miRNA-21在结直肠癌中的表达研究

2014-11-24 02:55孟凡旭刘林林
中国实验诊断学 2014年1期
关键词:癌基因定量试剂盒

邱 实,孟凡旭,刘 念,刘林林

(吉林大学第二医院 放疗科,吉林 长春130041)

结直肠癌(colorectal cancer,CRC)是胃肠道中常见的恶性肿瘤,随着近些年我国人口老龄化加剧、饮食习惯和生活方式的改变,结直肠癌的发病率和死亡率较前明显上升[1]。结直肠癌的早期筛查与诊断越来越受人们的关注。microRNA(miRNA)是由Lee等于1993年发现的一类新的长度为19-25的内源性非编码RNA分子,参与了发育、细胞增殖、分化及凋亡等一系列重要生命过程。近些年研究发现,在肿瘤发生发展过程中miRNA发挥类似抑癌基因和癌基因的作用,影响肿瘤的发生、发展[2]。本次研究应用实时定量聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)检测miRNA-21在正常人和结直肠癌患者血清,以及结直肠癌患者癌组织和癌旁组织中的表达,分析miRNA-21表达水平与结直肠癌临床病理参数的关系。

1 资料与方法

1.1 临床资料

选择2012年5月——2012年8月于吉大三院行手术治疗的42例经病理诊断为结直肠癌的患者为研究对象,术前未行放化疗。患者年龄52岁-74岁,中位年龄62岁,男26例,女16例,按照美国癌症联合委员会(AJCC)/国际抗癌联盟(UICC)结直肠癌TNM分期系统(2010年第七版)进行TNM分期。取肿瘤组织及癌旁组织(取材部位距离肿瘤边缘至少5cm的正常肠黏膜组织),离体10min内放入液氮保存;抽取患者术前及术后血液,保存于超低温冰箱。抽取同期16例健康人血液,年龄49岁-76岁,中位年龄61岁,其中男10例,女6例。

1.2 试剂及仪器

Trizol试剂(Takara公司)、DEPC 水(Takara公司)、miRNA isolation提取分离试剂盒(Takara公司)、MMLV Reverse Transcriptase(Takara公司)、Hairpin-itTM miRNAs RT-PCR Quantitation Kit试剂盒(苏州吉玛基因股份有限公司)、引物hsmiRNA-21及内参U6均购自苏州吉玛基因股份有限公司;ABI-7300实时荧光定量仪(美国ABI公司)。

1.3 实验方法

1.3.1 RNA提取 取3-5ml血液样本加入红细胞裂解液至10ml,3 000r/min离心10min,弃上清,沉淀中加入1ml Trizol,按照miRNA isolationg提取分离试剂盒说明书中的步骤提取miRNA。

取液氮保存组织样本约500mg,研磨后加入1 ml Trizol,然后按照miRNA isolationg提取分离试剂盒说明书中的步骤提取miRNA。

使用紫外分光光度仪测定提取RNA的浓度及纯度,其 A260/A280比值应在1.8-2.1之间,计算RNA浓度用于进一步实验。

1.3.2 RNA的逆转录 取3μg模版RNA,加入4 μl 5×MMLV RT Buffer、0.75μl dNTP(10mM)、1.20μl MiR-RT primers(1μM)、0.25μl Rnasin(40U/μl)及0.2μl MMLV Reverse Transcriptase(200U/μl),RNase-free water将总体系补至20μl构成逆转录反应体系。使用普通PCR仪将提取的总RNA逆转录成cDNA。反应条件:25℃30min,42℃30min,85℃5min。

1.3.3 RT-qPCR 血清样本和组织样本逆转录得到的cDNA 为模版,按照 Hairpin-itTMmiRNAs RT-PCR Quantitation Kit试剂盒说明书加入相关试剂及引物,以U6为内参,在ABI-7300实时荧光定量仪上进行PCR扩增。反应条件:95℃3min预热,然后95℃12s、62℃40s共40个循环。

1.4 数据分析

本试验采用2-ΔΔCt法进行表达量分析。反应体系中荧光信号达到阈值的循环数为Ct,ΔΔCt=(Ct实验组目的基因- Ct实验组管家基因)- (Ct对照组目的基因-Ct对照组管家基因),计算ΔΔCt后再计算2-ΔΔCt值,2-ΔΔCt为miRNA的相对表达比率。

使用SPSS 12.0统计软件,计算资料以均数±标准差(±s)表示,组间比较采用t检验,P≤0.05为差异具有统计学意义。

2 结果

miRNA-21在结直肠癌患者血清(3.64±0.31)中表达明显高于正常人血清(1.02±0.12)(P<0.05),miRNA-21在结直肠癌组织(7.17±1.46)中表达水平明显高于癌旁组织(2.33±0.84)(P<0.05),中晚期(Ⅲ期和Ⅳ期)结直肠癌组织(7.25±0.76)中表达水平明显高于早期(Ⅰ期和Ⅱ期)结直肠癌(3.25±0.24)(P<0.05);低分化肿瘤组织(7.18±1.08)中miRNA-21表达水平明显高于中高分化者(3.31±0.68);有淋巴结转移的结直肠癌组织(7.16±1.14)中miRNA-21表达水平明显高于无淋巴结转移者(3.47±0.84)(见表1)。且发现结直肠癌患者血清中 miRNA-21的表达与癌组织中的miRMA-21表达间存在秩相关关系(见图1)。

表1 miRNA-21表达水平与结直肠癌临床病理参数的关系

3 讨论

图1 miRNA-21在结直肠癌患者血清中与癌组织中相对表达率关系

大量研究表明,miRNA参与胚胎发育、细胞周期调控、细胞分化增殖与凋亡等重要的生命进程[3]。随着分子生物学技术的不断发展及研究的深入,对miRNA的认识也越来越深刻。其通过识别结合靶mRNA从而影响靶mRNA的降解或翻译来调节靶基因的表达[4]。生物信息学分析发现,尽管miRNAs仅构成人类基因组的1%-3%,但多达30% 的人类基因可能被miRNAs所调节[5]。有50%以上的miRNA基因位于肿瘤相关基因组区域内,多种miRNA在人类肿瘤中都存在异常表达,如结直肠癌中 miRNA-145表达下调[6]、胰腺癌中 miRNA-21表达上调[7]、胃癌中的 miRNA-155 表达上调[8]等。提示miRNA可能发挥类似癌基因及抑癌基因的作用,在肿瘤的发生发展过程中发挥着重要作用[9]。miRNA-21是在人类组织中发现较早、研究比较多的miRNA,现已发现在胃癌、胰腺癌、肝癌、肺癌等多种肿瘤组织中存在明显的上调,因此认为其在肿瘤发生过程中发挥类癌基因作用。目前已证实miRNA通过作用于 P53、Bcl-2、PTEN 等靶基因,参与肿瘤生长、转移,与肿瘤侵袭及耐药等密切相关[10-12]。

本次研究采用RT-qPCR技术检测了正常人和结直肠癌患者血清,以及结直肠癌患者癌组织和癌旁组织中的表达,结果显示结直肠癌患者miRNA-21表达水平与性别、年龄无明显相关性,结直肠癌患者血清中miRNA-21表达水平显著高于正常人血清(P<0.05);结直肠癌组织中 miRNA-21表达水平明显高于癌旁组织;而且miRNA-21的表达与TNM分期有关,TNM分期越晚,其表达水平越高,在淋巴结转移阳性的结直肠癌中表达明显增高,其表达水平还与分化程度相关,低分化肿瘤组织中miRNA-21表达水平明显高于中高分化者。同时还发现结直肠癌患者血清中miRNA-21的表达与癌组织中的miRMA-21表达间存在秩相关关系,但未能观察到结直肠癌血清与癌组织中miRNA-21的相对定量之间的线性相关关系,这可能与样本量较小有关,有待于更大样本的研究。

本实验入组的42例患者均行CEA及CA-199检测,大部分在正常范围内,仅有4例明显高于正常范围,但其血清miRNA-21的相对定量明显高于正常人的平均值。且在本实验中我们观察到结直肠癌血清与癌组织中miRNA-21的相对定量之间的相关性,这使得miRNA-21i的血液检测成为可能。但血清miRNA-21的检测是否比传统的肿瘤标记物具有更高的灵敏性及特异性,有待进一步大样本的临床研究。

[1]刘寒梢,马越云,肖华胜.血清微小 RNA(miR-129-3p、miR-767-3p和miR-877* )在结直肠癌诊断中的价值[J].肿瘤,2012,32(1):42.

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