乳清酸异构化反应的理论研究

2011-01-29 09:39王新利
泰山学院学报 2011年6期
关键词:能垒过渡态异构体

王新利,张 莉

(1.泰山学院国有资产管理处,山东泰安 271021;2.山东农业大学信息科学与工程学院,山东泰安 271000)

乳清酸(维生素B13;H3dtpc),酮式名称是1,2,3,6-四氢-2,6-二氧-4-嘧啶羧酸,烯醇式名称是2,6-二羟基嘧啶-4-羧酸,作为生物活体嘧啶基核酸生物合成过程中的有效前体,是一种重要的嘧啶衍生物,在生物和药物化学中发挥独特的作用[1].它可用作调节血液脂肪的药物.除了其生物方面的重要性之外,乳清酸还是配位化学中优良的配位单元[2].它的酮式和烯醇式互变异构体,以及其不对称结构,使其成为多用途的多齿有机配体[3].它包含潜在的氢键受体和氢键给体,并在超分子络合物中显示不同的氢键相互作用[4].最近,我们用乳清酸合成了数种有机金属络合物,如[Co(C5H2N2O4) (C14H8N4)2]2H2O[5]和[Mn(C5H2N2O4)(C12H8N2)(H2O)2][6].因此,有必要对乳清酸展开进一步的理论和实验研究,以更好地理解其结构和性质.有关乳清酸分析方法的进展被多次报道[7-10],但是,还未开展对其结构进行理论研究.本文将对乳清酸异构体的结构以及异构体直接的转化过程进行研究,并且,其红外光谱性质也将被研究并与实验数据比较.

1 实验与计算方法

所有结构的分子集合构型均使用Gaussian98程序包,在密度泛函理论的B3LYP方法[11-12]进行全优化,一个较高水平的基组6-311+G*自始至终被使用.选择这个基组是基于这样的考虑:要获得非共价相互作用的可靠性质,使用弥散函数的基组是必要的.用虚频的数目确定所得物种是一种稳定构型,还是过渡态或是亚稳态.下面要讨论的相对能量均为在298.15K下经过零点能校正(ZPE和热力学校正(TC)后的能量.

[Co(C5H2N2O4)(C14H8N4)2]·2H2O[5]和[Mn(C5H2N2O4)(C12H8N2)(H2O)2]的合成方法已经在文献[5-6]报道过.为了研究红外光谱,在相同基组水平是计算了异构体的振动频率,并且用Nicolet AVARAT360傅里叶红外(FT-IR)光谱仪记录了两个金属有机配合物的红外光谱.

图1 乳清酸异构体的结构参数.键长的单位是nm,键角的单位为度(°).元素符号旁边的数字是区分它们的序号,括号内的数字是相当于1a、以kJ/mol为单位的能量.

2 结果与讨论

2.1 乳清酸异构体的结构分析

由于氢的位置不同,乳清酸有多种异构体.基本异构体的结构参数列于图1中.异构体1a是能量上最稳定的一个.对于1c,3c,4b,4c和4d,空间位阻效应使它们能量较高.例如,由于H15的位置,3b的能量比3a高37.28 kJ/mol.

在1c,3c和3d中,羧酸基和苯环并不处在同一平面.虽然共轭效应在一定程度上被破坏了,但这些构型也避开了邻近氢原子间的排斥效应,因此它们的能量并没有异常显著地增加.异构体3a不能保持平面构型,2个氧原子不能参与形成共轭π键,但是由于H13和H14不存在空间位阻效应,并且这种空间构型使H7和H15间的位阻有效降低,因此它甚至比平面构型的3b和3c更稳定.1c中也存在同样的情况.

在这些化合物中,氢键相互作用是一个共同点特征.1a和1b比其他异构体含有更多的氢键,也就更稳定.2c的内能比1a显著地升高了46.86 kJ/mol,这主要是由于一些氢键的消失.对于最稳定的异构体1a,这些氢键的键长分别为0.2327、0.2328、0.2520、0.2500、0.2485、0.2679和0.2508 nm.

图1表明,空间位阻效应、π电子的离域和氢键能够影响乳清酸的稳定性,并且位阻效应是一个关键因素.比如,4d为平面构型,但有2对邻近氢原子,因此其能量比1a升高达146.82 kJ/mol.

2.2 不同异构体的转化

在B3LYP/6-311+G*基组水平上优化了一些质子转移过程的过渡态,过渡态的结构参数列在图2中,虚频的振动频率和振动模式指认列于表1中.从图2可以看出,质子转移过程的能垒相对较高.

图2 在B3LYP/6-311+G*基组水平是优化的过渡态和异构体5的结构参数.括号内的数字是相当于1a、以kJ/mol为单位的相对能量.

对于1a,H14转移到O12和O13以及H15转移到O13过程的能垒分别为193.33,207.42和200.74 kJ/mol.对于1a,H14可以通过TS1a1转移到O12上,TS1a1的唯一虚频是强度为576.0249 km/ mol、在i1952 cm-1处的O12-H14平面摇摆振动.这个虚频显示,H14正从N6向O12转移.H14也能够通过过渡态TS1a3从N6向O13转移,形成4a.TS1a3的虚频为O13-H14平面摇摆模式,也与正在转移的H14原子有关.以相似的方式,1a可以经由TS1a2转变为3a.对于其他质子转移过程,2b可以分别通过TS2b-5,TS2b-3e和TS2b-2c转变为异构体5,3e和2c,其能垒分别为147.02,147.97和149.46 kJ·mol-1.TS2b-2c是一个氢原子在羧基的O13和O14之间传递的过渡态,很高的能垒说明构型转变在能上是不利的.

表1 过渡态的最低频率和振动模式指认

但是,氢原子顺反异构过程的能量相对较低,这表明此类过程容易发生.比如,H15和H11通过过渡态TS3a-3b和TS2a-2b异构化的能垒仅为43.34KJkJ·mol-1和52.26 kJ·mol-1.

2.3 红外光谱研究

由于H原子位置的不同,不同的乳清酸异构体具有不同的IR谱图.异构体1a,2a,3e和4a的IR谱图绘于图3中.1a有一些引人注目的振动模式,如强度为173.07 km·mol-1在607 cm-1处的羧基O-H面外摇摆模式,在1187 cm-1处强度为325.56 km·mol-1的C-O-H平面摇摆模式,在1390 cm-1处强度为251.98 km·mol-1的C-O-H平面弯曲模式,以及C-O12伸缩模式 (1767 cm-1,810.52 km·mol-1)、C-O9伸缩模式 (1797 cm-1,312.47 km·mol-1)和C-O13伸缩模式 (1809 cm-1,722.56 km·mol-1).正如图1所示,由于2个N-H键长不同,1a有2个不同的伸缩振动模式,即NH14和N-H15非对称伸缩(3601 cm-1,157.49 km·mol-1)与N-H14和N-H15对称伸缩模式(3602 cm-1,28.40 km·mol-1).由于只有一个O-H键,唯一的O-H伸缩振动模式出现在732 cm-1(96.33 km·mol-1).对于2a,有2个容易辨别的都是属于O-H伸缩模式的特征频率,分别是在3604 (117.28 km·mol-1)、3724(87.89 km·mol-1)和3761 cm-1(74.97 km·mol-1)位置的 O-H15,O-H9和O-H11伸缩振动.但是,从图3看出,3e和4a都有一个N-H伸缩模式和两个非常接近的O-H伸缩模式.

图3 在B3LYP/6-311+G*基组水平上模拟的1a,2a,3e和4a的IR谱图

模拟的乳清酸IR谱图可以帮助我们理解乳清酸络合物的光谱和结构.用实验方法记录的[CoII(DPQN)2(C5H3N2O4)]·2H2O[5]和[MnII(C5H2N2O4)(C12H8N2)(H2O)2][6]的谱图分别列在图4和图5中.图4和图5显示,3421.34和3329.16 cm-1位置的吸收对应着N-H伸缩振动模式,这表明N-H键的存在;1641.20和1639.26 cm-1处的强烈吸收对应1a中C-O13的伸缩振动模式,并且1608.83和1511.21 cm-1处为C-O12的伸缩振动模式.因此,离解2个质子后,乳清酸以异构体1a参与中心金属的配位.

3 结论

本文使用Gaussian98程序包、在B3LYP/6-311+G*基组水平上对乳清酸异构体的结构进行了全优化,并在同一基组水平上计算了能量.我们的研究结果表明,空间位阻效应、氢键和共轭效应在维持乳清酸空间构型中发挥重要作用.异构体1a在能量上最稳定.同时研究了质子转移和异构化过程,研究显示,质子转移过程的能垒非常高,氢原子顺反异构过程的能垒相对较低,这说明顺反异构过程更容易发生.模拟的红外谱图可以帮助我们区分不同异构体,并确定红外光谱实验中的振动模式.DFT和IR研究使我们充分理解有多种用途的乳清酸的结构.

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