ABO等位基因调控区突变致抗原弱表达原因分析

2021-06-26 03:19顾玉微王成云潘秋辉陈广洁
检验医学 2021年6期
关键词:微卫星外显子血型

顾玉微,王成云,顾 萍,潘秋辉,王 静,陈广洁

(1.上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心输血科,上海 200127;2.上海交通大学医学院,上海 200025)

ABO血型系统在输血医学、移植学和法医学中有着极其重要的作用,是目前最具临床意义的血型系统[1]。人类ABO血型基因位于9q34.1-34.2,含7个外显子和6个内含子,编码区长1 062 bp,基因上游5'非编码区存在1个总长度为18~20 kb的调控区[2-3]。ABO基因外显子和内含子的突变、插入或缺失,以及受不同mRNA转录剪接模式的影响,调控区出现等位基因重组、片段缺失、甲基化/去甲基化或CpG岛形成等,均可导致ABO抗原表达的弱化。本研究对1例ABO血清学鉴定困难的患儿进行基因序列测定和序列分析,查找抗原弱表达的原因。

1 材料和方法

1.1 研究对象

选取上海儿童医学中心心胸外科收治的二尖瓣返流患儿1例,女,12岁,术前检查发现血型鉴定正反定型不符。

1.2 仪器和试剂

WADiana/8XT全自动血型系统(西班牙Diagnostic Grifols S.A公司)及配套ABO-Rh血型确认卡(DG Gel Confirm卡)、中性卡(DG Gel Neutral卡)、抗球蛋白卡(DG Gel Coombs卡)。ABO反定型细胞、抗H抗体、筛选细胞均购自上海血液生物医药有限责任公司。DNA纯化试剂盒[生工生物工程(上海)股份有限公司],聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增试剂(日本Takara公司),C1000 Touch Thermal Cycle PCR仪(美国Bio-Rad公司)。

1.3 方法

1.3.1 样本采集 采集本例患儿的静脉血,乙二胺四乙酸二钾抗凝,抽提DNA,置于-20 ℃保存。

1.3.2 血清学试验 采用微柱凝胶法进行ABO血型鉴定、直接和间接抗球蛋白试验、抗体筛查试验。

1.3.3 基因分型试验 抽提患儿全血样本中的基因组DNA,采用PCR扩增ABO基因增强子、启动子、第1~7号外显子及其相邻的内含子区域序列。参照美国国立生物信息中心(the National Center for Biotechnology Information,NCBI)GenBank(https://www. ncbi. nlm. nih.gov / gene /? term=ABO)中ABO基因序列设计引物,见表1。扩增体系为Taq DNA聚合酶(5 U/μL)12.5 μL、引物(10 mmol/μL)各1 μL、待测DNA 1 μL、ddH2O 9.5 μL,总反应体系25 μL。扩增条件:95 ℃预变性5 min;95 ℃变性30 s、64 ℃退火30 s、72℃延伸45 s,35个循环;72℃ 5 min。PCR产物由上海华大基因公司进行测序。测序结果与血型基因数据库进行比对,以标准序列(A101)判断患儿的血型基因型。

表1 ABO血型基因分型扩增及测序引物序列

2 结果

2.1 血清学结果

ABO血型鉴定和抗球蛋白试验结果显示:患儿血型表型为Aweak型,其父为A型,其母为B型。见表2。

表2 血清学血型鉴定和抗球蛋白试验结果

2.2 ABO血型基因分型结果

扩增患儿及其父母ABO基因第1~7号外显子、增强子和启动子区,将测序结果与A101等位基因标准序列进行比对,对照ABO血型基因数据库进行分析,发现患儿3号外显子存在106G>T变异,4号外显子存在188G>A、189C>T变异,6号外显子存在261delG缺失和297A>G变异,其余外显子未见异常,A等位基因增强子CBF/NF-Y微卫星区存在4个43 bp串联。患儿父亲6号外显子存在261delG缺失,7号外显子存在467C>T变异,其余外显子、增强子和启动子区未见异常,通过与血型基因数据库进行比对,确定其基因型为A102/O01。患儿母亲3号外显子存在106G>T变异,4号外显子存在188G>A、189C>T变异,5号外显子存在220C>T变异,6号外显子存在261delG缺失和297A>G变异,7号外显子存在526C>G、646T>A、657C>T681G>A、703G>A、771C>T、796C>A、803G>C、829G>A、930G>A和1096G>A变异,其余外显子、增强子和启动子区未见异常,通过与血型基因数据库进行比对,确定其基因型为B101/O02。见表3、图1和图2。

表3 血型基因分型结果

图1 本例患儿第1~7号外显子基因测序结果

图2 患儿增强子区测序结果

3 讨论

人类红细胞ABO血型是目前最具临床意义的血型系统,血型血清学技术虽然相对较完善和标准化,但只能鉴定表型,在鉴定某些异常表达的个体和分析遗传学规律时受到限制,疑难标本不易准确鉴定血型。当正反定型不能产生ABO抗原与抗体的互补结果时,排除技术上可能发生的错误后,还需要考虑细胞抗原表位的变异情况,可采用基因分型技术对这些ABO疑难血型标本进行基因测序,明确血型基因型,分析抗原变异的原因。

有研究结果表明,ABO血型基因型和表型直接相关[4-6],大多数遗传变异表现为1个或多个单核苷酸突变,这些变化在基因水平上可以分布在ABO基因的整个编码区,其中E6、E7尤为多见,导致编码的氨基酸改变,从而使A抗原或B抗原的表达减弱,甚至完全不表达。然而,有一部分抗原变异的患者在ABO基因外显子区域并未找到可能的变异位点,进一步对ABO基因调控区增强子、启动子及其相邻的内含子区域序列的研究发现,调控区序列对ABO血型抗原的表达亦存在影响[7-8]。

ABO基因的转录受调控区影响,其中包括引导转录开始信息的启动子区域及位于ABO基因上游约3.8 kb的增强子区域[7]。这段增强子区域包含了1个由43 bp的重复片段组成的微卫星序列,这个片段与调控ABO的转录密切相关[8]。常见的ABO等位基因有着不同数量的43 bp重复片段,呈现多态性。A1基因只有1个43 bp的重复序列,即5'-ACCCCAGCCAATAGGGGAAGGACACAGAAACAGAAACTGCATT-3',这个重复序列的第nt41位为A;B基因和部分O01等位基因在此区域为4个43 bp长度的重复序列,各序列第nt41位均为G,即5'-ACCCCAGCCAATAGGGGAAGGACACAGAAACAGAAACTGCGTT-3';大部分的O01和O02等位基因在此区域也为4个43 bp长度的重复序列,但不同的是,其第1个重复序列的第nt41位为C,即5'-ACCCCAGCCAATAGGGGAAGGACACAGAAACAGAAACTGCCTT-3';另外3个重复序列的第nt41位均为G,即5'-ACCCCAGCCAATAGGGGAAGGACACAGAAACAGAAACTGCGTT-3'[9]。

本例患儿血清学血型鉴定结果为Aweak,外显子编码区未发现新的突变位点,而位于调控区的增强子区域存在异常变化。家系调查结果显示,患儿父亲基因型为A102/O01,母亲基因型为B101/O02,分析发现本例患儿父亲的A102和O01基因在第7号外显子处发生了交换,使患儿A等位基因和O等位基因都发生了变化,从而产生了新的序列。同时基因重组还导致了调控区增强子微卫星区域发生改变。本例患儿外显子编码区未发现各亚型的特异变异位点,也未发现新的突变位点,因此其抗原变异并不是由ABO编码区外显子变异导致的,而是由调控区增强子微卫星区域发生改变导致的。

ABO基因增强子测序结果显示,本例患儿A等位基因增强子CBF/NF-Y微卫星区为4个43 bp的重复串联序列,其第1个串联序列的第nt41位为C,另外3个串联序列的第nt41位均为G。而正常A等位基因增强子CBF/NF-Y微卫星区只有1个43 bp的串联,其第nt41位为A。有研究认为,ABO基因的转录受CCAAT结合因子CBF/NF-Y微卫星序列的影响[10-11]。不同串联拷贝数呈现不同的特点,A抗原的正常表达有赖于完整的1个43 bp串联CBF/NF-Y微卫星序列,而B抗原的正常表达有赖于完整的4个43 bp串联CBF/NF-Y微卫星序列[12]。本例患儿正是由于基因重组导致A等位基因增强子特征消失,出现类似O等位基因的特征,从而表现为A抗原弱化。THURESSON等[13]也报道过与本例患儿相似的病例,是由基因重组导致的增强子改变。另外,还有各种增强子微卫星序列不同串联拷贝数引起血型弱表达的报道[8,14]。目前,对于微卫星序列串联拷贝数与基因转录活性的研究不多,但可以肯定的是,CBF/NF-Y微卫星序列与ABO抗原表达间确实有相关性,但其真正的作用机制目前尚不明确。由此可见,本例患儿的A抗原弱表达现象很有可能是由于其增强子区CBF/NF-Y微卫星序列发生重组引起串联拷贝数异常所致。

ABO抗原弱表达是目前输血研究的热点,调控区变异引起抗原弱化的现象已逐渐被人们所认识,本研究可为今后抗原弱化机制的研究提供一定帮助。

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