作为合成生物学的核心技术之一,大规模的DNA设计和合成技术赋予人们改造细胞功能甚至创造人工生命的能力,有助于进一步推动生命科学及其相关领域的发展。
随着合成生物学领域应用的不断拓展,DNA合成技术需要满足来自应用端的众多需求,其中包括合成更长的DNA序列。当前的DNA合成方法普遍局限于制备相对较短的寡核苷酸链,然后通过将许多短链“缝合”起来的方式获得更长序列。“随着序列变长,制造所需的时间、精力和成本将大幅增加。”英国DNA合成技术公司Evonetix的产品副总裁迈克尔·丹尼斯博士对此表示。
自2015年成立以来,Evonetix致力于将半导体技术引入DNA合成技术领域,以此打造其专有的大规模、高保真的DNA合成技术平台。凭借着该技术的不断推进,Evonetix自成立至今已完成总计4400万美元的融资。
2022年上半年,Evonetix完成其台式DNA合成平台开发的重要里程碑。结果表明,该公司基于半导体阵列的DNA合成平台能够与化学和酶促DNA合成法兼容,从而实现DNA长序列的快速、准确的构建方法。
据悉,Evonetix的专有工艺在于利用新型硅芯片,在硅芯片表面上具有数千个独立的热控反应位点。每个合成位点的温度均可以单独控制,因此该方法能够在特定的点位通过控制温度进而控制DNA的正确合成。并且,该方法可在单芯片上精确合成数千个序列,满足复杂文库和长链DNA的组装需求。
“半导体技術本质上就是硅芯片。我们已经开发出一种芯片,可以在其表面控制DNA的合成。”Evonetix公司介绍,基于硅芯片的合成方式能够支持数千位点同时进行DNA合成,在此之后,依靠先进的电泳工艺将合成的寡核苷酸单独释放,并从一个合成位点传输到下一个合成位点。传输的寡核苷酸将在下一个位点被电场捕获,并且与互补链完成组合。在此之后,该位点的温度将升高并且熔解其中不正确的序列。整个合成、组装和纠错过程可以在数小时内完成,而现有的合成技术仍需要数天或数周才能够完成。
据该公司声称,目前典型的酶促DNA合成方法依赖于更传统的平台。现有的方法很难增加并行制备的DNA序列数量,而通过热控制的方式则能够摆脱传统方法的限制,让用户能够在自己的实验室中通过单一平台完成大规模的基因合成、CRISPR筛选和蛋白质工程等工作。
“相关合成生物学的发展需要更好的、不易出错的合成方法,或者是建立更加准确的序列组装和错误消除步骤,以便更快、更简单地制备长序列,”丹尼斯认为,“而基于现有的酶促合成法,技术平台很难针对序列组装和纠错展开优化。因此,我们需要研究DNA的物理特性以寻找组装更长且准确的DNA的新方法。”
该公司于近期已宣布启动其半导体合成DNA的早期访问计划。在此之后,其将进一步扩大其半导体芯片的并行合成能力,以实现该专有技术在未来的全面商业化。