增强子
- 增强子调控异常与恶性肿瘤的关系研究进展
211166增强子最早于1981 年由Banerji 等［1］在猿猴空泡病毒SV40的DNA 序列5′端发现，它能使HeLa 细胞中兔血红蛋白β1 基因表达增加200 倍。之后，Gillies 等［2］在哺乳动物免疫球蛋白重链基因中也发现增强子的存在，并且该增强子的功能与序列方向、靶基因启动子的位置无关。近年来，人类基因组DNA 元件百科全书（encyclopedia of DNA elements，ENCODE）［3］和表观遗传组学蓝图计划［4］揭示了
南京医科大学学报（自然科学版） 2023年10期2023-11-27
- YY1作用机制及在动物繁殖调控中的研究进展
YY1通常占据增强子-启动子相互作用的位点,偶尔也占据绝缘子相互作用的位点。且研究发现大约 10% 的哺乳动物基因受该转录因子调控[6-8],因此YY1对基因的调控具有重要意义。本文将综述YY1的结构与功能、作用机制及其在动物繁殖调控过程中的研究进展,以期为深入挖掘该基因的功能及研究动物的繁殖调控机理提供理论参考。1 YY1蛋白结构及特点YY1是调控真核细胞生命活动的关键转录因子。YY1在某些无脊椎动物和所有脊椎动物广泛表达且高度保守[9]。在人类基因组中
畜牧兽医学报 2023年10期2023-10-29
- BRD4抑制剂JQ1通过超级增强子相关lncRNAs影响宫颈癌患者的预后研究*
对肿瘤相关超级增强子具有显著抑制作用,是JQ1发挥抗肿瘤作用的重要机制之一[8],但JQ1是否参与宫颈癌HeLa细胞超级增强子的调控尚未见报道。我们的先前研究表明,JQ1对宫颈癌HeLa细胞的增殖、侵袭能力具有抑制作用[9]。为了探讨JQl是否通过调控超级增强子相关lncRNA(Super enhancer-associated lncRNAs,SE-lncRNAs)表达谱发挥对宫颈癌HeLa细胞的抗肿瘤作用,本研究进一步通过全转录组测序,获得了JQl处理
医学理论与实践 2023年14期2023-07-27
- 超级增强子:肿瘤治疗的新靶点
730030)增强子是一类不依赖于其与靶基因的距离和方向而激活靶基因的一段DNA调控序列。增强子常与染色质形成长染色质,在生长发育过程中控制时间特异性和组织特异性基因的表达,其失调将导致多种疾病的发生[1]。人类所有细胞的基因组都是一样的,但细胞的形态和功能却不同,主要是由增强子决定的。2013年Young等[2]首次提出超级增强子(super-enhancers,SEs)模型,指出SEs为长度8～20 kb具有增强转录活性的超长顺式作用元件,该元件可以高
临床荟萃 2023年3期2023-05-15
- BMP2基因远程调控元件的功能分析
基因下游的远端增强子元件调控区域的异常重复是A2型短指(趾)症(brachydactyly type A2, BDA2)的致病原因，但是这段调控区域的确切分子功能尚不明确，甚至出现有相互矛盾的结果。本研究在生物信息学分析的基础上，通过PCR技术扩增了该调控区域的不同长度的目的片段，包括高度保守的2.1 kb核心序列和3个能够完全覆盖该2.1 kb片段的不同长度的截短体片段，进而构建基因重组载体，采用双荧光素酶报告基因检测方法对这些片段的生物学功能进行分析。
遗传 2022年12期2022-12-22
- 致癌超级增强子的形成与干预研究进展
文献报道,超级增强子(super enhancer,SE)在癌症发生、细胞分化、免疫应答等重要生物学过程中发挥着重要调控作用[1～3];肿瘤细胞的许多关键致癌基因由超级增强子驱动,超级增强子有潜力成为理想的抗癌靶点[1,4]。1 增强子与超级增强子的概念1981年,Banerji等[5]在猿猴空泡病毒SV40 DNA的5＇端上游发现了首个增强子,它能增强哺乳动物细胞中靶基因转录。随后,人们陆续发现许多增强子,它们都能通过转录因子募集共激活因子(例如中介体复
生命科学研究 2022年3期2022-09-13
- 对比mbk-2基因不同增强子对秀丽隐杆线虫胚胎发育的影响
种mbk-2的增强子(pptr-1、pptr-2、rsa-1和rsa-2)。由于RNAi可以有效的避免因某些基因功能缺失所引起的发育初期卵和幼虫的死亡，因此RNAi技术是研究胚胎发育初期相关基因的的有力手段。在本研究中，课题组借助RNAi技术深入的研究了mbk-2其及增强子在胚胎早期发育过程中的作用，以期为相关研究提供理论依据。1 材料与方法1.1秀丽隐杆线虫株系:野生型N2、mbk-2突变型线虫株系和OP50(大肠艾希杆菌)自美国秀丽线虫遗传中心(Cae
河北医学 2022年8期2022-09-06
- HS5-1增强子eRNA PEARL对原钙粘蛋白α基因簇的表达调控
远，寿佳，吴强增强子eRNA对原钙粘蛋白基因簇的表达调控徐思远，寿佳，吴强上海交通大学系统生物医学研究院比较生物医学研究中心，系统生物医学教育部重点实验室，上海 200240远端增强子对关键靶基因的表达调控通常可以决定细胞的命运和功能，激活的增强子可以双向转录产生长非编码(long noncoding)增强子RNA (enhancer RNA, eRNA)调控靶基因表达，课题组前期研究发现增强子eRNA能够通过形成R环(R-loop)来促进增强子与靶基因的
遗传 2022年8期2022-08-25
- 超级增强子在前列腺癌中的研究进展
点，势在必行。增强子是一类非编码DNA调控序列，结合了RNA聚合酶Ⅱ、转录因子(transcription factors,TFs)、辅助激活因子、调节因子(MED1、OGT等)等，增加启动子活性并促进靶基因转录发挥正向调控作用[2]。增强子对基因的调控可以发生在同一基因的不同位置，或是不同染色质上的基因。甚至在某些情况下，单个增强子能对多个基因进行调控。超级增强子(super-enhancer, SE)是高密度结合了关键调控因子和中介子(Mediator
中国肿瘤外科杂志 2022年3期2022-08-11
- 胶质母细胞瘤中差异甲基化增强子区域调控的蛋白编码基因识别研究
]，也有少量对增强子甲基化方面的研究[10]。异常甲基化增强子会导致多种疾病，其中包括多种癌症的基因表达异常[11]。研究[12]显示，与启动子相比，增强子区域的甲基化状态与靶基因表达的相关性更强。然而，只有少量研究[13-14]关注增强子区域且增强子甲基化模式在GBM中仍不清楚。1 资料与方法1.1 数据来源及预处理本研究从基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)数据库中下载GBM肿瘤样本(GSE36278)和正常样本
首都医科大学学报 2022年1期2022-06-29
- 增强子对基因表达的调控：从新技术到新机制
依然了解甚少.增强子调控元件是一段特定的非编码DNA序列，它们通过与转录因子(TF)结合，对细胞内基因表达进行顺式调控[1].第一个被确定的增强子是猴空泡病毒SV40基因组中一段长72 bp的序列，它可以将宫颈癌HeLa细胞中报告基因的转录提高数百倍[1].增强子通常具有特定的染色质特征，例如DNA序列保守性、染色质可及性、H3K27ac和H3K4me1等组蛋白修饰、可与启动子形成染色质三维环状结构等[2].随着“DNA元件百科全书”(ENCODE)和“表
厦门大学学报（自然科学版） 2022年3期2022-05-20
- 增强子调控癌症发生发展的机制研究
李春燕,3,4增强子调控癌症发生发展的机制研究漆思晗1,2，王棨临1,2，张俊有1,2，刘倩1,2，李春燕1,2,3,41. 北京航空航天大学，医学科学与工程学院，北京 100191 2. 北京航空航天大学，生物与医学工程学院，北京 100191 3. 北京航空航天大学，大数据精准医疗高精尖创新中心，北京 100191 4. 北京航空航天大学，工业和信息化部大数据精准医疗重点实验室，北京 100191增强子是一段具有转录调控功能的DNA序列，主要通过顺式调
遗传 2022年4期2022-04-24
- 超级增强子区域遗传变异与乙型肝炎病毒相关肝细胞癌术后总生存期的关联分析
4-5]。超级增强子（super-enhancers，SEs）是基因组中大量增强子富集的转录调控区域，能够结合转录因子，促进癌基因表达[6-7]。SEs主要负责调控决定细胞身份的基因表达，如决定癌细胞身份的致癌基因[8-9]。多项研究发现，SE区域的SNPs可通过调控致癌SEs的活性促进或抑制靶基因的表达，在肿瘤的发生发展中起重要作用[10-12]。然而，目前尚无SEs区域SNPs与HCC患者预后的研究报道。本研究探讨SEs区域SNPs与HCC患者预后之间
实用医学杂志 2022年24期2022-02-03
- 超级增强子调控基因表达的生物学作用及其在哺乳动物中的应用前景
750021)增强子(enhancer)最早发现于家兔β-珠蛋白(β-globin)的转录研究中[1]，之后在小鼠[2]等物种的基因组中得以证实。随着研究的进一步深入，人们发现增强子作为一种顺式作用的DNA调控元件，能远距离、无方向性地增加靶基因的转录输出，从而影响细胞的发育分化[3-7]。随着后基因组时代的到来，人类对于基因组和增强子的认识日益加深，在此基础上Whyte等[8]于2013年首先提出了超级增强子的概念。此后,关于超级增强子的多项研究均表明了
畜牧兽医学报 2021年12期2021-12-31
- 超级增强子驱动致癌转录机制的研究进展
和远端调控元件增强子的控制。1981年，Benoist等［4］在猿猴空泡病毒早期基因的5'端上游发现了首个增强子，由72 bp的重复序列构成，插入该序列的载体能使HeLa细胞中兔β球蛋白基因的表达量增加200多倍［5］。与启动子不同，增强子调控基因转录的模式不具有方向性，且不受距离限制［6］。增强子区域通过与启动子区域的直接相互作用形成三维环状结构［7］，激活远处的基因转录。有研究［8］发现，单个增强子甚至能调控多个基因的表达。除普通增强子（typical
上海交通大学学报（医学版） 2021年10期2021-12-05
- 哥本哈根大学：运动能改善DNA
片段叫基因，而增强子是DNA上一小段可与蛋白质结合的区域，与蛋白质结合后，基因的转录作用将加强。为验证耐力运动锻炼可以重塑骨骼肌中基因增强子的活性，研究团队招募了平均年龄23岁的健康男性参与者，让他们进行为期6周的耐力运动训练。实验期间，研究人员收集参与者训练前后大腿肌肉的活组织切片，并检查他们的DNA表观遗传特征是否在训练后发生了变化。结果显示，完成耐力训练计划后，参与者骨骼肌中有许多增强子的结构发生了改变。研究团队推测，运动对远离肌肉的器官（如大脑）的
晚晴 2021年11期2021-12-01
- 最新资讯
片段叫基因，而增强子是DNA上一小段可与蛋白质结合的区域，与蛋白质结合后，基因的转录作用将加强。为验证耐力运动锻炼可以重塑骨骼肌中基因增强子的活性，研究团队招募了平均年龄23岁的健康男性参与者，让他们进行为期6周的耐力运动训练。实验期间，研究人员收集参与者训练前后大腿肌肉的活组织切片，并检查他们的DNA表观遗传特征是否在训练后发生了变化。结果显示，完成耐力训练计划后，参与者骨骼肌中有许多增强子的结构发生了改变。研究人员通过将增强子与遗传数据库结合起来后观察
家庭医药 2021年19期2021-10-21
- eRNA AP003059.2与乳腺癌患者预后的相关性分析——基于TCGA数据库
标志物[5]。增强子是基因组中顺式调节元件的主要类型，通过与靶基因启动子相互作用从而增强靶基因的转录。近年来发现增强子也能转录lncRNA，称为增强子RNA（enhancer RNA,eRNA）。在人类细胞中已经鉴定出数以万计的eRNA。eRNA可以介导靶基因的激活，从而在基因的转录调控中发挥重要作用。在癌症发生、发展过程中，癌基因或致癌信号通路的激活通常会伴随着增强子的激活以及eRNA的产生。已有研究表明eRNA在肿瘤发生中存在重要作用，暗示它们可作为临
浙江医学 2021年15期2021-09-19
- 串联反向CTCF位点的系列删除揭示增强子调控HOXD基因簇表达的平衡
的系列删除揭示增强子调控基因簇表达的平衡王玲，李金环，黄海燕，吴强上海交通大学系统生物医学研究院比较生物医学研究中心，系统生物医学教育部重点实验室，上海 200240三维基因组染色质架构蛋白CTCF (CCCTC-binding factor)能够介导增强子与基因启动子的远距离染色质相互作用，也可以结合调控区域的绝缘子发挥增强子绝缘功能，对发育中的基因表达调控具有重要作用。同源框基因家族(Homeobox gene family,)编码一类控制动物发育的关
遗传 2021年8期2021-08-25
- 卫星导航系统功率增强子星座优化设计与性能分析
覆盖目标的功率增强子星座优化设计与性能分析方法。表1 GPS信号功率增强技术状态变化情况1 基于卫星数最少准则的功率增强子星座优化设计方法基于卫星数最少准则的功率增强子星座优化设计的目标是在满足设计指标要求的前提下，选取具有最少卫星数量和最优服务性能的功率增强卫星组合作为最优功率增强子星座[9]。其中，最优功率增强子星座包含两个层面的含义：1)在满足设计指标要求的条件下，功率增强子星座的卫星数量最少；2)在功率增强子星座卫星数最少条件下，功率增强子星座具有
国防科技大学学报 2021年4期2021-08-23
- ABO等位基因调控区突变致抗原弱表达原因分析
扩增ABO基因增强子、启动子、第1～7号外显子及其相邻的内含子区域序列。参照美国国立生物信息中心（the National Center for Biotechnology Information，NCBI）GenBank（https：//www. ncbi. nlm. nih.gov / gene /? term=ABO）中ABO基因序列设计引物，见表1。扩增体系为Taq DNA聚合酶（5 U/μL）12.5 μL、引物（10 mmol/μL）各1 μL
检验医学 2021年6期2021-06-26
- 斑马鱼和鲤miR-1-2/133a-1基因间序列活性和调控研究
330 bp的增强子片段, 受肌肉发育重要调控转录因子MEF2直接调控。而该区域约330 bp增强子结合位点包含一段保守的E-box(CANNTG), 可能是MyoD家族的结合位点。同时, 通过比较人、大鼠、狗和鸡等物种, 表明这一序列对于心脏和骨骼肌的表达是必要的, 且在脊椎动物中具有高度保守性。据此, 我们推测在斑马鱼和鲤中miR-1-2和133a-1基因间序列存在类似增强子的调控序列[12]。综上, 本研究拟在前期工作基础上, 分析斑马鱼和鲤miR-
水生生物学报 2021年3期2021-06-02
- 乳腺癌增强子-miRNA调控网络识别与分析
100071)增强子(enhancer)是真核生物基因组中的一类顺式作用元件，它通过组织特异性的方式招募转录因子(transcription factor，TF)及其辅因子来正向调控基因表达。增强子作为一种非编码序列，在组织中高度保守，增强子失活会导致包括肿瘤在内的多种疾病的发生[1]。微RNA(microRNA，mi-RNA)是一种长约22个核苷酸的非编码RNA，在大约60%的人类基因表达中起关键作用，有些miRNA可能通过调控癌基因表达而成为致癌miR
生命科学研究 2021年1期2021-03-19
- 基于特异性增强子的低级别胶质瘤分型研究
过程息息相关，增强子对IRGs的表达有重要的调控作用。增强子是DNA序列上重要的远端调控元件，其转录本称为增强子RNA(enhancr RNA，eRNA)，eRNA含量可代表增强子的功能活性。增强子在各类肿瘤/正常组织中广泛表达，而不同组织、癌症间，其表达有明显的特异性[7]。因此，研究特异性增强子调控的靶基因，有助于LGG患者精细、合理地分型；分析各型患者间的特征差异，对促进精准医疗实施、改善患者预后及相关机制研究具有重要意义。1 资料与方法1.1 数据
中国医院统计 2021年6期2021-02-17
- 乳腺癌中p53调控增强子的特征与功能分析
100071)增强子是一类具有组织特异性的顺式调控元件,通过富集多种转录因子调控基因的表达,并且不受距离和方向的限制。先前研究表明,大多数活性增强子在转录因子介导下可转录出RNA,即增强子RNA(enhancer RNA,eRNA)[1]。已有研究证实eRNA的表达量和增强子的活性相关,增强子的表达失调会导致包括乳腺癌在内的多种癌症的发生[2]。p53(tumor protein 53)作为一种肿瘤抑制转录因子参与调控绝大多数肿瘤的发生发展[3]。研究表明
生命科学研究 2020年6期2021-01-09
- 细胞凋亡反应中NOXA基因启动子发挥增强子功能调节BCL2基因表达
基因启动子发挥增强子功能调节基因表达秦中勇1,2，石晓1,2，曹平平1,2，褚鹰1,2，管蔚4，杨楠1,3，程禾1,2，孙玉洁1,21. 南京医科大学，江苏省人类功能基因组学重点实验室，南京 211166 2. 南京医科大学细胞生物学系，南京 211166 3. 南京医科大学生物化学与分子生物学系，南京 211166 4. 南京医科大学第一附属医院，南京 210029真核生物基因的转录受到近端启动子和远端增强子的共同调控，部分基因的启动子可兼具有增强子的活
遗传 2020年11期2020-12-09
- 增强子的鉴定及其在肿瘤研究中的应用
春燕,2综 述增强子的鉴定及其在肿瘤研究中的应用刘倩1，李春燕1,21. 北京航空航天大学，大数据精准医疗高精尖创新中心和医学科学与工程学院，北京 100191 2. 工业和信息化部大数据精准医疗重点实验室(北京航空航天大学)，北京 100191增强子是一类增强靶基因转录活性的DNA顺式作用元件。但是增强子与靶基因的方向和距离不确定，大大增加了研究增强子调控的靶基因及其作用机制的困难。已有大量研究显示，增强子的突变或功能异常与疾病发生发展相关；仅有少量研究
遗传 2020年9期2020-09-24
- 前列腺癌相关超级增强子RNA鉴定及调控功能分析
控元件分类，有增强子lncRNA、启动子相关ncRNA、3′-UTR相关RNA 等[5]。本文通过定制基因芯片和可获取的公共数据库，在芯片中鉴定出14213个超级增强子相关lncRNA（super enhancer-associated lncRNA，SE-lncRNA）；进一步筛选得到292个在前列腺癌中差异表达的SE-lncRNA。荧光定量PCR验证部分潜在调控SE-lncRNA及编码基因，结果与芯片完全吻合。结合生物信息学手段，通过对超级增强子及其靶
生物化工 2020年4期2020-08-27
- 生物信息学方法预测增强子及其作用位点综述
具有重要意义。增强子是对基因表达调控具有重要作用的非编码序列元件之一。一些增强子能够通过转录产生具有调控功能的RNA，也被称为增强子RNA（enhancer RNA，eRNA）。因此对于增强子的序列特征、作用位点以及在特定时间和特定组织中表达模式的研究成为了基因表达调控领域的一个重要问题。关键词： 增强子; eRNA; 基因表达调控【Abstract】 Specific function of cells is very important for mul
智能计算机与应用 2020年3期2020-07-04
- 溴结构域蛋白4在转录调节与肿瘤形成中的作用及其抑制剂的研究进展
件（如启动子、增强子等），在转录的起始和延伸阶段促进基因转录[17]。BRD4最初被发现时被认为是一种控制细胞周期的蛋白。在有丝分裂过程中，它能与染色体结合并标记在G1期准备转录的基因，保证正常的细胞周期[18]。它还在胚胎的发育期通过直接或与转录因子协同的方式调控胚胎干细胞的转录过程以及实现多能干细胞的自我更新[19]。BRD4同时还在脂肪细胞和肌肉细胞的形成中起重要作用[20]。使用BRD4抑制剂干扰BRD4的活性，还会影响成骨细胞矿化成骨[21]。总
中国普通外科杂志 2020年7期2020-01-10
- 组织特异性增强子调控SOX9 基因表达的研究进展
X9 基因相关增强子进行系统性论述， 聚焦不同增强子调控SOX9时空表达模式及机制的研究进展。1 SOX9 基因三维结构、染色体结构异常及相关疾病SOX9 基因位于人基因组17q24.3 上，其非编码序列的染色体结构异常，如微缺失、转位等已被证明与多种疾病相关。 根据对应的不同表型， 可将SOX9 上游的基因非编码区划分为不同的区间：弯肢发育异常相关区域（50～375 kb），无弯肢软骨发育异常相关区域 （789～932 kb）， 性别反转相关区域（516
口腔颌面外科杂志 2020年6期2020-01-04
- 红苹果着色分子机制获揭示
e反转座子充当增强子控制着苹果着色。这个增强子被命名为redTE。“不易着色的品种是由于缺少这一增强子，不能有效合成花青素。”张利义说。研究团队进一步推断，一系列红色芽变品种是这个转座子与其调控的基因，同周围环境综合作用引起的表观遗传结果，这无疑增进和丰富了科学家对苹果著色的理解和认识。更加重要的是，基于这一反转座子开发的分子标记，能精准地进行果色预先选择。（据《中国科学报》）
发明与创新·大科技 2019年5期2019-07-31
- 红苹果着色分子机制获揭示
e反转座子充当增强子控制着苹果着色。这个增强子被命名为redTE。“不易着色的品种是由于缺少这一增强子，不能有效合成花青素。”张利义说。研究团队进一步推断，一系列红色芽变品种是这个转座子与其调控的基因，同周围环境综合作用引起的表观遗传结果，这无疑增进和丰富了科学家对苹果着色的理解和认识。更加重要的是，基于这一反转座子开发的分子标记，能精准地进行果色预先选择。（据《中国科学报》）※
发明与创新 2019年17期2019-07-16
- 结肠癌中核内miRNA的激活调控作用研究
核内也存在通过增强子介导而激活基因表达的调控机制[2]。那么利用miRNA细胞核内调控机制，我们利用生物信息的多种分析方法对结肠癌的miRNA和基因进行补充性分析，从而为结肠癌发病的研究提供新的视角。通过整合多个数据库的miRNA、基因表达谱数据，结肠特异的增强子数据，通知利用miRNA增强子预测算法对上述数据进行系统的整合分析，并肩miRNA-增强子-靶基因调控网络，并对网络进行拓扑学分析，最后通过分析网络中差异表达基因的功能，发现了多个与结肠癌发生密切
生物信息学 2019年2期2019-07-05
- 肝癌中增强子调控miRNA前馈环路的识别与功能分析
ive）调控。增强子（Enhancer）一般是几百碱基对长度的DNA片段，并能被多个转录因子占据，在基因调控中通过顺式调控原件对靶基因起正调控作用。已有研究表明肝细胞癌中的增强子突变会导致增强子失活，进而影响靶基因的表达［4］。MicroRNA（miRNA）是一类长度为18-24 nt的非编码小RNA，在进化过程中高度保守，它通过与靶基因的3'UTR区特异性结合从而在转录后水平抑制靶基因的表达或直接降解靶mRNA，异常表达的miRNA在肝癌的发病机制中起重
生物技术通报 2019年5期2019-06-04
- 肺腺癌增强子调控miRNA前馈环路的识别与功能分析
合作用的结果。增强子是真核细胞中普遍存在的顺式调控元件，可以通过招募转录因子（transcription fac⁃tor，TF），进而结合多种激活因子，形成多蛋白复合物，使染色质成环，远端调控启动子。通过对增强子染色质的修饰和重塑等作用，促进基因的转录[4]。此外，较多证据表明，增强子与microRNA（miRNA）间同样存在复杂的调控关系。Xiao 等[5]通过删除HEK293T细胞系中的miR-24-1 增强子基因座，发现miR-24-1的表达量下降，
生物技术通讯 2019年6期2019-02-28
- 超级增强子在肿瘤研究中的进展
，米泽云超级增强子在肿瘤研究中的进展吴志强1,2，米泽云31. 天津医科大学肿瘤医院，放射治疗科，天津 300060 2. 国家肿瘤临床医学研究中心，天津市“肿瘤防治”重点实验室，天津市恶性肿瘤临床医学研究中心，天津 300060 3. 天津医科大学基础医学院，生物化学与分子生物学系，天津 300070超级增强子是由多个相邻近的普通增强子组成的、驱动调控细胞身份基因表达的一个大簇，该区域富集高密度的转录因子、辅因子及增强子相关表观修饰。超级增强子所驱动的
遗传 2019年1期2019-01-30
- 辨析分子生物学中的多个“子”
方式。1.6 增强子(Enhancer) 增强子是指位于功能基因附近，能够增强该基因转录活性的一段DNA顺序。增强子提高转录效率的特点如下： ①增强子只有启动子存在时才能发挥作用；②无方向性,无论位于启动子的上游或下游，增强子均能激活其相应的启动子；③增强子的作用与其序列的正反方向无关，将增强子方向倒置依然能起作用；④增强子一般具有组织或细胞特异性，增强子必须与特定的蛋白质结合后才能发挥增强转录的作用。1.7 沉默子(Silencer) 沉默子是指位于功能
生物学教学 2019年12期2019-01-11
- 组蛋白H3K4甲基转移酶KMT2D研究进展
胞修饰启动子和增强子的1种方法。组蛋白H3K4的三甲基化（H3K4me3）主要聚集在转录活跃的启动子区域，而一/二甲基化（H3K4me1，H3K4me2）则主要集中在增强子区域[1]。酵母菌中，Set1复合物中的催化亚基SET1，具有组蛋白H3K4的甲基转移酶活性，参与组蛋白H3K4的 me1，me2，me3 的修饰[2-3]。在果蝇中，dSet1、Trx和Trr是已知的3种Set1样组蛋白H3K4甲基转移酶。哺乳动物体内存在6种Set1样H3K4甲基转移
天津医科大学学报 2018年6期2018-12-26
- 去甲基化酶JMJD6调控雌激素受体依赖的增强子和编码基因转录激活的分子机制
过和基因组中的增强子结合并激活相应区域产生一种新型非编码RNA(增强子RNA)[2].增强子的激活对于邻近雌激素靶基因的转录激活至关重要,然而可供靶向的“分子开关”鲜有报道,制约了相关研究的开展.厦门大学药学院刘文教授课题组在早期研究中,揭示了去甲基化酶JMJD6和其相互作用的溴结构域蛋白BRD4通过与特定增强子结合,远程调控转录蛋白复合体的活性,进而调控邻近编码基因转录延伸的转录调控新模式[3];随后还发现JMJD6蛋白的另一个功能,即其直接和RNA发生
厦门大学学报（自然科学版） 2018年3期2018-06-12
- Tol2转座子介导斑马鱼rps26基因附近增强子捕获及注解分析
225009增强子是能强化转录起始的一段DNA序列，最早是由Benerji在SV40DNA中发现[1]，随后在病毒及真核生物基因组中均发现了增强子元件的存在。已有研究表明增强子在基因表达调控中通过介导转录因子与靶基因的结合，参与基因的表达调控，发挥重要作用。与启动子不同的是，增强子对基因的调控不具有方向性，且不受两者距离的影响，无论位于基因的上游或下游，甚至基因的内含子中，均可调控靶基因的表达[2-3]。因此，增强子的获得对于研究基因表达调控模式具有重要
生物工程学报 2018年3期2018-04-12
- ·Nature系列期刊导读·
g loss.增强子的冗余保证了哺乳动物发育表型的稳健性哺乳动物基因组中存在大量可远距离作用的增强子，但其功能调节的复杂性尚不清楚。本研究通过基因组编辑手段对小鼠7个影响肢体发育的增强子位点进行删除，发现单个删除并不会造成肢体形态异常，但成对删除同一基因的增强子会出现明显表型，并且冗余的增强子可通过加成作用影响基因表达水平。此外，小鼠肢体、大脑和心脏中均发现同一基因附近存在多个增强子的现象。结果表明，增强子的冗余是哺乳动物基因组的一个非常普遍的特征，其可提
生物技术进展 2018年2期2018-03-30
- 靶向ezrin增强子关键区的CRISPR/Cas9载体的构建
靶向ezrin增强子关键区的CRISPR/Cas9载体的构建郭晓龙， 张青峰， 野庆松， 莫镇涛， 李文娜， 高书颖(遵义医学院珠海校区 生物工程系， 珠海 519041)构建靶向人ezrin增强子关键区的CRISPR/Cas9载体并检测其基因敲除功能。设计2个gRNA，分别靶向人ezrin增强子关键区的上、下游。合成gRNA寡核苷酸序列，连接至质粒pX459构建重组质粒pX459-sgRNA-EL和pX459-sgRNA-ER。将鉴定正确的CRISPR/
生物学杂志 2017年6期2017-12-19
- 肝癌细胞HepG2中增强子的识别及生物信息学分析
胞HepG2中增强子的识别及生物信息学分析丁若凡1，李宇鹏1，张一鸣1，朱小冬1，胡海碧1，刘文荣1，李玲2，郭志云21.西南交通大学 生命科学与工程学院，四川 成都 610031；2.成都市第三人民医院 病理科，四川 成都 610031目的：整合增强子特征识别肝癌细胞HepG2增强子，并对其保守性、GC含量、转录因子调控、靶基因功能等进行分析，以期解析肝癌细胞增强子参与的调控网络。方法：通过整合H3K27ac、H3K4me1和H3K4me3组蛋白修饰及D
生物技术通讯 2017年4期2017-11-06
- 斜纹夜蛾核型多角体病毒Ⅱ型分离株同源重复区hr5的结构功能分析
复制起始原点和增强子的双功能作用。关键词：斜纹夜蛾；核型多角体病毒；同源重復区；增强子中图分类号：S433.4：Q78 文献标识号：A 文章编号：1001-4942（2017）08-0099-05Abstract The structure-function of homlogous region 5 （hr5） from Spodoptera litura Nucleopolyhedrovirus Ⅱ（SpltNPVⅡ）was studied in th
山东农业科学 2017年8期2017-09-09
- 骨关节炎患者软骨细胞Fas基因增强子区甲基化水平与Fas蛋白表达的相关性
细胞Fas基因增强子区甲基化水平与Fas蛋白表达的相关性陈 夏 彭 丹 陶 怀1，2沈 奕 周 政(中南大学湘雅二医院骨科，湖南 长沙 410011)目的 通过观察骨关节炎(OA)软骨细胞中Fas基因甲基化水平与Fas蛋白表达的相关性，探讨Fas基因增强子区异常甲基化在OA发生和发展中的作用。方法 采用亚硫酸氢钠方法处理基因组DNA，甲基化特异性PCR技术和免疫组织化学法分别检测14例健康人和35例OA患者软骨细胞中Fas基因增强子区甲基化水平和相关蛋白表
中国老年学杂志 2017年13期2017-07-18
- 斜纹夜蛾核型多角体病毒Ⅱ基因组DNA同源重复区生物信息学分析
；同源重复区；增强子中图分类号 S482.3+9 文献标识码 A 文章编号 1007-5739（2017）11-0111-01斜纹夜蛾核型多角体病毒Ⅱ型（Spodotera litura nucleo-polyhedrovirus，SpltNPVⅡ）分离株是一种繁殖率和毒力极强的病毒变异株，作为生物杀虫剂具有很高的研究价值和良好的应用前景[1]。同源重复区是一种存在于大多数杆状病毒基因组的重复序列区[2-3]，大量研究表明，同源重复区具有杆状病毒基因组DN
现代农业科技 2017年11期2017-07-14
- SB转座子介导的斑马鱼增强子捕获注解分析
子介导的斑马鱼增强子捕获注解分析刘帅军 沈丹 钟继汉 陈伟 王伟 张丽 陈才 杨昆仑 高波 宋成义（扬州大学动物科学与技术学院 扬州大学农业与农产品安全国际合作联合实验室，扬州 225009）为了建立斑马鱼增强子捕获突变体库及研究功能基因的表达调控模式，制备了SB转座子介导的增强子捕获转基因斑马鱼（F0），通过繁育建立了组织或器官特异表达报告基因绿色荧光蛋白（Green fluorescent protein，GFP）的品系（F1）。选择F1代的SK-3系
生物技术通报 2017年5期2017-05-19
- miRNA：除了抑制，它还有激活功能
RNA通过结合增强子起到激活基因表达的作用，命名为NamiRNA(nuclear activating miRNA)。那么miRNA的细胞定位是否会影响miRNA的功能呢？定位于细胞核内的miRNA到底与胞浆中的miRNA有何不同呢？miRNA；NamiRNA；定位；增强子；功能1 miRNA：从抗皮肤衰老开始说起每个女孩内心深处都渴望青春永驻，拥有婴儿般吹弹可破的细腻肌肤，无奈岁月的刻刀，毫不留情地在脸上留下深深浅浅的印痕，皱纹一来便是排山倒海，不可思量
自然杂志 2017年1期2017-04-11
- 复旦大学发现基因活性调控新机制，为癌症治疗提供新思路
胞的染色质中的增强子失控会过度强化附近癌基因的活性，导致细胞异常甚至癌变；而出现在该区域的蛋白质RACK7和去甲基化酶KDM5C可以限制此类增强子的活性，使基因表达保持在正常范围，从而抑制癌变。这项研究成果对以下临床现象提供了解释：很多癌症病例中存在RACK7和KDM5C突变现象，无法对增强子活性进行限制，使得本应保持低活性的基因异常活化。这一解释不仅为癌症的发生提供了新的理论，更为癌症的个性化治疗提供了新的药物靶点和治疗思路。相关研究成果发表于《细胞》杂
生物学教学 2016年9期2016-04-10
- 科学家深挖表观遗传组鉴别出引发髓母细胞瘤的关键原因
其可以结合名为增强子及超级增强子的DNA序列，这种主要的调节转录因子和超级增强子可以联合作用来调节关键基因的表达，比如负责细胞身份的基因等。研究者使用的工具对28种髓母细胞瘤肿瘤中超过3 000种超级增强子进行了鉴别，同时他们还根据不同肿瘤亚型鉴别出了超级增强子的活性，这些超级增强子可以开启一些癌症基因，包括ALK、MYC、SMO和OTX2基因等，这些基因都和髓母细胞瘤直接相关。研究者发现，Lmx1A或许是4型髓母细胞瘤亚型的主要转录调节子，Lmx1A被认
中华肺部疾病杂志(电子版) 2016年1期2016-01-24
- 采用DNA片段编辑技术反转CTCF结合位点改变基因组拓扑结构和增强子与启动子功能
因组拓扑结构和增强子与启动子功能郭亚，吴强 上海交通大学系统生物医学研究院比较生物医学研究中心，系统生物医学教育部重点实验室，上海 200240郭亚(博士研究生)人类的祖先很早就观察到生物性状的遗传现象，但是直到19世纪60年代孟德尔发现遗传因子的分离定律和自由组合定律，遗传学才真正建立并快速发展起来。尽管人类很快有了基因的概念，并认识了核酸和蛋白质，但直到1953年沃森和克里克阐明了DNA的双螺旋结构之后，人类对基因才有了本质的认识，从而开启了分子遗传学
遗传 2015年10期2015-01-03
- 启动子结构和功能研究进展
与CAAT框和增强子序列两个特定的位点相结合，从而控制转录起始的频率。研究发现，CAAT框距转录起始点Inr较远时，仍然能发挥调节转录起始频率的功效，且正反两种取向均可发挥作用，CAAT框对碱基突变十分敏感，一旦缺失或突变将导致转录效率的急剧降低，但是突变对启动子的特异性没有影响［9］。1.4 BRE元件BRE元件（TFⅡB recognition element，BRE）最初作为调节因子TFⅡB的结合序列被发现，BRE约占TATA框的10%-30%，并定
生物技术通报 2014年8期2014-04-09
- 基因组转录调控元件分析方法研究进展
要包括启动子、增强子、绝缘子等。据估算，哺乳动物基因组中约有5%的DNA序列含有编码信息，但仅有1.5%的序列能够编码蛋白质［1］。最近的研究表明，许多疾病的发生与转录调控元件的突变相关，因此，这些非编码转录调控元件的筛选及功能探索对基因表达调控机制和生物学功能研究具有重要意义［2］。如何对基因组中的TRE进行准确预测，将是研究人员面临的一个重大挑战。与固定于基因5'端的启动子不同，一些调控元件在基因组中位置不固定，如增强子，可以通过远程相互作用与远端启动
生物技术通报 2014年10期2014-03-21
- 人乙酰肝素酶基因增强子的初步筛选与鉴定
步筛选、鉴定其增强子序列奠定基础。1 材料与方法1.1 主要试剂、细胞和仪器DL2000 DNA Marker、DL5000 DNA Marker、DL15000 DNA Marker、PFX、dNTP、PCR Buffers(Takara 公司);PCR纯化试剂盒、DNA胶回收试剂盒(北京道普公司);无内毒素质粒大提试剂盒(北京天能生物技术有限公司);T4 DNA ligase、限制性内切酶KpnⅠ、SalⅠ、大肠杆菌DH5a感受态细胞、pEGFP-N1
东南大学学报（医学版） 2013年5期2013-09-03
- 相貌不同缘于“垃圾DNA”
与这些被称为“增强子”的序列片段密不可分。研究负责人、遗传学家阿克塞尔·菲泽尔说：“人类基因组中可能有成千上万个增强子，它们都在某种程度上影响脸型的形成，但我们尚不清楚这些增强子怎样发挥作用。”为验证他们的发现，研究人员培育了缺少3个已知增强子的转基因小鼠，接着用计算机断层成像来获取这些小鼠8周大时的头颅三维图像。结果与所预料的一样，转基因小鼠的头颅比普通小鼠的头颅要长或短些，或显得更窄或更宽些。更重要的是删除这些增强子没有引起腭裂、下巴突出或其他问题，所
发明与创新 2013年34期2013-04-18
- 克隆猿猴病毒40增强子修饰人乙酰肝素酶基因核心启动子及活性分析
实验初步尝试以增强子序列［3］修饰HPSE启动子，转染肿瘤细胞并分析其活性，为提高HPSE启动子的驱动活性提供实验依据。1 材料与方法1.1 细胞株、主要试剂和仪器人肝癌细胞(HepG2)、喉癌上皮细胞(Hep-2)、人慢性髄原白血病细胞(K-562)均为合肥一力公司产品;质粒pEGFP-HPSEp由皖南医学院附属弋矶山医院中心药理实验室提供，为前期实验构建并保存于－80℃超低温冰箱;含SV40增强子的载体pGL3-Control Vector和阳性对照质
东南大学学报（医学版） 2012年1期2012-09-03
- 不同免疫球蛋白启动子控制的白喉毒素A链基因对淋巴瘤细胞的抑制作用
序列(启动子/增强子)连接，则该基因的表达只限定在该种特定细胞中，在其他细胞中将不表达。已有实验证明，在转基因老鼠中导入由组织细胞特异性启动子控制的DT-A基因只能在特定细胞中表达，而对其他细胞无毒性作用，因此，白喉毒素基因组织特异性表达的特性可以应用于恶性肿瘤的靶向治疗［3，4］。免疫球蛋白启动子/增强子可以有效而特异性地控制其下游基因在产免疫球蛋白的B淋巴细胞或骨髓瘤细胞中表达［5］。如将免疫球蛋白启动子/增强子与某些毒素基因相连，可以使该基因特异性地
中国实用医药 2012年16期2012-06-02
- eRNA通过不同类型的增强子功能性地决定重新编程的转录过程
通过不同类型的增强子功能性地决定重新编程的转录过程哺乳类基因组中含有数千个转录增强子，发挥着调节细胞特异性的基因表达功能。尚不清楚这些增强子如何作用于可选择的结合位点，又如何与信号依赖的转录因子发生反应。美国科学家发现细胞特异性的FoxA1在雄激素受体(androgen receptor，AR)介导下，通过作用于结构和功能各异的增强子，可同时发挥促进或限制某些关键性转录因子的作用。接着，FoxA1发生下调(FoxA1下调是一些进展期前列腺肿瘤出现的一种预后
中国病理生理杂志 2012年5期2012-01-26