渤海虾酱中益消细菌的分离和鉴定

2020-04-03 04:48陈笑语张力元纪海玉刘安军
中国食品学报 2020年3期
关键词:吲哚芽孢测序

陈笑语 张力元 纪海玉 刘安军

(天津科技大学食品工程与生物技术学院 天津300457)

渤海虾酱酱色鲜艳,酱质细腻,组织均匀,气味鲜香、口感好,酱香味和虾鲜味浓郁,含有优质的蛋白质、钙、铁、硒、维生素A 和脂肪酸等营养元素。虾酱中还有虾青素和甲壳素两个重要的因子,其中被称为超等维生素的虾青素,具有维生素A、维生素E 和β 胡萝卜素,可以改善免疫力,阻挡紫外线的伤害,提高视力能力,还可避免不饱和脂肪酸被氧化。甲壳素具有降血压、降低胆固醇以及抗菌等功能。

近年来研究发现,虾酱的风味和保健活性与其中的微生物菌群密切相关。孙业盈等[1]通过研究蜢子虾酱,分离鉴定出一株嗜盐菌,经鉴定确定为盐脱氮枝芽孢杆菌,其属于枝芽孢杆菌属。连鑫等[2]对虾酱中呈味优势菌种进行挑选、分离鉴定,发现一株产香酵母,为季氏毕赤氏酵母,分析结果表明:菌株耐受高盐环境,对菌株进一步纯化,提高耐盐性,用于低盐虾酱的发酵,提高虾酱发酵香气,控制产品质量。连鑫等[3]从虾酱中分离出一株产蛋白酶霉菌,确定为黑曲霉,通过研究其在虾酱生产中各种因素对于风味变化的影响,对其产蛋白霉菌进行改造,为传统发酵产品的工业化生产提供优质的菌株。

传统虾酱中由于含有多种多样的微生物菌群,因此形成了比较稳定的微生物系统[4],风味良好,营养丰富,具有多种保健功能。鉴于目前对虾酱的研究主要集中在风味物质的相关菌群方面,而对其益消细菌鲜有研究报道。本研究用营养琼脂培养基对渤海虾酱中的细菌进行分离,采用PCR 测序技术对其进行鉴定,并研究该菌株的耐热性,为虾酱在食品加工过程中的合理利用提供一定的理论依据。

1 材料与方法

1.1 试验材料与试剂

渤海虾酱:黄骅市王曼老李水产品有限公司。

培养基:PDA 培养基、营养琼脂培养基、高氏一号培养基、马铃薯蔗糖MRS 培养基、营养肉汤培养基,购买于北京路桥技术有限责任公司。

试剂:无水乙醇,天津市科密欧化学试剂有限公司;27F 引物和1492R 引物,北京鼎国盛世有限公司。

1.2 仪器与设备

电泳仪,美国Thermo 公司;冷冻离心机,美国Thermo 公司;电热恒温培养箱,北京中兴伟业仪器有限公司;真空冷冻干燥机,北京博医康实验仪器有限公司。

1.3 试验方法

1.3.1 传统虾酱生产工艺 工艺流程:原料去杂洗涤→装入瓷缸→加入盐度为25%~30%的盐水→拌匀→控制温度25~30 ℃发酵→30 d 后油、酱分离→包装巴氏灭菌。虾酱中盐度一般控制到27%左右为佳,盐分过高过低都会直接影响微生物的生存以及虾酱的口感。

1.3.2 细菌的分离和纯化 在无菌条件下,取虾酱样品1 g 于锥形瓶中,注入9 mL 蒸馏水振荡摇匀(8 000 r/min,5 min),按10-1,10-2,10-3 梯度稀释并涂布于营养琼脂培养基中,37 ℃恒温培养48 h。然后用接种环挑取分离得到的细菌菌株,接种到营养琼脂培养基上培养进行纯化,37 ℃恒温培养48 h。

1.3.3 细菌的形态学鉴定 用接种环挑取分离纯化后的细菌菌株,接种到营养肉汤培养基上,37℃恒温培养48 h,观察并记录培养皿中菌落的形态特点,观察菌落形态并计数,然后通过革兰氏染色,光学显微镜观察其形态。

1.3.4 细菌的生理生化试验 根据《The Yeasts:A Taxonomic Study》对分离菌株进行糖、醇发酵试验、V-P 试验、甲基红(Methyl Red)试验、靛基质吲哚试验。

1)糖、醇发酵试验:将分离纯化后的菌株做糖发酵试验,检验菌株对各种糖醇类碳源的利用情况,将菌株制备成菌悬液,将装有培养液的杜氏小管倒置放入试管中,置于37 ℃恒温箱中培养5 d,如果颜色为紫色无气泡,不产酸不产气为阴性;如果颜色为黄色无气泡,产酸不产气为阳性;如果颜色为黄色有气泡,产酸产气为0。测定的糖类(醇、糖苷)包括:葡萄糖、蔗糖、甘露糖、乳糖(1.5%)、半乳糖(1.5%)、D-山梨醇、果糖、阿拉伯糖、麦芽糖、纤维二糖、木糖、水杨苷等[5-7]。

2)乙酰甲基甲醇V-P 试验:将分离纯化后的菌株做V-P 试验,将试验菌接种于上述培养基,于36 ℃±1 ℃培养4 d、培养液2.5 mL,先加入a 萘酚 (2-na-phthol)纯酒精溶液0.6 mL,再加40%氢氧化钾水溶液0.2 mL,摇动2~5 min,若出现红色,可判定为阳性细菌,若无红色出现,静置于36 ℃±1 ℃恒温箱,如2 h 内仍不显现红色,可判定为阴性细菌。

3)甲基红(Methyl Red)试验:将分离纯化后的菌株做甲基红试验,挑取新的待试纯培养物少许,接种于通用培养基,30 ℃培养3~5 d,从第2 天起,每日取培养液1 mL,加甲基红指示剂1~2 滴,阳性呈鲜红色,弱阳性呈淡红色,阴性为黄色。至发现阳性或至第5 天仍为阳性,即可判定结果。

4)靛基质吲哚试验 :将分离纯化后的菌株做靛基质吲哚试验,取装有蛋白胨水培养液的试管5 支,分别标记大肠杆菌、产气肠杆菌、普通变形菌、枯草芽孢杆菌和空白对照。以无菌操作分别接种少量菌苔到以上相应试管中,第5 管作空白对照不接种,置37 ℃恒温箱中培养24~48 h。在培养液中加入乙醚1~2 mL,经充分振荡使吲哚萃取至乙醚中,静置片刻后乙醚层浮于培养液的上面,此时沿管壁缓慢加入5~10 滴吲哚试剂,如有吲哚存在,乙醚层呈现玫瑰红色,此为吲哚试验阳性反应,否则为阴性反应,阳性用“+”、阴性用“-”表示。

1.3.5 16 SrDNA 序列分析及系统发育树构建方法采用煮沸法提取目的基因,参照细菌的16sDNA序列分析,选取细菌1492R 与27F 通用引物(见表1),进行PCR 反应。选择单菌落作为目的模板,反应条件:变性94 ℃,1 min,退火58 ℃,45 s,延伸72 ℃,45 s,一共需要29 个循环。用移液器吸取5 μL PCR 扩增产物,开始琼脂糖凝胶电泳反应,根据图判断扩增产物的分子质量大小,并保存观察,将扩增成功的PCR 产物送检(PCR 产物的测序工作由北京鼎国盛世有限公司完成)。将测序结果登录NCBI 网站用BLAST 程序进行序列比对,用ClustalX 2 软件进行多序列比对(Multiplealignments),用软件MEGA5.2 进行分析获得系统进化树[8-9]。

分子鉴定试验步骤:

目的基因的提取:取隔夜的菌液1 mL 于离心管中,振荡摇匀(11 000 r/min,1 min),弃上清液,再取1 mL 菌液,离心,然后取150 μL 灭菌水吹洗菌体沉淀物,离心,弃上清液,反复洗涤2 次。用一次性手套包上离心管,开水煮10 min(煮沸过程中实时拿出爆盖离心管,排气后,再放回,振荡摇匀)。取上清液,即所需要的目的基因。

表1 引物碱基序列Table 1 Primer base sequence

PCR 扩增目的基因:取一个干净的小离心管,依次加入17 μL H2O,0.5 μL Mg2+,1 μL 基因模板,2 μL dNTP,2 μL Buffer,0.5 μL Taq 酶,1 μL 27F,1 μL 1492R,放入PCR 仪中反应,设置程序(见表2)。制作胶体,取0.4 g 琼脂糖,加25 mL EDTA 缓冲液,再加入0.9 mL EB 溴乙锭液体,放置15 min 胶体便制好,加样跑胶,上机marker 跑胶出图[10-15]。

表2 PCR 程序Table 2 PCR program

MEGA 5 构建系统发育树:

1)准备序列文件 准备txt.格式序列文件。

2)多序列比对 开启MEGA 5 系统,单击Align→Edit/Build Alignment→Create a new alignment,点击OK,选择序列为核酸DNA。选好之后,单击Edit→Insert Sequence From File,选择需要的序列文件,点击按钮→Align DNA,在弹出的窗口中,选择默许的比对参数,点OK,进行序列比对,删除两端没有比对上的序列,并保存文件。

3)构建系统进化树 在多序列比对窗口中,点击Data→Phylogenetic Analysis,所用序列是否编码蛋白质,选Yes。返回MEGA 5 主界面,点击Phylogeny →Construct/Test Neighbor-Joining Tree…弹出的对话框:使用当前的数据,选Yes,Bootstrap 为1 000,点击Compute。建树完成后,注意点击Bootstrap consensus tree 查看树形。保存文件为filename.mts(可以用MEGA 5 打开)[16-24]。

1.3.6 细菌耐热性分析 将细菌悬液 (2.2×1010CFU/mL,6×109个)平均分成6 份,分别置于20,40,60,80,100,120 ℃的温度下处理5 min 和10 min,然后分别接种至营养琼脂培养基中进行培养(37 ℃恒温培养48 h)并计数,每组3 个平行,统计菌落数。

1.3.7 数据分析 采用ClustalX 2 对菌株Y8 及模式菌株序列进行比对,MEGA5.2 构建系统发育树。采用Excel 软件作图,结果由3 个平行样的平均值±标准偏差表示。

2 结果与分析

2.1 细菌菌株的形态学初步鉴定

从营养琼脂培养基中挑取分离纯化的菌株,利用光学显微镜观察其颜色、形态特征(见图1),并对比《伯杰细菌鉴定手册》,然后进行形态学鉴定分析。

根据对两种细菌菌落形态及革兰氏染色观察,发现两种菌株均呈短细杆状,表面较粗糙扁平湿润,半透明乳白色,且革兰氏染色为蓝紫色阳性。

2.2 细菌菌株的生理生化鉴定

对菌株进行糖发酵试验,结果如下。

菌株A1 和A2 的糖发酵试验结果见表3。乙酰甲基甲醇V-P 试验呈现红色,判定其为阳性菌。甲基红(Methyl Red)试验呈鲜红色,判定其为阳性菌。靛基质吲哚试验有吲哚存在,乙醚层呈现玫瑰红色,确定为吲哚试验阳性反应。

2.3 对细菌的16SrDNA 序列基因片段的扩增

本试验以1492R 和27F 作为引物,来进行PCR 扩增目的基因,得到的DNA 片段,经过琼脂糖凝胶电泳试验,可以看到一条长度为1 100 bp左右的扩增条带,PCR 基因扩增图(见图2)。

图1 菌株的菌落形态及菌体形态(×40)Fig.1 Colony and thallus morphology of the strain(×40)

表3 菌株的糖发酵试验Table 3 Strain sugar fermentation experiment

结果表明:菌株A2 没有扩增成功,舍去。菌株A1 的16SrDNA 基因片段扩增成功,可以将其送到北京鼎国盛世有限公司直接测序。

2.4 测序结果的BLAST 比对

双向测序结果如表4所示,将公司测序所得到的DNA 序列,输入NCBI 的数据库中,进行BLAST 比对,发现其与地衣芽孢杆菌中的Bacillus licheniformis ZF23 序列的相似度为98%,确定菌株A1 为地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis)。

序列比对分值为1 871 bits,因为分数值越高说明相似度越高;Expect 的期望值为0.0,说明比对效果很好;query cover 同源百分比为98%,Max ident 百分比为97%。确定菌株A1 为地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis)。

图2 菌株A1 的16SrDNA 扩增片段凝胶电泳图Fig.2 The 16SrDNA amplifying fragment gel electrophoresis diagram of the strain A1

表4 菌株A1 的16SrDNA 序列的测序片段Table 4 Sequence of 16SrDNA sequences of strain A1

(续表4)

2.5 基于16SrDNA 序列分析的菌株系统发育树构建及分子鉴定

根据序列BLAST 比对结果,选择同源性较高的菌株,建立系统进化树,分析菌株的种属地位。构建的系统发育树如图3所示。由图3可以看出菌株A1 与地衣芽孢杆菌的亲缘关系,菌株A1 与菌株Bacillus licheniformis strain ZF23 发育距离相近,其中bootstrap 值为99,可见菌株A1 与其同源性较高,确定其为地衣芽孢杆菌菌种。

2.6 菌株A1 的耐热性分析

由图4、图5可以看到菌株A1 对于高温具有一定的耐受性,在加热温度低于40 ℃时活菌体数量基本没有影响,但随着加热温度的继续升高其耐受力下降,当加热温度高于100 ℃时,加热5 min 和加热10 min 菌体个数基本都趋于0,菌体失活。结果表明本研究从渤海虾酱中分离的菌株A1耐热性不强,80 ℃以上加热熟制后,菌体基本失活,其助消化能力急剧降低。

图3 菌株A1 的16SrDNA 序列系统发育树分析Fig.3 16SrDNA sequence analysis of strain A1 analysis of the neighbor-joining tree

图4 菌株A1 加热5 min 的菌体个数变化Fig.4 The changes of bacteria strains A1 after heating 5 min

图5 菌株A1 加热10 min 的菌体个数变化Fig.5 The changes of bacteria strains A1 after heating 10 min

3 结论

以渤海虾酱为研究对象,通过营养琼脂培养基对虾酱中细菌进行分离纯化镜检,采用PCR 技术提取目的基因,并测序进行BLAST 比对,建立系统发育树,得到1 株细菌A1,与地衣芽孢杆菌中的Bacillus licheniformis strain ZF23 的同源相似度为98%,其中bootstrap 值为99。对该菌株进行耐热性分析,发现地衣芽孢杆菌对于高温耐受性较差,随着加热时间和温度的增加其存活率逐渐下降,结果表明虾酱在实际应用过程中80 ℃及以上的加热处理将致使其助消化能力显著降低。本研究为虾酱在食品加工过程中的合理利用提供一定的理论依据。

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