结直肠癌组织KRAS和BRAF基因突变情况及意义

2014-12-02 04:34:02孙亚琼
山东医药 2014年32期
关键词:突变率密码子基因突变

宋 敏,孙亚琼,张 莉,潘 琼

(郑州大学第一附属医院,郑州450052)

结直肠癌是三大常见的恶性肿瘤之一,多数患者就诊时已经处于晚期,失去了手术治疗的最佳机会。临床试验证明,西妥昔单抗、帕尼单抗等表皮生长因子受体(EGFR)拮抗剂治疗转移性结直肠癌的疗效较常规化疗显著提高,但只有KRAS野生型患者从中受益[1,2]。KRAS对抗 EGFR 治疗的预测作用已经明确,但其与临床特征、预后之间的关系无明确结论。而关于BRAF基因的研究相对较少,虽被报道与抗 EGFR 耐药相关[1,3],但其突变状态与病情及预后的关系尚无定论。2010年1月~2013年12月,我们观察了结直肠癌组织KRAS和BRAF基因突变情况,并探讨其意义。

1 资料与方法

1.1 临床资料 选择结直肠癌组织477例,均经甲醛固定、石蜡包埋,患者均未行抗EGFR(西妥昔单抗/帕尼单抗)治疗。其中男295例,女182例;年龄27~81岁,平均51岁;结肠癌316例,直肠癌161例;具有分化程度、肿瘤大小、淋巴结转移情况、浸润深度、TNM 分期等资料者分别为 473、209、373、366、362例。

1.2 方法

1.2.1 指标观察方法 记录肿瘤原发部位、大小、分化程度、淋巴结转移、浸润深度、TNM分期,并随访至疾病进展或死亡,记录无进展生存期(PFS)。

1.2.2 基因突变检测 采用实时荧光PCR及多重PCR-STR法检测KRAS基因外显子2第12、13位密码子的基因突变情况,其中315例同时检测BRAF基因外显子15的突变情况,并对扩增产物进行测序。按照DNA试剂盒(QIAGEN)说明提取石蜡标本基因组DNA,KEAS上游引物:5'-GGTACTGGTGGAGTATTTGATAG-3',下游引物:5'-TGGTCCTGCACCAGTAATATG-3',扩增长度248 bp;BRAF上游引物:5'-CTCTTCATAATGCTTGCTCTGATAGG-3',下游引物:5'-GTGGAAAAATAGCCTCAATTCTT-3',扩增长度211 bp。反应条件:初始变性95℃、5 min,95 ℃、30 s,56 ℃、30 s,72 ℃、20 s,共 45 个循环,72℃延伸10 min,4℃结束反应。PCR产物经3%琼脂糖凝胶电泳确定后,采用ABI Sequence Analyzer测序分析。

1.2.3 统计学方法 采用SPSS17.0统计软件。率的比较采用χ2检验,PFS的比较采用t检验。P≤0.05为差异有统计学意义。

2 结果

2.1 KRAS、BRAF 基因突变情况 KRAS 基因突变率为24.5%(117/477),其中单纯 G12D突变50例、G12V突变29例、G12A突变11例、G13D突变17例、G13A突变9例,G12D联合G12V突变1例。BRAF基因突变率为11.4%(36/315),均为V600E突变。未检测到同时发生KRAS与BRAF基因突变者,BRAF基因在KRAS基因野生型患者中的突变率为 14.2%(36/252),KRAS基因在BRAR基因野生型患者中的突变率为22.6%(63/279)。

2.2 KRAS、BRAF基因突变与结直肠癌临床因素的关系 左、右侧结肠癌患者KRAS基因突变率分别为13.3%、36.4%,P=0.05。KRAS 基因突变型和野生型分别有69.2%、30.0%出现肝转移(P<0.01),有 30.8%、32.5% 出现肺转移(P > 0.05)。KRAS基因在≥65岁患者中的突变率高于<65岁者,P<0.01。BRAF基因在男性、高分化、TNM 分期Ⅲ~Ⅳ期的突变率分别高于女性、中低分化、Ⅰ~Ⅱ期,P 均 <0.05。

表1 KRAS、BRAF基因突变与结直肠癌患者临床因素的关系[例(%)]

2.3 KRAS、BRAF基因突变与PFS的关系 KRAS基因突变型的PFS为6.2个月,野生型为10.6个月,P>0.05。BRAF基因突变型的PFS为10个月,野生型为8个月,P >0.05。

3 讨论

KRAS是大鼠肉瘤原癌基因家族(RAS)的成员之一,在抑制肿瘤细胞凋亡及加速其增殖方面起着重要的作用。BRAF通过激活MAPK通路和抑制促凋亡因子 BIM,导致细胞异常增殖和分化。当KRAS或BRAF基因发生突变时导致EGFR下游通路的激活,从而产生抗EGFR耐药。结合目前关于KRAS、BRAF基因突变状态的研究结果,虽然证实KRAS野生型患者能从抗EGFR治疗中获益,但仍有相当数量患者对抗EGFR治疗无效。KRAS基因状态并不能筛选出所有抗EGFR治疗有效人群,而BRAF基因突变检测目前均与KRAS基因检测同时进行,参考价值仍依赖于KRAS基因突变状态,尚不能单独作为预测因子。因此需要更有效、更多预测因子来确定更加精确地靶向治疗有效人群,目前已有 TP53、PTEN 与 PIK3CA、E-cadherin、NRAS 等相关因子的研究,但均未得出定论,希望更多的学者能在此研究方向得出更加精确的结论。

目前研究报道,KRAS突变率为20% ~45%[4~8],BRAF 突变率为 4%~ 15%[9~15],与本研究中KRAS(24.5%)和BRAF基因突变率(11.4%)基本一致。目前研究表明,KRAS、BRAF基因突变在女性、高级别肿瘤、右侧肿瘤、老年患者中多见,并有报道显示二者突变率在结肠癌中明显高于直肠癌[8]。而本研究显示,KRAS基因突变与老年显著相关,BRAF基因突变则在男性中多见,以上差异可能是由于地域性、研究样本量和基因检测方法不同等导致的。此前报道中未曾发现KRAS基因同时多个密码子突变,因此认为KRAS基因各密码子突变为独立事件。而本研究中观察到1例KRAS基因同时发生G12D、G12V密码子突变,可能系检测误差所致,但亦不能排除KRAS基因存在多种密码子突变形式共存的可能性,有待后续观察证实。本研究分析KRAS、BRAF基因突变状态与患者预后之间的关系,认为基因突变患者肝转移率较高;但未发现基因突变与PFS之间存在明显关联,表明KRAS与BRAF基因状态并不能预测以奥沙利铂/伊立替康为基础治疗的疗效。

综上所述,KRAS基因突变与结直肠癌患者的年龄、发病部位及肝转移有关,BRAF基因突变与性别、分化程度、肿瘤TNM分期有关;检测两基因突变情况有助于判断结直肠癌患者的病情。由于本研究患者均未行抗EGFR治疗,所以未能观察到两基因突变对抗EGFR靶向治疗的预测作用及其对预后的影响,有待进一步研究。

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