共表达
- 长链非编码RNA共表达基因在卵巢上皮性癌的生物学作用
lncRNA 共表达且差异表达的基因（1）差异表达mRNA 芯片数据的获取：①在美国国立生物技术中心（NCBI）的Gene Expression Omnibus（GEO）数据库中检索与OC 相关的mRNA 表达谱芯片数据集（检索条件：研究类型为expression profiling by array、种属为homo sapiens、病例和对照样本数目均≥10 例、时间为自建库至2022 年12 月31 日），随后下载符合纳入条件的mRNA 表达谱芯片数据
浙江临床医学 2023年4期2023-05-30
- 不同浓度氮处理毛竹水通道蛋白基因表达模式及其调控网络
P基因和TF的共表达网络，筛选关键的基因，并用转录组数据验证，以期为后续开展基因功能提供参考依据。1 材料与方法1.1 实验材料选取在人工气候室[光周期为16 h光/8 h暗、光照强度为300 μmol/(m2·s)、温度为28 ℃、湿度为60%]培养2个月左右、且生长状态一致的毛竹幼苗用于实验，将其根部清洗干净，然后放入含有不同浓度KNO3(N0=0 mmol/L，N6=6 mmol/L，N18=18 mmol/L)的改性木村B溶液中培养2周[8,11]
世界竹藤通讯 2022年6期2023-01-14
- 乳腺癌中垂体瘤转化基因1对免疫浸润的影响及其预后价值
整合构建的基因共表达数据库[16]。利用Coexpedia 分析在乳腺癌中与PTTG1 表达显著相关的基因，并选取排名前50 的基因做后续分析。1.3 富集分析使用R 语言中的clusterProfiler 包将PTTG1 共表达的前50 基因进行GO 和KEGG 通路富集分析[17]。1.4 肿瘤免疫细胞浸润相关性分析通过TIMER 数据库（https://cistrome.shinyapps.io/timer）分析PTTG1 的表达水平及其与6 种免疫
中国普通外科杂志 2022年11期2022-12-12
- 多组学联合分析神经胶质瘤中SOX4表达差异及临床意义*
.3 SOX4共表达基因筛选根据SOX4基因表达中位数分别将GBM和LGG分为高SOX4组和低SOX4组，运用R软件DESeq2(1.26.0)包[6]，以|log2(FC)|>1.5和adj.p value 1.4 SOX4共表达基因功能富集分析通过R软件ClusterProfiler(3.14.3)[7]包对SOX4共表达基因分别进行Gene ontology(GO)和通路Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(
湖北科技学院学报(医学版) 2022年5期2022-11-03
- 长链非编码RNA HAGLROS在胃癌中的生物信息学分析
AGLROS的共表达基因从TCGA数据库(https://portal.gdc.cancer.gov/)下载胃癌基因表达谱。采用R语言分析HAGLROS的共表达基因(选取的是蛋白质编码基因)，筛选标准为Pearson相关系数绝对值>0.3且P1.3 HAGLROS共表达基因的网络互作分析及关键基因的筛选应用STRING数据库(https://cn.string-db.org/)进行HAGLROS共表达基因的蛋白质互作(PPI)网络分析，再导入Cytosca
实用临床医药杂志 2022年15期2022-09-03
- PARVG基因在肾透明细胞癌患者中的表达及临床意义
rg/）是一个共表达网络分析以及可视化的在线工具，搜集了来自GEO数据库关于人和小鼠的900多个数据集，并对每个数据集进行了共表达分析，然后将共表达关系汇总成数据库信息。通过在Coexpdia数据库中检索，获得了在KIRC中PARVG基因的共表达基因网络。1.6 Funrich软件FunRich软件主要用于基因和蛋白质的功能富集和相互作用网络分析。选取Coexpedia数据库得到的“LLS分数＞2”的17个基因，在“Gene enrichment”模块下，
大理大学学报 2022年2期2022-04-02
- 孕中期羊水游离RNA中泌尿系统发育关键基因的筛选与生物学功能分析
。1.2 基因共表达网络分析 采用Olgio软件对芯片检测结果进行读取、背景校正以及归一化。在获取基因表达量后，利用SVA 软件包去除批次效应，使不同芯片检测结果具有相似的均值和标准差。在不同样品的检测结果具有可比性的基础上，利用WGCNA 软件的动态树形剪切算法建立基因共表达模块，进行基因共表达网络分析，软阈值设为12，最小类的大小设置为30。筛选得到的基因共表达模块以不同颜色名称表示。通过分析AfcfRNA 转录组中基因平均表达量和变异系数（CV%），
山东医药 2022年8期2022-03-31
- UdhA和博伊丁假丝酵母xylI基因共表达对木糖醇发酵的影响
因（xylI）共表达对木糖醇发酵的影响。[方法]将来源于博伊丁假丝酵母醛糖还原酶xylI基因克隆到pET28a（+）上，并在BL21（DE3）中表達，通过SDS-PAGE对表达产物的分子量和酶活进行测定。随即将xylI基因连接lacP启动子，构建pWYZ-2质粒并将其转化到E.coli AI07菌株。进一步将来源于E.coli W3110的UdhA基因克隆到pWYZ-2质粒实现与xylI共表达，所构建pWYZ-4质粒转化到E.coli AI07菌株，比较了
安徽农业科学 2022年1期2022-02-14
- 羊水游离RNA中神经发育关键基因分析*
录组，结合基因共表达网络分析和组织特异性基因分析，试图从AfcfRNA转录组中提取神经系统发育相关的关键基因，为AfcfRNA转录组在产前诊断中应用奠定基础。1 资料与方法1.1一般资料 以孕中期正常胎儿的羊水为研究对象，从Gene Expression Omnibus数据库中下载正常胎儿AfcfRNA的芯片检测结果。纳入标准：(1)核型分析结果正常；(2)单胎妊娠；(3)羊水采集时间为孕中期(孕13～27周)；(4)检测平台为Affymetrix Hum
国际检验医学杂志 2022年1期2022-01-19
- MYC与BCL6蛋白在弥漫性大B细胞淋巴瘤中的病理分析
CL-6 蛋白共表达被称为双重表达淋巴瘤，检出率高于基因分子学定义的双重打击淋巴瘤，且免疫组织化学染色法的操作方法简便、快速可满足临床诸多需求[4]。本研究分析在濮阳市安阳地区医院确诊为弥漫性大B 细胞淋巴瘤的患者，测定BCL-6、MYC 蛋白表达在弥漫性大B 细胞淋巴瘤患者中的表达情况，了解并表达弥漫性大B 细胞淋巴瘤患者的临床病理特征和预后，以期为临床提供有利参考依据。1 资料与方法1.1 临床资料选取2017年8月至2021年8月在本院确诊为弥漫性大
医药与保健 2021年12期2021-12-31
- TTF-1/p40共表达低分化非小细胞肺癌1例并文献复习
1和p40弥漫共表达低分化NSCLC，并进行二代测序，结合文献探讨其临床病理学特征、免疫表型、诊断及鉴别诊断等，旨在提高对该类肿瘤的认识水平。1 材料与方法1.1 临床资料患者女性，58岁，无吸烟史，2019年8月因咳嗽半年余在外院行CT检查示左上肺占位，考虑肺癌可能；两肺多发结节、纵隔淋巴结增大，考虑转移可能。颅脑MRI检查考虑右侧额叶转移。全身骨扫描考虑T2、T3椎体转移。行纤维支气管镜活检，病理检查示非小细胞肺癌(non-small cell lun
临床与实验病理学杂志 2021年10期2021-12-13
- 基于lncRNA-mRNA共表达网络筛选胃癌分期相关的lncRNA*
NA-mRNA共表达网络，探索与胃癌分期相关的lncRNA及其调控关系，为研究胃癌的进展机制及寻找胃癌治疗的潜在靶点提供依据。方法 利用TCGA数据库，收集胃癌RNA-seq数据及临床信息数据；采用表达数量性状位点(eQTL)分析与加权基因共表达网络分析(WGCNA)相结合的方法，构建lncRNA-mRNA共表达网络模块，结合临床信息筛选与胃癌分期相关的模块；采用Kruskal-Wallis秩和检验筛选模块内胃癌不同分期差异表达的lncRNA。结果 获得2
中国卫生统计 2021年5期2021-11-22
- α-1,3-岩藻糖基转移酶IV在肝癌转移中的表达及机制研究
中的表达水平和共表达基因，进行KEGG通路富集分析，探究FUT4在肝癌转移中的表达及机制，以期为肝癌转移的诊断和治疗提供新的思路和依据。材料与方法一、实验材料(一)细胞 人肝癌细胞MHCC97L、MHCC97H、HCCLM3为本实验室冻存，复苏使用；其中MHCC97L为低转移潜能人肝癌细胞，MHCC97H、HCCLM3为高转移潜能人肝癌细胞。(二)试剂 TGF-β1(美国R&D公司)，RNA提取试剂盒(广东广州美基生物科技有限公司)，逆转录试剂盒(美国Th
肝脏 2021年10期2021-11-19
- Genome-wide identification of the aquaporin gene family in wheat and their roles in salt and drought stress response
道蛋白的表达和共表达谱Under conditions of drought stress induced by mannitol (0.18mol/L) expression levels ofTaNIP4;03_3D,TaNIP3;03_6D,TaSIP2;02_4A,TaTIP2;02b_7BandTaNIP1;08_7Din leaves were similar to those under PEG-induced drought stress.
长江大学学报(自科版) 2021年5期2021-11-12
- 泪腺良性淋巴上皮病变基因网络分析及关键枢纽基因鉴定
据，构建了基因共表达网络，并鉴定其中的关键致枢纽病基因，有助于在分子水平上系统全面明确BLEL的发病机制，对BLEL的治疗也有一定的启示作用。1 资料与方法1.1 数据获取本研究选取了Gene Expression Omnibus(www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)数据库中编号为GSE76497的数据集，该数据集中包括18例BLEL和作为对照的18例眼眶海绵状血管瘤。该数据集也曾被Adzavon等[2]和Li等[3]用于研究BLEL的发病
肿瘤基础与临床 2021年4期2021-08-26
- 高世代回交玉米矮秆种质的转录组分析
与糖酵解相关。共表达分析结果表明，编码果糖-1，6-双磷酸酶的基因与多个差异表达基因存在功能关联。该研究结果揭示了玉米矮秆材料中的基因表达调控，为后续玉米株高调控节点的发掘提供了参考。关键词： 矮秆;高世代回交群体;转录组测序;共表达;玉米中图分类号： S513.035.3 文献标识码： A 文章编号： 1000-4440（2021）02-0280-09Abstract： Plant height affects plant type and is r
江苏农业学报 2021年2期2021-06-30
- 全转录组测序分析精子发生中RNA结合蛋白质的动态表达
.4 RBPs共表达调控网络分析：WGCNA(Weighted Gene Co-Expression Network Analysis)称为加权基因共表达网络分析，通过计算基因间表达关系鉴定表达模式相似的基因模块(Module，ME)，位于同一模块的基因共表达程度较高并且具有相似的调控作用。利用该方法分析RBPs在精子发生中的共表达网络，算法软阈值设置为22，其他为默认参数。2 结果2.1 RBPs在精子发生中的阶段特异性及动态表达模式目前小鼠物种RBPs
基础医学与临床 2021年6期2021-06-17
- 基于差异共表达分析的肝癌特异性基因的筛选与验证
用［6］。差异共表达分析（Differential coexpression analysis，DCA）可以作为DEA的补充，通过比较共表达网络，认为具有强烈改变的连接性的基因在疾病表型中起重要作用。随着公开转录组学研究的快速积累，结合多个转录组学研究的共表达分析，可以提供更准确和稳健的结果［7］。本文在Marjan等研究5种人类组织的差异共表达和平均表达水平的混杂效应的基础上，结合GEO数据库筛选25个肝组织数据集，根据肝癌发生、发展的3个阶段，构建了新
黑龙江大学自然科学学报 2021年1期2021-04-15
- 胆管细胞型肝癌lncRNA-mRNA 共表达网络的高通量基因芯片筛查分析
筛选分析，构建共表达网络，获取与肿瘤相关lncRNAmRNA，为胆管细胞型肝癌的诊断和治疗提供依据。1 资料与方法1.1 标本收集选取2017 年1 月—6 月新疆医科大学附属肿瘤医院（以下简称“我院”）肝胆外科手术切除的5 例胆管细胞型肝癌新鲜组织标本。标本自手术中离体后立即取样，注明标识后置入液氮中保存。5 例经病理证实均为胆管细胞型肝癌患者，女3 例，男2 例；年龄37～55 岁，中位年龄45.2 岁；肿瘤均单发，最大径介于2.2～4.7 cm，平均
中国医药导报 2021年3期2021-03-08
- ZnT8在胰腺癌发生和发展中的作用
、拷贝数变化、共表达基因，生存预后情况、以及GO功能富集分析按条目或功能分类，以及构建共表达基因蛋白质互作图，得到密切相关基因.本研究旨在为探索ZnT8在胰腺癌的疾病发生和发展机制作用方面做基础工作，探寻其作为胰腺癌预防诊断指标和治疗靶点.1 实验材料与方法本研究选取了TCGA数据库的胰腺癌泛癌图谱(Pancreatic Adenocarinoma，PanCancer Atlas)中的184个胰腺癌患者临床样本挖掘数据，通过cBioportal(https
南京晓庄学院学报 2021年6期2021-02-28
- 成釉细胞瘤患者lncRNA-mRNA共表达网络分析及作用研究
NA-mRNA共表达网络，对异常表达的lncRNA及mRNA进行生物信息学分析，寻找与成釉细胞瘤发生发展相关的靶基因，为成釉细胞瘤的分子机制研究及临床治疗提供理论基础。1 资料与方法1.1 研究对象本研究所选成釉细胞瘤患者组织芯片表达谱数据集GES38494及GES132472下载自美国国立生物信息中心(National Center for Biotechnology Information, NCBI)公共数据库基因表达数据库(Gene Express
口腔医学 2020年10期2020-11-12
- p-AXL与c-MYC和/或BCL-2共表达在弥漫大B细胞性淋巴瘤中的临床意义
CL-2 蛋白共表达的临床意义，以及p-AXL 与MYC断裂基因之间的临床病理联系。1 材料与方法1.1 选择入组病例本研究纳入2012年至2017年在中山大学附属第一医院确诊为原发性DLBCL的病例394例，根据以下标准筛选出118 例DLBCL 进行研究。入组标准：明确诊断为DLBCL；年龄＞18 岁；送检组织直径＞1 cm。剔除标准：合并其他重大疾病，如恶性肿瘤、艾滋病、移植术后；由其它类型淋巴瘤转化而来；既往有淋巴瘤病史者。本研究经中山大学附属第一
中山大学学报(医学科学版) 2020年4期2020-08-17
- 基于多数据库分析FAM72A在肝癌中的表达及意义
在肝癌组织中的共表达基因cBioPortal数据库(cBio Cancer Genomics Portal)是一个可视化、多维度分析癌症基因组数据网站。整合了miRNA表达、DNA甲基化等多种数据类型。本研究利用其分析TCGA数据库中FAM72A在肝癌组织中的共表达基因(spearman相关系数的>0.3为正相关，>0.8为高度正相关)。1.6 FAM72A共表达基因的GO富集功能分析及KEGG通路富集分析DAVID数据库(The Database for
安徽医科大学学报 2020年7期2020-08-05
- 活动性肺结核患者外周血髓样树突状细胞中BTLA与B7-H4共表达检测及临床意义
A及B7-H4共表达情况进行了检测，分析其与mDC表面成熟标志分子CD83、抗原递呈分子HLA-DR以及共刺激分子CD86表达的相关性，探究其临床意义。资料与方法1.研究对象:46例活动性肺结核患者及23例健康对照均来自广东医科大学附属厚街医院。排除标准：①妊娠;②酗酒;③年龄65岁;④HIV阳性;⑤其他传染病和慢性疾病(如糖尿病);⑥近1个月内服用激素等治疗的患者。根据抗结核药物治疗情况，本研究中将活动性肺结核患者分为抗MTB药物治疗前(prior tr
医学研究杂志 2020年6期2020-07-03
- 转录因子Bach1在小鼠胚胎发育时期的生物信息学分析
5］。加权基因共表达网络分析（weighted gene co-expression network analysis，WGCNA）是利用基因表达数据构建无标度网络的系统生物学方法。它能寻找协同基因模块，探索基因网络和感兴趣的表型之间的关系，以及网络中的中枢基因。WGCNA 分析方法目前已成为胚胎发育研究领域的一种重要生物信息学分析手段［6-8］。我们在前期研究中发现，Bach1 维持人胚胎干细胞的干细胞特性，通过募集去泛素化酶Usp7 来稳定多能性因子，
复旦学报(医学版) 2020年3期2020-06-17
- 利用WGCNA鉴定玉米株高和穗位高基因共表达模块
高和穗位高基因共表达模块马 娟 曹言勇 王利锋 李晶晶 王 浩 范艳萍 李会勇*河南省农业科学院粮食作物研究所, 河南郑州 450002株高和穗位高是玉米株型的重要影响因子, 与产量性状紧密相关。加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis, WGCNA)是探索基因网络与特定性状间关联关系的重要方法, 为株高和穗位高相关基因的挖掘提供新途径。本研究利用郑58、掖478、昌7-2和黄早四及其
作物学报 2020年3期2020-02-20
- 共表达分子伴侣提高漆酶在毕赤酵母中的分泌
storis中共表达PDI 使重组菌IFNβ-HAS 表达量提高了90%。为提高漆酶的表达水平，作者拟通过表达蛋白质折叠（BIP、ERO1）、囊泡运输（SEC53、SEC1）、胁迫应激（HAC1、GCN4）等相关6 种分子伴侣，以期提高Cerrenasp. WR1 漆酶在重组P. pastoris中的表达水平。1 材料与方法1.1 材料1.1.1 菌株及质粒Cerrenasp. WR1 来源的漆酶（GeneID：899203）：由南京金斯瑞公司按照P. p
食品与生物技术学报 2019年11期2020-01-19
- 基于角质酶共表达策略的大肠杆菌胞外生产耐高温α-淀粉酶及其发酵条件优化
有角质酶基因的共表达载体pETDuet-cutinase：均由作者所在实验室保藏。1.2 试剂与培养基限制性内切酶NcoI 和HindIII、 碱性磷酸酶（CIAP）、琼脂糖和标准核酸相对分子质量：均购自大连宝生物工程有限公司；质粒小提试剂盒和DNA回收试剂盒：购自田根生化科技有限公司；蛋白质标准相对分子质量和蛋白质电泳试剂盒：购自上海碧云天生物科技有限公司； 异丙基-β-D-硫代半乳糖 苷 （Isopropyl β -D -1 -Thiogalactop
食品与生物技术学报 2019年11期2020-01-19
- 利用加权基因共表达网络分析构建食管腺癌预后枢纽基因网络
，通过加权基因共表达网络分析（weighted gene co-expression network analysis，WGC原NA）研究肿瘤的RNA-seq数据，筛选与预后相关的模块及枢纽基因，并根据表达谱信息构建多个枢纽基因的共表达网络关系。现将结果报道如下。1 资料和方法1.1 数据来源与预处理 9例正常食管组织和78例食管腺癌组织的基因表达数据及临床预后数据均来源于免费、开源的TCGA数据库（https://cancergenome.nih.gov
浙江医学 2019年20期2019-11-16
- 细胞分裂周期蛋白6拷贝数变异与肺腺癌患者预后关系的研究△
CDC6基因的共表达基因的相关性分析采用Spearman相关性分析，以Spearman≥0.3，P＜0.01筛选CDC6基因的共表达基因。采用Kaplan-Meier法绘制生存曲线，生存率的比较采用Log-rank检验。使用在线分析软件DAVID 6.8[10]对差异基因的共表达基因进行GO功能富集分析，使用在线数据库KOBAS 3.0软件[9]对差异基因的共表达基因进行KEGG通路分析，GO/KEGG使用超几何检验。以P＜0.05为差异有统计学意义。2
癌症进展 2019年19期2019-11-08
- 苏博美利奴羊毛囊发育相关lncRNA与mRNA共表达网络的构建
NA与mRNA共表达网络的构建陈华峰1,2，田可川2，黄锡霞1，阿布来提·苏来曼1，何军敏3，田月珍2，徐新明2，付雪峰2，赵冰茹4，朱桦1，哈尼克孜·吐拉甫2（1新疆农业大学动物科学学院，乌鲁木齐 830052；2新疆畜牧科学院畜牧研究所，乌鲁木齐 830011；3甘肃农业大学动物科学技术学院，兰州 730070；4中国农业大学动物科技学院，北京 100083）【】随着高通量测序技术的发展和完善，海量的转录组测序数据随之涌现，基因网络的方法也越来越多被用
中国农业科学 2019年19期2019-10-12
- 基于TCGA数据库分析TET1在肺腺癌的表达及其相关分析
获取TET1的共表达基因后，与来源于TCGA和GEO的LUAD数据集所共有的高表达基因（P-value＜0.001，|FoldChange|＞2.02）进行venn图分析，找出确定的基因组，并将基因组集导入DAVID分析工具［7］进行GO基因集富集分析和通路分析，并使用funrich3.1.3导出效果图。1.3 统计分析 采用SPSS 20.0统计软件。生存分析使用Kaplan-Meier和Log-rank检验，P＜0.05为差异有统计学意义。其它基因表达
浙江临床医学 2019年6期2019-07-30
- 腐败梭菌α毒素和产气荚膜梭菌ε毒素的共表达及其免疫效力评价
实验构建了可以共表达腐败梭菌α毒素和产气荚膜梭菌ε毒素的双基因表达载体，探究了共表达产物的反应原性、毒性和相互作用等生物学特性，并将其制成基因工程灭活疫苗，评价了该疫苗的免疫效力，为羊快疫和肠毒血症基因工程多联疫苗的研制提供了试验基础。1 材料与方法1.1 实验材料 腐败梭菌C55－1株、D型气荚膜梭菌C60－3株、腐败梭菌毒素和D型产气荚膜梭菌毒素及其抗毒素羊血清均由中国兽医药品监察所保存，自诱导培养基由中国兽医药品监察所配制。pETDuet－1 购自
中国兽药杂志 2019年2期2019-03-12
- 白蚁及其共生菌来源的4种木质纤维素酶的共表达
木质纤维素酶的共表达杜娇，姜淑喆，未建华，申玉龙，倪金凤山东大学 微生物技术国家重点实验室，山东 青岛 266200杜娇, 姜淑喆, 未建华, 等. 白蚁及其共生菌来源的4种木质纤维素酶的共表达.生物工程学报, 2019, 35(2): 244–253.Du J, Jiang SZ, Wei JH, et al. Co-expression of lignocellulase from termite and their endosymbionts. Ch
生物工程学报 2019年2期2019-02-26
- 基于生物信息学技术探讨宫颈癌肿瘤组织中p53突变、共表达网络及临床转归分析
中p53突变、共表达网络及临床转归分析赵子骞，梁新苗，张飞跃，赵培庆255036 山东，淄博实验中学（赵子骞、梁新苗）；255036 山东，淄博市中心医院妇科（张飞跃），转化医学中心（赵培庆）利用生物信息学技术探讨 p53 在宫颈癌的突变、共表达网络及在疾病预后中的预测能力，为宫颈癌的诊断与预后判断提供一定的理论基础。利用癌症基因组图谱数据库对靶标分子 p53 进行检索，发现其突变及可能的作用分子与网络。p53 基因在宫颈癌中的突变率约为 9%，通过 ST
中国医药生物技术 2019年1期2019-02-18
- 与多形性胶质母细胞瘤患者生存期相关的权重基因共表达网络构建
究采用权重基因共表达网络（Weighted Gene Co-Expression Network，WGCNA）分析构建了多形性胶质母细胞瘤权重基因共表达网络，并与患者生存期进行相关性分析，筛选出与生存期显著相关的共表达模块，并进一步利用通路富集分析软件对模块中的基因进行通路分析，从而为多形性胶质母细胞瘤临床治疗提供参考依据。1 资料与方法1.1 一般资料本研究纳入的胶质瘤患者临床资料和胶质瘤组织RNA测序数据全部从TCGA数据库获得。TCGA数据库共收录了
中国医药科学 2019年24期2019-02-15
- S-亚胺还原酶和葡萄糖脱氢酶共表达系统的构建及手性胺的合成
单质粒双启动子共表达系统，并以大肠杆菌为表达宿主实现了辅酶NADPH的再生，以全细胞为催化剂催化手性仲胺的合成。由于很多亚胺在水溶液中不稳定，因此，本研究选取了pH中性条件下在水溶液中几乎不会水解的亚胺2-甲基吡咯啉（2MPN）为模式底物，检验双酶共表达的全细胞催化剂的反应效率。同时，本研究探究了温度、pH及有机溶剂对胞内双酶反应的影响，进一步优化了全细胞双酶反应的条件，旨为亚胺还原酶高效合成手性胺奠定基础。1 材料与方法1.1 材料1.1.1 菌种和质粒
生物技术通报 2019年1期2019-01-23
- MYC/Bcl-2蛋白共表达与弥漫性大B细胞淋巴瘤临床特征的关系及其对预后的影响
过表达则称为“共表达”，提示更差的预后。而MYC/Bcl-2的共表达与DLBCL预后的关系报道较少。本研究收集武汉大学人民医院（以下简称“我院”）DLBCL患者的临床资料，结合免疫组化结果，探讨MYC/Bcl-2的共表达与弥漫性大B细胞淋巴瘤临床特征的关系及其对预后的影响，现报道如下：1 资料与方法1.1 一般资料收集2012年1月～2014年1月我院经病理确诊的DLBCL的患者共59例。治疗前Hans分型参照2008年WHO关于造血与淋巴组织肿瘤分类标准
中国医药导报 2018年31期2018-12-20
- 弥漫大B细胞淋巴瘤中MYC和BCL-2蛋白共表达的临床病理意义
BCL-2蛋白共表达的临床病理意义胡名娟1*，李国伟1，欧阳小明2(1.广州市花都区人民医院病理科，广东 广州510800；2.广州医科大学附属第二医院病理科)目的检测弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)中MYC和BCL-2蛋白表达状况，探讨MYC/BCL-2共表达在DLBCL中的临床意义和预后评估价值。方法回顾性分析76例确诊并采用利妥昔单抗初治的非特指型DLBCL病例的Ann Arbor分期、标准国际预后指数评分(IPI)、免疫组化Hans分型和临床疗效等
中南医学科学杂志 2017年3期2017-12-25
- 膀胱癌相关lncRNA及其共表达mRNA的初步筛选与功能预测
ncRNA及其共表达mRNA的初步筛选与功能预测舒静1，黄梦鸽1，田强1，姜源1，陈俊霞2(1西南医科大学附属医院，四川泸州 646000；2重庆医科大学)目的 筛选出在膀胱癌组织中特异性表达的长链非编码RNA(lncRNA)及其共表达mRNA，并进行初步验证及功能预测。方法 采用lncRNA v4.0芯片筛选4对膀胱癌和癌旁组织中lncRNA及其共表达mRNA的差异表达谱，通过聚类分析比较二者表达差异；采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)法对5个异常
山东医药 2017年20期2017-07-01
- 两种半纤维素酶在毕赤酵母中的共表达
与筛选，获得了共表达菌株GS115/DSB-ManA。其热稳定性检测结果表明，该共表达菌株产出的DSB与ManA均有较高的热稳定性。重组菌株两种酶的成功表达为复合酶制剂的研究和生产奠定了基础。关键词：木聚糖酶（DSB）；甘露聚糖酶ManA；毕赤酵母（Pichia pastoris）；共表达中图分类号：Q19 文献标识码：A 文章编号：0439-8114（2017）10-1971-02DOI：10.14088/j.cnki.issn0439-8114.201
湖北农业科学 2017年10期2017-06-22
- 共表达磷脂酶C促进葡萄糖异构酶在大肠杆菌中的胞外表达
214122）共表达磷脂酶C促进葡萄糖异构酶在大肠杆菌中的胞外表达姜 琪， 宿玲恰， 吴 敬， 陈 晟*（食品科学与技术国家重点实验室，江南大学，江苏 无锡 214122）磷脂酶C（PLC）能够水解细胞膜主要成分磷脂，使细胞膜通透性增强，从而能够释放出胞内物质。作者构建了PLC与天然胞内定位蛋白葡萄糖异构酶（GI）共表达的重组大肠杆菌，摇瓶发酵胞外上清液中GIC酶活达到3.4 U/mL，占胞外和胞内总酶活的93%，表明GIC成功实现了胞外表达。将胞外上清液
食品与生物技术学报 2017年3期2017-05-03
- PPK和GMAS共表达重组菌株的构建及其在L-茶氨酸合成中的应用
PK和GMAS共表达重组菌株的构建及其在L-茶氨酸合成中的应用李元*，刘珊*，祝俊中国科学院天津工业生物技术研究所，天津 300308李元, 刘珊, 祝俊. PPK和GMAS共表达重组菌株的构建及其在L-茶氨酸合成中的应用. 生物工程学报, 2016, 32(12): 1745-1749.Li Y, Liu S, Zhu J. Construction of recombinant strains co-expressing PPK and GMAS fo
生物工程学报 2016年12期2016-12-28
- Ⅰ，Ⅱ期宫颈癌组织HIF-1α与COX-2蛋白共表达对预后的影响及机制*
COX-2蛋白共表达对预后的影响及机制*罗爱华，丰大利，付娟，李欣（三峡大学第二人民医院暨宜昌市第二人民医院 肿瘤放化疗科，湖北 三峡 443000）目的探讨Ⅰ，Ⅱ期宫颈癌组织中HIF-1α与COX-2蛋白的共表达对预后的影响及可能的机制。方法免疫组织化学法分析71例宫颈癌标本的HIF-1α和COX-2的共表达情况；RT-PCR法检测标本中HIF-1α mRNA和COX-2 mRNA的表达水平。χ2检验分析不同表达组患者1、2和3年存活率的差异；采用KM生
中国现代医学杂志 2016年16期2016-08-29
- 黄色短杆菌ilvN基因定点突变和ilvBN、ilvC串联表达对L-缬氨酸产量的影响
酸异构还原酶；共表达引 言L-缬氨酸(valine)是一种支链氨基酸，广泛应用于医药、食品及调味剂、动物饲料和化妆品等行业[1-3]。目前，发酵法、直接提取法和化学合成法是工业生产L-缬氨酸的3种主要方法[4]。微生物发酵为首选，常用生产菌株主要由棒杆菌和短杆菌选育而来，其中以谷氨酸棒状杆菌和黄色短杆菌为代表[5]。诱变和代谢工程育种在L-缬氨酸生产菌种选育中最为常用[6]。诱变育种操作简单，技术要求低，但工作量大、周期长、突变不定向性及副产物杂酸多，提纯
化工学报 2016年7期2016-08-06
- 家蚕生物反应器共表达猪α+γ干扰素的生产研究
家蚕生物反应器共表达猪α+γ干扰素的生产研究丁 农， 张金卫， 李江涛， 鱼南洋， 冯世民， 沈建华， 徐森华(湖州市农业科学研究院，浙江湖州 313000)近年来，随着基因工程技术的发展，家蚕生物反应器(家蚕BmNPV杆状病毒表达载体系统)生产转基因生物活性物质的良好特性被生物学家所认识，许多基因工程产品通过家蚕这一优良生物反应器得到表达，家蚕生物反应器成为免疫学和基因工程真核生物表达系统等研究领域的重大进展之一[1]。采用家蚕生物反应器技术成功地表达了
安徽农业科学 2016年1期2016-02-26
- 一对2型糖尿病老年双生子基因表达谱动态变化比较
基因为双生子的共表达基因，通过FatiGO Compare工具比较两组共表达基因功能注释的异同。结果分别筛选到大、小双的共表达基因473和529个，其中相同的共表达基因功能富集于“T细胞活化调节” 基因本体(GO)类，不同的共表达基因功能差异体现在分子功能调节及刺激反应2个GO类别。结论免疫功能基因的异常表达是该对双生子T2DM随病程延长而稳定出现的共性特征。关键词〔〕2型糖尿病；同卵双生子；共表达基因；基因表达谱中图分类号〔〕R587.1〔文献标识码〕A
中国老年学杂志 2015年5期2015-12-31
- 共表达蛋白质折叠辅助因子对毕赤酵母分泌表达IFNβ-HSA融合蛋白质的影响
。有文献报道，共表达分子伴侣BiP能够促进毕赤酵母分泌外源蛋白质[7]；但也有研究表明，BiP的过量共表达会对外源蛋白质表达造成负面影响[8]。分析其原因可能是过表达BiP将导致其辅助分子伴侣Lhs1p或内质网腔内ATP等含量不足，过多的BiP不再能发挥分子伴侣活性，从而使蛋白质进入ERAD途径而被降解[9-10]。二硫键异构酶（PDI）能够加速对蛋白质的进一步折叠，主要负责二硫键的形成和异构化，能够防止新生多肽多聚体产生，而且能使错误折叠的蛋白质重新正确
食品与生物技术学报 2014年12期2014-12-25
- 携带pGRIM-19-si-survivin共表达质粒的减毒沙门菌对前列腺癌移植瘤的体内抑制作用*
rvivin 共表达质粒的基础上，以减毒沙门菌作为运载体，观察其对裸鼠前列腺癌皮下移植瘤的抑瘤效应，并探讨相关机制。材 料 和 方 法1 动物雄性裸鼠，30只，4～6周龄，质量18～20 g，购于中国医学科学院实验动物研究所。2 主要材料psi-survivin质粒、psi-scramble质粒、pGRIM-19质粒、pGRIM-19-si-survivin重组质粒和DU145细胞株由吉林大学前列腺疾病防治研究中心馈赠；减毒人伤寒沙门氏菌Ty21a由美国马
中国病理生理杂志 2014年6期2014-08-08
- Delta-catenin和Rac1蛋白在肺癌组织中共表达的临床意义
白在肺癌组织中共表达的临床意义张俊毅1，董彩凤2（1.赤峰学院医学院病理教研室；2.赤峰学院附属医院呼吸内科，内蒙古 赤峰 024000）张俊毅，男，汉族，1977年3月出生于内蒙古乌兰察布市商都县。2000年毕业于内蒙古医科大学临床医学专业，2003-2006年于河北医科大学攻读病理学硕士学位，2007-2010年于中国医科大学攻读病理学博士学位，2012年9月进入汕头大学医学院基础医学博士后流动站从事博士后科研工作。现任赤峰学院医学院副教授，呼吸内科副
赤峰学院学报·自然科学版 2014年14期2014-07-19
- “双打击”B细胞淋巴瘤的研究进展
Bcl-2蛋白共表达(MYC/Bcl-2 protein coexpression)”，其发生率远远高于根据分子遗传学定义的DHL，甚至可以发生在非生发中心来源的DLBCL中，这与传统意义上的DHL存在本质的区别。对于MYC/Bcl-2蛋白共表达的DLBCL，目前的共识是其预后显著差于无共表达的DLBCL。在迄今为止样本量最大的1项研究中，Hu等［15］分析了466例接受R-CHOP方案治疗的DLBCL，发现MYC/Bcl-2共表达的发生率为34%，并且具
中国癌症杂志 2014年10期2014-06-01
- 慢病毒载体系统介导hUC-MSC绿色荧光蛋白和荧光素酶共表达技术体系的建立
荧光素酶基因的共表达，且该双外源蛋白的共表达对hUC-MSC的生长增殖无显著影响。慢病毒载体系统介导hUCMSC绿荧光蛋白和荧光素酶共表达技术体系的建立不仅极大地方便了其体内转归的示踪，同时也为基因工程修饰干细胞提供了强有力的手段。材料和方法一、材料1.细胞和质粒：hUC-MSC来源于福州总医院泌尿外科实验室干细胞组，取P4代细胞。人胚肾上皮细胞系HEK293T购自美国典型培养物保藏中心（ATCC）。慢病毒表达载体pLEXMCS购自美国Open Biosy
中华细胞与干细胞杂志(电子版) 2013年3期2013-12-06