李 祝, 段绪果,2, 宿玲恰,2, 吴 敬*,2
(1. 食品科学与技术国家重点实验室, 江南大学, 江苏 无锡214122; 2. 江南大学 生物工程学院, 江苏 无锡214122)
耐高温α-淀粉酶由于其优良的热稳定性而被广泛的应用于啤酒、酒精、氨基酸及淀粉等工业领域[1]。地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis)α-淀粉酶(BLA) 在pH 6~7 之间具有较好的热稳定性, 而当pH 在6 以下时,BLA 的热稳定性将明显降低,并且催化效率也将受到抑制,不能满足酸性条件下淀粉原料深加工工艺的要求。 在前期工作中,我们通过分子改造的手段提高了BLA 在95 ℃、pH 5.5 条件下的热稳定性, 同时突变体的催化效率也得到提升,该突变体具有潜在的应用价值[2]。
大肠杆菌由于遗传背景清晰、 培养成本低廉、能进行高密度发酵等优势,已被广泛应用于重组蛋白质的表达及生产[3]。 相较于胞内表达,胞外表达重组蛋白质具有很多优势,例如:胞外表达可以提高重组蛋白质的稳定性和生物活性,并且胞外表达更加适合工业生产[4-5]。 作者所在实验室的前期工作中发现,来源于嗜热放线菌(Thermobifida fusca)角质酶具有一定的磷脂酶水解活力,可以适量水解大肠杆菌细胞膜上的磷脂成分,从而增强大肠杆菌细胞膜透性,进而提高重组蛋白质的胞外表达效率[5]。 在前期工作中,重组大肠杆菌表达BLA 的3 L 罐发酵研究表明,发酵上清液中重组BLA 的分泌比例仅为53%,大量的重组蛋白质仍然残留在细胞内。为了实现BLA 的胞外高效表达,作者尝试采用在大肠杆菌中同时表达角质酶与BLA 的方式来提高大肠杆菌细胞膜透性,从而提高BLA 胞外分泌效率。 随后对影响大肠杆菌产酶的诱导条件进行优化, 以提高BLA 的产量。
pETDuet-1 载体被设计用来在大肠杆菌中同时表达两个外源基因, 该载体含有两个多克隆位点,并且每个多克隆位点是通过T7 启动子、Lac 操纵子和一个核糖体结合位点组成。 因此本研究将采用该载体在大肠杆菌中同时表达BLA 和角质酶基因。
含有突变后Bacillus licheniformisα-淀粉酶基因的Escherichia coliBL21 (DE3)/pET20b-amy菌株: 由作者所在实验室构建并保藏;E. coliJM109、E. coliBL21(DE3)菌株及含有角质酶基因的共表达载体pETDuet-cutinase:均由作者所在实验室保藏。
限制性内切酶NcoI 和HindIII、 碱性磷酸酶(CIAP)、琼脂糖和标准核酸相对分子质量:均购自大连宝生物工程有限公司;质粒小提试剂盒和DNA回收试剂盒:购自田根生化科技有限公司;蛋白质标准相对分子质量和蛋白质电泳试剂盒:购自上海碧云天生物科技有限公司; 异丙基-β-D-硫代半乳糖 苷 (Isopropyl β -D -1 -Thiogalactopyranoside,IPTG)、 氨苄青霉素 (Ampicillin,Amp)、 卡那霉素(Kanamycin,Kan): 购自上海生物工程股份有限公司;酵母粉和蛋白胨:均购自英国Oxiod 公司;其他试剂:均为国产分析纯,购自上海国药集团化学试剂有限公司。
LB 种子培养基(g/L): 蛋白胨10, 酵母粉5,NaCl 10;摇瓶TB 发酵培养基(g/L):蛋白胨12,酵母粉24, 甘油5, 磷酸氢二钾2.34, 磷酸二氢钾16.43;3 L 罐 发 酵 培 养 基 (g/L):(NH4)2HPO44,KH2PO413.5,MgSO4·7H2O 1.38,一水合柠檬酸1.7,蛋白胨1,酵母粉2,甘油8,微量元素液10 mL/L;3 L罐补料培养基(g/L):甘油600,MgSO4·7H2O 15,蛋白胨2,酵母粉4;3 L 罐诱导培养基(g/L):乳糖60;微 量 元 素 液 (g/L):(NH4)6Mo7O240.1,CaCl22.0,MnSO4·4H2O 0.5,FeSO4·7H2O 10.0,CuSO4·5H2O 3.0,ZnSO4·7H2O 5.3,Na2B4O7·10H2O 0.2。
1.3.1 摇瓶培养将重组菌接种至含有相应抗性的种子培养基中, 在37 ℃、200 r/min 条件下培养8 h,以5%的接种体积分数接种至含有相应抗性的摇瓶发酵培养基中,37 ℃、200 r/min 下培养至菌体浓度OD600达1.0 时, 加入终浓度为0.02 mmol/L IPTG,随后将摇瓶至于25 ℃、200 r/min 条件下继续培养40 h 至发酵结束。
1.3.2 3 L 罐培养将培养好的种子培养基以10%的接种体积分数接种至3 L 发酵罐中 (Labfors 5,Infors-HT Co.,Ltd)。 在3 L 罐上的发酵周期可分为3 个阶段。在第一阶段中,控制发酵温度为37 °C,随着发酵时间的进行, 发酵液中的甘油质量浓度和pH 会逐步降低, 当发酵液中的pH 和溶解氧(DO)突然升高时,此时培养基中的甘油耗尽,发酵进入第二阶段。 在此阶段中,需将补料培养基逐步加入至3 L 罐中,以满足菌体的生长需求。 当OD600达到15 时, 一次性加入终质量浓度为10 g/L 的甘氨酸。当OD600为50 时,降低发酵温度至32 ℃,同时加入诱导培养基以诱导重组蛋白质的表达,此时发酵进入第三阶段,即诱导阶段。 在此阶段中,随着诱导剂的添加,发酵液中重组蛋白质逐渐积累。 整个发酵过程中, 通过转速和通气量控制发酵液中的DO 为30%,通过氨水的添加控制发酵液中的pH 为7.0。
1.4.1 共表达BLA 和角质酶载体和菌株的构建分别用限制性内切酶NcoI 和HindIII 同时对质粒pET20b-amy 和pETDuet-cutinase 进行双酶切,用DNA 胶回收试剂盒回收相应的基因片段,然后将淀粉酶基因amy 和含有角质酶基因的共表达载体pETDuet-cutinase 用T4 连接酶在16 ℃连接过夜。将连接产物转化E. coliJM109 并涂布至含有Kan抗性的LB 平板上, 挑取阳性克隆至含有Kan 抗性的LB 液体培养基中,抽提质粒,经NcoI 和HindIII双酶切验证正确的重组质粒送至测序公司进行基因测序。 将测序正确的质粒转化表达宿主E. coliBL21(DE3),构建能共表达BLA 和角质酶的重组菌株E. coliBL21(DE3)/ pETDuet-cutinase-amy。
1.4.2 菌体浓度的测定吸取一定量的发酵液,将发酵液用去离子水稀释至适当的倍数,使得稀释液在600 nm 下的吸光值在0.2~0.8 之间, 菌体浓度OD600则为吸光值乘以稀释倍数。
1.4.3 酶活力的测定吸取一定量的发酵液, 在12 000 r/min、4 ℃下离心5 min, 吸取离心后的上清液, 测量上清液中的重组α-淀粉酶活力即为胞外α-淀粉酶活力。 吸取一定量的发酵液, 将发酵液用20 mmol/L、 pH 6.0 的磷酸缓冲液稀释菌体浓度OD600至5.0, 将稀释后的发酵液采用超声破壁的方法破碎细胞, 随后将经过超声破壁的发酵液在12 000 r/min、4 ℃条件下离心5 min,吸取离心后的上清液, 此上清液中所含的α-淀粉酶活力即为总α-淀粉酶活力。
α-淀粉酶酶活力测定的条件为:底物为1 mL 1%的可溶性淀粉,加入0.9 mL 的磷酸缓冲液(pH 6.0、20 mmol/L) 混匀, 置于70 ℃恒温水浴锅中预热3 min,加入100 μL 稀释好的酶液,在70 ℃下反应5 min,之后向反应体系中加入3 mL DNS 溶液终止反应。将反应体系置于100 ℃下处理7 min 后,立刻将反应体系放入冰水中降温。 随后将体系定容至15 mL,在540 nm 下测定吸光值,计算酶活力。 用DNS法[6]制作标准曲线时所用的还原糖为葡萄糖。 在分析条件下,α-淀粉酶每分钟降解淀粉生成1 μmol的还原糖所需的酶量定义为一个酶活力单位。 角质酶活力的测定参照文献[5]。
1.4.4 蛋白质浓度的测定和SDS-PAGE 分析以牛血清蛋白质为标准蛋白样品制作标准曲线,采用Bradford 方法测定样品中蛋白质质量浓度[7]。聚丙烯酰胺凝胶电泳胶的制备采用碧云天蛋白电泳试剂盒进行操作,分离胶质量浓度12 g/dL,浓缩胶质量浓度5 g/dL。
将含有α-淀粉酶基因的重组质粒pET20bamy和含有角质酶基因的重组质粒pETDuetcutinase用NcoI 和HindIII 进行双酶切,胶回收相应的目的基因并将其进行连接, 连接产物转化E. coliJM109,挑取单克隆提取质粒用Nco I 和Hind III 双酶切验证,结果见图1。 琼脂糖凝胶电泳显示约为6 084 bp 和1 443 bp 的两条片段, 说明同时含有α-淀粉酶基因和角质酶基因的重组质粒构建成功,命名为pETDuet-cutinase-amy。
将构建好的重组质粒pETDuet-cutinase-amy转化E. coliBL21 (DE3) 构建共表达菌株E. coliBL21(DE3)/pETDuet-cutinase-amy。 首先在摇瓶水平上对共表达菌株和单表达菌株的发酵产酶情况进行对比,结果见图2。 从图2(a)可以看出,在相同的培养条件下,两种菌株的菌体生长趋势相似。 随着发酵的进行,两种菌株的胞外α-淀粉酶活力逐渐升高。当发酵至28 h 时,共表达菌株的胞外α-淀粉酶活力达到最高,为2.21×103U/mL。 而单表达菌株的胞外α-淀粉酶活力在40 h 达到最大, 为2.14×103U/mL。尽管两种菌株所产胞外α-淀粉酶活力相差不大, 但共表达菌株在单位时间内产酶量更大,生产强度更高,具有一定的优势。
进一步在3 L 发酵罐水平上对比两种菌株的生长和产酶情况,采用37 ℃生长、32 ℃诱导,乳糖的诱导强度为0.2 g/(L·h),结果见图3。共表达菌株和单表达菌株在3 L 罐中的生长趋势相似, 可能由于同时表达两种外源蛋白质对菌体代谢有细微影响,共表达菌株的最高菌浓比单表达菌株的稍低(图3(a))。 尽管如此,共表达菌株和单表达菌株的胞外酶活力有着较大的区别。 从图3(b)可以看出,共表达菌株的胞外α-淀粉酶活力在44 h 达到最高,为2.87×104U/mL。 而单表达菌株的最高胞外α-淀粉酶活力为1.69×104U/mL(47 h)。 共表达菌株胞外最高α-淀粉酶活力为单表达菌株的1.7 倍。 从发酵总酶活的数据可知,共表达菌株的总酶活也比单表达菌株的高(图3(c))。 因此,共表达菌株在产酶方面比单表达菌更加具有工业应用前景。 为了更大限度的提高胞外α-淀粉酶的产量,作者对影响大肠杆菌产酶的因素进行优化。
诱导温度对大肠杆菌表达外源蛋白质有着重要的影响[8-9]。 一般来说,较低的诱导温度有利于抑制包涵体的生成,从而提高具有生物活性外源蛋白质的产量[10]。 为了优化诱导温度,作者在25、32、37℃三种诱导温度条件下检测共表达菌株生长和产酶的情况。从图4 可以看出,诱导温度为37 ℃时,菌株的生长情况最好, 在此条件下菌体浓度OD600最高为116.1。然而,在此条件下的最高胞外α-淀粉酶和总α-淀粉酶活力均为三个温度条件下的最低值(1.50×104、2.86×104U/mL)。 当诱导温度为32 ℃时,此时的胞外和总α-淀粉酶活力均为最高 (2.87×104、5.47×104U/mL), 分别为在25 ℃诱导时的1.43和1.44 倍。在25 ℃条件下诱导时,较低的诱导温度可能导致外源蛋白合成速率降低,从而导致重组α-淀粉酶活力减少。 因此,选取32 ℃为共表达菌株的最适诱导温度。
图3 共表达菌株和单表达菌株在3 L 罐上的发酵趋势对比图Fig. 3 Comparison of time profiles for fermentation in 3 L fermentor between co -expression system and individual expression system
图4 不同诱导温度条件下共表达菌株的发酵过程曲线图Fig. 4 Comparison of time profiles for fermentation of co-expression system under different temperatures
充足的诱导强度是大肠杆菌表达过量重组的必要条件[10]。然而,诱导剂的添加必须兼顾菌体的生长和重组蛋白质的合成,防止生成大量的包涵体[11]。作者将对乳糖的诱导强度进行优化,乳糖添加速率分别在1.0、0.5、0.2 g/(L·h)的条件下检测共表达菌株的生长及产酶的情况,结果见图5。当乳糖的诱导强度为1.0 g/(L·h)时,此时菌体的最终浓度OD600为94.6,随着诱导强度的降低,菌体的最终浓度逐渐升高,这可能是由于高诱导强度对菌体的生长代谢有压力,从而抑制了菌体的生长。 在乳糖诱导强度为1.0 g/(L·h)时,菌体产酶受到明显的抑制,α-淀粉酶总酶活及胞外酶活均为最低。 当乳糖的诱导强度为0.5 g/(L·h)时,此时的α-淀粉酶活力有着明显的提升,在此条件下,最高α-淀粉酶总活力和胞外α-淀粉酶活力分别达到9.70×104、5.17×104U/mL,胞外酶活占总酶活的比例为53.3%。 随着诱导强度的进一步降低,共表达菌株所产α-淀粉酶活力有所下降。 因此,选取乳糖诱导强度为0.5 g/(L·h)。
图5 不同乳糖诱导强度下共表达菌株的发酵过程曲线图Fig. 5 Comparison of time profiles for fermentation of co-expression system under different lactose concentrations
由于稳定期的大肠杆菌细胞膜将变得更加的刚性[12],并不适合大肠杆菌将重组蛋白质分泌至胞外。 因此,在稳定期前过量表达角质酶,尽可能多的水解细胞膜上的磷脂,从而提高膜透性,可能对提高胞外α-淀粉酶活力有促进作用。 诱导剂IPTG 相对于乳糖能更快的进入大肠杆菌细胞内诱导重组蛋白质的表达[13]。因此,作者在诱导前期添加不同浓度的IPTG 来加强角质酶的表达,同时持续添加0.5 g/(L·h)乳糖来保证诱导强度。
图6 显示,在0.1、0.15、0.2 μmol/L IPTG 和0.5 g/(L·h)乳糖诱导时,共表达菌株的最高菌浓分别为112.5、107.1、96.4 g/L。在两种诱导剂共同的作用下,共表达菌株的胞外α-淀粉酶活力比单独诱导时有着明显的增加。 在0.1 μmol/L IPTG 和0.5 g/(L·h)乳糖的诱导条件下,发酵进行31 h 时,胞外α-淀粉酶活力最高可达3.97×104U/mL。 当IPTG 的浓度增加至0.15 μmol/L 时,胞外α-淀粉酶活力在发酵32 h 时达到6.05×104U/mL,此时目的蛋白质质量浓度为8.92 g/L。随后继续提高IPTG 的浓度并不能促进胞外α-淀粉酶活力的提升。 蛋白质电泳显示,随着发酵的进行,胞外BLA 逐渐积累,见图7。 与总酶活的数据对比可知,IPTG 和乳糖共同诱导时,胞外α-淀粉酶活力占总酶活的比例有着较大的提升。 在0.1、0.15、0.2 μmol/L IPTG 和0.5 g/(L·h) 乳糖诱导时的胞外分泌比例分别为88.6%、93.2%和88.4%,见表1。
图6 不同浓度IPTG 结合0.5 g/(L·h) 乳糖诱导条件下的共表达菌株发酵过程曲线图Fig. 6 Comparison of time profiles for fermentation of co -expression system under different IPTG concentrations and 0.5 g/(L·h) lactose
图7 共表达菌株3 L 发酵罐发酵过程中胞外上清液SDSPAGE 蛋白质电泳图Fig. 7 SDS-PAGE analysis of extracellular α-amylase and cutinase in E. coli C induced with 0.15 μmol/L IPTG and 0.5 g/(L·h) lactose
表1 共表达菌株在不同发酵条件下的发酵数据对比表Table 1 Comparison of parameters for recombinant α-amylase production in E. coli C in fermenter
为了验证IPTG 的添加有助于提高角质酶的表达, 作者在0.5 g/(L·h) 乳糖诱导和0.15 μmol/L IPTG 与0.5 g/(L·h)乳糖共同诱导时的角质酶总酶活进行测定, 结果见图8。 从图8 可以看出, 当在0.15 μmol/L IPTG 和0.5 g/(L·h)乳糖共同诱导条件下,角质酶的最高酶活力为300 U/mL(34 h)。 而在0.5 g/(L·h)乳糖诱导时,角质酶在相同发酵时间下的酶活力为53 U/mL(34 h),仅为IPTG 和乳糖共同诱导时的17.6%, 并且在此条件下的最高角质酶活力为170 U/mL。而角质酶酶活的提高可能更多的水解大肠杆菌细胞膜上磷脂, 从而增加细胞膜透性,进而提高BLA 的分泌效率。
地衣芽孢杆菌来源的耐高温α-淀粉酶在大肠杆菌、枯草芽孢杆菌、毕赤酵母等表达宿主中的重组表达均有研究,然而国内的大部分研究主要集中在重组蛋白质的性质研究和重组菌的摇瓶发酵优化[14-16]。本研究将经过分子改造的来源于地衣芽孢杆菌α-淀粉酶基因与嗜热放线菌角质酶基因在E.coliBL21(DE3) 中进行共表达, 构建了共表达菌株E. coliBL21(DE3)/pETDuet-cutinase-amy,并将共表达菌株与单独表达α-淀粉酶菌株Escherichia coliBL21(DE3)/pET20b-amy进行摇瓶和3 L 罐的初步发酵对比。 结果显示,共表达菌株在胞外表达重组α-淀粉酶具有明显的优势。 尽管同时表达两种外源蛋白质对大肠杆菌宿主的代谢产生更高的压力,但是角质酶的表达可以增加大肠杆菌细胞膜透性,从而使得重组蛋白质更加高效的分泌至胞外,减少细胞内重组蛋白质的过量积累。 这种情况下可能进而减少包涵体的形成,从而提高具有活性外源蛋白质的产量[4]。因此,大肠杆菌内BLA 与角质酶的共表达可以提高BLA 的产量。 随后,作者对影响大肠杆菌表达重组蛋白质的因素进行优化。 在优化诱导温度的研究中发现,37 ℃条件下对共表达菌株的生长有益,然而在此条件下有活性的重组α-淀粉酶却很少,这可能是由于在较高温度时, 重组蛋白质快速表达,大部分重组蛋白质来不及折叠而生成大量的包涵体[17]。 在25 ℃低温条件下,虽然低温有利于重组蛋白质的折叠,然而低温不利于重组蛋白质的快速表达[18]。 32 ℃下可以兼顾重组蛋白质的合成速率和折叠效率,从而提高有活性重组α-淀粉酶的表达量。
合适的诱导强度是过量表达重组蛋白质的必要条件[19]。在乳糖诱导强度的优化中发现,在持续添加0.5 g/(L·h)乳糖时,共表达菌株发酵产生的总α-淀粉酶活力和胞外α-淀粉酶活力均最高。尽管在此条件下的胞外α-淀粉酶活力比未优化前有着较大程度的提高,然而胞外α-淀粉酶活力仅占总活力的53.3%,细胞内仍有大量的重组α-淀粉酶未分泌至胞外。IPTG 和乳糖均可以通过乳糖启动子诱导重组蛋白质的表达[20]。IPTG 可以直接进入大肠杆菌细胞内,并直接结合到lac 阻遏蛋白,使得外源蛋白质表达[21]。 而乳糖首先需要在lac 透性酶的帮助下进入大肠杆菌细胞内,随后在β-半乳糖苷酶的作用下转变成异乳糖, 进而结合lac 阻遏蛋白以诱导外源蛋白质的表达[12]。 因此,相较于乳糖,IPTG 可以迅速诱导大肠杆菌外源蛋白质表达。 当在开始诱导阶段添加一定浓度的IPTG 并持续添加乳糖, 共表达菌株中的重组α-淀粉酶和重组角质酶都得到迅速表达。由于角质酶具有一定的磷脂酶活性,角质酶的快速表达可以更好的破坏大肠杆菌细胞膜,从而增强大肠杆菌细胞膜透性,提高胞外α-淀粉酶活力。
图8 在不同诱导条件下角质酶总活力的对比图Fig. 8 Comparison of the time profiles for total cutinase activity induced with 0.5 g/(L·h) lactose,0.15 μmol/L IPTG and 0.5 g/(L·h) lactose in E. coli C
构建了能同时表达α-淀粉酶和角质酶的重组菌E. coliBL21(DE3)/pETDuet-cutinase-amy,在与单独表达α-淀粉酶的重组菌E. coliBL21(DE3)/pET20b-amy的摇瓶和3 L 罐的初步发酵对比可知,共表达菌株在胞外表达重组α-淀粉酶有着明显的优势。 对共表达菌株的诱导条件进行优化,结果显示, 在诱导温度为32 ℃, 诱导剂为0.15 μmol/L IPTG 和0.5 g/(L·h)乳糖共同诱导时,胞外α-淀粉酶活力可达6.05×104U/mL, 胞外α-淀粉酶蛋白质质量浓度为8.92 g/L,胞外分泌比例为93.2%,实现了重组α-淀粉酶的胞外过量表达,在工业生产上具有较好的应用前景。