生命树是一个概括所有现生生物之间的进化历程和亲缘关系的简化比喻。自从150 多年前的达尔文时代,学者们就在构建生命之树。近期,研究者利用公共数据库中4000 多个物种的完整或近完整的基因组序列,构建了全蛋白质组生命树。图中显示了简化的全蛋白质组生命树的最深部,所有现生生物可归为五个"大类",五个列对应于古细菌,细菌,真菌,植物和动物,以及一个并系的原生生物"大类"(由三个粗的红色虚线框代表,对应三类原生生物,分别标记为PR-1~5,PR-P 和PR-A,其中P 代表" 植物姊妹群",A 代表" 动物姊妹群")。右方的宽箭头示意性地显示了六个" 大类" 的所有" 创立者"在进化进展标尺的0.01 至0.20 的非常短的累积基因组信息差异范围内出现了深部爆发。
(PNAS 2020,117:3678-3686)