猪链球菌广东株的分离鉴定及药敏试验

2015-06-18 11:27杨旭夫朱必凤刘博婷
动物医学进展 2015年2期
关键词:猪链球菌生化引物

彭 凌,杨旭夫,朱必凤,刘博婷

(韶关学院粤北生猪生产及疫病防控协同创新发展中心,英东生命科学学院,中国农业科学院哈尔滨兽医研究所-韶关学院动物疫病诊断中心联合实验室,广东韶关 512005)

猪链球菌(Streptococcussuis,SS)是一种重要的人兽共患病病原体,多年来一直困扰我国养猪业发展,按其荚膜抗原的差异,可分为35个血清型(1~34及1/2),对猪致病性较强的血清型是1型、2型、1/2型、7型和9型[1]。症状主要为脑膜炎和败血症,发病率和病死率均较高,少数育肥猪则以关节炎型为主要特征,给养猪业造成了巨大的经济损失,并对相关从业人员的生命安全构成严重威胁。2005年6月~7月份发生在四川省资阳、内江等地区的2型猪链球菌感染事件造成了一定的社会影响和极大的经济损失,引起广泛关注[2]。虽然理论上有很多药物能治疗猪链球菌病,但随着抗菌药物的广泛使用及不合理用药,使得病原菌的耐药现象日趋严重[3-4]。本试验从广东某猪场采集具有临床症状的病死猪的关节液,其中的优势病原菌疑为猪链球菌的病原菌,对其进行了形态学观察、生化试验、16SrRNA序列分析、猪链球菌2型的毒力基因检测及药敏试验,为控制该病的发生与流行提供了依据。

1 材料与方法

1.1 材料

1.1.1 病料 病料来源于广东韶关某一猪场,猪群表现为患猪体温升高,被毛粗乱,一肢或四肢关节肿胀、疼痛,有跛行,严重者不能起立。无菌采取病死猪的关节液等病变组织涂布于血清营养琼脂平板上,37℃培养24h后观察。

1.1.2 主要试剂 各类生化反应管、药敏纸片为杭州天和微生物试剂有限公司产品;DNA Marker、TaKaRaTaqenzyme为宝生物工程(大连)有限公司产品。

1.2 方法

1.2.1 细菌分离培养 将无菌采集的新鲜关节液涂布于血清营养琼脂平板上,37℃培养24h后观察菌落形态。挑取直径1.0mm、半透明、圆形光滑的菌落接种于血清营养琼脂平板纯化。挑取纯培养物的单个菌落,进行革兰染色,镜检。

1.2.2 生化鉴定 从分离得到的菌株的纯培养物中挑取单个典型菌落,按照杭州天和微生物试剂有限公司反应管说明书进行。

1.2.3 基因组DNA的提取 取适量的培养物离心收集菌体,沉淀物加入567μL的TE缓冲液重悬,加入30μL 100g/L的SDS和3μL 20mg/mL的蛋白酶K,振荡充分混匀,于37℃水浴锅中温育1h,直到溶液变得透明为止。加入100μL 5mol/L NaCl,充分混匀,再加入80μL CTAB/NaCl溶液,混匀,于65℃温育10min;加入等体积的酚/氯仿/异戊醇(25∶24∶1)混匀,10 000×g离心5min,取上清,再用酚/氯仿/异戊醇抽提1次;加入0.6倍体积的异丙醇(约450μL),轻轻混合,经10 000×g离心10min,弃上清,沉淀用700mL/L乙醇洗涤2次,重溶于TE缓冲液中,4℃冰箱中保存备用。

1.2.4 1 6SrRNA序列测定 根据文献[5-6]设计猪链 球 菌 16SrRNA 基 因 扩 增 引 物,F:5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′,R:5′-AAGGAGGTGATCCAGCC-3′,扩增长度约为1 500bp,委托上海生工生物工程技术服务有限公司合成。反应体系(总体积为25μL)含:10mmol/L Tris-HCl(pH 8.3),10mmol/L KCl,2.5mmol/L MgCl2,0.4mmol/L dNTP,引物各0.5μmol/L,基因组DNA 100ng,Taq酶1.5U。扩增程序为:94 ℃5min;94℃30s,50℃1min,72℃1.5min,30个循环;72℃6min。PCR产物委托上海生工生物工程技术服务有限公司纯化后进行序列测定,测序引物同PCR扩增引物,双向测通。序列测定后,通过DNA Star 7.1软件对原始测序数据进行校对分析,建立完整可靠的序列,并通过采用GenBank数据库中Blast程序与已知序列进行相似性分析,对菌株进行鉴定。

1.2.5 PCR分型鉴定 根据文献[7]合成对猪链球菌2型荚膜多糖(cps2J)特异性引物,cps2J-s:5′-GTTGAGTCCTTATACACCTGTT-3′,cps2J-as:5′-CAGAAAATTCATATTGTCCACC-3′。预期扩增出的目的基因片段长度为459bp。反应体系(总体积为25μL)含:10mmol/L Tris-HCl(pH 8.3),10mmol/L KCl,2.5mmol/L MgCl2,0.4mmol/L dNTP,引物各0.5μmol/L,基因组 DNA 100ng,Taq酶1.5U 。扩增程序为:94℃2min;94℃30s,55 ℃ 30s,72 ℃ 1min,35个循 环;72 ℃6min。扩增产物用14g/L的琼脂糖凝胶进行电泳,利用Master VDS凝胶成像系统进行拍照。

1.2.6 药敏试验 采用K-B纸片法将纯化猪链球菌菌液调整浊度与比浊管(0.5麦氏单位)相同,用灭菌棉签均匀涂布于血平板上,37℃培养24h后,并用美国NCCLS标准对结果进行判定[8]。

2 结果

2.1 细菌的分离

从采集的病料中分离得到3株革兰阳性球菌,分别将其编号为SG1、SG2、SG3。分离菌株在血清营养琼脂平板上均呈半透明、表面光滑、微隆起的淡灰白色状的小菌落;镜检呈单个、成双或短链状排列的革兰阳性球菌。

2.2 生化试验

对分离到的3株革兰阳性球菌进行生化试验,3个菌株生化试验结果一致,均可发酵乳糖、蔗糖、蕈糖、葡萄糖和七叶苷,不发酵山梨糖、山梨醇、甘露醇、尿素、水杨苷、棉子糖、阿拉伯糖、甘油。生化反应结果符合猪链球菌的生化特性。

2.3 16SrRNA序列测定

通过16SrRNA的PCR扩增,3个菌株均扩增出1 500bp左右的目的片段,且产物浓度高,无非特异性杂带,与预期结果一致,可用于纯化测序。具体电泳结果见图1。

图1 16SrRNA片段PCR扩增产物Fig.1 PCR products of 16SrRNA gene fragment

将测序公司的原始数据通过DNA Star 7.1软件处理和校对,3株菌测得有效序列1 393bp,菌株之间存在5个碱基突变位点。将所得菌株的1 6S rRNA基因序列在NCBI上用Blast进行同源性比较,结果基因同源性达99%以上的参考菌株全为SS。与湖南长沙的JX207110和JX207111SS参考株关系最近,与分离株SG1、SG2、SG3的基因同源性分别为99.7%、99.8%、100%。进一步确定该细菌为SS。

2.4 PCR分型鉴定

用猪链球菌2型Cps2J引物进行PCR扩增,获得459bp大小的目的片段(图2),与预计扩增片段的分子质量一致。

图2 Cps2J片段PCR扩增产物Fig.2 PCR products of Cps2Jgene fragment

2.5 药敏试验结果

3株菌株药敏试验结果基本表现一致,均表现对头孢氨苄、头孢拉定、先锋Ⅴ、左氟沙星高度敏感;先锋噻肟、环丙沙星、氧氟沙星、恩若沙星、头孢呋肟、氟哌酸、氯霉素、利福平、洛美沙星、氟罗沙星中度敏感;呋喃妥因、多西环素、阿莫西林、复方新若明、林可霉素、克拉霉素、卡那霉素、痢特灵、红霉素、阿奇霉素、克林霉素、阿米卡星、依诺沙星、氨苄青霉素、羧苄青霉素、庆大霉素、四环素、链霉素、罗红霉素、甲氧胺嘧啶、青霉素G等21种药物不敏感。

3 讨论

本研究从广东某发病猪场的发病猪关节液分离到3株革兰阳性球菌,生化试验鉴定为猪链球菌,将所得菌株的16SrRNA基因序列在NCBI上用Blast进行同源性比较,结果基因同源性达99%以上的参考菌株全为SS。16SrRNA基因具有高度的保守性和特异性,已经广泛应用于细菌的分类和鉴定[9-13]。根据不同属细菌16SrRNA基因同源性为70%~90%,而同一种内不同株间基因同源性>99%[14],从分子水平确定这3株细菌为猪链球菌。为进一步确定这3株菌的型别,我们采用已报道的扩增猪链球菌2型荚膜多糖的特异性引物对它们进行鉴定,结果这3株菌均扩增出预期的459bp的预期片段。

近年来,由于抗生素的滥用,产生了大量耐药菌株,抗生素也失去应有的作用,疾病难以控制;其次,猪链球菌具有较强的地域性,即使同一地区的不同菌株也有明显的差异,因此在用药前应做药敏试验来确定敏感药物。为指导临床用药,本试验选用目前常用的35种药物对分离到的3株猪链球菌进行了药物试验。试验结果表明,3个分离菌株对头孢菌素类、喹诺酮类、氯霉素类药物表现出敏感,而对青霉素类、大环内酯类、磺胺类、林可胺类、四环素类、氨基糖苷类等21种抗生素表现出耐药,耐药性相当严重,应引起养殖户的高度重视。

理论上很多药物对链球菌有疗效。但近年来由于抗生素的滥用,如在动物饲料中长期添加抗生素用于促进生长及预防和治疗疾病,发生疾病后未经兽医诊断就盲目大量使用多种抗生素等,不仅治疗成本提高,而且产生了大量耐药菌株,使得疾病难以控制。臧莹安等[3]对猪链球菌广东分离株的药敏试验结果发现,85%菌株对阿莫西林等药敏感,45%菌株对先锋霉素Ⅴ、先锋霉素 Ⅵ 等中度敏感,85% 以上的菌株对大环内酯类、磺胺类、氯霉素类、喹诺酮类、林可胺类和四环素类等不敏感。黄文明等[4]对猪链球菌广东分离株的药敏试验结果发现对四环素类、磺胺类和氨基糖苷类抗菌药物表现较强的耐药性,尤其对四环素类药物的耐药率高达98.2%;对头孢菌素类药物比较敏感。本文猪链球菌广东分离株的药敏试验结果与以上不尽相同,分析原因可能与各猪场用药习惯不同,进而产生耐药性不同有关。建议猪场在防治猪链球菌病时,应在确诊的基础上,通过药敏试验,有目的、有针对性地用药,避免滥用抗生素,并根据试验结果选用用2种~3种敏感药物交替用药,避免菌株耐药性的增强,尽量减少耐药菌株产生。

[1]何孔旺,倪艳秀,王继春.猪链球菌2型的分子流病学研究[J].中国人兽共患病杂志,2002(5):45.

[2]郝春燕,王利勤,王晶钰.猪链球菌的分离鉴定及药敏试验[J].动物医学进展,2010,31(5):124-128.

[3]臧莹安,卢 顿,胡 波,等.广东地区发病猪群猪链球菌感染监测及药敏试验[J].中国兽医杂志,2011,47(12):73-75.

[4]黄文明,欧阳昀,张民泽,等.广东地区猪链球菌的耐药性特点及四环素耐药基因携带情况[J].中国畜牧兽医,2013,40(5):54-58.

[5]William G,Susan M B,Dale A P,et al.16Sribosomal DNA amplification for phylogenetic study[J].J Bacteriol,1991,173(2)697-703.

[6]苏 良,欧新华,杨柳青,等.猪链球菌长沙分离株的鉴定与16SrRNA系统进化分析[J].中国人兽共患病学报,2013,29(6):547-550.

[7]Marois C,Bougeard S,Gottschalk M,et al.Multiplex PCR assay for detection ofStreptococcussuisspecies and serotypes 2 and 1/2in tonsils of live and dead pigs[J].J Clin Microbiol,2004,42(7):3169-3175.

[8]CLSI/NCCLS document M100-S22(ISBN 1-56238-786-3),Performance standards for antimicrobial susceptibility testing,twenty-second informational supplement[S].

[9]陈 煜,吴 达,孙 敏,等.一株猪源豕链球菌的分离鉴定[J].动物医学进展,2012,33(12):219-223.

[10]黄平容,田世成,苏建明.一株耐万古霉素粪肠球菌的分离鉴定[J].动物医学进展,2013,34(6):81-84.

[11]Claire J,Clare L L,Holly L C,et al.Detection and identification of bacteria in clinical samples by 16SrRNA gene sequencing:comparison of two different approaches in clinical practice[J].J Med Microbiol,2012,61(4):483-488.

[12]Christian F P S,Knud P,Mogens K,et al.Novel molecular method for identification of Streptococcus pneumoniae applicable to clinical microbiology and 16SrRNA sequence-based microbiome studies[J].J Clin Microbiol,2012,50(6):1968-1973.

[13]Kirstin J E,Julie M J L,Sally L,et al.Utility of real-time amplification of selected 16SrRNA gene sequences as a tool for detection and identification of microbial signatures directly from clinical samples[J].J Med Microbiol,2012,61(5):645-652.

[14]沈德新,封志纯.核糖体核糖核酸基因簇在细菌系统分类中的研究进展[J].医学综述,2004,10(2):69-71.

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