王文文 马骉 厉佳丽 许健
人类乳头瘤病毒(human papillomavirus,HPV)感染被认为是宫颈癌的主要病因之一。全世界70%的宫颈癌病例与高危型HPV16和HPV18的持续感染相关[1]。我国每年宫颈癌患病人数10.97万,尤其在15~44岁年龄段女性中,癌症感染风险高居第3位[2]。宫颈癌筛查已从单独的细胞形态学观察,发展到现在的HPV病毒核酸检测[3]。目前HPV16和HPV18的分子水平检测技术主要是荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,qPCR)和环介导等温扩增技术LAMP(loop-mediated isothermal amplification,LAMP),前者依赖昂贵仪器不适合现场检测,后者受限于多重能力不适合多目标同步检测[4]。HPV基因组中的L1保守区广泛用于病毒的鉴定[5]。检测宫颈上皮细胞样本中病毒的高保守、高特异性片段,有助于判断高危型HPV16和HPV18的感染程度。本研究将重组酶聚合酶扩增(RPA)技术[6]与侧向流免疫层析技术(LFIC)联合[7],使用铕纳米粒子(EuNPs)取代胶体金作为标记物[8],实现HPV16和HPV18病毒核酸同时检测,提供一种快速、简便、敏感、高效的临床早期筛查方法。
1.1 样本采集与核酸提取 选取2019年8月至2020年1月浙江中医药大学附属第一医院采集的女性宫颈分泌物样本248例。样本经过PCR-反向点杂交法[人乳头瘤病毒基因分型(23型)检测试剂盒]筛查后确定HPV病毒感染分型。选取单一感染(n=123),混合感染(n=60)和阴性(n=65)样本,其中HPV16阳性样本29例,HPV18阳性样本26例,保存在-80 ℃。采用裂解法快速提取病毒基因组DNA:取200 μL样本液,与裂解液[800 mM盐酸胍,50 mM Tris-HCl(pH 8.0),0.5% Triton-X100,1% Tween-20,40 μg/mL 蛋白酶K]混匀后,95 ℃孵育10 min。6,000 r/min离心,1 min后,上清液保存在-20℃,用于核酸扩增。
1.2 主要试剂与仪器 羧基修饰的EuNPs[购自和卓生物科技(上海)有限公司)];牛血清白蛋白(BSA)、Triton-X100(购自美国Sigma-Aldrich公司);羊抗鼠二抗、Hi-Flow Plus 180硝酸纤维素膜(300×25 mm)、Ahlstrom玻璃纤维膜(用作样品垫和结合垫)、H21吸水纸(用作吸水垫)与PVC底板(购自浙江迪恩生物科技股份有限公司);nfo RPA恒温扩增试剂盒(购自英国TwistDX公司);Tween-20(购自阿拉丁试剂(上海)有限公司);其他化学试剂均为分析纯(购自上海国药集团化学试剂有限公司)。Mini-6KS便携式低速离心机(杭州奥盛仪器有限公司)用于HPV病毒基因组的快速提取;T2DDA台式点膜喷金一体机、C6切条机(杭州韩感科技有限公司)用于制备荧光免疫层析试纸条;365 nm便携式紫外灯(北京海天有诚科技有限公司)用于观察荧光试纸条视觉检测结果分析;FICS2011-B14荧光读数仪(苏州海尔曼精密仪器有限公司)用于EuNPs荧光试纸条的扫描分析;F-4500荧光光谱仪(日本东京Hitachi公司)用于EuNPs纳米颗粒及其标记单克隆抗体探针的表征分析。
1.3 引物和探针设计 针对HPV16和HPV18基因保守区域(L1),使用Primer 5软件自行设计特异性引物和探针。选取序列的GenBank登录号分别为HPV16(FJ797058.1)和HPV18(MH057744.1)。采用地高辛(Digoxin)标记下游引物,生物素(Biotin)和羧基荧光素(FAM)分别标记nfo探针。引物和探针见表1。
表1 HPV16和HPV18特异性RPA引物探针序列
1.4 荧光免疫层析试纸条的制备 用800 μL MES缓冲液(0.05 mol/L,pH 8.2)溶解2 mg羧基修饰的EuNPs。加入30 μL的EDC孵育30 min后,离心(12,000 r/min,25 min)去除多余活化剂。加入10 μg抗地高辛单克隆抗体(anti-digoxin mAb)搅拌偶联(25℃,2 h),离心(12,000 r/mim,2 min)去除多余抗体。重悬沉淀后的EuNPs-mAb保存在4℃备用。免疫层析试纸条由样品垫,结合垫,硝酸纤维素膜,吸水纸和PVC底板组成。NC膜上的两条测试线和控制线间隔3 mm,分别固定1.2 mg/mL抗FAM抗体(anti-FAM antibody,T1线)、0.8 mg/mL抗生物素抗体(anti-biotin antibody,T2线)和1.5 mg/mL羊抗鼠二抗(IgG,C线)。EuNPs-mAb稀释20倍,以1 μL/cm的喷涂量均匀分布在结合垫上。NC膜和结合垫置于37℃恒温干燥箱2 h。试纸条组装后室温干燥,密封保存备用。
1.5 双重EuNPs-LFIC-RPA检测 RPA反应体系体积为50 μL,包含2x反应缓冲液、10 μmol/L引物、2.5 μmol/L探针、14 μmol/L醋酸镁、反应酶和模板DNA。反应液37℃孵育10 min,用Tris buffer(pH 8.0)稀释50倍后滴入荧光免疫层析试纸条。静置5 min后,在365 nm紫外灯下观察结果。随后利用FIC-S2011-B14荧光读数仪扫描EuNPs荧光试纸条,进行定量分析。
1.6 参数优化 为达到最优的检测效果,对引物探针浓度比例、核酸扩增时间、抗体标记量、试纸条包被浓度、免疫孵育时间、EuNPs-mAb偶联物与单克隆抗体浓度等进行优化。引物探针浓度比例分别设置为1∶1、1∶2、1∶4、1∶8;核酸扩增时间分别设置为5、10、15、20 min;抗体标记浓度分别设置为2.5、5、10、20、40 μg/mL;T线包被抗体浓度依次为:0.4、0.6、0.8、1.0、1.2 mg/mL,C线包被抗体浓度依次为:0.5、1.0、1.5、2.0、2.5 mg/mL;试纸条孵育时间分别设置为1、5、10、20 min;T线抗体包被抗体浓度依次为:0.4、0.6、0.8、1.0、1.2 mg/mL,EuNPs-mAb偶联物浓度依次为:2、4、6、8、10 ng/mL。每个参数条件测试3次记录数据进行分析。
1.7 样品分析 通过10倍浓度梯度稀释提取的HPV16和HPV18病毒DNA进行敏感度实验。以浓度对数值为X轴,以相对荧光强度(T/C值)为Y轴绘制标准曲线。应用其他亚型样本提取DNA进行特异性测试,观察是否出现交叉反应。采用EuNPs-LFIC-RPA方法检测样本,结果与PCR-反向点杂交法对比。
1.8 统计学方法 计数资料以n(%)表示,采用卡方检验。P<0.05为差异有统计学意义。
2.1 荧光免疫层析试纸条结果判读 RPA上游引物与标记了地高辛的下游引物配对,同时加入与下游引物重叠区同源且标记荧光素的nfo探针进行反应。利用nfo酶识别探针中四氢呋喃(THF)位置的特点,通过Bsu聚合酶延伸,生成FAM或Biotin标记的双链DNA扩增产物。RPA扩增产物一端被EuNPs-mAb捕获,另一端被标记对应基团的特异性抗体捕获并固定在T线处。固定在C线上的pAb作为分析对照,捕获EuNPs-mAb。在365 nm激发光下获得荧光信号,借助读数仪获取T线与C线的荧光信号强度比。若T1线或T2线检测出荧光值,分别表明HPV16和HPV18为阳性;若C线无荧光值,证明试纸条失效。
2.2 参数优化 通过优化实验确定,引物探针浓度比例为1∶1时,HPV16和HPV18扩增效果最好。RPA反应进行到10 min后,相对荧光强度(T/C值)趋于平稳。制备荧光探针(EuNPs-mAb)的抗体标记量为5 μg/mL时,获得最高的测试荧光值。T线包被抗体浓度为0.8 mg/mL,C线包被抗体浓度为1.5 mg/mL,EuNPs-mAb偶联物浓度为8 ng/mL时,T/C值最高。试纸条孵育5 min即可达到理想的读数状态。
2.3 敏感度和特异性评估 敏感度实验结果显示,EuNPs-LFIC-RPA可以检测到100 ng/μL水平的HPV病毒。应用最小二乘法拟合,以相应病毒浓度对数值为横坐标,相对荧光强度(T/C值)为纵坐标,得到线性回归方程分别为HPV16:y=0.2653x-0.0108,R2=0.9926;HPV18:y=0.2852x-0.177,R2=0.9911。相关系数表明在106~100 ng/μL范围内线性较好。特异性实验结果中,HPV其他亚型扩增后,并未测得荧光值,只有HPV16和HPV18扩增产物扫描得到较高的荧光值。
2.4 实际样本检测分析 采用EuNPs-LFIC-RPA方法对经过PCR-反向点杂交法鉴定的248例临床样本检测,HPV16、HPV18和HPV16/18的阳性检出率分别为12.50%、11.29%和19.35%,均略高于试剂盒检测结果(见表2)。EuNPs-LFIC-RPA方法检测HPV16的阳性预测值和阴性预测值分别为90.32%和99.54%;检测HPV18的阳性预测值和阴性预测值分别为85.71%和99.09%;同时检测HPV16和HPV18的阳性预测值和阴性预测值分别为100%和98.50%。
表2 EuNPs-LFIC-RPA方法和PCR-反向点杂交法检测临床样本的结果比较
HPV是DNA病毒,其主要结构蛋白为HPVLl蛋白,HPVLl蛋白和L2蛋白构成HPV衣壳蛋白,HPV衣壳蛋白包裹HPV形成新的病毒颗粒,高危型HPVLl蛋白为变异体,和L2蛋白不能组装成HPV病毒颗粒,从而使DNA病毒在宿主细胞内大量复制并整合到宿主细胞DNA中,引起感染HPV的细胞无限增殖,导致细胞发生恶性转化[9]。HPV有多种亚型,引起宫颈病变的有30多种亚型,HPV16和HPV18是最常见的高危型HPV感染亚型,高危型HPV感染后更易导致感染细胞发生永生化,使病毒清除时间延长,从而引起HPV感染,不仅引起外生殖器疣,还可引起宫颈上皮内瘤变、宫颈癌等[10],而早期宫颈癌患者的预后相对较好。因此,针对性开展HPV基因检测及基因分型筛查,能及时发现宫颈癌高危人群,且可对HPV阳性群体风险进行分级评价,有利于对病情准确评估,也可减少对患者过度的有创诊断。
早期宫颈细胞学检查是做好癌前病变筛查的主要方法,有助于降低宫颈癌罹患风险并及早预防治疗[11]。针对高危型HPV病毒的分子水平检测技术,除了作为细胞学检查的辅助方法,越来越多地应用到临床检测领域[12-13]。本研究建立的EuNPs-LFIC-RPA检测方法,采用RPA技术在37℃等温条件下具有快速扩增未经纯化微量核酸样品的独特优势,加上免疫层析技术非常适合现场诊断的特点,通过检测荧光信号强度定量分析病毒载量,实现对宫颈细胞样本内高危亚型HPV16和HPV18病毒的联合快速筛查。核酸扩增过程中可能会出现干扰结果,假阴性结果可能误导诊断且丧失最佳治疗时机,假阳性结果可能带来频繁复查和心理负担。使用荧光纳米材料EuNPs取代传统胶体金,不仅提高检测敏感度,还减少假阴性结果的出现。核酸扩增体系加入的nfo探针,不仅可以更好地与免疫层析试纸条衔接,更增加识别目标片段的特异性,降低假阳性检测风险。