常染色体D2S1338基因座被检父稀有等位基因分析

万静 邓小娟 唐泽英

常染色体短串联重复序列STR基因座，是目前广泛运用于亲子鉴定的遗传标记；而在DNA亲子鉴定中，随着鉴定案件的增多，发现稀有等位基因的机率也在增大，这给亲子鉴定结果分析带来困扰。

一、材料与方法

某委托人为明确孩子身份，特委托西南政法大学司法鉴定中心对某被检父、被检子进行单亲亲子鉴定。经现场提取被鉴定人血样2份，应用北京基点认知技术有限公司GoldeneyeTMDNA身份鉴定系统20A（免提取）在9700扩增仪上进行复合扩增，扩增产物在ABI3500型遗传分析仪上进行DNA电泳，得结果后再经GeneMapperID-X软件判读，得到各等位基因的基因型。检验结果，被检父在D2S1338基因座为杂合子OL/18；增加宁波海尔思基因科技有限公司STRtyper-21G_PLUS复合扩增系统进行复核检测，其结果仍然相同（详见图1、图2）。

图1 GoldeneyeTMDNA身份鉴定系统20A被检父血样

图2 STRtyper-21G_PLUS被检父血样

图3 GoldeneyeTMDNA身份鉴定系统20A Ladder

二、检验结果

应用GoldeneyeTMDNA身份鉴定系统20A复合扩增，共检出19个常染色体STR基因座且均符合遗传规律,被检父D2S1338基因座发现OL峰。OL峰又称“off-ladder峰”，一般位于与Ladder上相应等位基因0.5bp范围之外，可分析其前后已自动化正确命名的片段相对与Ladder等位基因的漂移偏离情况，对OL峰进行漂移校正，人工修正命名[1]。

依据相关文献[2]鉴定标准，对OL峰进行分析计算。被检父D2S1338基因座OL峰显示size为203.20（详见图1）；为准确判断OL峰的等位基因，依据检材样本等位基因18与同时电泳Ladder等位基因18的bp值分别为223.84（详见图1）和223.82（详见图3），参照文献[3]对OL峰bp值计算，得：223.84-223.82=0.02，表明样本等位基因18相对于Ladder漂移了0.02bp；OL峰bp值扣除漂移，即被Ladder等位基因18的bp值相减，得223.82-（203.20-0.02）=20.64 bp，OL峰实际长度比Ladder等位基因18小20.64bp。由于D2S1338基因座是位于人类二号染色体上的短串联重复序列，其核心序列为(TGCC/TTCC）[4],重复单位为4个碱基对，故该被检父OL峰分型比Ladder等位基因18少5个重复单位，因而该被检父D2S1338基因座OL峰可判断为稀有等位基因13。

三、分析与讨论

笔者查阅了相关文献，在其中袁丽等、李莉等、曹林枝等、刘长晖等、郝宏蕾等、肖莉等、赵芳芳等、霍振义等、于嘉源等、袁亮等、王晓勋等、白雪等、张旋等、刘胜等、朱巍等的16篇报道中，均未发现基因座D2S1338等位基因13。[5]

而徐志成等调研，在11250个日常检案无关个体中发现1例[6]；李天光等调研，在黑龙江绥化地区汉族2627例无关个体中该稀有等位基因的基因频率为0.0002[7]；张柠等调研，在云南苗族人群747例无关个体中，基因频率为0.0013[8]，可计算出该群体中仅有1例检出该等位基因：这三篇文献所涉人群中检出该等位基因的例数和基因频率都极低（详见下表）。

林子清等的调研，在6788个新疆维吾尔族无关个体中，发现13例[9]；冯春梅等的调研，在牡丹江市朝鲜族500例无关个体中基因频率为0.0210[10]；刘新胜等佛山汉族570例无关个体中，基因频率为0.054386[11]。能看出来基因座D2S1338等位基因13分布相对集中（详见下表）。

分析结果显示，基因座D2S1338等位基因13虽属稀有基因，但在基因频率调查中，显示出其相对集中地分布在新疆维吾尔族、牡丹江朝鲜族、佛山汉族中，具有明显的地区和人群特异性，有利于地域、种族的确认；特别是在刑事案件法医物证鉴定中，其对个体识别与嫌疑人的认定具有重要价值和意义。

目前，基因座D2S1338是亲缘关系鉴定中常用的STR基因座之一，也是常规亲缘关系鉴定规范所推荐的基因座。稀有等位基因的存在，对DNA检验的应用会产生一定的影响；同时,其对提高基因座的个体识别能力、非父排除率有重要的应用价值。但是，若由其产生误判，会影响数据库的应用及各实验室间的数据交流，所以建议在遇到稀有等位基因时,最好采用不同试剂系统进行复核检验。本案被检父的稀有等位基因虽对鉴定结果分析影响不大，但随着案件量的不断增加，鉴定风险会逐步加大，因此在司法鉴定实务中遇此类案件应准确把握，以避免发生错误判断。

表 国内部分地区STR基因座D2S1338等位基因13频率统计