何 珊,马淑一,付玉华,于敬达,高 芳,蔡 琳
(1.内蒙古科技大学包头医学院医学技术学院,内蒙古 包头 014040;2.内蒙古科技大学包头医学院第一附属医院检验科)
ZBED6是在研究瘦肉型猪的影响因素时发现的一个转录因子,在哺乳动物中有高度的保守性[1]。ZBED6结合在胰岛素样生长因子2(IGF2)的3号内含子区,可抑制IGF2的表达量[1]。但是关于ZBED6的研究很少,而关于其与人类疾病相关的研究更是少之又少,只在胰岛细胞和人结直肠癌细胞系中做过相关研究。发现ZBED6介导的对IGF2的调控可能与胰岛β细胞有关,因为发现在自发糖尿病小鼠中异常的IGF2产物会引起后续β细胞量的异常[2]。而且,人胰岛素基因成簇排列在IGF2附近,说明除了IGF2外,胰岛素或许也受到ZBED6依赖性方式的调控[3]。本实验采用单核苷酸多态性(SNP)的关联研究,初步探讨ZBED6基因1043A/G多态性与2型糖尿病发病的相关性。
1.1研究样本 2型糖尿病患者83例,均来自包头地区,彼此间无亲缘关系。其中男37例,女46例,年龄28-88岁。同等数量的健康对照来自同时期社区体检人群,均无2型糖尿病,且性别、年龄与患病组相匹配。
1.2聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)检测 (1) 提取基因组DNA:EDTA抗凝管采集研究对象静脉血,使用天根基因组DNA提取试剂盒提取外周血基因组DNA。(3)引物设计、合成:通过NCBI查找ZBED6基因序列,并使用Primer5软件设计引物,交由生物公司合成。引物序列F:TCAAGAGCTGTGTGTAATATATGTA,R: CTAACATAGGTTCATCTGAATCAGA。扩增基因序列长280 bp。(3)PCR扩增:反应体系:模板3 μl,上下游引物各1 μl,2×Taq PCR Master Mix 13 μl,去离子水7 μl。反应参数:94 ℃ 5 min,94 ℃ 30 s,51 ℃ 30 s,72 ℃ 30 s,33个循环,72 ℃ 5 min;(4)基因分型和测序:对PCR产物进行酶切反应,反应体系10 μl,包括PCR产物4 μl,内切酶NlaⅢ 0.2 μl,10×限制性内切酶Buffer 1 μl。37 ℃反应15 min后,电泳,分析基因型(GG型:280 bp,AA型:205和75 bp,AG型:205,280,75 bp),随机选取患者及正常对照PCR产物各5份,送北京六合华大基因科技有限公司测序,验证酶切结果。
2.1ZBED6基因1043A/G位点基因分型 经酶切反应确定ZBED6基因1043A/G位点只存在1种基因型AA,2型糖尿病患者与正常对照无差异,见图1。
2.2ZBED6基因1043A/G位点测序结果 PCR产物测序结果显示:ZBED6基因1043A/G位点只有1种基因型AA,与酶切结果一致,2型糖尿病患者与正常对照无差异,见图2。
图1 ZBED6基因1043A/G位点基因分型电泳图
图2 ZBED6基因1043A/G位点PCR产物测序结果
2型糖尿病是一种常见的内分泌代谢性疾病,其发病特点主要表现为胰岛素抵抗和/或胰岛β细胞功能受损。目前研究显示ZBED6基因的表达对胰岛β细胞的发育与功能有重要的调节和控制作用。有人证实ZBED6在胰岛素分泌细胞、小鼠胰岛及人的β细胞中均有表达。且转录因子ZBED6影响胰岛β细胞的基因表达、增殖和细胞死亡[4], 因而可能与各型糖尿病的发病机理有关。2型糖尿病病因复杂,通常认为其发病与遗传及环境这两大因素有着密切的联系。有报道显示CAPN-10基因的单核苷酸多态性与2型糖尿病呈显著相关,尤其CAPN-10的SNP43与2型糖尿病呈显著相关[5]。有学者对中国人群进行了一项大规模的研究,该研究验证了从韩国人、新加坡华人和欧洲美国人等3个GWAS中筛选出2100个SNP,研究后发现rs1359790,rs10906115和rs1436955与2型糖尿病相关[6]。另外,也有人发现在胰岛β细胞出现的HDAC基因变异可能在糖尿病的发生中有作用[7]。目前,研究发现牛ZBED6基因存在3个对牛体重等性状有显著影响的SNP[8],其中1043A/G位点与人最具同源性。但尚无关于人ZBED6基因1043A/G位点多态性与2型糖尿病发病关系的研究,故本课题选取了1043A/G位点,探讨其多态性以及与2型糖尿病关系。结果显示人ZBED6基因1043A/G位点无突变,均为AA型。表明2型糖尿病发病风险与1043A/G位点是否突变无相关性。虽然ZBED6基因在哺乳动物中具有高度保守性[1],但与牛不同,在人群中此位点不存在多态性,亦或可能因标本数量不足而出现误差。在后续研究中可选择NCBI中已有的人ZBED6基因SNP位点进行分析,进一步探寻ZBED6基因多态性与2型糖尿病发病关系。以确证2型糖尿病发病是否与该基因某位点多态性相关。