张冉 石长林 苟小军 何鸿晏
作者单位:四川省巴中市中心医院胸心外科(四川省巴中市636000)
肺癌是严重威胁人类健康的恶性肿瘤之一,其发病率和死亡率呈现逐年上升趋势[1]。肺癌是由肺部上皮细胞的异常增殖导致,但其具体机制尚未阐明,尽管手术、放化疗等治疗手段有了较为明显的突破,但晚期肺癌患者的5年生存率仍未明显改善。有研究[2]显示,导致肺癌患者治疗失败的主要原因是淋巴、胃等器官的恶性转移。因此,深入揭示肺癌的发病、发展以及转移的分子机制,寻找肿瘤转移的分子靶点,有助于临床上开展个体化的靶向治疗,提高晚期肺癌患者的生存[3]。
微小RNA(microRNA,miRNA)是包含19~22个核苷酸的单链非编码的生物小分子。有研究显示,miRNA 在癌细胞的恶性增殖与转移过程发挥促癌或抑癌作用[4]。miR-302c 属于miR-302 家族中的一员,在肝癌、胶质瘤、胃癌等恶性肿瘤中发挥抑癌作用。Ye 等[5]研究报道miR-302c 在肺癌中表达异常,与患者的不良预后关系密切。但并未详细探讨miR-302c在肺癌中的作用机制。转录因子环磷酸腺苷(cAMP)反应元件结合蛋白-1(cAMP-responsive elementbinding protein-1,CREB-1)是细胞内重要的转录调控基因[6]。Jiang 等[7]研究表明,作为机体内重要的原癌基因,CREB-1 在白血病、肾癌、乳腺癌等肿瘤组织中的表达高于正常组织,且在肿瘤细胞的恶性转移中发挥重要作用。但是有关CREB-1 在肺癌中的报道较少。本研究通过对在线数据库以及肺癌细胞株A549的研究,探讨miR-302c 和CREB-1 在肺癌中的作用机制,以期为临床上肺癌的个体化治疗提供潜在靶点。
1.1.1 细胞 永生化人肺支气管上皮细胞BEAS-2B、人肺癌A549 细胞、人胚胎肾细胞293T 均购自美国ATCC,miR-302c-mimic 和miR-302c-mimic-NC 由生工生物工程(上海)股份有限公司提供。
1.1.2 试剂与仪器 鼠抗甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)单克隆抗体购自美国Jackson 公司;CCK-8试剂盒、Western blot 试剂盒均购自美国Invitrogen公司;Transwell 小室购自美国Sigma-Aldrich 公司;苏净Airtech 超净工作台购自美国Thermo Fisher 公司;BD-56 集成式恒温恒湿细胞培养箱购自德国BINDER 公司;IXplore Standard 倒置显微镜购自日本Olympus 公司;Multiskan Sky 全波长酶标仪购自美国Thermo Fisher 公司;Hitachi H-600 透射电子显微镜购自日本日立公司。
1.1.3 在线生物数据库信息 收集在线生物基因数据库GEO 中GSE19945 和GSE136043 两组肺癌数据集信息。GSE19945 为手术切除的肺癌组织样本的miRNA 芯片数据,包括8 例正常肺组织、4 例肺腺癌、11例大细胞神经内分泌癌、35 例小细胞肺癌、5例鳞状细胞癌。GSE136043 为15 例肺腺癌组织、25例淋巴结转移组织以及5 例正常组织的miRNA 芯片数据。Kmplot 网站(https://kmplot.com/analysis/)用于评估数据库中的肺癌样本中的生存率,通过UALCAN数据库分析TCGA 数据库中获得差异表达的基因,获取靶标信息[8]。
通过Human Protein Atlas 数据库(https://www.proteinatlas.org/)分析CREB1 在正常人体不同组织中的分布情况,以及CREB1 在正常肺组织以及肺癌中的表达情况[9]。
1.2.1 定量反转录-聚合酶链反应(qRT-PCR)检测BEAS-2B 细胞和A549 细胞中miR-302c 和CREB1的mRNA 的表达 使用Trizol 试剂盒分别提取细胞总RNA,根据Prime Scrip TM 试剂要求逆转录生成反义cDNA,以此为模板采用PCR 仪进行扩增[10](95℃,5 s,单次循环后;95℃,5 s;60℃,60 s,采集荧光信号40 个循环);各目的基因mRNA 的相对表达量采用2–△△CT表示。使用序列如下:
内参U6 上游引物为 5’-GCCAAGGCTGTGGGC AAGGT-3’,下游引物为 5’-TCTCCAGGCGGCACG TCAGA-3’;miR-302c 上游引物为 5’-AGCCTTGCAG AAAAGAGAGC-3’,下游引物为5’-AGCTAGTTGTC ATCCTGCT-3’;CREB1 mRNA 上游引物为 5’-AGC TAGTTGTCATCCTGCT-3’,下游引物为5’-AGGAAG TCTTTCAGTGATGT-3’。
1.2.2 双荧光素酶实验 使用生物信息学数据库miRactDB(https://ccsm.uth.edu/miRactDB)判断miR-302c 和CREB1 存在特异性结合位点。推测CREB1可能为miR-302c 的靶基因。293T 细胞常规培养,依次构建突变型pGL3-CREB1-3-UTR-MUT 和野生型pGL3-CREB1-3-UTR-WT 质粒,将100 ng 质粒通过Lipofectamine2000分别共转染至293T 细胞,按试剂盒要求培养细胞,48 h 后以PROMEGA 双荧光素酶系统检测萤火虫荧光素酶活性/海肾荧光素酶的活性比值[11]。
1.2.3 细胞培养以及分组处理[12]将人A5491 接种于含有灭活的10%胎牛血清的DMEM 培养基中,37℃,5%CO2培养。将细胞分为正常组、对照组和实验组,正常组不加任何药物,常规培养;对照组将细胞转染150 nmol/L 的miR-302c-mimic-NC 后常规培养;实验组将细胞转染150 nmol/L 的miR-302c-mimic 后常规培养。
1.2.4 观察细胞超微结构改变 调整细胞的浓度至1×106个/mL 接种于6 孔板上,分组处理同上,将细胞在37℃,5%CO2细胞培养箱中培养48 h 后,固定,包埋,制成超薄切片,醋酸双氧铀-枸橼酸铅双重染色[13],Hitachi H-600 透射电子显微镜下观察各组细胞的超微结构改变。
1.2.5 Transwell 实验 在Transwell 小室平板平铺一层Matrigel 基质胶(约50 μL)并将以无血清培养基中的各组单细胞悬液加至上室(侵袭实验中铺Matrigel 胶,迁移实验中不铺胶),在小室下室平铺含有灭活的10%胎牛血清的DMEM 培养基,置入37℃,5%CO2培养箱常规培养24 h,清洗后,甲醛固定;染色后,显微镜下观察并对穿过膜的细胞进行计数[14]。
1.2.6 小管形成实验 在96 孔培养板上平铺一层新鲜Matrigel 溶胶,迅速转移进无菌培养箱(37℃),待Matrigel 溶胶凝固后,将HUMCEs 细胞以1×104个/mL接种在96 孔板中,分组同上,分别加入含A549 细胞的培养上清液,继续培养48 h,倒置光学显微镜下观察HUMCEs 的血管生成情况并拍照记录[15]。
1.2.7 Western blot 检测 胰酶消化细胞,离心稀释成细胞悬液,分组处理同上,按1×105个/孔接种至6孔板中培养24 h,加入蛋白裂解液,常规提取总蛋白,测定浓度,置于沸水中变性,进行电泳分离,转模,清洗后,在封闭液中孵育30 min,加入一抗(1∶500),孵育过夜,加入二抗(1∶1 000),二氨基联苯胺(DAB)显色[16],以GAPDH 作为内参,Image J 图像分析软件统计分析各条带的灰度值。
采用SPSS 19.0 软件进行统计学分析。采用Graphpad5.01 绘制统计图。两组间比较采用t检验,多组间比较采用单因素方差分析。以P<0.05 为差异具有统计学意义。
针对数据集GSE19945 中的标本进行分析,结果显示miR-302c 在肺癌中的表达最低(图1);针对数据集GSE136043 的标本进行分析,结果显示miR-302c在出现淋巴结转移的患者中的表达水平降低(图2)。两数据集经Kmplot 分析显示,miR-302c 高表达的肺癌患者的生存期为(77.52±8.45)个月,明显高于miR-302c 低表达的肺癌患者(45.92±6.43)个月(图3),提示miR-302c 在肺癌中的表达与患者的预后以及恶性转移关系密切。
图1 在GSE19945 样本中表达差异明显的miRNA 的热图
图2 miR-302c 在GSE136043 样本中表达差异明显的miRNA 的热图
图3 miR-302c 不同表达水平患者的生存期
Human Protein Atlas 数据库显示,CREB1 在脑、鼻咽、胃、肝、肾、支气管、肺等组织和器官中广泛存在,数据内的组织样本经免疫组织化学法检测后,与正常组织相比,肺癌组织中CREB1 的表达明显升高(图4)。
图4 CREB1 在人体中以及肺脏和肺癌组织中的表达
qRT-PCR 结果显示,与正常BEAS-2B 细胞相比,A549 细胞中miR-302c 的表达明显下降,CREB1 的mRNA 表达明显升高,差异均具有统计学意义(均P<0.05,图5)。
图5 细胞系中miR-302c 和CREB1 的mRNA 表达
上述研究结果提示,在肺癌中miR-302c 和CREB1 基因的表达具有一定的相关性;在线生物信息数据库miRactDB 显示miR-302c 和CREB1 基因存在特异性结合位点。双荧光素酶报告基因结果显示,转染miR-302c 后,野生型CREB1 的荧光素酶活性被抑制(P<0.05),突变型CREB1 荧光素酶活性无明显变化(P>0.05),提示miR-302c 与CREB1 具有靶向调控关系(表1,图6)。
图6 双荧光素酶实验
表1 miR-302c 和CREB1 基因的结合位点
电镜观察结果显示,正常组细胞结构完整,清晰可辨,细胞质内内容物数量丰富,线粒体、内质网、核糖体以及高尔基体等细胞器结构完整,线粒体嵴结构清晰可辨,核质界限清晰;对照组细胞的细胞质界限清晰,线粒体嵴结构正常,核仁性状稳定;实验组细胞的细胞质界限不清,胞膜缺失严重,线粒体呈现空泡样变性,嵴结构数量明显减少,染色质固缩、聚集明显,核膜凹陷缺失明显,细胞超微结构损伤严重(图7)。
图7 各组细胞超微结构的改变(×8 000)
Transwell 小室结果显示,与正常组相比,实验组迁移和侵袭的细胞数量明显下降,差异均具有统计学意义(均P<0.05);正常组与对照组相比,差异无统计学意义(P>0.05,图8,9)。
图8 Transwell 小室迁移实验
小管形成实验结果显示,与正常组相比,实验组细胞小管生成的数量明显下降(P<0.05);正常组与对照组相比,差异无统计意义(P>0.05,图10)。
图10 小管形成实验
从蛋白质数据库中研究发现,CREB1 和P53 存在调控位点(图11),为进一步探索CREB1 基因的作用通路,采用Western blot 检测各组细胞中P53、P21的磷酸化水平。结果显示,与正常组相比,实验组细胞中CREB1 的表达明显下降,p-P53、p-P21 的表达明显升高,差异均具有统计学意义(均P<0.05);正常组与对照组相比,差异无统计学意义(P>0.05,图12)。
图9 Transwell 小室侵袭实验
图11 CREB1 和P53 存在调控位点
图12 各组细胞中CREB1、p-P53、p-P21 的表达
作为一种常见的呼吸系统疾病,肺癌的发病率和死亡率居所有恶性肿瘤前列。目前,临床上主要以放疗、化疗、手术以及免疫治疗为主,但在提高晚期肺癌患者的5年生存率方面,现有的治疗手段均面临严峻的挑战[17]。大量的临床数据显示[18],肺癌患者死亡的主要原因是肿瘤细胞的靶器官侵袭以及恶性转移。因此,研究肺癌细胞的侵袭与转移的分子机制,寻找有效可靠的治疗靶点,为患者寻找安全的分子靶向治疗方案,成为该领域的研究热点。
研究显示[19],作为体内重要的非编码基因,miRNAs 参与调控肿瘤细胞的增殖、分化、凋亡、血管新生、化疗耐药以及侵袭与转移等生物学过程。Guo等[20]研究证实miR-151a-5p、miR-23b 等多种miRNA在肺癌中表达异常,并影响肿瘤细胞的增殖与侵袭等。作为miR-302 家族中的一员,miR-302c 在肝癌、子宫内膜癌等多种肿瘤中发挥抑癌作用,并引起广泛关注[21]。Ma 等[22]研究表明miR-302c 靶向调控转录因子激活蛋白-4(AP-4)基因的表达,抑制大肠癌细胞的上皮间质转化以及癌细胞转移。Wang 等[23]研究证实miR-302c 抑制细胞周期蛋白cyclin O(CCNO)基因的表达从而诱导宫颈鳞状细胞癌的凋亡。本研究中通过对在线生物信息数据集GSE1994 和GSE 136043 研究发现,miR-302c 在肺癌中存在低表达的现象,并且miR-302c 在肺癌中的表达与患者的预后以及恶性转移关系密切;细胞实验显示,过表达miR-302c 后,A549 细胞超微结构损伤严重,细胞的侵袭与转移能力以及血管新生能力明显下降。
有研究[24]显示,肿瘤细胞的侵袭与转移是肺癌发展中的重要的环节,肿瘤血管新生是癌细胞进行侵袭和转移的主要途径。Ramadan 等[25]研究指出,众多信号通路与靶基因参与或调控肿瘤细胞的侵袭与转移过程。CREB1 是细胞内功能明确的促癌基因。Hu 等[26]研究显示,在乳腺癌中抑制CREB1 的表达能明显抑制乳腺癌细胞的体内生长与靶器官转移。Cheng 等[27]研究显示CREB1 高表达的结肠癌患者的预后不佳,并且发生多处靶器官的转移。本研究通过对Human Protein Atlas 数据库的数据进行研究显示,CREB1 在肺癌中处于高表达的状态。qRT-PCR 结果显示,与正常肺组织细胞相比,在A549 细胞中miR-302c 的表达明显下降,CREB1 的mRNA 表达明显升高,验证了数据库的研究结果。双荧光素酶结果显示miR-302c 能靶向调控CREB1 的表达。
揭示靶基因的作用位点,能更深入地阐明肿瘤转移与侵袭的分子机制。P53 信号是细胞内重要的抑癌通路,Lacroix 等[28]研究显示该通路中的P53、P21 经磷酸化后具有生物活性,并广泛影响肿瘤细胞的代谢、增殖、细胞周期以及转移与侵袭等生理病理过程。Vennin 等[29]研究指出P53 信号通过调控下游相关基因的转录,推动P21 等相关抑癌分子的磷酸化,抑制胰腺癌细胞的上皮间质转化过程。Wang 等[30]研究显示,在前列腺癌中,CREB1 能调控P53 的活性,抑制肿瘤细胞的血管生成。本研究结果显示,P53 与靶基因CREB1 存在特异性结合位点。Western blot 结果显示实验组细胞CREB1 的表达明显下降,p-P53、p-P21 的表达明显升高。
综合上述,miR-302c 在肺癌组织表达降低,过表达miR-302c 后能明显抑制肺癌细胞的侵袭与转移,这可能与抑制靶基因CREB1 的表达以及P53 信号激活有关。但miR-302c 在肺癌临床治疗的价值尚需更深入的研究。