食管癌组织中lnc RNA DNAJC3-AS1的表达及其与临床病理特征的相关性研究

2021-04-17 08:12梁晓虎雷尚昆郭俊霞宝鸡市人民医院胸外肿瘤外科胸外科陕西宝鸡71000宝鸡市中心医院全科医学科陕西宝鸡71008
现代检验医学杂志 2021年2期
关键词:逆转录宝鸡市引物

梁晓虎,雷尚昆,郭俊霞(1.宝鸡市人民医院 a.胸外肿瘤外科;b.胸外科,陕西宝鸡 71000;.宝鸡市中心医院全科医学科,陕西宝鸡 71008)

食管癌(esophageal cancer,EC)是消化道常见的恶性肿瘤[1-3],预后较差[4-6],严重危害人类健康。我国是EC的高发国家,也是世界上EC 新发病例最多的国家[7-8]。近年来研究表明,长链非编码RNA(long non-coding RNAs,lncRNAs)的表达异常与多种疾病有关,尤其在肿瘤中扮演重要角色。因此,确定肿瘤相关的lncRNA 并且深度解析其生物学功能对阐明肿瘤的发生、发展至关重要。lnc RNADNAJC3-AS1位于染色体13q32.1,含有2个外显子,已有报道指出lnc RNADNAJC3-AS1 与骨肉瘤[9]和乳腺癌[10]密切相关。关于lnc RNADNAJC3-AS1 与EC的关联研究鲜有报道,本研究拟分析EC组织中lnc RNA DNAJC3-AS1的表达及其与临床病理特征的相关性,旨在为EC的临床诊疗提供合理参考。

1 材料与方法

1.1 研究对象 选取2017年6月~2019年5月宝鸡市中心医院全科医学科收集的246例EC患者的肿瘤组织及相应的癌旁正常组织(距离原发灶>5cm)为研究对象,取材后用液氮保存并标记。患者均为食管鳞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC),手术前未行免疫治疗、放化疗等抗肿瘤治疗。其中,男性180例,女性66例;年龄33~75岁,平均年龄54.9±13.1岁。本研究经由我院伦理委员会批准,患者自愿参加且均签署知情同意书。

1.2 仪器与试剂 逆转录试剂盒(日本TAKARA公司),ABI7500 PCR 仪(美国ABI),Sybr Green荧光染料(日本TAKARA 公司)。

1.3 方法 从液氮中取适量EC组织标本,充分研磨后,用Trizol 法抽提总RNA,逆转录试剂盒将RNA 逆转录为相应的cDNA,用pfimer 5 软件设计引物,引物设计如下:正向引物5’-TTGCTCT AAGGCAGGTAGGTAA-3’;反向引物:5’-GGG TCTTCCACAATCGCTCT-3’。与Sybr Green 荧光染料配置,使用PCR 仪进行实验,qPCR Mix选用ABI 公司配套的Master Mix,反应体系根据其说明书配置。结果采用2-ΔΔCt法进行分析,使用GAPDH 作为内参。当lnc RNA DNAJC3-AS1在肿瘤组织中的相对表达量高于相应的癌旁正常组织则为高表达,反之为低表达。

1.4 统计学分析 采用SPSS 19.0 统计学软件进行数据分析,计数资料以n(%)表示,采用χ2检验,计量资料采用t检验,以均数±标准差(±s)表示。采用K-M 法绘制EC患者生存曲线,用log-rank检验lnc RNA DNAJC3-AS1表达水平与患者总体生存率(overall survival,OS)的关系。P<0.05为差异具有统计学意义。

2 结果

2.1 lnc RNA DNAJC3-AS1 在EC肿瘤组织及相应癌旁正常组织中的相对表达量 见图1。lnc RNA DNAJC3-AS1 在EC肿瘤组织中的相对表达量高于相应癌旁正常组织(0.008 9±0.020 3 vs 0.004 9±0.010 4,P=0.000 8)。

图1 lnc RNA DNAJC3-AS1 在EC肿瘤组织及相应癌旁正常组织中的相对表达量

2.2 lnc RNA DNAJC3-AS1表达水平与EC患者临床特征间的关系 见表1。依据2.1的结果,根据lnc RNA DNAJC3-AS1表达水平的不同将患者分为高表达组和低表达组,每组各123例。lnc RNA DNAJC3-AS1表达水平与EC患者饮酒史(χ2=25.07,P<0.001)、家族肿瘤史χ2=4.73,P=0.047)、BMI指数(χ2=16.94,P<0.001)、临床分期(χ2=33.39,P<0.001)、是否原位癌(χ2=11.97,P=0.001)、是否淋巴结转移(χ2=19.01,P<0.001)、是否远端转移(χ2=16.65,P<0.001) 和肿瘤类型(χ2=9.17,P=0.010)显著相关。

2.3 lnc RNA DNAJC3-AS1表达水平与EC患者总体生存率的关系 见图2。使用Kaplan-Meier法进行生存分析结果显示,lnc RNA DNAJC3-AS1 低表达组患者的中位生存时间为34.0个月,高表达组患者的中位生存时间为17.0个月。lnc RNA DNAJC3-AS1 高表达组患者的OS 低于lnc RNA DNAJC3-AS1 低表达组(χ2=20.93,P<0.001)。

图2 lnc RNA DNAJC3-AS1表达水平与EC患者OS的关系

表1 不同临床特征研究对象lnc RNA DNAJC3-AS1表达水平差异性分析[n=123,n (%)]

3 讨论

食管是癌症的常见发病部位,EC是全球排名第6位的癌症死因。EC 预后较差,对人类健康危害严重。近年来研究指出lncRNAs 在EC的发生、发展中扮演重要角色[11-12],lnc RNA DNAJC3-AS1位于染色体13q32.1,含有2个外显子,其与DNAJC3是同源靶基因。有报道指出,在骨肉瘤组织中高表达并与骨肉瘤的分化程度、临床进展密切相关,其能提高骨肉瘤体内外的细胞增殖、迁移和侵袭能力,并降低对顺铂的药物敏感性。另外lnc RNA DNAJC3-AS1 在乳腺癌中高表达且其高表达能缩短乳腺癌患者生存期。目前,关于lnc RNADNAJC3-AS1 与EC的关联研究鲜有报道。

本研究结果显示,lnc RNA DNAJC3-AS1 在EC肿瘤组织中高表达,并且高表达lnc RNA DNAJC3-AS1 患者的OS 较低,这就说明了lnc RNA DNAJC3-AS1是EC的潜在生物标志物,其表达水平的升高会对EC患者的OS 带来消极影响。分析lnc RNA DNAJC3-AS1表达水平与EC患者临床病理特征间的关系,结果表明lnc RNA DNAJC3-AS1表达水平与患者饮酒史、家族肿瘤史、BMI指数、临床分期、T,N,M 等相关。

EC的组织学类型分为ESCC 和EAC,本研究纳入的对象均是ESCC患者,并未涉及EAC患者,因此关于lnc RNA DNAJC3-AS1 与EAC的关联仍未阐明,值得深入探究和分析。

猜你喜欢
逆转录宝鸡市引物
2010—2019年宝鸡市手足口病流行特征及时空聚集分析
甘蔗褐锈病菌单管巢式PCR检测体系的建立
甜菜全基因组SSR引物的筛选与评价
玉米品种德美亚多重SSR-PCR系统的建立及应用
我的识字小秘诀
太阳第一家
有关PCR扩增过程中的疑虑与剖析
宝鸡市陈仓区:五化提升强堡垒 党建引领扶真贫
鲤春病毒血症病毒逆转录环介导等温扩增(RT—LAMP)检测方法的建立
高中生物教材中几个疑难点的解读