赵楚生,王奕忠,吴令杰,郭旭武
(广东省汕头市中心医院,广东汕头515031)
·临床论著·
Micro RNA-146a基因多态性与慢性乙型肝炎患者抗病毒疗效的相关性
赵楚生,王奕忠,吴令杰,郭旭武
(广东省汕头市中心医院,广东汕头515031)
目的探讨micro RNA-146a(miR-146a)基因单核苷酸多态性(SNP)和慢性乙型病毒性肝炎(CHB)患者干扰素-α(IFN-α)治疗应答反应的相关性。方法选择接受IFN-α抗病毒治疗的慢性乙型肝炎患者133例,其中应答组79例,无应答组54例。采集两组静脉血并提取DNA,用聚合酶链式反应-限制性内切酶长度多态性(PCR-RFLP)方法对miR-146a行SNP分型。结果miR-146a CT基因型与TT基因型比较,差异有统计学意义(P=0.009);CC基因型与TT基因型比较,差异有统计学意义(P=0.029)。T等位基因与C等位基因频率比较差异有统计学意义(P=0.020)。结论MiR-146a基因多态性与慢性乙型肝炎患者抗病毒疗效相关,T等位基因或TT基因型与IFN治疗应答相关,而C等位基因或CC基因型与干扰素治疗应答无相关。
RNA;基因多态性;肝炎病毒;等位基因
乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)是一种导致急、慢性乙型肝炎的病原体,世界上约有4亿慢性HBV感染者,其中75%为亚洲人。急性感染可导致严重致命的爆发性肝炎,慢性感染可导致肝硬化甚至肝细胞癌,所以在许多国家,这是一非常严重的问题[1]。干扰素-α(Interferon-α,IFN-α)有抗病毒、免疫调节、抗增生及基因诱导特性。应用IFN-α治疗可使CHB患者获得病毒学应答,并可改善临床结果[2]。影响IFN-α疗效的因素很多,本研究目的是探讨microRNA-146a(miR-146a)基因多态性对慢性乙型肝炎患者IFN-α抗病毒治疗应答的影响。
1.1临床资料
选取2010年1月-2013年12月本院感染科就诊的CHB患者133例,HBeAg阳性及HBV-DNA阳性,所有患者接受24~72周的普通IFN或聚乙二醇化干扰素(PEG-IFN)治疗。根据患者对IFN-α的病毒学反应分成应答组(n=79)和非应答组(n=54)例。应答组定义为治疗期间患者血清HBV-DNA<100 IU/ml,随访1年未复发。非应答组定义为治疗期间未达到以上标准,或者达到以上标准后随访1年复发。
1.2检测方法
1.2.1 标本采集和基因组DNA提取抽取静脉血1 ml,乙二胺四乙酸抗凝外周全血。将1 ml全血加至2.5 ml抽提缓冲液中,60℃保温1 h,15 000 r/min离心10 min,上清液转入另一个新的离心管中。加入等体积的氯仿∶异戊醇(24∶1),混匀抽提至水乳胶融状。15 000 r/min离心10 min,上清液转入另一个新的离心管中。加入2/3体积的预冷异丙醇,置入-20℃冰箱保温30~60min,缓慢混匀DNA成絮状析出。15 000 r/min离心10 min,弃上清液。用70%乙醇洗2次沉淀DNA,加入400μl TE buffer溶解DNA。
1.2.2 聚合酶链式反应-限制性内切酶长度多态性(polymerase chain reaction-restriction fragment lengthpolymorphism,PCR-RFLP)分析利用PCR-RFLP方法分析miR-146a基因多态性。其中PCR引物参照JAZDZEWSKI等[3]的报道,并行PubMed blast比对,与扩增产物符合。PCR反应体系为20μl,包括300 ng的基因组DNA,正、反向引物各0.2μmoL/L,10×PCR buffer 2μl,2.5 mmol/L dNTPs 2μl及lμl Taq DNA聚合酶(日本TaKaRa公司)。PCR反应条件为:94℃预变性5min,94℃变性30 s,57℃退火45 s,72℃延伸30 s,共33个循环,72℃继续延伸7 min,于40℃保存。PCR产物经2%琼脂糖溴化乙锭电泳分析,100 bp DNA Marker(日本TaKaRa公司)作为参照组,验证目的片段是否扩增成功。138 bp PCR产物经限制性内切酶MspⅠ(立陶宛MBI Fermentas公司)消化,37℃、5 uEcoRⅠ过夜反应,经3%琼脂糖溴化乙锭凝胶电泳分析。单一138 bp条带代表野生型TT纯合子,双带112和26 bp代表突变的CC纯合子,3条带138、112和26 bp代表CT杂合子。为确保基因型分析的准确性,随机选取10%PCR产物进行测序,与酶切结果100%符合。
1.3统计学方法
采用SPSS 18.0统计软件进行数据分析,计量资料以均数±标准差(±s)表示,组间比较用两独立样本的t检验,计数资料以率表示,用χ2检验,两组患者等位基因频率行Hardy-Weinberg equilibrium分析、等位基因频率比较及A值计算用χ2检验,以TT基因型作为参照,P<0.05为差异有统计学意义。
2.1两组患者一般资料比较
两组患者年龄、性别、丙氨酸转氨酶及天冬氨酸转氨酶比较,差异无统计学意义(P=0.130、0.627、0.420和0.685)。两组患者感染HBV的途径比较,包括输血史、吸毒史、其他医疗操作或其他方面,差异无统计学意义(P=0.281),具有可比性。
2.2MiR-146a基因多态性分析
MiR-146a序列和PCR产物序列测序结果见图1。MiR-146a PCR扩增产物片段长度为138 bp。其中野生型TT纯合子不能被EcoRⅠ酶切,仍为138 bp。突变的CC纯合子可被EcoRⅠ完全酶切,产物片段为112和26 bp(因片段太小,电泳条带不清楚)。CT杂合子的扩增产物部分酶切,可见138、112和26 bp片段(因片段太小,电泳条带不清楚)。见图2。
2.3MiR-146a C/T基因多态性与患者抗病毒疗效的相关性
图1 测序结果
慢性乙型肝炎患者miR-146a基因型分布经χ2检验符合Hardy-Weinberg平衡(χ2=0.610,P=0.382),说明研究对象具有群体代表性。两组患者中miR-146a CT杂合子为主要的基因型,CT基因型与TT基因型比较差异有统计学意义[A=2.935,(95%CI:1.291,6.341),P=0.009],CC基因型与TT基因型比较差异有统计学意义(A=3.027,95%CI:1.048,9.078,P=0.029)。应答组的T等位基因频率(64.6%)比非应答组(49.1%)高,而非应答组的C等位基因频率(50.9%)比应答组(35.4%)高,且C等位基因与T等位基因频率比较差异有统计学意义(OR=1.782,95%CI:1.028和2.914,P=0.020)。miR-146a CC基因型或C等位基因可能与慢性乙型肝炎患者抗病毒疗效欠佳有关。见附表。
图2 miR-146a C/T多态性位点EcoRⅠ酶切电泳图
附表 两组患者的miR-146a C/T基因多态性例(%)
IFN-α是目前治疗乙型肝炎病毒感染具有持久疗效的抗病毒药物,有抗病毒和免疫调节作用,可以清除HBV,抑制肝脏坏死性炎症,降低肝硬化或肝细胞癌的危险性。据报道,应用IFN-α治疗的患者中,HBeAg阳转率约为40%,HBV-DNA阴转率约为50%[4]。
与核苷类似物相比,IFN-α治疗疗程有限,治疗应答率偏低。寻找影响治疗反应的预测因素对制定个体化治疗方案、节省医疗成本、避免副反应,具有一定的临床意义。研究证实,高丙氨酸转氨酶水平(>200 u/L)、女性、低HBV载量、病毒基因型(B>C)等因素可预测HBcAg阳性的慢性HBV患者对干扰素治疗的应答,并预示良好的应答效果[5-6]。除上述影响疗效的外在因素,不同个体的遗传背景亦影响自身对药物的反应性。通过SNP的研究,可以从遗传背景的角度探讨影响疗效的预测因素,并为阐明干扰素确切的作用机制提供线索。
MiRNA是一种在机体中高度保守的20~23个核苷酸长度的非编码RNA,能够广泛地参与基因的转录后调节,包括调节生物体的生物学和各种疾病的进程[7]。其中miR-l46a作为较早发现的与免疫炎症相关的调节因子,与乙肝肝癌的易感性密切相关[8]。
本研究表明,miR-146a CT杂合子在慢性乙型肝炎患者中占优势,且CT基因型与野生TT基因型比较差异有统计学意义。CT基因型在非应答组频率较高,表明CT基因型比野生TT基因型疗效差。C等位基因与T等位基因比较差异有统计学意义,表明C等位基因或CC基因型与患者对干扰素应答欠佳或治疗后复发率高相关。MiR-146a基因多态性可能影响相关靶基因的表达,从而影响疾病对药物的疗效。下一步笔者将通过研究miR-146a的可能调控因素和相关基因表达,为慢性乙型肝炎患者个体化治疗提供理论依据。
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[3]JAZDZEWSKI K,MURRAY EL,FRANSSILA K,et al.Common SNP in pre-miR-146a decreases mature mir expression and predisposes to papillary thyroid carcinoma[J].Proceedings of the National Academy of Sciences,2008,105(20)∶7269-7274.
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[5]徐学俊.干扰素治疗慢性乙型肝炎的长期疗效观察[J].中国临床医学,2006,13(5)∶758-760.
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(申海菊 编辑)
MicroRNA-146a gene polymorphism and antiviral therapy of chronic hepatitis B
Chu-sheng ZHAO,Yi-zhong WANG,Ling-jie WU,Xu-wu GUO
(Shantou Central Hospital,Shantou,Guangdong 515031,P.R.China)
【objertive】To investigate the relationship between the single nucleotide polymorphism(SNP)on miR-l46a gene and the treatment effects of TFN-α.【Methods】Totally 133 patients of chronic hepatitis B infection who
the treatment of IFN-α were enrolled in this study.The patients were divided into two groups:sustained virological response(n=79)group and non virological response(NVR)or recurrence(n=54)group.Blood samples were collected and chromosomal DNA was extracted.The miR-146a polymorphism was determined with the method of polymerase chain reaction restriction fragment length polymorphism(PCRRFLP).【Results】In our study,there was a statistical association between miR-146a polymorphism and the antiviral therapy efficacy in the hepatitis B patients.There was a statistical difference in the CT genotype and the TT genotype of miR-146a between the two groups(P=0.009).There was a significant difference in the CC genotype and TT genotype between the two groups(P=0.029).There was a significant difference in the C allele and T allele between the two groups(P=0.02).【Conclusions】These findings suggested that the SNP in miR-146a is associated with the antiviral therapy efficacy of hepatitis B patients.And the TT genotype or T alleles is associated with the response to TFN-α therapy while the CC genotype or C allele is not related to the response to TFN-α therapy or recurrence.
RNA;gene;hepacivirus;allele
R512.62
A
1005-8982(2015)35-0070-03
2014-03-27