肿瘤坏死因子-α基因多态性与中国汉族人群乙肝病毒感染的相关性研究*

2016-09-01 02:13刘丽军
中国现代医学杂志 2016年15期
关键词:显性等位基因乙肝

刘丽军

(西藏民族大学医学院,陕西 咸阳 712082)

论著

肿瘤坏死因子-α基因多态性与中国汉族人群乙肝病毒感染的相关性研究*

刘丽军

(西藏民族大学医学院,陕西 咸阳 712082)

目的探讨中国汉族人群肿瘤坏死因子-α(TN F-α)基因单核苷酸多态性(r s1800629和r s361525)与乙型肝炎病毒(H B V)感染的相关性。方法用T a q M a n探针对纳入的1 097例样本进行TN F-α、r s1800629和r s361525位点多态性检测,血样本包括429例慢性H B V感染者(C H组)、429例乙肝感染后自发清除者(S R组)及239例健康对照者(H C组)。结果①C H组与S R组比较,r s1800629 G A基因型与G等位基因与感染后病毒的自发清除有关[基因型:O R^=0.369,P=0.000;等位基因:O R^=2.210,P=0.000;显性模型(GG v s G A+AA):O R^=0.536,P=0.000]。②C H组与S R组比较,SN P r s361525 G A基因型或A等位基因与感染后病毒的自发清除密切相关[基因型:O R^=0.288,P=0.000;等位基因:O R^=0.549,P=0.000;显性模型(GG v s G A+AA):O R^=0.634,P=0.000]。结论TN F-α基因多态性与中国汉族人群H B V病毒感染后的自发清除密切相关。

乙型肝炎;单核苷酸多态性;肿瘤坏死因子-α基因

慢性乙型肝炎病毒(hepatitis B v ir u s,HBV)感染是我国面临的一个严峻的卫生问题。尽管大部分的感染者能自发清除病毒,但仍有约5%~10%的感染者发展为慢性感染[1]。半数以上慢性HBV感染患者病情稳定,可表现为无症状携带或轻度慢性肝炎。部分患者则会进展为肝硬化或肝癌等严重的肝病[2]。影响HBV感染结局的因素主要是宿主、病毒及环境3大因素,越来越多的证据表明宿主遗传因素在慢性HBV感染中发挥重要作用[3]。

肿瘤坏死因子-α(t u mor necrosis f actor-α,TN F-α)作为一种重要的细胞因子,被证实参与HBV病毒清除的过程[4]。近年来有报道称,TN F-α启动子区单核苷酸多态性位点rs1800629与rs361525与HBV慢性感染有关[5-7],但结论不一致。因此,本研究通过病例对照方法来探讨TN F-α启动子区基因多态性(rs1800629和rs361525)与乙型肝炎病毒感染结局的相关性。

1 资料与方法

1.1研究对象

选取2011年1月-2015年6月就诊于西藏民族大学附属医院的无血缘关系的患者。其中包括正常对照组(H C组)、自发清除组(SR组)、慢性乙型肝炎(chronic hepatitis B,C HB)(C H组)、乙肝肝硬化(cirrhosis o f li v er,L C)、乙肝肝癌(hepatocell u lar carcinoma,H CC)。诊断标准参见《慢性乙型肝炎防治指南》。排除标准:①HBV血清两对半标志物不明确者;②仅有乙型肝炎表面抗体阳性(+)的HBV疫苗接种者;③艾滋病或其他非HBV肝炎病毒感染者;④严重的系统性疾病如系统性红斑狼疮、非H CC肿瘤等其他肝脏疾病;⑤如自身免疫型肝病、原发性胆汁性肝硬化等;⑥非汉族人。本研究得到西藏民族大学附属医院医学伦理委员会的批准,所有受试者签署书面的知情同意书。

1.2样本及生化指标的采集

采集每个受试者血液约3ml,置于-80℃冰箱冷冻保存备用。通过问卷调查方式收集其年龄、性别等基本情况。乙肝两对半、丙氨酸转氨酶(alanine aminotrans f erase,A L T)、天冬氨酸氨基转移酶(aspartate aminotrans f erase,A S T)、血清总胆红素(total bilir u bin,T B I L)及乙肝病毒的脱氧核糖核酸(hepatitis B v ir u s-deo x yribon u cleic acid,HBV-DN A)水平的测定由本院检验科完成。

1.3DN A的提取与基因型分析

使用W i z ard G enomic DN A纯化试剂盒(美国P rome g a公司)提取外周血基因组DN A。NanoDrop 2000(美国Thermo S cienti f ic公司)测定DN A浓度及光密度值,并稀释成30 n g/μl备用。单核甘酸多态性(sin g le n u cleotide polymorphism,S N P)rs1800629 与rs361525分型采用Ta q M an探针法(美国A pplied B iosystems公司)。Ta q M an等位基因鉴别实验由A B I 7500快速实时荧光聚合酶链反应(real-time polymerase chain reaction,R eal-time q PC R)系统完成(美国A pplied B iosystems公司)。其中每96孔设置1个阴性对照和1个阳性对照。聚合酶链式反应扩增反应体系为20μl,含30n g/μl DN A2μl,master mi x 10μl,primer-probe mi x 0.5μl及DN A ase-f ree w ater 7.5μl。PC R反应条件:95℃预变性10 min,92℃变性15 s,60℃退火1min,共39个循环。随机选取10%样本用同一方法重复验证以保证分型准确,基因分型错误率<0.1%。

1.4统计学方法

采用S P SS 22.0统计软件进行数据分析,计量资料以均数±标准差(x±s)表示,H ardy-W einber g遗传平衡由 HW E软件完成,用S t u dent't检验或M ann-W hitney U检验,3组计量资料比较用方差分析;计数资料以用百分比或率表示,用χ2检验;基因型及基因模型使用二分类L o g istic回归校正年龄与性别后进行比较。使用H aplo v ie w so f t w are(v4.2)软件进行单体型分析。考虑到多重检验的问题,P<0.0125(0.05/4)为差异有统计学意义。

2 结果

2.1基本资料及H ar d y-We i n ber g遗传平衡

2.1.1基本资料本研究共纳入1 097例患者,其中C H组429例,SR组429例,H C组239例。各组年龄比较,经方差分析,差异无统计学意义(F=0.080,P=0.923)。3组男女比较,经χ2检验,差异有统计学意义(χ2=63.210,P=0.000),C H组男性比例高于SR组与H C组。3组A L T、A S T、T B I L、HBV-DN A定量比较,经方差分析,差异有统计学意义(F=15.049,P=0.005;F=49.216,P=0.000;F=7.594,P=0.023;F= 15.004,P=0.005),C H组高于SR组及H C组。见表1。

2.1.2H a rd y-W e in b e r g遗传平衡rs1800629与rs361525均符合H ardy-W einber g遗传平衡(SR组:rs1800629位点P=0.085,rs361525位点P=0.199;H C组:rs1800629位点P=0.136,rs361525位点P= 0.451)。

2.2TN F-α rs1800629基因型与乙肝感染结局的关系

rs1800629 G是各组中最常见的等位基因。携带rs1800629 G A基因型与G等位基因有利于感染后病毒的自发清除,该保护性作用在显性遗传模型中仍存在[C H组v s SR组基因型:O R^=0.369,P=0.000;等位基因:O R^=2.210,P=0.000;显性模型(GG v s G A+ AA):O R^=0.536,P=0.000](见表2)。在疾病进展方面,未发现多态性与疾病相关(见表3)。

2.3TN F-α rs361525基因型与乙肝感染结局的关系

携带G A基因型或A等位基因有利于感染后病毒的自发清除[C H组v s SR组基因型:O R^=0.288,P= 0.000;等位基因:O R^=0.549,P=0.000;显性模型(GG v s G A+AA):O R^=0.634,P=0.000](见表2)。在疾病进展方面,未发现多态性与疾病相关(见表3)。

2.4TN F-α基因单体型与乙肝病毒感染结局的关系

表1 各组纳入研究者的人口学及临床特征比较

表2 慢性乙肝感染与TN F-α基因型的关系

表3 慢乙肝进展与TN F-α基因多态性的关系

考虑到单体型在解释多态性与疾病相关性上有更好的说服力,本研究以TN F-α两位点为基础构建单体型。但未发现两个位点之间能够构建单体型。

3 讨论

TN F-α是由单核巨噬系统细胞产生的细胞因子,具有免疫调节作用,增加I L-1、I L-8和粒-巨噬细胞集落刺激因子的分泌,提高I L-2R基因表达的水平,促进T细胞增殖,增强抗体依赖细胞介导的细胞毒作用,促进B淋巴细胞增殖、分化和产生抗体等作用。

有研究发现,TN F-α 基因启动子区域内rs1800629和rs361525等S N P与丙型肝炎病毒感染、HBV感染及其抗病毒治疗应答相关[8-10]。本研究主要探讨 TN F-α 基因启动子区 rs1800629和rs361525位点多态性与HBV感染结局的相关性。

结果显示,我国人群TN F-α基因rs1800629和rs361525位点基因型均以GG为主,等位基因频率G>A,与相关研究结果一致[6,11]。在HBV病毒感染后的自发清除方面,携带rs9275572 G等位基因表现出保护作用,且该效应在显性模型中也有体现。携带rs361525 G A基因型或A等位基因有利于感染后病毒的自发清除,且该效应在显性模型中同样得到印证。本实验结果与前人的研究一致[12-14]。rs1800629和rs361525位于TN F-α基因的启动子区,不同的等位基因,可能会影响TN F-α启动子的活性,进而影响TN F-α的表达,从而对HBV感染后的清除过程产生作用。

本研究将 rs1800629和 rs361525结合探讨TN F-α基因多态性与乙肝感染结局的关系。然而,对于这2个位点来说,本研究较之其他研究仍有相悖之处[6,11],考虑可能存在以下原因:①S N P受种族、地域等因素的影响,导致其遗传差异显著,这也是导致该研究与其他文献报道差异的原因之一。②样本量与其他混杂因素的存在,例如基因或者环境因素。本研究也存在一定的不足之处,例如纳入研究的样本量不够多,这在一定程度上降低实验的信度。今后需要更大样本量、设计更严谨的实验进一步验证。

总之,本研究表明,中国人TN F-α基因多态性与HBV病毒感染后病毒的自发清除有关,一定程度上为慢性乙型肝炎的早预防和高应答率的治疗奠定基础。

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(童颖丹 编辑)

Association between TNF-αgene polymorphism s and chronic hepatitis B virus infection*

Li-jun Liu
(Medical College of Xizang Minzu University,Xianyang,Shannxi 712082,China)

Objective To assess the relation between two single nucleotide polymorphisms(rs1800629 and rs361525)of TNF-αgene and the outcomes of HBV infection in Chinese Han population.M ethods TNF-α (rs1800629 and rs361525)was genotyped by TaqMan probe method in 1,097 subjects,including 429 patients with chronic HBV infection(CH),429 HBV spontaneous clearance subjects(SR)and 239 healthy control individuals(HC).Results rs1800629 GA genotype and G allele showed significant protective effect on HBV spontaneous clearance[CH vs SR:genotype:O R^=0.369,P=0.000;allele:O R^=2.210,P=0.000;dominant model (GG vs GA+AA):O R^=0.536,P=0.000].SNP rs361525 showed a significant association with HBV spontaneous clearance.The rs361525 GA genotype and A allele played a protective role[CH vs SR:genotype:O R^= 0.288,P=0.000;allele:O R^=0.549,P=0.000;dominant model (GG vs GA+AA):O R^=0.634,P=0.000]. Conclusions TNF-αgene polymorphisms are associated with HBV spontaneous clearance.

hepatitis B;single nucleotide polymorphism;tumor necrosis factor-αgene

R 512.6

A

10.3969/j.issn.1005-8982.2016.15.016

1005-8982(2016)15-0087-04

2016-01-06

西藏自治区科技厅重点项目(No:Z2014A09G2-3);西藏自治区科技厅项目(No:2015ZR-13-19)

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