病进展
精准医学杂志 2015年2期2015-04-17
- ldlD-14细胞表达NCAM并控制其N-聚糖合成的细胞模型的建立
纵NCAM分子上糖链的修饰,为后期研究糖基化对NCAM分子功能的影响提供工作基础。糖链,神经细胞黏附分子,转染,多聚唾液酸,ldlD-14细胞糖生物学是21世纪生命科学的前沿和热点领域之一,其核心内容是揭示细胞糖链的结构和生物学功能。糖链作为生物信息分子参与细胞生物几乎所有的生命过程,特别是在细胞分化、发育、免疫、老化、癌变、信号传递等生命和疾病过程中起着重要作用。糖生物学研究的对象之一是发生了糖基化修饰的糖蛋白。糖蛋白上的糖链主要是通过两种糖基化形式形成
生物工程学报 2014年6期2014-09-16
- 巴戟天糖链对骨骼肌成肌细胞向心肌样细胞分化的影响
0052)巴戟天糖链是巴戟天醇提物水溶性部分中的主要有效成分,研究发现在经典成骨诱导组(地塞米松、维生素C和β-甘油磷酸钠)中使用巴戟天水提取物和巴戟天醇提取物含药血清能显著促进骨髓基质细胞向成骨细胞分化作用〔1〕。但巴戟天寡糖对成肌细胞增殖分化的研究,目前尚未见报道。本实验研究巴戟天糖链诱导成肌细胞分化为心肌样细胞的作用及机制。1 材料与方法1.1动物、药品与试剂、仪器 新生1~3 d SD大鼠(合格证号:410116),雌雄不限,由河南省实验动物中心提
中国老年学杂志 2014年23期2014-09-13
- 卵粘蛋白的糖链解析及构效关系研究进展
修饰。糖蛋白上的糖链是重要的信息分子,承载着数倍于核酸蛋白的生物信息,因而其被认为是继核酸链与蛋白质链之后,与生命活动息息相关的第三链。鸡蛋中的卵粘蛋白就是一种糖基化程度超过30%的高分子量硫酸酯糖蛋白。1898年Eichlolz首次从鸡蛋蛋清中分离出卵粘蛋白[1]。卵粘蛋白主要分布在禽蛋蛋清中,占蛋清总蛋白质含量的2%~4%[2],此外,在系带和卵黄膜外层中也有分布。蛋清中的卵粘蛋白与溶菌酶和其它蛋白质等形成复合物而存在[3-4]。卵粘蛋白对维持蛋清粘稠
食品研究与开发 2014年12期2014-07-26
- 糖组学研究技术进展
组的分离与纯化、糖链组的分离和富集糖链的结构解析和定量以及糖链的性质和功能研究。根据糖蛋白组、蛋白聚糖组和糖脂组生物化学性质的不同,可相应采用分步沉淀法、硼酸亲和法、二氧化钛法、亲和层析法、体积排阻法、凝胶过滤层析和柱层析法等进行分离与纯化,进而通过植物凝集素、亲水色谱和固相萃取等技术富集高纯度且特异性的糖链。通过凝集素芯片技术、各种生物质谱及其联用并辅以糖链的衍生化标记对糖链进行结构解析,并用同位素标记法和代谢标记法对糖链进行相对定量。最后,借助糖链结构
中国药理学与毒理学杂志 2014年6期2014-03-22
- 流感病毒蛋白糖基化及其功能研究进展
毒与宿主细胞表面糖链受体之间结合能力和特异性的功能[2-3]。1.1血凝素糖蛋白1.1.1HA的糖链受体结合特异性 HA是流感病毒最重要的表面糖蛋白,由病毒RNA 片段4 编码,在病毒表面以三聚体的形式存在,包括胞内尾巴、穿膜区、颈部和头部4部分[4]。HA远膜端三聚体球形头部的受体结合位点(receptor binding site,RBS)识别宿主细胞膜上的糖蛋白或糖脂糖链末端的唾液酸(sialic acid,SA)多糖受体并与之相结合是A型流感病毒接
中国人兽共患病学报 2014年12期2014-01-28
- 糖组学在生命科学及体育科学的研究述评
指的是细胞中全部糖链及相关糖基复合物。而糖组学(Glycomics)是专门研究糖链表达、调控和生理学功能的一门科学,主要研究糖蛋白的空间结构,确定糖蛋白的编码基因,分析探明相关蛋白质糖基化的内部机制[1-2]。牛津大学教授Dwek于1988年首次提出糖生物学的概念并由此产生了糖生物学是糖组学的基础研究部分,近年来该学科在糖链的结构、生物合成、生理功能等方面取得了巨大进展。日本学者的研究在寻找糖链合成的酶基因并解析糖链的功能方面取得了显著成果,美国学者在糖组
和田师范专科学校学报 2013年2期2013-08-15
- 毛冬青中三萜皂苷类化合物的提取分离及电喷雾多级质谱快速分析研究
青中三萜皂苷按其糖链结构主要分为C-3单糖链皂苷和C-3,28双糖链皂苷。单糖链皂苷的二级质谱中主要给出C-3位糖链依次脱去单糖基的碎片离子,而双糖链皂苷则优先在C-28位发生各单糖基的顺序断裂,脱去整个C-28位糖链后形成的离子峰为基峰,以之为母离子继续进行多级质谱实验则出现C-3位糖链的断裂[12]。表2给出了本研究检测到的各皂苷成分在负离子模式下的多级质谱中主要碎片离子的质量数。根据二级质谱数据并结合文献报道[3-10],确定组分Ⅰ中含有 ilexo
天然产物研究与开发 2013年3期2013-05-17
- 机械牵张力对人成骨样细胞糖链影响的初步研究
中差异表达糖蛋白糖链,从而分析糖蛋白糖链在不同加载时长情况下与骨改建中细胞信号转导的关系。1 材料和方法1.1 主要材料和仪器人成骨肉瘤 MG-63细胞(ATCC,MI,美国);MEM(北京赛默飞世尔公司);胎牛血清(北京民海生物公司);6孔弹性基底膜培养板(Flexcell,美国);BCA蛋白定量试剂盒(武汉博士德公司);Cy3荧光染料(Amerhsma公司,美国);76 mm×25 mm×1 mm玻璃片基(Gold Seal公司);37种凝集素(表1)
牙体牙髓牙周病学杂志 2012年2期2012-11-05
- 应用凝集素芯片检测细胞膜表面糖链种属特异性
否具有相同类型的糖链这方面报道尚不多。凝集素(lectin)是一类糖结合蛋白,能专一地识别单糖或寡糖中特定的糖基序列并与之结合,常用于寡糖和糖复合物的分离纯化和糖链的结构分析[2]。在本研究中,我们用构建的凝集素芯片分别对小鼠和兔的细胞膜表面糖链类型进行了检测,提取相同组织细胞并进行荧光标记,利用凝集素与糖链的亲和性捕获细胞,激光扫描仪扫描检测捕获细胞的凝集素位点,根据捕获得到的细胞膜表面糖链与凝集素特异亲和性的不同确定不同组织细胞膜的糖链类型[3],以探
中国医药生物技术 2011年1期2011-06-08
- 昆虫与哺乳动物蛋白质 N-糖基化修饰异同的比较及其潜在的应用意义
端的杂合型 N-糖链构型,而昆虫细胞表达的糖蛋白糖链具有非常简单的侧链,是低甘露糖型,并且含有对人类具有过敏反应[7]的核心 α-1,3连接的岩藻糖。这些糖链结构的差异,极大地限制了昆虫杆状病毒表达系统在人类医药上的应用。因此,正确认识、分析比较昆虫与哺乳动物的蛋白质 N-糖基化修饰途径及其分子机制的不同,对改造昆虫杆状病毒表达系统糖基化修饰途径,表达人源化糖蛋白具有非常重要的必要性。本文对昆虫与哺乳动物蛋白质 N-糖基化修饰途径中的糖链修饰的起始、核心糖
中国蚕业 2011年2期2011-02-10
- 仿刺参皂苷类化合物的电喷雾负离子质谱裂解规律研究
键,然后连续丢失糖链的末端单糖,最后生成苷元的特征碎片离子m/z423,这些特征有助于皂苷类化合物的结构解析。仿刺参;皂苷;质谱;裂解规律海参皂苷是棘皮动物海参体内所特有的一类三萜皂苷,由苷元和寡糖链两部分组成,苷元均为羊毛甾烷的衍生物,寡糖链一般由2~6个单糖组成,常见的单糖有木糖(Xyl)、奎诺糖(Qui)、葡萄糖(Glc)、甲基葡萄糖(MeGlc)和甲基木糖(MeXyl),其化学结构较复杂,且呈现多样性[1]。研究表明,海参皂苷具有抗真菌、抗病毒、细
质谱学报 2011年2期2011-02-02
- 基质辅助激光解吸电离质谱和电喷雾电离质谱在辣根过氧化物酶糖肽结构分析中的应用
海200032)糖链结构的质谱解析是今后糖蛋白分析中的重要研究内容,其中完整糖肽的分析,由于可以同时获得糖基化位点和对应糖链的结构信息,更具有重要意义和研究前景。本工作对质谱软电离技术在完整糖肽分析中的应用进行了研究,其中包括了基质辅助激光解吸电离(matrix-assisted laser desorption ionization,MALD I)和电喷雾电离(electrosp ray ionization,ESI)技术。通过平行使用两种串联质谱(ta
色谱 2010年2期2010-10-21