孙涛,彭映潮,史卓,高春林,夏正坤
肾发育不良和肾发育不全(renal agenesis and hypodysplasia,RAH)是导致儿童慢性肾脏病的主要原因之一,包括肾发育不良、肾发育不全,具有高度遗传异质性。突变的 GREB1L(growth regulation by estrogen in breast cancer 1-like)基因在2017年被首次报道为RAH易感基因[1]。作为新型易感基因,GREB1L基因突变导致RAH的报道较少,其确切发病率尚不明确。大型全外显子测序研究显示,2.8%的RAH患儿合并有GREB1L基因突变[1]。GREB1L基因突变所致的患者临床表现异质性大,主要表现为先天性单侧或双侧RAH,病变甚至可累及膀胱、子宫、骨骼、耳朵[2],遗传上具有不完全外显的特点。迄今为止,该基因的遗传和表达特点仍不清楚。本文报道1例GREB1L基因突变患儿的临床特征和遗传特点,有利于加深临床医生对该基因的认识。本研究通过中国人民解放军东部战区总医院伦理委员会批准(批准文号:2021NZGKJ-023),患儿监护人均签署知情同意书。
患儿,男,5岁2个月,因“反复蛋白尿3年余”于2021-04-14就诊中国人民解放军东部战区总医院。2018年无明显诱因出现全身水肿伴尿量减少于外院就诊,查24 h尿蛋白定量4.864 g,血生化示:白蛋白14.9 g/L(参考范围:40~55 g/L),总胆固醇11.02 mmol/L(参考范围:0~5.18 mmol/L),诊断为“肾病综合征(nephrotic syndrome,NS)”,外院给予足量醋酸泼尼松诱导治疗,足量激素治疗4周,尿蛋白未转阴,加用环孢素口服液早晚各40 mg治疗,1周后尿蛋白转阴。其后激素及环孢素按规律减量,减至小剂量时易复发,每年复发1~2次。病程中定期复查发现右肾进行性萎缩,左侧肾脏大小正常,行泌尿系统CT及血管造影等检查排除了血栓、尿路梗阻、肿瘤及结核等继发因素所致的后天性肾萎缩。2021-04-14因尿蛋白再次复发,至本院儿科门诊就诊,查肾脏超声示:右肾65 mm×25 mm,左肾大小正常。入院诊断:(1)NS;(2)右肾萎缩。入院查体:身高110 cm,体质量22 kg,智力正常,心肺查体无明显异常,双下肢轻度水肿。
入院完善相关检查,肾脏超声示:右肾,上下径63 mm,左右径29 mm;左肾,上下径96 mm,左右径39 mm。肾脏发射单光子计算机断层扫描仪(ECT)检查示:(1)右肾体积偏小,右肾肾小球滤过率(GFR) 28.3 ml/min;(2)左肾GFR 93.6 ml/min;考虑右肾功能不全。全腹CT示:右肾萎缩,右肾血管未见狭窄,未见局部压迫。
因患儿出现右肾进行性萎缩,已排除继发因素所致,故高度怀疑可能存在基因突变。为进一步明确病因,经患儿家长同意后,取患儿及父母外周静脉血各2 ml,使用北京智因东方公司全基因组测序方法进行测序,结果显示患儿存在GREB1L基因c.4688A>G杂合突变,突变源自母亲,但母亲尚无临床表型。
该患儿GREB1L基因的突变在第18号常染色体19088505位置的第4 688位碱基。该处在正常情况下为腺嘌呤(A),先证者的父亲表型正常且基因型与野生型相同,而其母亲虽表型正常但基因发生改变,由A突变成鸟嘌呤(G)并遗传给后代。先证者此处的碱基由A变异成G,使得其第1 563位氨基酸由天冬酰胺(Asn)变为丝氨酸(Ser),为错义突变,该位点为A/G杂合,见表1、图1。该突变在先证者上的变异深度与总深度的比值为563/1 174,其父亲为野生型,比值为0/729;而其母亲为杂合型,比值为307/590。
表1 全基因测序显示基因变异结果Table 1 Whole genome sequencing shows the results of gene variation
图1 患儿GREB1L基因c.4688A>G杂合突变及家系验证Figure 1 Heterozygous mutation of GREB1L gene c.4688A>G of this child case and pedigree verification
致病性分析:根据美国遗传学及基因组学学会(ACMG)指南(2015年)[3],该病例基因错义变异被评级为可能致病(likely pathogenic),致病证据:PM1+PM2+PP2+PP3。中等致病证据PM1:变异位于致病热点区(突变左右10 bp范围内存在3个以上有害突变);中等致病证据PM2:在所有正常人群数据库中频率<0.000 5,为罕见变异;支持致病证据PP2:在GnomAD数据库中属于z-score≥3.09的基因突变;支持致病证据PP3:多种蛋白质危害预测软件(Polyphen2和mutationtaster等)预测出变异对基因(基因产物)有影响。本例患儿临床表现符合GREB1L基因突变相关的部分临床特征,因该基因突变不完全外显,或可解释母亲携带同样突变基因但表型正常的现象。以上均提示本例GREB1L基因变异的危害性与患儿表型存在相关性。
本研究中患儿就诊时以NS、右肾萎缩为主要表现,不明原因肾萎缩提示可能为复杂的遗传性疾病。经全基因组测序技术确诊存在GREB1L基因突变。近几年,GREB1L基因被鉴定是RAH的致病新基因。2017年BROPHY等[1]首次在2个肾发育不全的家系中发现了GREB1L基因变异,通过CRISPR/Cas9技术将变异引入斑马鱼和小鼠模型并证实GREB1L基因变异和肾发育不良相关。
继2017年以来,全球共报道了76个GREB1L基因突变位点[2,4-7],携带致病突变的个体可能存在各种系统器官的发育异常,包括肾脏、膀胱、子宫、骨骼、耳朵[2]。本报道的先证者及其母亲存在相同的GREB1L基因杂合突变位点(c.4688A>G),目前未见有关此突变位点的文献报道,可能扩展了与RAH相关基因突变谱。WANG等[4]在一个中国家系中发现GREB1L基因杂合突变,先证者为2岁女孩,临床表现为右肾萎缩,祖父患左侧肾萎缩,父亲为致病基因携带者,但无临床表现。HERLIN等[8]在一个家系中发现了一个GREB1L的共分离错义突变,该家系2名女性表亲有生殖系统发育不全合并单侧肾发育不全,1名男性亲属单侧肾发育不全,还包含1例因双侧肾发育不全而未能出生的男性胎儿。SCHRAUWEN等[6]报道了1例GREB1L基因突变合并先天性内耳畸形、听力异常,但缺乏肾脏系统异常表现。临床表现的异质性说明了GREB1L基因表达的复杂性。即便携带相同致病变异位点,患者的临床表现可能不完全相同。
GREB1L基因的遗传方式为常染色体显性遗传,具有不完全外显性。同一家系中即便多人携带同样的杂合变异,有人症状严重,有人症状轻微,有人无临床表现[9-10]。本病例先证者出现右肾萎缩,携带相同突变位点的母亲无临床表型,与国外相关报道发病特点相符合,本研究认为GREB1L杂合变异可能需要额外的遗传因素或环境因素来实现完全外显率。HERLIN等[11]认为同卵双胞胎存在不同表型也一定程度上支持环境病因学,其还指出GREB1L变异基因只有来自母亲时,才会出现表型[8]。但有报道发现如果GREB1L的突变来自父亲,也可出现肾发育不良表型,但死亡率更高[5]。据统计,约75%的病例中的变异基因源自母亲,这种母性偏差可能与基因印迹有关,还有可能是由于GREB1L变异对男性生育能力影响更大,导致父系遗传率较低[8-9]。
GREB1L基因变异导致RAH的机制尚未明确。有研究表明GREB1L基因是视黄酸受体基因的共激活因子,而视黄酸参与胚胎发育过程中的多种生物过程,GREB1L基因的表达对脊柱动物肾脏系统的细胞分化、形态发生和细胞稳态有重要影响[11]。DE TOMASI等[9]使用RNA原位杂交技术通过原位杂交,证实了GREB1L基因在小鼠胚胎期的肾源性区表达,提示GREB1L基因在小鼠和人类的胚胎期肾脏发育起着重要作用。目前多认为GREB1L基因与先天性RAH相关,现有报道均未对携带致病突变但无临床表型的患者进行随访,因此GREB1L基因对儿童成长期间肾脏发育的作用有待进一步探讨。本病例患儿2岁时超声提示双肾大小正常,随后出现右肾进行性萎缩,属于在生长发育过程中出现的单侧肾萎缩,可能是国内外首例后天性肾萎缩合并GREB1L基因突变的报道,可能拓宽了GREB1L基因变异的临床谱,提示该基因异常可能导致儿童生长发育过程中出现肾脏萎缩。基于此,本研究将对该患儿的肾脏发育情况进行长期随访。未来需要更深入的机制研究,以及相关位点的验证,以明确GREB1L基因对人类肾脏发育的作用机制。
综合文献分析,GREB1L基因突变临床表现多为先天性RAH,且存在不完全外显性。本例患儿可能为国内外首例GREB1L基因突变合并后天性单侧肾萎缩。GREB1L基因突变位点c.4688A>G杂合突变为新发位点,未见文献报道。本病例可能拓展了与RAH相关的基因突变谱和临床谱。
作者贡献:孙涛负责文章的构思与设计及论文的撰写和修订;彭映潮、史卓负责文献资料收集和图表绘制;高春林负责文章审校,参与分析与讨论;夏正坤负责文章的质量控制,整体监督,对论文负责。
本文无利益冲突。