王成红 ,于传亭,张奇舒,李鹏飞,王晓丹,修冰水,张贺秋
1.烟台市烟台山医院 检验科,山东 烟台 264000;2.军事医学科学院 基础医学研究所,北京 100850
肺炎支原体(Mycoplasma pneumoniae,Mp)是儿童和青少年非典型肺炎的首要病原微生物[1],由其引起的临床症状同其他病原体相似,但临床用药并不相同[2],因此,研制灵敏、特异、便捷的快速早期诊断试剂,对于Mp感染的诊断和治疗意义重大[3]。
肺炎支原体M129 株的全基因测序工作于1996年完成。M129 基因组全长816 kb,编码超过400 个功能蛋白[4]。其中P30 蛋白是锚定于Mp 细胞膜上的重要黏附蛋白,包含275 个氨基酸残基,相对分子质量约为29.7×103,其基因序列全长825 bp。研究显示P30 蛋白可以激起宿主的免疫反应[5],是除了黏附蛋白P1 外的另一个重要的黏附素和免疫原。由于Mp采用的是偏性密码子,其野生基因不适合在大肠杆菌中进行表达。为此,我们利用生物信息学方法和密码子优化技术设计并获得优化的Mp 黏附蛋白P30基因序列,实现了其在大肠杆菌中的高效表达。
Mp 患者血清样本来自烟台山医院小儿科住院病人,正常人血清样本来自烟台山医院体检中心。
TaqDNA 聚合酶为北京百泰克生物技术有限公司产品;T4DNA 连接酶为TaKaRa 公司产品;DNA限制性内切酶XhoⅠ和XbaⅠ购自Promega 公司;PCR 产物回收试剂盒由北京百泰克生物技术有限公司生产;引物由上海英骏生物技术有限公司合成;DNA序列测定由中美泰和生物技术有限公司完成。
样品与未致敏粒子(最终稀释率1∶20)的反应图像判定为(-),而与致敏粒子(最终稀释率1∶80)的反应图像判定为(+),则结果判定为阳性。将显示反应图像为(+)时的最终稀释率作为抗体滴度。
从NCBI 网站(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/guide/proteins/)下载P30 黏附蛋白的氨基酸序列和核苷酸序列,采用Biosun 生物软件比对序列,分析P30 的抗原表位情况,确定克隆表达的优势抗原表位区间。
采用Genscript 软件在线分析P30 基因的密码子表达情况;采用自编软件,根据P30 优势抗原表位的氨基酸序列,设计并优化由大肠杆菌优势密码子组成的P30 基因,分段设计并合成引物,采用退火PCR方法合成各基因片段,利用基因片段末端重复序列将各片段搭桥扩增,最终得到完整的P30优化基因。
利用分别含XhoⅠ和XbaⅠ酶切位点的上游引物P30F-XhoⅠ(GCCTCGAGGCCCTCATTGTTC)、下游引物P30R-XbaⅠ(GCTCTAGATTAACGCTTCGG T)对上述基因进行PCR 扩增,从而在基因片段两端引入酶切位点,经双酶切回收后插入同样经XhoⅠ、XbaⅠ酶切的原核表达载体pBVIL1-His,转化大肠杆菌HB101,挑选阳性克隆,振荡培养过夜后42℃诱导表达,SDS-PAGE鉴定,对高表达菌株测序。
鉴定出的阳性克隆于37℃培养过夜后转至新鲜的LB 培养基,37℃培养2~3 h,至D600nm值为0.4~0.6,42℃水浴诱导表达5 h,离心收集菌体,用TE 缓冲液冲洗菌体并悬起,超声波破碎细胞,离心收集上清,用Ni 柱分离纯化融合蛋白IL1-P30,收集洗脱峰,SDS-PAGE鉴定各步分离产物。
以纯化的IL1-P30 融合蛋白包被酶联板,用间接ELISA 法对肺炎患者和正常人血清样本进行测定,根据D450nm值计算S/c,评价重组抗原的反应活性。
运用Biosun 生物软件分析比对肺炎支原体P30黏附蛋白的氨基酸序列(GenBank:M57245.1),结果显示,除75~95 aa区段抗原性较弱外,整个P30蛋白具有较强的抗原性(图1)。
野生型P30 基因全长825 bp,由275 个密码子编码相应的氨基酸序列。采用Genscript软件对野生Mp基因进行密码子分析显示,约13%的密码子表达效率低于30%,属于稀有密码子,密码子适应指数(CAI)为0.59(图2A),属于Genscript 软件中定义的难于表达的基因。采用自编程序对P30 密码子基因优化后,稀有密码子比率仅为3%,CAI 提高到0.84,属于Genscript软件中定义的易表达基因(图2B)。
采用重叠延伸PCR 方法分4 段分别扩增基因片段,而后相邻片段末端搭桥退火延伸,最终获得全长825 bp 的目的基因,测序结果显示获得的基因序列正确。
图1 肺炎支原体P30黏附蛋白氨基酸序列抗原表位预测
图2 P30基因密码子分析
大量诱导表达测序正确的表达菌株,超声波破碎后SDS-PAGE鉴定,IL1-P30融合蛋白为包涵体表达,相对分子质量为43.5×103,与预期相符(图3)。
用纯化的IL1-P30 融合蛋白包被酶联板,用间接ELISA 法初步检测了47 例正常人和85 例肺炎支原体患者的血清。结果70 份患者血清检出阳性,42例正常人血清反应阴性,灵敏度和特异性分别为82.35%和89.36%(图4A),ROC 分析显示曲线下面积(AUC)为0.9088(图4B),证明IL1-P30 融合蛋白有较好的抗原活性和特异性。
Mp 的早期诊断对疾病的治疗具有重要意义。由于Mp采用偏性密码子,在大肠杆菌中表达较为困难,因此临床应用较广的Mp检测试剂如日本富士冷凝集法和欧蒙试剂均采用灭活的Mp 全菌体提取的膜抗原,工艺复杂,且由于含有大量非活性成分导致试剂的灵敏度低、特异性差。因此,克隆表达的Mp抗原对肺炎支原体的诊断具有重要意义。
在Mp基因组表达的数百种抗原中,研究较多的是黏附蛋白P1,由于其特殊的定位及在致病中的重要作用而成为研究热点。我们在研究中发现,P1 蛋白虽具有很好的抗原性,但仅靠P1 进行检测不能覆盖所有患者,提示除了P1 抗原外,还存在其他重要的抗原表位[6]。Varshney 等克隆表达了P30 抗原,用ELISA 法检测融合蛋白与Mp 患者血清的反应,测得其灵敏度和特异性分别为78.57%和89.47%[4],但由于其采用的基因为野生型基因,表达量较低,限制了在诊断和疫苗研制中的应用。
本研究采用密码子优化结合退火延伸PCR 技术,获得了CAI 为0.84 的优化的P30 基因,并实现了P30抗原的高效重组表达,表达后的P30抗原具有很好的灵敏度和特异性。这为P30 抗原在Mp 检测和疫苗中的应用奠定了基础。
图3 优化P30基因的表达
图4 P30抗原活性的ELISA鉴定(A)及其特异性分析(B)
[1]Montagnani F,De Paolis F,Beghetto E,et al.Use of recombinant chimeric antigens for the serodiagnosis of Mycoplasma pneumoniae infection[J].Clin Microbiol Infect Dis,2010,29(11):1377-1386.
[2]袁壮.肺炎支原体肺炎的诊治[J].中国实用儿科杂志,2008,23(8):561-572.
[3]Drasbek M,Nielsen P K,Persson K,et al.Immune response to Mycoplasma pneumoniae P1 and P116 in patients with atypical pneumonia analyzed by ELISA[J].BMC Microbiol,2004,5:4-7.
[4]Himmelreich R,Hilbert H,Plagens H,et al.Complete sequence analysis of the genome of the bacterium Mycoplasma pneumoniae[J].Nucleic Acids Res,1996,24(22):4420-4449.
[5]Varshney A K,Chaudhry R,Kabra S K,et al.Cloning,expression,and immunological characterization of the P30 protein of Mycoplasma pneumonia[J].Clin Vaccine Immunol.2008,15(2):215-220.
[6]张奇舒,修冰水,宋晓国,等.密码子优化的肺炎支原体P1 蛋白在大肠杆菌中的克隆表达[J].生物技术通讯,2012,23(3):380-382.