转座子
- 谷子、水稻与其野生种基因组转座子比较
030801)转座子(Transposable elements,TEs)最早由Barbara McClintock在玉米(Zeamays)中发现,在细菌、病毒以及真核生物的基因组中广泛分布[1-2]。转座子类似内源性病毒,能够在宿主基因组中“复制粘贴”、“剪切粘贴”自己的序列,以达到自我“繁殖”的目的[3-6]。按其复制方式可分为逆转录转座子(Class I retrotransposons)和非逆转录转座子(Class II DNA transposo
中国农业大学学报 2023年7期2023-07-15
- 小麦幼苗活性LTR反转录转座子筛选及其对非生物胁迫的响应
性LTR反转录转座子筛选及其对非生物胁迫的响应周宾寒1杨 竹1王书平1方正武1胡赞民2徐兆师3张迎新1,*1长江大学农学院 / 主要粮食作物产业化湖北省协同创新中心, 湖北荆州 434025;2中国科学院遗传与发育生物学研究所, 北京 100101;3中国农业科学院作物科学研究所 / 农作物基因资源与基因改良国家重大科学工程 / 农业部麦类生物学与遗传育种重点实验室, 北京 100081LTR (长末端重复, long terminal repeat)反转
作物学报 2023年4期2023-02-27
- 红毛丹基因组中MITEs转座子的鉴定与演化分析
61801）转座子（transposon）是动植物基因组的重要组成成分[1]，是基因组演化过程中不可忽视的一部分[2]，它们可以通过复制或移位从基因组的一个位点转移至另一个位点[3]，从而造成基因组重排，并对基因组大小、染色体结构和附近基因的表达水平等有着不同程度的影响[4]。转座子的含量和种类在不同的生物基因组中存在较大的差异，根据其转座的不同机制，大致可分为ClassⅠ和ClassⅡ两大类[5]。ClassⅠ型转座子以RNA为中间媒介进行转座，可以自
四川农业大学学报 2022年5期2022-11-02
- 云南原始地方种四路糯基因组中的MITE类转座子“124”
是玉米基因组中转座子活动造成的突变。其中-124是由MITE类转座子“124”插入基因的第六外显子造成的突变。转座子插入是造成基因突变的主要原因之一。转座子是基因组中一段可移动的DNA序列，可以通过切割、重新整合等一系列过程从基因组的一个位置“跳跃”到另一个位置。根据转座子在基因组内跳跃媒介的不同，可以将转座子分为DNA转座子和RNA转座子，RNA转座子又叫反转录转座子。RNA转座子通过“复制—粘贴”的方式转座，DNA转座子通过“剪切—粘贴”的方式转座。微
安徽农业科学 2022年13期2022-07-18
- 牛亚科物种转座子与串联重复序列之间的进化关系
高雪牛亚科物种转座子与串联重复序列之间的进化关系张瑞，张天留，范婷婷，朱波，张路培，徐凌洋，高会江，李俊雅，陈燕，高雪中国农业科学院北京畜牧兽医研究所，北京 100193【】重复序列是真核生物基因组中重要组成部分，对物种进化、基因遗传变异、转录调控等具有重要作用。研究旨在揭示牛亚科物种重复序列特征，研究转座子和串联重复序列间的进化关系，为牛亚科物种重复序列的研究提供理论支撑。以普通牛、瘤牛、牦牛、水牛、野牛以及大额牛6个牛亚科物种的基因组序列为研究对象，利
中国农业科学 2022年9期2022-05-17
- 转座子介导MYB在果树花青素合成中的调控作用*
]，本文重点就转座子调控重要果树果实着色的相关分子机制进展进行综述，以期为研究果树花青素代谢调控网络和改善果实品质育种提供新的理论指导。1 花青素的生理功能花青素属于水溶性黄酮类色素，通常都以糖苷形式存在液泡中，不同水果成熟时花青苷含量和种类不一样，诸如影响苹果和梨果皮的色苷主要为矢车菊素-3-O-半乳糖苷[4-6]，血橙和红肉桃主要为矢车菊素-3-葡萄糖苷[7-8]，葡萄主要为二甲花翠素-3-葡萄糖苷与二甲花翠素-3-乙酰葡萄糖苷[9]，蓝莓主要为锦花葵
中国果树 2022年2期2022-04-20
- Tc1/Mariner转座子超家族在褶皱臂尾轮虫中的进化和表达分析❋
572000)转座子(Transposons)，又被称为转座元件(Transposable elements, TEs)，是一段能通过非同源重组在宿主基因组内或基因组间进行移动的散在分布的重复序列[1]。真核生物的转座子按转座机制可分为两大类：Ⅰ类元件即逆转录元件，是通过逆转录酶使用“复制-粘贴”的机制进行转座的RNA转座子；Ⅱ类元件DNA转座子，则是使用基于DNA的“剪切-粘贴”转座模式直接将转录子从原始位点整合至目标位点的转座子，其中最大的亚纲是两端有
中国海洋大学学报（自然科学版） 2022年4期2022-03-26
- 毛竹Mariner-like element自主转座子的鉴定与生物信息学分析*
311300)转座子广泛分布在生物基因组内，是生物基因组成的重要部分，在有些植物中转座子含量可以高达80%以上(Sergeevaetal.，2011)，如在小麦(Triticumaestivum)基因中转座子含量为88%(Chouletetal.，2010)，在玉米(Zeamays)基因中转座子含量为84%(Schnableetal.，2009)。转座子在基因组内的活动可以对生物基因组产生巨大的影响，主要表现为：转座子的转座活动造成基因插入突变，同时，转座
林业科学 2022年1期2022-03-23
- blaKPC耐药基因在肺炎克雷伯菌中的传播机制研究
的广泛流行。2转座子介导的blaKPC耐药基因传播机制转座子(Tn)是指能将自身基因插入基因组中任何一个序列的一组DNA序列，它可以在基因组上进行自由移动[15]。转座子可以介导β-内酰胺酶基因，通过水解β-内酰胺类抗生素，从而导致blaKPC耐药基因的水平传播[16]。据流行病学调查报告表明，转座子Tn4401是欧美地区最常见的携带blaKPC的基因元件[17]。Tn4401转座子全长10 kb左右，其结构组成包括blaKPC-2基因、转座酶基因(tnp
海南医学 2021年21期2021-12-07
- 重复序列对植物基因组大小进化的影响
是LTR反转录转座子的插入与删除是造成基因组大小巨大差异的主要因素。种内和种间基因组大小之间的差异都与重复序列的差异表现出了明显相关性。该项研究将详细地讨论重复序列对基因组大小进化的影响。2植物基因组中重复序列的分类重复序列是指在基因组中不同位置重复数百次或数千次的DNA序列基序[16]，重复序列主要分为两大类：一类是串联重复序列，主要包括一些较短的重复，如卫星DNA；另一类是散在重复序列，主要指的是转座元件，包括DNA转座子和RNA转座子[17]，具体分
华北理工大学学报(自然科学版) 2021年4期2021-10-26
- piggyBac转座子AgoPLE1.1在黑腹果蝇种系转化中的应用
要作用的DNA转座子有果蝇Drosophila的P因子、Tc1/Mariner家族的Minos、hAT家族的Hermes、Mariner家族的Mos1和piggyBac转座子(PB)家族的IFP2。研究表明，果蝇P因子在天然宿主以外的生物中没有活性(O′Brochta and Atkinson,1996)；Tc1/Mariner家族转座子不仅转座频率较低(Drabeketal., 2003)，并且其携带外源基因的能力有限(Dingetal., 2005)；
昆虫学报 2021年6期2021-07-20
- 毛竹长末端重复序列反转录转座子的全基因组特征及进化分析
311300）转座子(transposable elements, TEs)是一种自私的基因组“寄生虫”，能够增加拷贝数并改变其在宿主基因组中的位置[1]。转座子由于具有突变的可能，会对邻近基因表达产生潜在的危害，并导致染色体重排，对基因组的稳定性构成威胁[2−4]。转座子根据其转座中间产物被分为2类，其中Ⅰ类转座子包括复制黏贴式反转录转座子(retrotransposons, REs)[5]，Ⅱ类转座子包括剪切黏贴式转座子[6]。Ⅰ类转座子根据其内部的结
浙江农林大学学报 2021年3期2021-07-12
- 转座子沉默与DNA甲基化
311300）转座子(transposable elements，TEs)被定义为能够在生物体基因组中移动的DNA序列，能在同一染色体的不同位点或者不同染色体之间转移[1]。由于起源和进化路径的差异，TEs包含不同的家族。FINNEGAN[2]首次根据TEs的转座中间体和转座机制将转座子分为Ⅰ类RNA转座子(retrotransposons)和Ⅱ类DNA转座子(DNA transposons)。Ⅰ类通过RNA介导的复制-粘贴过程迅速增殖，RNA转座子进一步
浙江农林大学学报 2021年3期2021-07-12
- 地熊蜂基因组中具有潜在活性的转座子鉴定
100093）转座子（TEs）是能够从基因组一个位点转移到另一个位点，在此过程中通常会发生自我复制的DNA 片段[1]。转座子可分为逆转录转座子和DNA 转座子两大类。逆转录转座子借助转座子转录后产生的mRNA 而完成转座过程，转座后逆转录转座子的拷贝数增加；而DNA 转座子是借助自身的DNA 序列发生转座，可以是复制或非复制型的转座[2,3]。在几乎所有生物的基因组中都发现了转座子，通常数量很多。例如在脊椎动物基因组中，转座子含量的变化范围从绿河豚的6%
中国蜂业 2021年5期2021-05-22
- 高温导致男性不育的研究进展
双链结构受损和转座子的激活。（一）睾丸温度升高对氧化应激加速的影响氧化应激是由于体内产生自由基导致的，身体细胞氧化和抗氧化失衡且倾向于氧化的一种状态。短时间的睾丸温度升高即可引起精母细胞的氧化应激反应加速。一方面，氧化应激反应可导致精子磷脂和脂肪酸快速氧化分解，影响精子活性[9]。研究表明精子膜脂质过氧化会导致高粘度精液发生，而高粘度精液是精子功能不足，导致MI的因素之一[10]。另一方面，氧化应激加速也可能会导致精子的DNA、RNA以及端粒受到损害，导致
中国男科学杂志 2021年5期2021-01-03
- 张丽课题组揭示心里美萝卜花青苷合成的新机制
CACTA类型转座子插入。通过调查CACTA转座子在111份萝卜种质中的分布，揭示了该CACTA转座子对于心里美萝卜红肉形成必不可少。甲基化分析表明：CACTA转座子在红肉和白肉材料中均有较高的甲基化水平，但RsMYB1基因启动子的甲基化水平白肉材料明显高于红肉材料。愈伤组织过表达和VIGS互补试验验证了RsMYB1基因的功能，去甲基化试剂5-azaC处理白肉突变体能够部分恢复花青苷的积累。综上，研究人员认为RsMYB1启动子区域的CACTA转座子插入在心
蔬菜 2020年4期2020-12-14
- 栉孔扇贝LTR逆转录转座子的基因组分布特征及时空表达模式分析*
266237)转座子又被称为跳跃因子(Mobile genetic elements)，最早是由Mc Clintock在玉米中发现[1]的。近几十年的研究表明，转座子存在于所有真核生物的基因组中，并对基因组的进化起着重要的作用[2]。根据转座方式的不同，转座子主要被分为两大类，第一类是过“剪切-黏贴”的方式进行移动的DNA类型的转座子，这种转座的方式并不会影响基因组的大小；第二大类是通过“复制-黏贴”的方式，以RNA为中介插入基因组的其它位置，这类转座子又
中国海洋大学学报（自然科学版） 2020年10期2020-09-17
- 绿豆Copia类反转座子全基因组注释及进化分析
nts)，又叫转座子，是基因组中可以移动的DNA片段。根据转座方式的不同，植物中的转座子一般可分为2种类型，即以RNA为媒介的反转座子和以DNA为媒介的DNA转座子。根据结构的不同，反转座子又可以分为LTR(Long terminal repeat)类反转座子和非LTR类反转座子[1]。研究结果表明，LTR类反转座子是植物基因组的主要组成部分。在玉米中，LTR类反转座子的DNA含量可以达到75%[2]。根据序列相似性和转座酶的先后顺序，LTR类反转座子又可
江苏农业学报 2020年4期2020-09-10
- 日本：科学家研究表观遗传对整个基因组的影响
”，抑制被称为转座子的破坏性“跳跃基因”的活动，否则它们会在基因组中跳跃并威胁其完整性。科学家们仍在努力解开细胞用来精确控制基因活动的许多通路。现在，来自冲绳科学技术大学院大学（OIST）的研究人员通过观察植物细胞如何抑制转录，发现了解开这个谜团的线索。他们最近发表在《自然通讯》（Nature Communications）上的发现，精确地指出了以前未知的DNA片段，这些片段因表观遗传调控而沉默，其中许多基因源自转座子。这项研究提供了一个关于细胞如何以及在
国际种业前沿动态 2020年14期2020-08-12
- 玉米花粉的高表达基因与邻近转座子协同调控花粉发育和受精（2020.4.5 莱肯生物）
育过程中存在着转座子的动态表达，不同转座子会产生不同小RNA，调控不同的基因表达。在转座子丰富的玉米中，转座子在花粉发育过程中的表达动态有待研究。美国俄勒冈州立大学John E.Fowler团队利用RNA-seq技术测量了玉米雄穗原基、小孢子、成熟花粉和精子细胞四个雄性生殖阶段的基因转录谱。研究人员发现，与拟南芥花粉中转座表达不同，玉米早在小孢子期就存在转座子转录现象，成熟花粉和精子细胞均存在高表达基因和邻近转座子间的协调表达。研究者测量了50多个在花粉营
三农资讯半月报 2020年7期2020-04-28
- Mutator超家族转座子研究进展
2综 述超家族转座子研究进展从春生1，李玉斌1,21. 中国农业科学院生物技术研究所，北京 100081 2. 青岛农业大学农学院，青岛 266109转座子是一类可以在基因组中不同遗传位点间移动的DNA序列，在其转移过程中有时会伴随自身拷贝数的增加。作为基因组的重要组成部分，转座子可以通过多种方式影响宿主基因及基因组的结构与功能，进而在宿主的演化过程中扮演重要角色。目前依据转座过程中间体类型的不同可以将其分为I类转座子和II类转座子。超家族转座子是20世纪
遗传 2020年2期2020-04-13
- 淅川乌骨鸡全基因组转座子的鉴定与分析
乌骨鸡全基因组转座子的鉴定与分析李东华，付亚伟，张晨曦，曹艳芳，李文婷，李转见，康相涛，孙桂荣（河南农业大学牧医工程学院，郑州 450046）【】通过分析淅川乌骨鸡全基因组重测序数据，获取淅川乌骨鸡转座子的基本信息和特征分布，探究转座子相关基因参与的通路。不仅对研究淅川乌骨鸡转座子的生物学功能具有重要的意义，而且为探索基因组扩增、基因组功能及进化研究提供重要基础数据。对淅川乌骨鸡血液DNA进行全基因组重测序，采用双末端短序列比对基因组，运用RepeatMo
中国农业科学 2020年7期2020-04-11
- 转座子引起的猪ktn1基因结构变异及其与生产性能的关联分析
兽医生物技术·转座子引起的猪基因结构变异及其与生产性能的关联分析陈才，陈伟，郑尧，顾浩，王伟，王宵燕，高波，宋成义扬州大学 动物科学与技术学院，江苏 扬州 225009为探明转座子对猪的基因及其侧翼区结构变异的贡献，从全基因组测序(WGS) 数据库中获取 14个猪基因组中的基因序列和侧翼序列，通过ClustalX多序列比对和RepeatMasker转座子注释，全面解析转座子对的影响。通过PCR检测到一个SINEA1转座子插入多态，在苏姜猪群体中与相关性状进
生物工程学报 2020年2期2020-03-11
- piRNAs在果蝇中使转座子沉默
陈语摘 要：转座子（TEs）是可以在基因组内移动的DNA序列。TEs可以通过多种机制大幅度地塑造基因组，转录本和宿主生物的蛋白组。但是，TEs通常干扰基因并且是宿主基因组不稳定，这样本质上降低了宿主生物的适合度。理解TEs的基因组的干扰和进化的动态将大大地加深我们对TE介导的生物过程的理解。大部分TE插入在黑腹果蝇中是高度多态的，提供给我们一个很好的系统在群体水平来研究TEs的进化。数十年的理论和实践的研究已经很好的建立起“转座-选择”群体基因模型，此模型
科学与财富 2019年15期2019-10-21
- 水稻转座子受驯化选择和在抗病抗逆中的调节功能
果——发现水稻转座子受驯化选择和在抗病抗逆中的调节功能。该项研究发现自然条件下一个活跃的反转录转座子HUO（“活”），该转座子广泛存在于野生稻基因组中，部分存在于考古水稻样本和农家种，但在现代栽培稻中丢失。研究揭示HUO通过表观遗传学途径影响基因组水平的功能基因，激活基因组的不稳定性/防卫反应，这些都有利于野生稻适应复杂多变的自然环境。但由于HUO的存在不利于对栽培稻高产稳产的需求，该转座子在水稻驯化和育种过程中被逐步选择性删除。该研究首次提出转座子元件也
粮食科技与经济 2019年7期2019-10-20
- 毛竹 Phyllostachys edulis retrotransposon 7（PHRE7）转座子的克隆与鉴定
分重要的地位。转座子是真核生物中一类重要的转座元件，在毛竹基因组中有广泛分布。转座子又可称跳跃因子，其实质是基因组染色体上能自主复制和位移的一段脱氧核糖核酸（DNA）序列，可以直接从基因组内的一个位点移到另一个位点［1］，其转座的发生会导致自身碱基位置的改变和（或）拷贝数的增加。转座子根据转座方式不同可分为DNA转座子（DNA transposon）和核糖核酸（RNA）反转录转座子（retrotransposon）。DNA转座子是以DNA为中间媒介，通过
浙江农林大学学报 2019年5期2019-09-25
- 禾谷镰刀菌全基因组候选效应因子预测与分析
菌全基因组内的转座子进行分析，但未发现转座子存在，值得进一步分析研究。本研究采用生物信息学分析方法预测出了禾谷镰刀菌的候选效应分子并查找其基因组内转座子情况，可为进一步研究这些效应分子的功能，了解禾谷镰刀菌进化奠定基础。关键词：禾谷镰刀菌;全基因组;候选效应因子;转座子;生物信息学;致病机制;进化历程禾谷镰刀菌（Fusarium graminearum）属半知菌类丛梗孢目瘤座孢科镰刀属菌。在粮食上普遍存在，它与其他几种镰刀菌都能引起小麦、大麦、玉米等作物发
江苏农业科学 2019年6期2019-09-25
- 棉铃虫膨胀线粒体基因组的鉴定与分析
RNA解旋酶;转座子中图分类号：S 435.622文献标识码：ADOI：10.16688/j.zwbh.2018223线粒体是真核细胞中一种最基本的细胞器，一般认为其起源于细菌在真核细胞中的内共生作用[1]，且保留了一套独立于细胞核基因组之外的遗传系统，能够进行自我复制和表达。在植物和动物中，尽管线粒体承担的生物学功能相似，但其基因组却向两个极端对立的方向演化：植物线粒体基因组复杂、庞大，变异程度较大，富含大量非编码序列和内含子;而动物的线粒体基因组较为保
植物保护 2019年1期2019-06-11
- 一个毛竹LTR反转录转座子结构鉴定及表达模式分析
311300转座子广泛存在于真核生物基因组中，是基因组的主要组成成分。转座子主要包括DNA转座子和RNA转座子，RNA转座子又称为反转录转座子。长末端重复序列 (Long terminal repeat，LTR) 转座子属于反转录转座子的一个大类，包含有Ty1-Copia、Ty3-Gypsy、Bel/Pao、Retroviridae、Caulimoviridae、LARD (Large retrotransposons derivatives) 和TRI
生物工程学报 2019年3期2019-03-27
- 酿酒酵母中PiggyBac 转座子筛选系统的构建
酵母中使用基于转座子的酵母突变基因组文库进行基因筛选[6]。在这个系统中，转座子在大肠杆菌中通过转座酶被插入含有酵母基因组的质粒文库中。随后将突变的质粒文库转入酵母并替换染色体上的等位基因，由此引起突变[7]。尽管这一方法适用于在酵母体内进行遗传筛选，但仍然存在一些问题，比如整合效率低，筛选覆盖范围有限以及突变文库的保存比较困难。相比之下在酵母细胞内使用转座子进行突变比转座子文库更高效。酵母本身有一种内源性的反转录转座子Ty1 可以高效地进行转座，使用这种
食品与生物技术学报 2019年10期2019-02-06
- 基于植物转座子的分子标记研究进展
07)1 植物转座子植物转座子是广泛分布于植物基因组中的一类能从染色体的一个位置跳跃到另一个位置或者另一条染色体的DNA序列。根据转座机制的不同可分为DNA转座子和反转录转座子。DNA转座子是一类由DNA介导，通过“剪切-复制”进行转座的可移动元件，包括微型反向重复转座元件(miniature inverted repeat transposable elements，简称MITEs)和Helitron，其插入位点多态性丰富、拷贝数多。MITEs两端由末端
江苏农业科学 2018年23期2019-01-09
- 中科院植物研究所在植物适应性进化方面取得新进展
研究人员发现，转座子在C.rubella里高度富集，其变异促进了快速的表型变异，如转座子插入到开花时间相关基因FLC区域促进开花。研究表明，遗传多样性很低的物种能够通过转座子的大量扩增，快速产生遗传变异，并导致开花时间等关键适应性状的变异，从而提高其适应能力；其揭示了“生物入侵的遗传悖论”一个可能原因，即转座子的“爆发”产生的遗传变异可以使遗传多样性很低的物种能够快速适应新生境。相关研究成果于2019年3月15日发表在国际学术期刊《PNAS》上。
蔬菜 2019年4期2019-01-04
- 生防解淀粉芽孢杆菌Bs—18 TnYLB—1突变体文库的构建
击法构建了携带转座子TnYLB-1的穿梭质粒pMarA转化Bs-18的突变体文库。通过对转座温度和转座时间的筛选，筛选出50℃高温诱导16 h可获得最大转座成功率，并对突变体进行了PCR验证。Bs-18突变体文库的构建为研究其生防功能基因并深入揭示其生防作用机制奠定了基础。关键词：突变体文库；转座子；生防功能基因中图分类号：S476.1+Q785文献标识号：A文章编号：1001-4942（2018）04-0012-04Abstract Bacillus a
山东农业科学 2018年4期2018-06-21
- 四倍体海岛棉LTR反转录转座子的数量与分布
LTR）反转录转座子是真核生物基因组中普遍存在的一类可移动的DNA序列，它们以RNA为媒介，通过“复制-粘贴”的形式在基因组中不断自我扩增。LTR反转录转座子的插入和删除对基因组的进化和物种的环境适应能力都具有重要的意义［1］，此外，LTR反转录转座子、基因组重复和多倍化是导致植物基因组扩增和收缩的三个主要原因［2，3］。LTR反转录转座子根据内部编码基因（gag，pol和int）排列顺序的不同，分为Copia和Gypsy两类主要的超家族［4］。LTR末端
生物技术通报 2018年5期2018-06-07
- 睡美人转座子在草鱼CIK细胞中介导的高效基因整合
ty, SB)转座子属于Tc1/mariner转座子家族, 普遍存在于脊椎动物基因组中。但在生物体漫长进化过程中由于突变累积失去了活性。1997年Ivics等[1]在鲑科鱼类基因组中运用生物信息学方法恢复了转座子的活性。SB转座子能携带外源DNA在转座酶的催化作用下, 以“剪切和粘贴”的方式发生转座, 偏向于随机插入基因组中TA序列处[2]。2009年Mates等[3]通过高通量定点突变得到目前转座活性最高的转座酶SB100X,它能显著提高SB转座子转座效
水生生物学报 2018年2期2018-03-30
- 植物中活性MITEs转座子研究进展
311300转座子 (Transposons) 是染色体中一段可以跳跃的 DNA序列，可以从基因组的一个位置移动到另一个位置，引起基因组的改变甚至染色体结构的变异等[1]。根据转座子的转座机制不同，可将转座子分为两大类：RNA类转座子和 DNA类转座子。RNA类转座子又称反转录转座子，该类转座子先是转录成 RNA，然后再通过反转录成 DNA转座到其他位置，整个过程以“DNARNA-DNA”的形式完成转座，所以RNA类转座子是以“复制-粘贴”的方式转座。R
生物工程学报 2018年2期2018-03-23
- 9种硬骨鱼类转座组注释
225009转座子是一类具有迁移特性的可移动遗传因子，又称转座因子 (Transposable element，TE)，属于散在重复序列的一种，也是在染色体上可移位和自主复制的基本单位，其本质是具有不同结构和换位机制的移动基因序列[1]。转座子几乎存在于所有生物基因组中，依据转座机制的不同，可以分为两大类：RNA转座子 (Ⅰ类转座子，也称为逆转录转座子) 和 DNA 转座子 (Ⅱ类转座子)。RNA转座子通过 RNA聚合酶Ⅱ先转录为mRNA，然后在反转录酶
生物工程学报 2018年1期2018-02-28
- 斑马鱼转座子时空表达特性
225009)转座子是染色体上可移位和自主复制的基本单位，其本质是具有不同结构和换位机制的移动序列[1]。转座子从原位点上单独复制或断裂下来，环化后插入到另一个位点，就像从基因组的一个位置“跳跃”到另一个位置，此基因切割整合的过程称为转座[2]。转座子依据转座机制的不同，可以分为：反转录转座子(I类转座子)和DNA转座子(II类转座子)[3]。反转录转座子通过自身编码的逆转录酶使用“copy-and-paste”机制实现转座，DNA转座子则通过自身编码的转
生物信息学 2017年4期2018-01-17
- 一个可区分银鲫F系和A+系BAC序列的特征、染色体定位和SCAR标记筛选
bp, 富含转座子序列, 包含1个具备完整结构的Tc1-like转座子, 以及不具备完整结构的transposase-like、PIF/Harbinger、target-primed reversed transcription(TPRT) 和transponX-element等6个转座子。用地高辛标记F782-BAC质粒得到的DNA探针进行了银鲫F和A+系有丝分裂中期相的染色体荧光原位杂交, 结果表明不论是在F系还是A+系的有丝分裂中期相中, 3个阳性
水生生物学报 2017年6期2017-11-29
- 植物转座子与基因表达调控
0007）植物转座子与基因表达调控何虎翼 谭冠宁 唐洲萍 杨鑫 李丽淑 何新民（广西农业科学院经济作物研究所，南宁 530007）植物转座子是植物基因组中可移动的DNA重复序列，在植物基因组进化、基因表达调控、系统发育和遗传多样性评价方面具有重要作用。综述了植物转座子分类、起源和转座机制以及转座子与宿主基因组间的表观遗传互作，阐述了不同转座子对基因表达调控方式，并对今后研究前景进行了展望，旨为全面了解植物转座子的功能提供参考。转座子；转座机制；基因表达；调
生物技术通报 2017年4期2017-05-19
- 辣椒Ty3-gypsy逆转录转座子逆转录酶序列的克隆及分析
ypsy逆转录转座子逆转录酶序列的克隆及分析李宁，杨生保，杨涛，王柏柯，唐亚萍，王强，帕提古丽·艾斯木托拉，余庆辉(新疆农业科学院园艺作物研究所，乌鲁木齐 830091)【目的】从辣椒基因组中克隆Ty3-gypsy逆转录转座子逆转录酶序列，分析其家族特性及进化关系。【方法】根据Ty3-gypsy逆转录转座子逆转录酶保守区域设计简并引物，通过PCR扩增、回收、克隆、测序得到的目的基因序列。【结果】克隆从辣椒基因组14条逆转录转座子逆转录酶序列，序列大小均为3
新疆农业科学 2016年12期2017-01-09
- piggyBac转座子在畜牧兽医科学中应用研究进展
iggyBac转座子在畜牧兽医科学中应用研究进展林丽梅1周世业2白丁平*（1.福建农林大学动物科学学院福州350002；2.国家水禽品种资源基因库福建石狮362700）piggyBac（PB）转座子已被证明是一种高效的非病毒基因工程操作工具，现广泛用于基因操作和转基因动物研究中。借助PB转座子已获得转基因小鼠、鸡、猪、山羊等动物。文中重点就PB转座子在畜牧兽医科学研究中的应用进行综述。piggyBac转座子基因工程转基因动物PB转座子是一种非病毒转基因载体
福建畜牧兽医 2016年4期2016-12-17
- 花叶矢竹转录组中的转座子表达分析
矢竹转录组中的转座子表达分析安苗苗，刘 静，郦 元，周明兵（浙江农林大学 亚热带森林培育国家重点实验室培育基地，浙江 临安 311300）以花叶矢竹Pseudosasa japonica f.akebonosuji 10种不同颜色和不同发育阶段的叶片转录组数据为基础，调查了花叶矢竹中转座子的种类、数量以及选择性表达特性。结果表明：花叶矢竹转录组中转座子类型丰富、数量繁多，其中RNA转座子明显多于DNA转座子，转座子LTR/Copia类型数量最多。绿叶的5个
浙江农林大学学报 2016年6期2016-12-12
- 石刁柏Ty1—copia反转座子逆转录酶序列克隆及异质性分析
818的两个反转座子逆转录酶序列进行了PCR扩增并对其在基因组中的异质性进行了分析。结果表明，s101366和s107518两个转座子序列均属于Ty1-copia反转座子，是Ty1-copia反转座酶的部分保守区序列，其长度分别为636和653 bp。对随机获得的两个反转座子测序表明两个反转座子存在一定的异质性，其突变主要是由于发生了碱基置换，其中碱基转换分别占到80.4%和80.0%，T？圮C和G？圮A转换的比例差异不显著。通过对两个石刁柏品种 （TD8
湖北农业科学 2016年18期2016-12-08
- PiggyBac转座系统在转mCherry基因斑马鱼上的应用
iggyBac转座子供体质粒5'-PTK-3'，将红色荧光蛋白基因（mCherry）定向插入其中，构建得到了基因捕获载体质粒：PTK-mCherry。通过显微注射，将PiggyBac 转座子供体质粒与PiggyBac转座酶mRNA共注射于斑马鱼受精卵中，筛选得到了mCherry的表达在时间及空间上均不同的转基因斑马鱼，统计表明mCherry在F0代中有8.2%的表达率，PiggyBac转座子能够在斑马鱼中进行有效转座且捕获到不同基因，有效实现突变体的筛选。
生物技术通报 2016年2期2016-10-13
- 北京地区草莓灰霉病菌的转座子及其分布频率
草莓灰霉病菌的转座子及其分布频率张佳,张晓歌,张璨,张国珍*(中国农业大学植物病理学系,农业部植物病理学重点实验室, 北京100193)为了解北京地区草莓灰霉病菌的转座子类型及其分布,本研究用转座子Boty和Flipper的特异性引物对北京地区2012-2013年从12个草莓园采集和分离的60株草莓灰霉病菌进行PCR扩增。结果表明,北京地区草莓灰霉病菌群体中共存在3种转座子类型:transposa型、Boty型和Flipper型。其中,以transposa
植物保护 2016年2期2016-09-14
- 植物活性长末端重复序列反转录转座子研究进展
重复序列反转录转座子研究进展梁琳琳，周明兵浙江农林大学 亚热带森林培育国家重点实验室培育基地，浙江 临安311300梁琳琳, 周明兵. 植物活性长末端重复序列反转录转座子研究进展. 生物工程学报, 2016, 32(4): 409–429.Liang LL, Zhou MB. Plant active LTR retrotransposons: a review. Chin J Biotech, 2016, 32(4): 409–429.摘要:长末端重复序
生物工程学报 2016年4期2016-07-04
- 利用AhMITEI转座子分子标记鉴定栽培花生杂交F1代种子真伪
子；杂种鉴定；转座子；AhMITE1；分子标记中图分类号：S565.203.7 文献标识号：A 文章编号：1001-4942（2015）12-0001-05花生常规育种方法主要包括引种、系统育种、杂交育种和诱变育种等，其中杂交育种是目前最重要、最有效的育种方法。为培育适宜不同地区种植的优良花生品种，需要采用杂交转育的方法使一些种质的优异性状更加有效地得以利用。理论上讲，通过现有的人工去雄授粉杂交技术获得品种间真杂种F1的概率应该很大，但在实际操作过程中，由
山东农业科学 2015年12期2016-02-05
- 昆虫转座子在转基因技术中的应用
0044昆虫转座子在转基因技术中的应用许军1,2， 张宏波3， 韩民锦3， 谭安江1， 黄勇平1， 张泽3*1中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所，昆虫发育与进化生物学重点实验室，上海 200032；2中国科学院大学，北京 100049；3重庆大学生命科学学院，重庆 400044摘要:转座子是基因组中一段可移动的DNA重复片段。越来越多的研究表明，转座子是真核生物基因组的主要组成成分，是基因组和表型进化的主要动力之一，并且对基因表达调控网络的进
生物安全学报 2015年2期2015-12-16
- 害虫遗传防治的研究历史与现状
传定性品系； 转座子History and status of the genetic control of insect pestYing YAN1,2,3, Fang-hao WAN1,4*20世纪30~40年代，害虫遗传防治(Genetic pest management,GPM)的设想被提出，即将不育性引入野生种群从而通过遗传手段控制害虫，当时也称作不育昆虫技术(Sterile insect technique,SIT)。60年代后，SIT被不同国
生物安全学报 2015年2期2015-12-16
- 转座子：一个可移动的防御武器
陈轶翔/编译转座子：一个可移动的防御武器陈轶翔/编译转座子构成了多达90%的玉米基因组，并导致玉米粒颜色的差异。这是造成多样性免疫防御体系的根本原因●在病原体和宿主之间的进化军备竞赛中，被称为转座子的遗传因素常常发挥着细胞防御的攻击性武器之功效。研究人员现在意识到，遗传物质一旦简化为整齐的有机体包，就不仅限于个体，甚至物种——当包内的遗传物质转化为稳定的感染性病毒微粒后，可以将部分或全部基因导入宿主基因组，即使病毒本身已经离开，但残留物依然存在。在较小范围
世界科学 2015年5期2015-12-02
- 转座子中关于转座机制及相关技术的探究
464000）转座子中关于转座机制及相关技术的探究尹洋（信阳师范学院 生命科学学院，河南 信阳 464000）转座子是基因组上可自主复制和移动的DNA片段，广泛存在于生物界.转座子及相关技术在后基因组时代是研究基因组功能的重要手段和强大武器.概述转座子的基本性质、类型、调控机制及相关技术手段.转座子；调控机制；相关技术转座子即跳跃基因，它是存在于染色体DNA上可自主复制和位移的基本单位，是基因组中可移动的一段DNA序列，可以从基因组的一个位置“跳跃”到另一
赤峰学院学报·自然科学版 2015年18期2015-03-20
- 转座子在植物XY性染色体起源与演化过程中的作用
龙斗，高武军转座子在植物XY性染色体起源与演化过程中的作用李书粉，李莎，邓传良，卢龙斗，高武军河南师范大学生命科学学院，新乡 453007XY性染色体决定系统是决定植物性别的主要方式，但是对于其起源与演化机制却知之甚少。目前认为，携带控制雌蕊或雄蕊发育基因的一对常染色体由于某种未知原因的突变形成早期的neo-Y或neo-X性染色体，随着演化的进行，早期XY性染色体之间的重组逐渐受到抑制，非重组区域扩展最终形成异型的性染色体。研究发现，重复序列的累积以及D
遗传 2015年2期2015-02-12
- 转座酶的人工改造与修饰
311300转座子 (Transposable elements, TEs)是指在基因组上能从同一条染色体的一个位置转移到另一个位置或者从一条染色体转移到另一条染色体上的一段DNA序列，20世纪40年代美国遗传学家 McClintock[1]首次在玉米中发现。此后科学家们发现了多种类型的转座子，它们广泛存在于细菌、酵母和高等动植物基因组中。转座子依据转座方式的不同分为DNA转座子和反转录转座子两类。DNA转座子以“剪切-粘贴”的方式转座，其转座只是位置的
生物工程学报 2014年10期2014-10-31
- PiggyBac转座子:人类基因编码研究的新工具
研究已经证明，转座子是多种生物中极为有价值的遗传工具，这种自然的基因转移因子不但可以抑制基因的活性，而且可以在果蝇或简单生物中插入或突变基因以了解单个基因的功能［1］。在低等生物实验中，转座子十分有效，且已被大规模地用于转基因和基因诱变分析，在酵母、线虫和果蝇等低等生物类模式生物的基因功能研究中起到了重要作用。然而，在过去由于缺少可在哺乳动物中高效作用的转座系统，在哺乳动物中的转座子运用仍极其有限。1 转座子的作用机制转座指一段DNA序列从原位上单独断裂或
医学研究生学报 2014年2期2014-03-08
- 利用Tol2 转座子构建转基因草金鱼初探
100068）转座子（transposon）是基因组上的一段具有一定长度的DNA 序列，其在自身编码的转座酶或逆转录酶的作用下，以“剪切/复制-粘贴”的方式在基因组中进行移动［1］。自1951 年McClintock［2］首次在玉米中发现AC/Ds（Activator/Dissociator）转座子以来，在细菌及多种真核生物中均发现有转座子的存在［3-6］。但是长期以来，对脊椎动物中转座子的研究和应用都还是空白。直到近十几年才有青鳉Tol1 和Tol2［7
生物技术通报 2014年5期2014-01-14
- 转座子PiggyBac在哺乳动物中的应用
1）转座元件或转座子是指宿主基因组内发生基因座位置的改变的遗传元件。当对转座子进行基因工程改造，使之携带一段外源基因，当在转座过程中插入基因的内部或是邻近位置，会对被插入基因造成基因功能的突变或失活，用以研究基因的功能［1］。转座子一般由转座酶和转座酶所识别一段DNA序列 （转座识别序列）所组成，转座序列能够在转座酶的作用下完成转座反应。按转座过程是否经过RNA中间体而分为I型转座子和II型转座子。I型转座子（或称逆转座子），需要先被转录成RNA，然后在由
中国比较医学杂志 2012年1期2012-02-01
- 猪链球菌四环素耐药性与Tn916接合型转座子的关系＊
n916接合型转座子的关系＊白雪梅,赵爱兰,张少敏,王忆婷,孙 晖,叶长芸目的 研究我国分离的血清2型猪链球菌四环素耐药性与 Tn916接合型转座子的关系。方法采用微量稀释法进行药物敏感性检测,PCR方法检测四环素耐药基因及Tn916接合型转座子。结果我们检测了56株我国分离的血清2型猪链球菌及12株国外分离的血清2型猪链球菌,56株我国分离株均对四环素耐药并且携带四环素耐药基因tet(M),我国猪链球菌携带的tet(M)基因位于接合型转座子 Tn916上
中国人兽共患病学报 2010年12期2010-01-24
- 紫糯玉米遗传与育种探析
玉米色素遗传与转座子、市场需求与紫糯玉米的遗传、紫糯玉米育种方法以及花糯玉米形成的原因等内容,对市场开拓各色品种寄予瞻望,同时指出紫糯玉米的育种方法是值得研究的课题。关键词紫糯玉米;糊粉层;转座子;遗传与育种中图分类号S513文献标识码A文章编号 1007-5739(2009)21-0043-02近年糯玉米市场争夺日益激烈,市场经济的导向已进入玉米育种的领域。可喜的是,一批优质、高产的白色糯玉米杂交种领先问世,赢得消费者的赞扬,育种家也获得相当丰厚的回报。
现代农业科技 2009年21期2009-07-07