施冰,李俊峡
环状RNA:心力衰竭新的生物标志物
施冰1,李俊峡2
环状RNA(circRNAs)是1976年发现的一类特殊的非编码RNA,呈共价闭合环状结构。环状RNA不具有5′端多聚A尾和3′端帽子结构,也不被核糖核酸外切酶降解[1]。由于环状RNA的特殊结构,核酸外切酶无法将其降解,因此它们比多数线性RNA更加稳定。环状RNA序列高度保守,具有组织特异性和发育阶段特异性表达的特征[2]。随着环状RNA芯片和二代测序技术的广泛应用,有关环状RNA在心血管疾病的研究已引起人们的广泛重视。本文就环状RNA的分类、功能及其在心力衰竭的研究进展进行简要综述。
根据circRNAs来源于基因组的不同位点,将circRNAs分为以下5类:①外显子环状RNA,来源于线性转录体的同一条意义链中的一个或多个外显子。最近,科学家们已构建了一个包含超过32 000条人类外显子circRNAs的数据库circRNADb[3]。②内含子环状RNA,来源于线性转录体的同一个内含子。③反义链环状RNA,来源于线性转录体的反义链的一个或多个外显子。④基因区内环状RNA,源于线性转录体上与内含子或外显子相隔1 kb内的基因区域。⑤基因间区环状RNA,来源于线性转录体上与内含子或外显子相隔1 kb以上的基因间隔区域。
研究发现circRNAs具有以下功能:microRNAs海绵[4,5];调节剪切或转录[6,7];与RNA结合蛋白(RBPs)相互作用调节基因表达[8,9]。微小RNA(miRNA)可与特定的mRNA的3′端非翻译区碱基互补配对,抑制其翻译,甚至可引起靶mRNA的降解。circRNAs能够与miRNA结合,解除miRNA对mRNA的抑制,从而调节多种细胞功能,因此circRNAs又称为miRNA海绵。
在真核生物中,circRNAs作为microRNAs海绵发挥作用是一种普遍现象。如ciRS-7/CDR1AS具有70个miR-7的结合位点,可吸附miR-7抑制其生物功能。circ-Sry具有16个miR-138的结合位点,可吸附miR-138并发挥基因调节作用[4]。除了作为miRNA海绵发挥生物学功能,circRNAs还可以通过与RNA聚合酶Ⅱ相结合促进基因转录,以及通过影响基因剪切过程而发挥生物学功能。文献报道,circRNAs-EI可通过与U1snRNP和RNA聚合酶Ⅱ相互作用促进基因转录[6]。circRNAs可与RBPs相互作用而发挥生物学功能。如circRNAs-Mbl有MBL蛋白结合位点。MBL与circRNAs-Mbl相互结合使circRNAs-Mbl与mbl mRNA的生成处于动态平衡[7], circ-Foxo3与CDK2、p21形成复合体而阻止细胞周期进程[8]。
在人类心脏中,基因titin和基因RYR2可表达大量的不同的circRNAs[10,11]。目前,在心血管系统疾病中,有9个环状RNAs(HRCR、CDR1AS、Circ-foxo3、cZNF292、cTTN1、cTTN2、cTTN4、cTTN5、MICA)已被报道与心肌肥厚、心力衰竭、心肌梗死、左心室收缩功能不全、心肌缺氧、扩张性心肌病等相关[7,12-15]。环状RNAcZNF292存在于血管内皮并被缺氧所介导,在缺氧心肌可见cZNF292表达上调[15]。在心力衰竭患者心肌组织中,四种与RBM20相关的环状RNAcTTN1、cTTN2、cTTN4、cTTN5表达显著下调,其表达变化与RBM20基因的可变剪接相关[10]。
心脏相关circRNA(HRCR)是第一个被发现的与心血管疾病相关的环状RNA。HRCR可在小鼠心肌组织中表达,在小鼠心肌肥厚和心衰模型中,心肌组织中HRCR表达被抑制。miR-223转基因小鼠可以出现心力衰竭,而miR-223基因敲除小鼠未发生心力衰竭,提示miR-223在心力衰竭的发生发展过程中具有重要意义。Wang等[7]发现miR-223可通过调节包含CARD域的细胞凋亡抑制因子(ARC)从而导致心力衰竭的发生和发展。在心肌细胞中ARC呈高水平表达,ARC是miR-223的下游靶标。HRCR作为内源性miR-223海绵,通过吸附miR-223而抑制miR-223的表达,抑制miR-223活性,使下游ARC的表达增加,从而抑制心力衰竭。
研究发现,在小鼠心肌梗死模型中,随着心肌梗死面积扩大,心肌组织中环状RNA CDR1AS表达上调[13]。CDR1AS具有促凋亡作用,与miR-7的抗凋亡作用一致。小鼠心脏组织中过表达CDR1AS可导致心肌梗死后梗死面积扩大。而这种作用可被miR-7的过表达所抑制。miR-7a可通过抑制促凋亡因子PARP及转录因子SP1的表达而抑制心肌细胞凋亡。CDR1AS通过吸附miR-7a,抑制了miR-7a的作用,导致心肌组织中PARP及SP1表达水平上调,加重心肌梗死后心肌细胞凋亡,过表达miR-7a可逆转上述作用[13]。
环状RNA作为一类新型的竞争性内源性RNA(ceRNA),具有作为生物标志物的潜质。与其他类型的ceRNA相比,环状RNA具有高度保守、结构稳定、表达量高、稳定性强、与miRNA结合位点更多等优点。环状RNA与miRNA的结合和释放也更加快速和稳定。对miRNA的竞争性抑制有明显的优越性。由于高通量测序技术的发展,在人类和小鼠的组织中已识别了近千个细胞特异的环状RNA位点。环状RNA存在于全血、血浆和细胞外囊泡中,检测便捷。目前有关circRNAs在心血管疾病的研究才刚刚起步,仅发现几种与心血管疾病相关的circRNAs。随着研究的深入,相信会发现更多与心血管疾病相关的circRNAs及其作用机制,为心血管疾病诊断及治疗提供新的思路和治疗靶点。
[1] QuS,YangX,LiX,et al. Circular RNA:A new star of noncoding RNAs[J]. Cancer Lett,2015,365(2):141-8.
[2] Conn SJ,PillmanKA,ToubiaJ,et al. The RNA binding protein quaking regulates formation of circRNAs[J]. Cell,2015,160(6):1125-34.
[3] Chen X,Han P,Zhou T,et al. circRNADb: A comprehensive database for human circular RNAs with protein-coding annotations[J]. Sci Rep 2016,6:34985.
[4] Hansen TB,JensenTI,ClausenBH,et al. Natural RNA circles function as efficient microRNA sponges[J]. Nature,2013,495(7441):384-8.
[5] Li F,ZhangL,LiW,et al. Circular RNA ITCH has inhibitory effect on ESCC by suppressing the Wnt/β-catenin pathway[J]. Oncotarget,2015, 6(8):6001-13.
[6] Yang W,DuWW,LiX,et al. Foxo3 activity promoted by non-coding effects of circular RNA and Foxo3 pseudogene in the inhibition of tumor growth and angiogenesis[J]. Oncogene,2016,35(30):3919-31.
[7] Wang K,LongB,LiuF,et al. A circular RNA protects the heart from pathological hypertrophy and heart failure by targeting miR-223[J]. Eur Heart J,2016,37(33):2602-11.
[8] Li Z,HuangC,BaoC,et al. Exon-intron circular RNAs regulate transcription in the nucleus[J]. Nat StructMolBiol,2015,22(3):256-64.
[9] Du WW,YangW,LiuE,et al. Foxo3 circularRNA retards cell cycle progression via forming ternary complexes with p21 and CDK2[J]. Nucleic Acids Res,2016,44(6):2846-58.
[10] Khan MA,ReckmanYJ,Aufiero S,et al. RBM20 regulates circular RNA production from the titin gene[J]. Circ Res,2016,119(9):996-1003.
[11] Werfel S,Nothjunge S,Schwarzmayr T,et al. Characterization of circular RNAs in human,mouse and rat hearts[J]. J Mol Cell Cardiol,2016,98:103-7.
[12] Vausort M,Salgado-Somoza A,Zhang L,et al. Myocardial infarctionassociated circular RNA predicting left ventricular dydfunction[J]. J Am CollCardiol,2016,68(11):1247-8.
[13] GengHH,LiR,SuYM,et al. The circularRNA Cdr1as promotes myocardial infarction by mediating the regulation of miR-7a on its target genes expression[J]. PLoS One,2016,11(3):e0151753.
[14] Du WW,Yang W,Chen Y,et al. Foxo3 circular RNA promotes cardiac senescence by modulating multiple factors associated with stress and senescence responses[J]. Eur Heart J,2017,38(18):1402-12.
[15] Boechel JN,Jae N,Heumuller AW,et al. Identification and characterization of hypoxia-regulated endothelia circular RNA[J]. Circ Res,2015,117(10):884-90.
本文编辑:孙竹
R541.61
A
1674-4055(2017)08-1008-02
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10.3969/j.issn.1674-4055.2017.08.40