信号肽
- 信号肽优化提高葡萄糖氧化酶在毕赤酵母中的表达量
是酿酒酵母α 信号肽（α mature factor）[17]。分泌信号由2 部分组成，一部分是19 个氨基酸的N-末端信号序列，指导易位进入内质网（endoplasmic reticulum，ER）；另一部分是66 个氨基酸的蛋白区，介导受体依赖性包装进入内质网衍生的COP Ⅱ转运囊泡[18-19]，重组蛋白通过ER 腔中的Kex 2 蛋白酶去除α 因子信号序列。α 因子信号肽在毕赤酵母中能有效分泌多种异源蛋白质，但不同蛋白的表达水平差异较大，因此，人们
中国农业科技导报 2023年2期2023-05-17
- 信号肽筛选和核糖体结合位点优化的组合策略提高角蛋白酶在枯草芽孢杆菌中的胞外表达
问题之一。通过信号肽筛选增强分泌能力是提升异源蛋白胞外表达量的常用策略。WATANABE等[10]通过对谷氨酸棒杆菌CorynebacteriumglutamicumR全基因组系统筛选，得到405条信号肽序列，其中11条信号肽能够表达嗜热脂肪地热芽孢杆菌Geobacillusstearothermophilus来源的α-淀粉酶，表达量相比常见的棒状细菌分泌蛋白PS2增加了50～150倍不等；GUO等[11]在解淀粉芽孢杆Bacillusamylolique
食品与发酵工业 2023年4期2023-03-07
- 小肠结肠炎耶尔森菌非特异性核酸酶培养条件优化
想宿主[7]。信号肽(signal peptide,SP)作为一种重要的蛋白分泌调控元件，是一段存在于前体蛋白N-端的短肽链，其功能在于引导和调节前体蛋白的折叠，在蛋白转移和分泌过程中发挥极其重要的作用[8]。B.subtilis缺乏外膜结构，分泌蛋白会转运到胞外培养基中，保证分泌蛋白的正确定位和转移则由信号肽来完成[9]。鉴于Nucyep在E.coli表达系统中重组表达后提取复杂的问题，本研究拟采用B.subtilis表达系统进行Nucyep的分泌表达，
生物学杂志 2022年6期2022-12-18
- 杜邦嗜热菌脂肪酶在黑曲霉中的异源表达
察TDL2自带信号肽和pCAMBIA0380质粒信号肽对脂肪酶TDL2表达的影响，为其应用奠定基础.1 材料与方法1.1 材料1.1.1 菌种和质粒 以A.nigerCICC 2213作为黑曲霉表达宿主菌，购自中国工业微生物菌种保藏管理中心，E.coliDH5α用于质粒的构建，携带一个辅助 Ti 质粒的根瘤农杆菌AgrobacteriumtumefaciensAGL-1用于介导黑曲霉转化；黑曲霉表达实验所用质粒为pCAMBIA0380[8],含有黑曲霉的β
江西师范大学学报（自然科学版） 2022年5期2022-12-17
- 信号肽筛选优化提高耐热α-环糊精酶在枯草芽胞杆菌中的表达
分泌表达依赖于信号肽的引导，主要有两个途径：Sec途径和Tat途径。对于同一种外源蛋白质，不同信号肽的引导分泌效率相差较大，两者之间存在适配性[12]。枯草芽胞杆菌信号肽由N端正电荷区（1～5个带正电氨基酸）、H段疏水区（7～15疏水性氨基酸）及C端信号肽酶识别区（3～7个亲水性氨基酸）组成。研究表明信号肽N端正电荷数、H端疏水性会影响目的蛋白在枯草芽胞杆菌中的分泌途径（Sec、Tat途径），从而影响目的蛋白的分泌效率。因此针对特定的蛋白质需要选择合适的信
福建农业学报 2022年3期2022-05-24
- 树生黄单胞杆菌脂蛋白生物信息学分析
用.具有脂蛋白信号肽的蛋白作为分泌蛋白中的一类，参与锚定蛋白的正确定位、修饰和转运过程，从而对维持细胞膜的稳定性、细胞分裂、信号转导和营养获取等生理功能具有非常重要的作用[6].原核生物脂蛋白最早在大肠杆菌(Escherichiacoli)中被发现[7].研究发现，脂蛋白前体在胞质中合成，可以通过Sec分泌途径以未折叠形式穿过胞质膜，也可通过双精氨酸转位TAT途径或SecA突变体以折叠形式穿过胞质膜[8].前人对黄单胞菌中脂蛋白的研究主要集中在相关蛋白的表
福建农林大学学报（自然科学版） 2022年2期2022-04-14
- 中华绒螯蟹微孢子虫全基因组分泌蛋白的预测分析
对蛋白序列进行信号肽预测，筛去其中N端无信号肽的蛋白质[11-12]；MitoProt程序预测线粒体蛋白[15]；TargetP程序对非线粒体蛋白进行亚细胞定位预测，筛选定位于胞外的分泌型蛋白[16]；Kohgpi程序去除可能具有GPI锚定修饰的蛋白质[17]，得到中华绒螯蟹微孢子虫的分泌蛋白集合。1.3 分泌蛋白序列特征的分析根据分泌蛋白的信号肽预测结果，统计信号肽以及完整分泌蛋白序列的长度及氨基酸组成，提取信号肽剪切位点前后各3个氨基酸残基，通过Web
水产科学 2022年2期2022-03-20
- 基于信号肽的β-葡萄糖苷酶的分泌表达
宿主细胞，使用信号肽OprI、OsmY、PelB、OmpA将纳豆芽孢杆菌的β-葡萄糖苷酶基因bglH锚定到大肠杆菌BL21（DE3）外膜和周质上。然后使用启动子T7、Trc、LacUV5诱导表达Ⅱ型分泌途径的SecB伴侣蛋白，进而实现全细胞催化糖苷型底物水解。本研究通过表征不同细胞定位的β-葡萄糖苷酶活性，发现信号肽PelB分泌效果明显高于其他信号肽，LacUV5启动子与SecB伴侣蛋白组合表达bglH的重组菌株全细胞催化酶活性最高。此外，添加甘氨酸至质量
江苏农业学报 2022年1期2022-03-16
- 蛋白质分选的共翻译转运途径*
成一小段后，在信号肽的指导下边合成边转运到粗面内质网，经过加工最终分选到溶酶体、液泡等细胞结构，有的分泌至胞外。人教版普通高中生物学必修1（2019 版）进一步明确了分泌蛋白的起始合成是在游离的核糖体上，通过共翻译转运途径分泌到细胞外，纠正了旧教材中的“最初是在内质网上的核糖体中由氨基酸合成肽链”。本文将详细阐述该途径。1 共翻译转运机制的探究史20世纪60年代，乔治·帕拉德（George Palade）发现细胞质中的游离核糖体产生非分泌蛋白，而附着在内质
生物学通报 2021年1期2021-11-01
- 基于信号肽策略提高外源蛋白在枯草芽孢杆菌中的表达
源蛋白N末端的信号肽来完成，它可以正确的将外源蛋白导向分泌装置，在蛋白分泌过程中起着不可替代的作用［2，4］。目前，只有少数外源蛋白在枯草芽孢杆菌表达系统中实现了高效表达，但还有大多数外源蛋白的分泌和表达效果不理想。其中枯草芽孢杆菌信号肽的氨基酸组成、类型和分泌途径均会对外源蛋白分泌的效率产生影响，合适的信号肽是保证外源蛋白在枯草芽孢杆菌高效表达的关键因素之一。基于信号肽的策略提高外源蛋白的分泌量是切实可行的，并且往往会取得意想不到的效果［5-6］。虽然科
生物技术通报 2021年6期2021-08-11
- 对Deinococcus actinosclerus RM菌株分泌蛋白的预测
编码序列的N端信号肽预测分析、筛选，通过在线程序：SignalP-4.1完成；蛋白质的亚细胞定位预测分析通过网站：http：//www.cbs.dtu.dk/services/TargetP-1.1/index.php完成.蛋白质的跨膜结构域预测分析通过网站：http：//www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/完成.2 结果与分析2.1 RM菌株的基因组测序结果通过SPAdes对二代测序数据进行拼装后，获得RM菌株测序全长为4 013
韶关学院学报 2021年6期2021-07-23
- 基于全基因组序列的黄单胞菌分泌蛋白质预测及其特征分析
菌;全基因组;信号肽;生物信息学中图分类号： S435.1 文献标识码： A 文章编号： 1000-4440（2021）01-0053-07Prediction and characteristic analysis of Xanthomonas campestris secretory protein based on whole genome sequenceQIN Yue1， ZHU You-peng1， HAN Chang-zhi1，2（1.Col
江苏农业学报 2021年1期2021-03-25
- 枯草芽孢杆菌信号肽依赖分泌表达系统研究进展
枯草芽孢杆菌信号肽依赖分泌胞外蛋白途径在外源基因的克隆表达过程中，重组蛋白一般以3种形式表达，包括细胞外的分泌表达、细胞内的可溶性表达和在细胞内形成不溶性的胞涵体。枯草芽孢杆菌为格兰氏阳性菌，只有一层细胞膜，蛋白可直接分泌至胞外而不形成胞涵体，其表达产物多数具有天然构象和生物活性，产物较易纯化，极大地方便了外源蛋白的下游加工和酶活测定，经枯草芽孢杆菌分泌的很多外源蛋白质已经应用于益生菌、酶制剂等工业生产领域[10]，占有很大的市场份额。根据SubtiLi
陇东学院学报 2021年2期2021-03-11
- 可可毛色二孢全基因组分泌蛋白的预测及分析
因组序列，利用信号肽预测软件SignalP v5.0、跨膜结构分析软件TMHMM v2.0、细胞器定位分析软件ProtComp v9.0、GPI锚定预测软件big-PI Fungal Predictor和亚细胞器定位分析软件TargetP v2.0生物信息学软件对该菌中的典型分泌蛋白进行筛选。对分泌蛋白N端信号肽的长度、氨基酸使用频率及其切割位点进行统计分析。依据蛋白序列的同源性，应用BLASTP程序对分泌组蛋白进行功能注释分析，预测其生物学功能。采用蔗糖
中国农业科学 2020年24期2021-01-04
- 白假丝酵母菌(Candida albicans)WO-1分泌蛋白质组的生物信息学分析
的N端是否存在信号肽和酶切位点进行预测分析;TMHMM server v 2.0软件(http:∥www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/)和 Phobius软件(http:∥phobius.sbc.su.se/)预测蛋白质序列跨膜区的拓扑结构和数量;TargetP 1.1软件(http:∥www.cbs.dtu.dk/services/TargetP/)预测靶标肽段在亚细胞器的定位,确定是否为穿膜信号肽;Big-PI Fungal P
沈阳师范大学学报(自然科学版) 2020年5期2020-12-04
- 虾肝肠胞虫全基因组分泌蛋白的预测分析*
LS)，蛋白质信号肽预测软件SignalP-4.0(Petersen et al, 2011)，蛋白质GPI 锚定位点预测软件Kohgpi-1.5(Fankhauser et al, 2005)，蛋白质亚细胞定位预测软件TargetP-1.1(Emanuelsson et al, 2000)和WoLF PSORT(Horton et al,2007)，真核生物分泌蛋白预测程序 EuSecPred2.0(https://silkpathdb.swu.edu.
渔业科学进展 2020年6期2020-11-03
- 信号肽序列对A型流感病毒H1N1 HA蛋白表达的影响
胞质中合成的，信号肽(signal peptide, SP)是位于新合成蛋白质N端的一段的序列[3]，可以指导蛋白质在胞质的正确转移。在信号肽的引导下，新生蛋白质向内质网转移，当蛋白质进入合适的位置后，信号肽序列被切除[4]。然后蛋白质被接着加工转移，最终到达合适的场所发挥功能。HA是一个跨膜蛋白，在其N端含有信号肽序列[5-6]。本研究在含Flag标签真核载体N端和C端分别引入H1N1分离株(A/Puerto Rico/8/34)的 HA 序列，构建带有
畜牧与兽医 2020年8期2020-08-12
- 不同信号肽对人鼠嵌合CMV-IgM分泌表达的影响
白质前体N端的信号肽与信号肽识别因子结合，在信号肽识别因子的帮助下进入内质网进行下一步的修饰，合适的信号肽有助于重组蛋白表达量的提高[7-10]。本研究在已报道的基础上[11-14]，通过RLM-RACE技术钓取杂交瘤细胞基因序列，与人源Fc段进行拼接，构建人鼠嵌合CMV-IgM表达载体，并通过PCR方法将5种不同的分泌型信号肽 (SigA–SigE) 代替 CMV-IgM 自身信号肽(SigF)，利用CHO作为宿主细胞进行体外表达。对纯化后的 CMV-I
生物工程学报 2020年6期2020-07-31
- 16种微生物蛋白酶的生物信息学分析
、肠杆菌属具有信号肽，其余蛋白酶氨基酸序列不具有信号肽的特点。可以推测出蛋白酶为非分泌性蛋白;只有绿脓杆菌和猪链球菌有跨膜结构，剩下其余几种微生物均没有跨膜结构。具有2个蛋白功能域，分别为Peptidase S8 familyi、Fn3_5like domain。关键词：微生物;蛋白酶;序列分析;生物信息学;理化性质;蛋白结构;信号肽中图分类号： S188+.3文献标志码： A文章编号：1002-1302（2020）04-0065-08收稿日期：2018-
江苏农业科学 2020年4期2020-04-16
- 遗传算法背景下人工信号肽优化设计探讨
洋摘要：为提高信号肽以及识别信号肽拼接精度，在结构融合度特征的基础上，构建氨基酸综合替代矩阵和马尔科夫转移矩阵，对不分泌/极低分泌的信号肽序列进行人工调整和优化设计。结果表明：通过寻找信号肽中不同位置氨基酸的偏向性选取趋势，能够确定影响蛋白质分泌水平的关键氨基酸，提高了外源蛋白质高分泌表达信号肽拼接准确度。关键词：信号肽;马尔科夫转移矩阵;特征向量;人工优化序列;遗传算法0 引言随着科研水平的提高，发现信号肽对于蛋白质的定位有着非常重要的作用，使得信号肽的
荆楚理工学院学报 2020年6期2020-04-06
- 大肠杆菌分泌表达裂解性多糖单加氧酶发酵条件的优化
。因此，不同的信号肽被广泛用于将外源蛋白输出到大肠杆菌胞质空间或者直接分泌到胞外培养基中[26, 28]。如来源于苏云金芽孢杆菌的BtLPMO10A利用载体自身信号肽实现了在大肠杆菌胞内的可溶性表达[29]；来源于粘质沙雷氏菌的CBP21(LPMO10)通过不同的信号肽尝试，最终实现了在大肠杆菌的胞外表达[30]。但是目前利用大肠杆菌分泌表达真菌来源LPMO的相关研究较少。实现重组蛋白在大肠杆菌中的胞外表达，可以简化下游处理工艺，因此酶的胞外表达可以降低工
食品与发酵工业 2020年5期2020-03-28
- Pyrococcus yayanosii L-天冬酰胺酶在枯草芽孢杆菌中分泌途径的鉴定及其分泌能力的提高
蛋白质是否依赖信号肽，可以分为信号肽依赖的分泌途径和不依赖于信号肽的分泌途径。枯草芽孢杆菌中依赖信号肽分泌的途径又分为以下4种[7]：Sec分泌途径（General secretion pathway），原核微生物中主要的蛋白质分泌途径，该类信号肽的最典型特征是C端氨基酸序列为Ala-X-Ala（X代表任何氨基酸），由Ⅰ型信号肽酶切割；Tat分泌途径（Twin-arginine translocation pathway），其特征在于N端含有双精氨酸（RR
食品与生物技术学报 2020年11期2020-03-22
- 毕赤酵母引导外源蛋白分泌的信号肽研究进展
-factor信号肽1.1 α-factor信号肽结构和功能当前毕赤酵母系统中应用最广也最为成功的信号肽是酿酒酵母的α-factor信号肽，因而它的结构和功能也得到了较为详细的研究。α-factor信号肽是酵母α细胞分泌的交配信息素（mating factor 1，MF1）N端一段α交配因子前导肽，其编码基因位于酿酒酵母的染色体XV1上[10]。α-factor信号肽由86个氨基酸残基组成，实则包含前肽（Pre-sequence）和前导区（Pro-regi
生物技术通讯 2020年6期2020-03-10
- 一株高效降解羽毛废弃物菌株的筛选及表达条件优化
础上，通过筛选信号肽来提高角蛋白酶基因在枯草芽孢杆菌中的表达，旨为探索信号肽与靶蛋白表达效率之间的关系研究奠定基础，同时有助于实现重组角蛋白酶的工业化生产。1 材料与方法1.1 材料1.1.1 土样 来自新疆、河南、内蒙古、河北、山东地区的羊圈或猪圈的土壤。羽毛：来自宁夏好水川养殖有限公司。菌株与质粒：B.subtilisWB600和质粒pWB980均由本实验室保存。试剂与培养基：DNA限制性内切酶、DNA聚合酶、DNA连接酶，购自TaKaRa公司；质粒提
生物技术通报 2019年9期2019-09-18
- 构建表达Flag-GPI的重组乙型肝炎病毒载体
C端各含有一个信号肽，N端信号肽的作用是将蛋白质带到内质网(endoplasmic reticulum，ER)内腔进行加工；C端信号肽又被称为GPI添加信号肽，其作用是用来替换预先在ER内合成的GPI，使GPI通过特定的化学键连接在蛋白质的C端[22-24]。基于HBV载体5c3c和GPI的特性，本研究设想在5c3c载体中插入外源基因，该基因编码带有N端分泌信号肽和C端GPI添加信号肽的Flag标签，通过构建表达Flag-GPI的重组HBV，使Flag标签
微生物与感染 2019年4期2019-08-30
- 刺齿报春苣苔肌醇半乳糖苷合成酶基因的鉴定及序列分析
基因序列分析;信号肽中图分类号： S184文献标志码： A文章编号：1002-1302（2019）08-0056-04肌醇半乳糖苷合成酶（galactinol synthase，简称GolS）是糖基转移酶家族的一个亚家族，能催化半乳糖和肌醇反应合成肌醇半乳糖苷，为棉子糖系列寡糖的合成提供半乳糖基。棉子糖系列寡糖（raffinose family oligosaccharides，简称RFOs）主要包括棉子糖、水苏糖、毛蕊草糖等，是高等植物中重要的可溶性小分
江苏农业科学 2019年8期2019-08-20
- DrwH类信号肽序列对其抗氧化功能的影响
个氨基酸组成的信号肽序列，完整野生型dWHy1蛋白在大肠杆菌中异源表达，其存活率高于只含有空载体的对照菌株；而缺失信号肽的截短蛋白dWHy1ΔSP能显著增强宿主细胞耐受冷冻胁迫的能力［10］。本研究前期对来源于耐辐射异常球菌的DrwH核心结构域蛋白Dr-WHy在大肠杆菌中的抗逆功能进行初步研究，其在大肠杆菌中表达能够增强宿主的氧化胁迫抗性。此外，氧化胁迫（H2O2）条件下，Dr-WHy蛋白对苹果酸脱氢酶（MDH）和乳酸脱氢酶（LDH）的酶活性有保护作用［5
生物技术通报 2019年5期2019-06-04
- 嗜热内切葡聚糖酶(E1)植物亚细胞定位表达载体的构建及验证
不同亚细胞定位信号肽的ImpactVectors载体连接，构建成E1-IV1.1～E1-IV1.5系列载体，其中载体编号1.1表示不含有信号肽，1.2表示通过内质网分泌的胞外信号肽，1.3表示内质网滞留信号肽，1.4表示叶绿体信号肽，1.5表示线粒体信号肽。利用PCR技术将上述载体中信号肽-E1基因序列扩增。根据载体序列设计的PCR扩增引物分别为：正向扩增引物(1.1S)5′-GTCCATTCCTCCTAAGTATCTAGAA-3′，反向扩增引物(1.1A
江苏农业学报 2018年6期2019-01-04
- 极端嗜热酸性α-淀粉酶PFA在枯草芽孢杆菌中的高效分泌表达
于枯草芽孢杆菌信号肽的引导，并且信号肽与外源蛋白质之间存在适配性[15]。因此针对特定的蛋白质需要选择合适的信号肽来实现有效的分泌表达。来源于极端嗜热古生菌（Pyrococcus furiosus）的极端嗜热酸性α-淀粉酶PFA是目前已知的热稳定性最好的α-淀粉酶。PFA的最适反应温度高达100 ℃，最适反应pH值为5.0，在未补加Ca2＋的条件下于98 ℃的半衰期长达13 h，并且其热稳定性和高温活性均不依赖于Ca2＋[16-17]。鉴于PFA的优良酶学
食品科学 2018年18期2018-10-08
- 基于外泌蛋白质组的酿酒酵母信号肽元件的分析及鉴定
的前体通常含有信号肽，翻译后首先被定向地转运到内质网；另一类不含有信号肽的胞质蛋白如糖代谢酶、伴侣蛋白和翻译起始因子等也可以经过非经典的 ER-Golgi 非依赖分泌途径分泌到胞外，其外泌的分子机制还没有阐明[3]。许多外泌蛋白和胞内膜蛋白在合成时都依赖于其 N-端的信号肽功能元件，细胞内膜定位的蛋白尽管也经过ER-Golgi 途径转运，但是其信号肽的下游和分子内部存在穿膜肽或 C-膜定位信号（如核定位信号肽）控制蛋白的亚细胞转位[4]。分泌型的信号肽含有
中国医药生物技术 2018年4期2018-08-15
- 烟草β—1，3—葡聚糖酶的生物学分析
酶的理化特性、信号肽和跨膜结构的组成成分。[结果]NtBGl-2的分子量最大（40 390.76 Dk），NtBGl-3的分子量最小（37 722.64 Dk）；NtBGl-1和NtBGl-2的等电点小于7.0，而NtBGl-3的等电点大于7.0；NtBGl-1和NtBGl-2属于不稳定蛋白，NtBGl-3属于稳定性蛋白，且耐热性大于NtBGl-1和NtBGl-2；NtBGl-1和NtBGl-2的优势氨基酸为甘氨酸和丝氨酸，NtBGl-3的为天冬酰氨和丙氨
安徽农业科学 2018年17期2018-05-14
- 信号肽对溶血素在大肠杆菌中跨膜转运的影响
核糖体上进行。信号肽（Signal peptide）是蛋白质的一个片段，能够引导核糖体并定位于内质网上，并将不断合成的肽链穿过通道，随后信号肽被切割下来，完整的蛋白被释放进内质网腔后被转运到胞外[1]。研究发现，一般情况下，新生蛋白通常在位于其N端信号肽的指引下到达细胞特定区域，并由其介导完成跨膜转运[2]。猪链球菌属于链球菌属，现在公认的血清型有33个， 其 中2型（Streptococcus suis type 2，SS2）最为常见，也最重要[3]。大
中国动物检疫 2018年3期2018-03-09
- 整体优化的信号肽和人溶菌酶基因在毕赤酵母的高效表达
外源蛋白可通过信号肽引导分泌至胞外等诸多优点，是表达真核细胞来源蛋白质的理想系统之一。在将外源基因转入毕赤酵母前，研究者会根据毕赤酵母密码子偏爱性对外源基因序列进行优化设计。刘真英等[20]对柞蚕溶菌酶基因进行密码子优化后，其在毕赤酵母中表达量可达2.4 g/L，且纯化后的柞蚕溶菌酶比酶活力达到23 970 U/mg。Zhou等[18]对人源溶菌酶基因进行优化，并转入毕赤酵母(P.pastorisSMD1168)进行表达，发酵上清液中人源溶菌酶蛋白浓度为3
江苏农业学报 2018年1期2018-03-07
- 全基因组预测褐环乳牛肝菌的分泌蛋白
基酸大小分布、信号肽长度、信号肽切割位点等进行分析，明确该菌分泌蛋白的氨基酸长度集中于51～450 aa，信号肽长度以17～21 aa的序列最为集中，其信号肽切割位点均属于A-X-A类型。通过上述生物信息学分析方法有效地实现了褐环乳牛肝菌分泌蛋白的预测，分泌蛋白的信号肽切割位点类型与其他已经报道的致病疫霉、粗糙脉孢霉、禾谷炭疽菌等分泌蛋白信号肽切割位点一致。研究结果为进一步解析分泌蛋白在该菌为宿主植物提供营养过程中发挥的作用机制提供重要的理论支持。关键词：
江苏农业科学 2017年23期2018-01-29
- 信号肽对木聚糖酶在马克斯克鲁维酵母中分泌表达的影响
200438)信号肽对木聚糖酶在马克斯克鲁维酵母中分泌表达的影响吴 玥1，周峻岗1,2，吕 红1,2(1. 复旦大学 生命科学学院 遗传工程国家重点实验室，上海 200438；2. 上海工业菌株工程技术研究中心，上海200438)马克斯克鲁维酵母(Kluyveromycesmarxianus)是一种新型的非常规酵母，具有生长快、分泌能力强、安全性高等优势．在酵母表达系统中，分泌信号肽不仅介导了外源蛋白沿着正确途径分泌到胞外，也在蛋白质翻译后加工等方面发挥了
复旦学报（自然科学版） 2017年4期2017-12-14
- 动物双歧杆菌AD011表面脂蛋白的全基因组预测和功能分析
中表面脂蛋白和信号肽进行预测，同时采用COG 功能数据库对预测的脂蛋白进行功能注释和聚类分析。[结果]对动物双歧杆菌AD011基因组1 518个蛋白的表面脂蛋白预测，结果表明，19个蛋白具有脂蛋白信号肽。功能分析显示，该菌株19个脂蛋白中有3个蛋白没有功能注释，16个蛋白有功能注释，其中10个蛋白参与氨基酸代谢与转运、3个蛋白参与碳水化合物代谢与转运，3个蛋白参与无机盐离子代谢与转运。[结论]动物双歧杆菌AD011表面脂蛋白参与的功能主要与营养物质的转运和
安徽农业科学 2017年11期2017-05-30
- 青春双歧杆菌ATCC15703 I型Sec途径分泌蛋白的预测和功能分析
pase I）信号肽酶识别的I型Sec途径分泌蛋白，分泌蛋白的信号肽长度最大的有54个氨基酸，最小的有11个氨基酸。I 型Sec途径分泌蛋白的功能分析结果显示，分泌蛋白主要参与碳水化合物代谢与转运，氨基酸代谢与转运，复制、重组和修复，以及无机离子代谢和转运。[结论]青春双歧杆菌I型Sec途径分泌蛋白的预测和功能分析为了解该菌胞外蛋白的分泌机制提供了数据基础。关键词青春双歧杆菌；基因组；分泌蛋白；Sec分泌途径；信号肽中图分类号R151.3文献标识码A文章编
安徽农业科学 2017年12期2017-05-30
- 谈信号肽及蛋白质分选转运
转运的过程中，信号肽起着十分重要的作用。本文就信号肽的结构和功能，蛋白质分选转运类型与途径等方面进行详细分析，阐述了信号肽对蛋白质的定位重要作用，探究信号肽的研究在生物蛋白质、医疗、制药等方面的应用情况，以及对信号肽研究的未来展望。【关键词】 信号肽 蛋白质 分选转运 实际应用1 信号肽与蛋白质分选转运1.1 信号肽的结构与功能信号肽引导并定位蛋白质新生肽链，类似于一段具有特定的“条形码”，位于蛋白质的N端氨基酸序列，一般由20左右个氨基酸残基组成，包括疏
今日健康 2016年7期2017-04-12
- 运用计算机软件预测木质部寄生属信号肽
测木质部寄生属信号肽张志超1，黄 勇2，徐可成1，宋 红1，杨俊誉1，张 彧1，黄 琼1，3，*(1.云南农业大学 教育部生物多样性与病虫害控制重点实验室，云南 昆明 650201； 2.云南省医疗器械检验所，云南 昆明 650034； 3.云南生物资源保护与利用国家重点实验室，云南 昆明 650201)利用已经公布的木质部寄生属(Xylellafastidiosa)2 766个基因组数据信息，运用在线计算机预测软件，分析了木质部寄生属(Xylellafa
浙江农业学报 2017年3期2017-04-08
- 全基因组预测枯草芽孢杆菌BEST195的分泌蛋白
的氨基酸分布、信号肽长度大小、信号肽切割位点等性质进行分析。结果表明：枯草芽孢杆菌含有分泌蛋白102个，其氨基酸长度、信号肽长度与植物病原菌不同；信号肽切割位点属于A-X-A类型，与其他已经报道的植物病原真菌、细菌以及卵菌中分泌蛋白信号肽切割位点一致。通过上述生物信息学分析方法有效地实现了枯草芽孢杆菌BEST195分泌蛋白的预测，分泌蛋白的信号肽切割位点具有物种保守型特点。枯草芽孢杆菌；分泌蛋白；信号肽；预测枯草芽孢杆菌BEST195 (Bacilluss
西南林业大学学报 2016年6期2016-12-15
- 烟草野火病菌Pseudomonas syringae pv. tabaci yuexi-1信号肽预测及分析
yuexi-1信号肽预测及分析王铁霖，李晶，杨玉文，赵廷昌中国农业科学院植物保护研究所，植物病虫害生物学国家重点实验室，北京 100193利用SignalP 4.0、 LipoP 1.0 及TMHMM v2.0对烟草野火病菌Pseudomonas syringaepv.tabaciyuexi-1菌株基因组中信号肽的数量、长度和氨基酸组成进行了预测及分类。结果确定其中432个ORFs (Open reading frame) 所编码的N 端有信号肽序列，占全
中国烟草学报 2016年1期2016-11-16
- 土壤宏基因组中芽孢杆菌信号肽的克隆及分析
因组中芽孢杆菌信号肽的克隆及分析唐国鑫1，2，陈宁1*（1.天津科技大学生物工程学院，天津300457；2.中国科学院天津工业生物技术研究所，天津300308）从土壤宏基因组中筛选获得在芽孢杆菌中高效分泌重组蛋白的信号肽。通过数据分析，将预测到的信号肽DNA片段与蛋白酶基因融合，在枯草芽孢杆菌（Bacillus subtilis）WB800和地衣芽孢杆菌（Bacillus licheniformis）DL6中表达，进行胞外蛋白酶酶活测定。筛选得到25个可能
中国酿造 2016年6期2016-10-14
- 分散泛菌蔗糖异构酶在大肠杆菌中的表达及发酵优化
量，研究了不同信号肽及发酵条件对蔗糖异构酶在大肠杆菌中重组表达的影响。将携带天然信号肽的蔗糖异构酶基因优化后，转入大肠杆菌Escherichia coli BL21 （DE3） 构建重组表达菌株——ORI菌株，摇瓶发酵总酶活和胞外酶活分别为85 U/mL、65 U/mL。从天然信号肽开始第22位氨基酸作为成熟蛋白的起始，连接PelB或OmpA信号肽构建P22和O22菌株，其中P22菌株发酵总酶活提高至138 U/mL，是ORI菌株总酶活的1.6倍；而O22
生物工程学报 2016年8期2016-09-13
- 真核细胞内蛋白质的定位
外的精准定位与信号肽和囊泡密切相关。1.1 “信号肽”假说 20世纪70年代初，洛克菲勒大学布洛贝尔(Gūnter Blobel)博士提出 “信号肽假说”,以解释蛋白质如何从核糖体合成后到达内质网，并在随后的20多年的工作中证实了假说的正确性和普遍性。什么是信号肽？一般认为是新合成多肽链中用于指导蛋白质跨膜转移的N-末端氨基酸序列。信号肽通常由16～36个氨基酸组成，一般位于N端(有时不一定在N端)，对蛋白质的靶向转运有决定作用。信号肽假说的内容包括：①蛋
生物学教学 2016年7期2016-08-20
- 烟草合子时期特异表达基因的克隆与分析
含有1段疏水性信号肽，但在其他物种中没有发现同类蛋白。NtZE583-绿色荧光蛋白（NtZE583-GFP）融合蛋白亚细胞定位显示，该蛋白可能存在于液泡中。利用染色体步移技术获得该基因5′端上游3 866 bp的侧翼序列（启动子和5′UTR），经检测发现，具有较强的启动子活性。研究结果为进一步研究该基因在烟草早期胚胎发生中的功能奠定了基础。关键词：烟草；合子；液泡；基因克隆；信号肽中图分类号： S572.01；Q785文献标志码： A文章编号：1002-1
江苏农业科学 2016年5期2016-07-23
- 中温α-淀粉酶基因在枯草芽孢杆菌中的高效表达及其发酵条件优化
研究了启动子和信号肽对外源蛋白表达分泌的影响。分别选取了4种启动子以及8种信号肽来进行筛选，结果表明，启动子PAprE的强度最高，信号肽SPnprE的分泌效率最好。针对重组菌株1A751Q31进行系统的发酵优化，在72 h发酵液中α-淀粉酶酶活达到380 U/mL。在7.5 L发酵罐中进行放大实验，发酵液中α-淀粉酶酶活最高达到853 U/mL。以上研究表明，α-淀粉酶适合在枯草芽孢杆菌中进行表达，同时表明枯草芽孢杆菌是良好的异源蛋白表达系统。关键词枯草芽
食品与发酵工业 2016年4期2016-05-24
- 信号肽对Bacillus subtilis表达环糊精葡萄糖基转移酶的影响
14122）信号肽对Bacillus subtilis表达环糊精葡萄糖基转移酶的影响毛婷1，2，李江华*1，2，刘龙1，2，堵国成1，2，陈坚1，2 （1．江南大学，工业生物技术教育部重点实验室，江苏无锡214122；2.江南大学生物工程学院，江苏无锡214122）摘要：将来源于作者所在实验室构建保存E.coli pET-20b（+）/CGT△E-CBMAmy的CGT△ECBMAmy基因插入6种含有不同信号肽（estA、bpr、vpr、yncM、yvgO
食品与生物技术学报 2016年2期2016-05-23
- 内质网的蛋白质合成功能
(氨基末端)的信号肽，指导蛋白质由核糖体转至内质网上合成，并因此获得1999年诺贝尔生理学或医学奖。2.1 信号肽 在成熟mRNA5′端起始密码(AUG)之后，有一组编码特殊氨基酸序列的密码子，称为信号密码，由信号密码翻译出的肽链，叫做信号肽。信号肽为高度疏水氨基酸组成的肽链，一般由13～26个氨基酸组成，是新生肽链上的一段特殊的氨基酸序列，可引导蛋白跨膜或分泌到胞外。信号肽的位置大多位于新生肽的N-端，少数位于多肽链的中部。信号肽一般可分为：亲水区、疏水
生物学教学 2016年2期2016-04-10
- 希金斯刺盘孢全基因组候选效应分子的预测
孢；效应分子；信号肽；十字花科植物炭疽病；生物信息学中图分类号 S436.34 文献标识码 AAbstract Colletotrichum higginsianum Sacc. is one of the important phytopathogenic fungi worldwide， and often causes severe anthracnose disease on a wide range of cruciferous plants，
热带作物学报 2015年6期2015-05-30
- 树鼩全基因组分泌蛋白的预测分析
蛋白质序列进行信号肽预测，最后利用TargetP、PSORT和WoLF PSORT对具有信号肽的蛋白质进行亚细胞定位预测，筛选定位于细胞膜外的蛋白质。以上所有程序的运行及结果的处理通过EuSecPred 2.0在线流程完成[8]。筛选得到的分泌蛋白合集包括含有信号肽的经典型分泌(classical secreted protein，CSP)以及无信号肽的非经典型分泌蛋白(non-classical secreted protein，NCSP)两种[17]。
中国比较医学杂志 2014年4期2014-08-14
- 褐色喜热裂孢菌Thermobifida fusca产麦芽糖α-淀粉酶基因的克隆表达及酶学性质研究
引物分别扩增含信号肽和去除信号肽的T.fuscaα-淀粉酶基因。为便于基因与载体的连接，在上下游分别加入Nco I和Eco R I的酶切位点（带下划线），同时为方便后期的过镍柱纯化目的蛋白，设计引物时在表达的目的蛋白基因前端加上6个组氨酸尾巴序列，并委托鼎安生物公司合成。其中，引物Sense1和Antisense扩增的是含信号肽的T.fuscaα-淀粉酶基因，而引物Sense2和Antisense扩增的是去除信号肽的T.fuscaα-淀粉酶基因。1.2.2
食品工业科技 2013年24期2013-02-21
- 信号肽与分泌通路在毕赤酵母表达异源蛋白中的作用机制
）研究认为，除信号肽外，分泌通路在外源蛋白高效分泌过程中起关键作用，因此成为突破蛋白质分泌瓶颈的焦点。本文就毕赤酵母信号肽关联的分泌机制、结构特征和蛋白分泌通路改造等方面的研究进展作一综述。1 信号肽牵引的外源蛋白分泌通路假说Gunter Blobel于20世纪70年代提出信号肽假说，认为蛋白质合成在核糖体上进行，信号肽作为蛋白质的一个片段引导核糖体定位于内质网通道上，并牵引合成的多肽穿过内质网通道，随后信号肽被肽酶切除，蛋白质被释放到内质网腔，由转运小泡
中国饲料 2013年1期2013-01-25
- 禽类MHCⅡ类分子β链信号肽保守性分析
CⅡ类分子β链信号肽保守性分析宗文明1,叶 红2（1.安徽农业大学，安徽 合肥 230036；2.安徽省医学科学研究院，安徽 合肥 230061）Ⅱ类主要组织相容性复合物（major histocompatibility complex，MHC）的β链显示极为丰富的多态性.为了分析禽类MHCⅡ类分子β链信号肽是否呈现出多态性的分子生物学特征，利用NCBI网站查找到原鸡等五种禽类编码MHCⅡ类分子β链的mRNA，再用DNAStar软件转译成氨基酸序列，然后用
赤峰学院学报·自然科学版 2012年15期2012-10-16
- 信号肽编码序列库的构建及耐热乳糖酶的分泌
214122）信号肽编码序列库的构建及耐热乳糖酶的分泌夏 雨 弓紫丰 成玉梁 赵 莹 孙 震（江南大学食品学院，江苏 无锡 214122）为了实现来源于嗜热脂肪芽孢杆菌的β－半乳糖苷酶在枯草芽孢杆菌中的分泌表达，建立一种较简便的方法筛选能够分泌该酶的信号肽，即针对11种信号肽构建信号肽编码序列库，采用随机筛选方法得到合适的信号肽，构建相应的分泌表达载体和重组表达菌株。结果表明，通过信号肽随机筛选方法获得的枯草芽孢杆菌中性蛋白酶NprE信号肽能够有效引导该酶
食品与机械 2011年6期2011-12-28
- 细菌一种“新的分泌机制”初探
到达周质时会被信号肽酶剪切掉［2］。I型是 Sec非依赖途径。与II型和IV型分泌途径相比较，I型和III型分泌不依赖于Sec系统，所以不需要分泌蛋白的氨基端加工。I型和III型途径的蛋白质分泌是一个连续的过程，不存在明显的周质中间体［3－4］。重组蛋白在大肠杆菌胞周质中分泌表达应属于II型分泌机制［2］，在重组蛋白的氨基端通常融合一段信号肽基因，当翻译完成后，这条信号肽就会被大肠杆菌胞质中的信号肽酶切除，这是一条传统的分子生物学基本原理。但是，本文在构建
中国兽药杂志 2011年3期2011-05-29
- 斑马鱼成纤维细胞生长因子(FGFs)信号肽的预测分析
都具有一个N端信号肽,属于典型的分泌型生长因子,可被细胞分泌到胞外,以自分泌或者旁分泌形式发挥调控作用[4]。因此,研究FGF成员的信号肽结构对于研究其在生物体内的分泌途径,可以揭示它在胚胎发育、组织形成与修复、炎症、血栓形成、肿瘤发生等生理及病理过程中的作用途径。本文利用分析准确率较高的Signal P3.0[5]、TMHMM 2.0、Big.PI-Predictor和 Target P1.01四种软件对斑马鱼FGF中分泌型蛋白的信号肽进行预测,并对其信
中国兽医杂志 2010年6期2010-11-22
- 一种表征蛋白质可分泌性的结构融合度特征
22选择适宜的信号肽是实现外源蛋白高效分泌表达的一个重要因素。本研究利用生物信息学方法分析信号肽与外源蛋白之间的相容程度，将其定义为结构融合度，并从数学角度分析拼接信号肽与目的蛋白邻近残基之间的相互作用，提出了信号肽拼接区域与目标蛋白之间的数学模型，利用该模型进行结构融合度特征提取，以此来表征外源蛋白质的可分泌性。模拟结果显示结构融合度特征能有效区分枯草芽胞杆菌宿主的可分泌和不可分泌蛋白。研究结果有助于信号肽的选择，对目的蛋白分泌表达的优化具有一定的指导意
生物工程学报 2010年5期2010-10-11
- 欧文氏杆菌CXJZ95-198甘露聚糖酶基因N端缺失表达
比说明缺失了的信号肽序列对酶活或者酶的分泌能力有负面影响，pF2和pF3透明圈大小无明显差异说明N端信号肽后10个AA对该酶的活性无影响，可删除。pF4和pF3比较说明pF4多删除的10个AA对该酶的活性有非常重要的影响。2.4 重组子表达产物的SDS-PAGE分析分别挑取pF1-pF4四种菌的阳性克隆子的单菌落，在5 mL含有终浓度为50 μg/mL卡那霉素的LB培养基中37℃，180 r/min震荡培养6 h，再将活化菌按2%的比例接种100 mL含有
湖南农业科学 2010年11期2010-07-09