马会卿 郝秀双 刘晓玲 郭志娟 杨灵敏
脆性X综合征是一种X染色体连锁不完全显性遗传疾病(据估计外显率为:男79%,女35%[1]),新生儿发病率0.4‰~0.67‰,占所有X连锁智力低下疾病的15%~25%,其发病率仅次于唐氏综合征[2]。是引起自闭症障碍和遗传性智力障碍最常见的单基因疾病,可表现为多动症及不同的神经性退化[3]。可以根据CGG重复数划分FMR1基因的不同类型:正常型为5~44个重复,以29,30个重复最为常见[4,5];45~54个重复为中间型,又称灰区,一般来说,此基因型携带者表型正常,但其后代可能发生重复单元数量变异;55~200个重复为前突变,此时CGG重复数变得很不稳定,在母亲和孩子间易于发生变异,且携带者有几率表现出临床症状,如脆性X相关原发性卵巢功能不全及共济失调综合征;若CGG重复数大于200,常伴有FMR1基因异常甲基化,携带者表现为脆性X综合征[5]。为有效控制脆性X综合征的发病率,进行产前筛查及新生儿筛查是十分关键的措施。本文采用了PCR全长扩增与重复引物PCR扩增相结合的方法,以提高新生儿筛查准确性。共筛查992名新生儿,其中野生型984例,中间型1例,全突变男性1例。
1.1 一般资料 此科研项目通过了伦理委员会审查。并经家属知情同意后,我院对2017年6月至2018年2月出生的新生儿随机采集脐带血以进行脆性X综合征筛查,共检测992例新生儿,其中男546例,女446例。
1.2 研究对象与样本采集 在充分告知父母该项研究的性质、目的、内容、可预期的风险和影响等知情同意后采集样本。新生儿筛查中采集新生儿的脐带血。胎儿娩出后结扎脐带,胎盘娩出后,由接生者在胎盘侧近断脐端的脐带作为进针点,进针前先用消毒纱布擦干其表面,酒精消毒,然后抽脐静脉血2 ml平均滴在两个血斑上,待其自然风干后封存。
1.3 方法
1.3.1 DNA提取:按照厂家说明书步骤,使用QIAamp DSP DNA Blood Mini Kit(Qiagen,德国)提取所采集血液样本;使用NanoDropTM(Thermo Fisher,美国)进行定量,根据检测结果稀释DNA样本至50 ng/μl,保存于4℃待用。
1.3.2 PCR扩增:使用FMR1基因CGG重复数检测试剂盒(北京阅微基因,中国)对DNA样本进行检测。每个检验包含全长扩增和重复扩增两个体系,体系配制及PCR设置遵循厂家说明书。使用ABI VeritiTM96-Well PCR仪(Applied Biosystems,美国)进行PCR扩增。
1.3.3 毛细管电泳及结果判读:电泳每个体系包括上述PCR产物1 μl,分子量内标QD1200 0.3 μl,Hi-Di甲酰胺(Applied Biosystems,美国)8.7 μl,共计10 μl。使用50 cm POP-7TM胶于ABI 3500XL DX遗传分析仪(Applied Biosystems,美国)进行电泳分离。使用GeneMapper v5.0软件进行分型分析,分析阈值设定为50 RFU。结果判读标准遵循厂家说明书,全长体系和重复扩增体系可分别计算样本CGG重复数,按说明书规定的方法综合两者体系的重复数读数得出最终的CGG重复数结果。
2.1 新生儿脆性X综合征筛查情况 992例新生儿筛查中一次成功检出986例,一次检出率达99.4%。共检出野生型984例,中间型1名、全突变1例,三种类型的基因突变图谱如图1所示。其中,全突变患者的CGG重复数大于200个,经随访发现确为来自脆性X综合征家系的1例男性患者。见图1。
图1 (a)野生型(CGG重复数为28);(b)中间型(CGG重复数为29和50);(c)全突变(CGG重复数>200)
2.2 CGG重复数分布情况 986例检出FMR1基因CGG重复数分布,共检出28种CGG重复数,其中CGG重复数在13~44范围内的均为正常型。正常型的CGG重复数占比图如图2所示,正常型的CGG重复数主要集中在29、30个重复,占全部样本约78.2%,这与先前文献报道一致;本研究还发现36个CGG重复是除29、30个重复外最常见的基因型,占全部样本的约8.74%。另外,本文采用Fisher精确检验的方法分析男性和女性之间CGG重复数的差异,发现无显著差异(P=0.415),表明CGG重复数的分布情况与性别无关。见表1,图2。
表1 986名新生儿筛查CGG重复数分布情况 例(%)
脆性X综合征发病率仅次于唐氏综合征,因此进行大规模的产前及新生儿筛查很有必要。目前已有多种方法可以用于检测脆性X综合征,如Southern blot[6-9]、PCR法检测甲基化[10]、PCR法检测CGG重复序列长度[11]及重复引物PCR法[12](Repeat Primer PCR,RP-PCR)。但是以往的检测方法存在样本采集运输困难,检测时间长,通量低等各种缺陷。因此,建立一个简便准确的筛查方法尤为重要。本研究结合CGG重复全长PCR检测和重复引物检测这两种方法计算样本的CGG重复数,可提高检测的灵敏度并实现了CGG重复数的准确判读。此检测体系样本采集运输简便稳定,操作简单,检测准确,适合用于新生儿脆性X综合征的大规模区域性筛查。
图2 正常型CGG重复数占比图
我院基于该方法对近千例新生儿进行了脆性X综合征筛查,结果表明其FMR1基因CGG重复数分布情况与以往报道相似[12]。在正常人群中,除最为普遍、常见的29、30个重复外,我们还观察到了相对高频(8.7%)的36个CGG重复。相对高频的36CGG重复并非来自随机突变,而是产生于人群亚结构。Chen等[13]最早报道了中国人群中的相对高频的36CGG重复数现象,并通过测序确认其与一种9A9A6A9的CGG-AGG排布模式相关。后续基于其他东亚、东南亚人群的脆性X综合征调查发现了相似的高频36CGG重复数[14],揭示了这一特殊重复数在东部亚洲人群中广泛存在。而基于非亚洲人群的调查中没有发现类似的高频36CGG重复基因型[13,15,16]。通过SNP分析,研究者认为36CGG重复是与亚洲特有的单倍群高度相关的,这与本研究的结果相符。
此外,我们发现了一例脆性X综合征患儿,其FMR1基因的CGG重复数>200,该患儿男性,孕足月出生,出生时体重2 700 g,大耳朵,余未见明显异常,通过进一步对其家系的检查,我们确认了该患儿来自一个脆性X综合征家系,已经在该家系中至少传递了三代人。脆性X综合征目前无法治愈,因存在中重度的智力障碍,对整个家庭及社会造成严重、长期的影响;且脆性X综合征可以在家系中扩大,如果不加以管理,该家系后代中患病人数增加,为了预防患儿出生,应行婚前或孕前检查脆性 X 染色体,诊断携带者的高危人群,以便有的放矢进行产前诊断,避免患儿出生。 脆性 X 染色体阳性者应做家系调查,发现杂合子进行遗传咨询和产前诊断。确诊脆性 X 染色体阳性男胎儿应终止妊娠,如杂合子的女胎儿,则可能为脆性X 染色体携带者或者是轻度智力低下的患者[17]。这进一步说明了加强基层脆性X综合征宣传和加大筛查力度、倡导优生优育的重要性。
综上所述,通过全长扩增结合重复引物扩增的方法可以有效、准确检测出FMR1基因CGG重复数,并且此检测体系操作较为简便,适合用于新生儿脆性X综合征的大规模筛查,最终达到优生优育的目。