蒋玉凤 周德江 张建军 黄 飞 史小玲
转化生长因子β(transforming growth factorβ,TGF-β)及其信号转导途径在肝纤维化发生机制中起着关键作用[1,2]。结缔组织生长因子(connective tissue growth factor,CTGF) 与金属蛋白酶组织抑制因 子 1(tissue inhibitor of metalloproteinase 1,TIMP-1)都是TGF-β信号传导途径的下游信号介质[3,4], 针对CTGF和 TIMP-1的小RNA干扰阻断TGF-β下游信号途径,将有望成为一种更特异和更有效的长期防治肝纤维化的手段。本研究旨在设计并构建同时含CTGF和TIMP-1靶基因片段的双重RNA干扰重组质粒,并转染到大鼠肝星状细胞,为进一步研究其对肝星状细胞细胞因子和细胞外基质分泌做准备。
一、材料 真核表达载体psiRNA-DUO-GFPzeo、感受态大肠杆菌Lyo Comp GT115、Fast-Medi aRZeoX-Gal、Fast-MediaRZeoX-GUS、lipofectamine( 脂质体)2000试剂、Zeocin抗生素购自InvivoGen公司;限制性内切酶ACC 65I、Hind III、 BbsI、MakerO'RangeR μlerTM1000bpDNALadder、MakerO'RangeRμlerTM50bp DNA Ladder与T4 DNA连接酶购自Fermentas公司;少量质粒提取试剂盒购自OMEGA公司;胎牛血清购自天津TBD公司;目标OligoDNA由上海生工合成;大鼠肝HSC-T细胞株由我院中心实验室冻存。
二、CTGF和TIMP-1短发卡RNA(short hairpin RNA,shRNA)序列的设计与合成 在线查询大鼠CTGF和TIMP-1基因序列,设计3个RNA干扰靶位,化学合成双链RNA(dsRNA),各自转染或不同组合转染经TGF-β1刺激活化的大鼠肝星状细胞。筛选出对Ⅲ型胶原、透明质酸、粘连蛋白抑制作用最强的RNA干扰候选靶位[5](前期研究中已完成),即 CTGF:5’-GCCAGGAGAAAGACAGGUACU 和TIMP-1:5’-GCCUUCGUAAAGACCUAUAGU。 为便于克隆和鉴定,shRNA干扰序列的5'端和3'端分别引入ACC 65I和Hind III酶切位点,反义片段后接终止信号TTTTT以终止转录。形成ACC 65I+正义链+Loop+反义链+终止信号+Hind III的靶序列结构模式。在真核表达质粒psiRNA-DUO-GFPzeo(6046bp)中插入CTGFshRNA序列,再用BbsI双酶切(质粒中含两个BbsI酶切位点),再插入TIMP-1shRNA序列,形成BbsI+正义链+Loop+反义链+终止信号+BbsI的靶序列结构模式。针对CTGF和TIMP-1基因的shRNA片段序列见表1。
表1 针对大鼠CTGF和TIMP-1基因的shRNA靶序列
三、重组质粒 psiRNA-GFP-CTGF和 psiRNA-GFP-TIMP-1的构建及鉴定用内切酶ACC 65I和Hind III双酶切空载质粒psiRNA-DUO-GFPzeo,胶回收目的线性DNA;用灭菌三蒸水将shRNA片段溶解,终浓度为25μM。按以下条件完成退火:正义链2μl, 反义链 2μl,NaCl 6μl, 加三蒸水到总体积30μl,80℃ 水 浴 2min。将线性载体质粒psiRNA-DUO-GFPzeo与退火shRNA片段用T4 DNA连接酶连接,转化感受态大肠杆菌,接种到含博莱霉素( zeocin)的 Fast-MediaRZeoX-Gal固体培养基,做蓝白筛选后提取重组质粒psiRNA-GFP-CTGF、psiRNA-GFP-TIMP-1,分别用ACC 65I和Hind III双酶切,通过电泳图初步鉴定重组质粒是否构建成功,并各取20μl重组质粒送上海生物工程公司测序。
四、重组质粒psiRNA-GFP-Com(含有C TGF和TIMP-1)的构建及鉴定 将测序确定构建成功的重组质粒psiRNA-GFP-CTGF用内切酶BbsI双酶切(内切质粒中两个不同位置的BbsI位点),胶回收目的线性质粒,psiRNA-GFP-CTGF与退火shRNA片段连接,转化感受态大肠杆菌,并接种至Fast-MediaRZeo GUS固体培养基,将蓝白筛选后提取的重组质粒psiRNA-GFP-Com与空载质粒psiRNA-DUO-GFPzeo分别用内切酶BbsI双酶切(内切质粒中两个不同位置的BbsI位点),酶切产物电泳显示重组质粒构建成功后,取20μl重组质粒送上海生工测序鉴定。
五、重组质粒转染肝星状细胞 取肝星状细胞培养,应用Lipofectamine 2000将质粒转染细胞,每组两孔。分组如下:CTGF组(转染质粒psiRNA-GFP-CTGF)、TIMP-1组(转染质粒psiRNA-GFP-TIMP-1)、CTGF+TIMP-1组( 转染质粒psiRNA-GFP-CTGF和 psiRNA-GFP-TIMP-1)、Com组【转染质粒psiRNA-GFP-Com(含有C TGF和TIMP-1)】、空质粒组(转染空载质粒psiRNA-DUO-GFPzeo)与空白对照组(以等量无血清培养基代替质粒与脂质体混合)。在转染24小时和48小时后,在显微镜下观察绿色荧光,并使用流式细胞仪检测每组细胞中荧光蛋白(GFP)表达情况,并以GFP表达的比率来确定转染效率。
一、重组质粒psiRNA-GFP-CTGF和psiRNA-GFP-TIMP-1酶切电泳鉴定 重组质粒psiRNA-GFP-CTGF和 psiRNA-GFP-TIMP-1用ACC 65I和Hind III双酶切,其产物经电泳符合预期,重组质粒psiRNA-GFP-CTGF和psiRNA-GFP-TIMP-1双酶切产物均有一大小约5711bp(6046-335+23-23)片段( 图1)。
二、重组质粒 psiRNA-GFP-CTGF和psiRNA-GFP-TIMP-1测序鉴定 经测序显示重组质粒psiRNA-GFP-CTGF和psiRNA-GFP-TIMP-1中siRNA编码序列与设计片段完全一致,表明载体构建成功( 图 2、图 3)。
三、psiRNA-GFP-Com酶切电泳鉴定 psiRNA-GFP-Com经BbsI双酶切(内切质粒中两个不同位置的BbsI位点)产物电泳符合预期,电泳图谱中显示重组质粒psiRNA-GFP-Com双酶切产物中有一大小约 3782bp(5711-1929+23-23)片段( 图 4)。
四、重组质粒psiRNA-GFP-Com测序分析 经测序结果显示重组质粒psiRNA-GFPCom(同时含有C TGF和TIMP-1,将psiRNA-GFP-CTGF重组质粒用BbsI双酶切后连接上TIMP片段)中siRNA编码序列与设计片段完全一致,表明重组质粒psiRNA-GFP-Com构建成功(图5)。
五、转染效率测定情况 经流式细胞仪测定,空白对照组无GFP表达,空质粒和各组重组质粒均有荧光蛋白表达,初步证实各重组质粒均能转染肝星状细胞。同时,在24小时和48小时,空质粒组、CTGF组、TIMP-1组与CTGF+TIMP-1组转染效率无统计学差异(P>0.05),而它们的转染效率均低于质粒psiRNA-GFP-Com转染组(Com组),差异有统计学意义(P<0.05),说明Com组转染效率最高(表2)。
表2 各组质粒的转染效率(%,)
表2 各组质粒的转染效率(%,)
与Com组比,①P<0.05
24h 48h空白对照 无 无空质粒 15±2① 10±2①CTGF 13±1① 9±1①TIMP-1 15±1① 8±2①CTGF+TIMP-1 14±2① 10±1①Com 20±2 15±2
RNA干扰是作用于mRNA水平的基因沉默技术,细胞内双链RNA在Dicer酶的作用下,可形成21~23bp大小的小干扰 RNA(small interfering RNA,siRNA),精确降解与 siRNA序列相同的mRNA,能特异性抑制靶基因的转录,进而抑制该基因在细胞内的翻译,达到转录后水平的基因静默[6,7]。由于siRNA表达载体成功转染后可进行瞬时或稳定的基因沉默,因此相对于化学合成的siRNA更有应用价值和前景[8]。
CTGF是新近发现的一种促器官纤维化的重要细胞因子。在TGF-β的诱导下,由成纤维细胞等间质细胞产生,反过来又介导TGF-β对间质的作用,被认为是TGF-β的下游部分生物学功能介质,CTGF在TGF-β诱导下的异常高表达在肝纤维化的发生、发展过程中始终起着关键作用[9,10]。
基质金属蛋白酶(Matrix mealloproteiuases,MMP)在ECM降解过程中起主要作用,而其活性可特异性地被TIMP所抑制,其中TIMP-1对MMP的活性抑制作用最强[11]。TGF-β及其信号转导途径可诱导TIMP-1产生,从而阻断MMPs对ECM的降解[12]。因此,TIMP-1也是TGF-β1生物学作用的下游效应介质。
从理论上讲,通过靶向抑制CTGF和TIMP-1表达可抑制纤维化的发生和发展。本研究筛选出对CTGF和TIMP-1具有干扰作用的RNA序列,构建了双重RNA干扰重组质粒psiRNA-GFP-Com(同时含有C TGF和TIMP-1siRNA编码序列),并成功转染肝星状细胞。下一步研究拟采用针对CTGF和TIMP-1的RNA双重干扰,力求从阻断CTGF对ECM形成和解除TIMP-1对ECM的降解抑制(促进降解)两方面着手,研究双重RNA干扰重组质粒psiRNA-GFP-Com对肝星状细胞细胞因子表达及ECM分泌的影响。
本次实验质粒转染效率不是太高,而质粒转染效率与碱基数目有一定的关系[13]。
[1]刘平.重视肝纤维化的病理生理机制与治疗学研究.中华肝脏病杂志,2010,18( 8):561-562.
[2]徐列明.肝纤维化的研究进展.中华肝脏病杂志,2010,18(8):563-565.
[3]Gressner OA,Gressner AM.Connective tissue growth factor:a fibrogenic master switch in fibrotic liver diseases.Liver Int,2008,28( 8):1065-1079.
[4]孙华丽,张建军.组织金属蛋白酶及其抑制因子与肝纤维化.西南军医,2010,12( 1):81-83.
[5]蒋玉凤,黄飞,张建军,等.结缔组织生长因子和金属蛋白酶组织抑制因子-1RNA干扰靶位的筛选.实用肝脏病杂志,2011,14( 4),246-248.
[6]Bora RS,Gupta D,Mukkur TK,et al. RNA interference therapeutics for cancer:Challenges and opportunities.Mol Med Report,2012,6( 1):9-15.
[7]Tomari Y,Zamore PD.Perspective:Machines for RNAi.Genes Dev,2005,19( 5):517.
[8]李曙芳,刘田福.RNA干扰技术的应用新进展.中国实验动物学报,2009,17( 1):76-79.
[9]张馨,汪茂荣,马勇,等.慢性乙型肝炎患者肝组织PDGF表达与肝窦病变的关系.实用肝脏病杂志,2012,15( 1):1-3.
[10]Tche D,Boqdan F,Pisoschi C,et al.Evidence for the involvement of TGF-β1-CTGF axis in liver fibrogenisis secondary to hepatic viral infection. Rom J Morphol Embryol,2011,52( 1suppl) :409-412.
[11]Murphy G.Tissue inhibitors of metalloproteinases.Genome Biol,2011,12( 11):233.
[12]Hemmann S,Graf J,Roderfeld M,et al.Expression of MMPs and TIMPs in liver fibrosis-asystematic review with special emphasis on anti-fibrotic strategies.J Hepatol,2007,22( 5):955-975.
[13]Rudolph C,Rosenecker J.Formation of solid lipid nanoparticle(SLN)-gene vector complexes for transfection of mammalian cells in vitro.Cold Spring Harb Protoc,2012,25( 3):357-360.