于文青,赵英玲,罗 玲,叶春桃,饶 晨,冯碧珊,肖小灵,黄望香 (深圳市龙岗中心医院血液内科,广东 深圳 518116)
环状RNA(circular RNA,circRNA)是基因组在转录过程中反向剪接而形成的一类单链闭环非编码RNA分子,长度在数百至数千个核苷酸之间[1]。circRNA最早于20世纪70年代被发现于植物中,称之为类病毒。随着RNA测序和生物信息学分析技术的迅猛发展,迄今为止已有发现超过10 000个人类circRNA[2]。近年来,越来越多的研究表明,circRNA也参与造血和血液恶性肿瘤的调控[3]。本文系统综述了circRNA在恶性血液病中的作用。
circRNAs可以定位在细胞质和细胞核内,也可以定位在细胞外的胞外囊泡中[4]。circRNAs表达呈现组织特异性,在癌症和其他病理学组织中circRNA表达谱可能会发生改变[5-6]。随着研究的深入,circRNAs的许多功能已被陆续发现,包括最新发现的合成多肽/蛋白质、募集蛋白质以及作为特定酶和底物之间的桥梁[7-8]。近年来,随着关于circRNA功能挖掘的深入,研究发现一些具有特殊序列的circRNA具有编码成多肽或蛋白质的功能,如circSHPRH、circAKT3等,这些circRNA编码的多肽或蛋白质进一步参与疾病进展的调控[9]。
白血病是一种来源于骨髓造血祖细胞的恶性疾病,根据其自然病程和细胞来源可分为许多亚型。急性髓细胞白血病(AML)、慢性髓性白血病(CML)、急性淋巴细胞白血病(ALL)和慢性淋巴细胞白血病(chronic lymphocytic leukemia,CLL)是最常见的亚型,约占所有白血病病例的85%,其中AML是最致命的[6]。
AML是成人最常见的急性白血病,特点是不成熟白细胞数量急剧增多,抑制骨髓中正常造血细胞的生成[10]。许多导致AML的细胞遗传学异常已被陆续揭示,包括t(8;21)、t(15;17)和t(9;11)染色体易位,它们分别产生融合蛋白RUNX1-RUNX1T1、PML-RARA和MLL-AF9[10]。Guarnerio等通过检测患者样本发现,染色体重排可导致融合circRNA(f-circRNA)的生成,并分别从融合转录物PML-RARA和MLL-MLLT3(AF9)中鉴定出促进肿瘤进展的f-circRNA[11]。正常核型AML以异质基因突变为特征,这些异质基因突变对于疾病的治疗和预后具有重要的意义。Hirsch等在携带正常或突变的伴侣核磷蛋白基因(NPM1)的CN-AML细胞系中发现hsa_circ_0075001的升高与NPM1突变状态相关[12]。Wu等的研究发现circDLEU2在CN-AML中显著上调表达,高表达的circDLEU2导致AML细胞增殖和凋亡的改变[13]。Papaioannou等发现CN-AML中高表达的circHL8与较好的预后和生存率显著相关,同时血液和骨髓中恶性肿瘤的比例较低[14]。另外两种circRNAs,即circFOXO3和circFBXW7,被认为是AML中的肿瘤抑制因子[14-15]。
近年来,在AML中发现了更多的circRNA表达紊乱的现象。Chen等发现circANAPC7在AML骨髓样本中表达上调,并通过吸附miR-181发挥调控作用[16]。Ping等研究发现circ_0009910可吸附肿瘤抑制因子miR-20a-5p,进而促进AML的进展[17]。而Fan等报道circ_100290可通过吸附miR-293促进AML细胞增殖并抑制其凋亡[18]。Li等报道了circ_0004277在新诊断患者中表达水平较低,但其表达在诱导治疗完全缓解后恢复[19]。Yuan等在一项儿童AML队列研究中发现circ_0004136的表达量显著增加,并预测circ_0004136可能通过结合并抑制miR-142的表达促进AML细胞增殖[20]。Yi等在一项113例AML患者的队列研究中,发现circVIM表达水平升高与总生存期缩短显著相关,这表明circVIM可能是AML的预后标志物[21]。髓外浸润(EMI)是AML预后不良的指标,Lv等发现hsa_circ_0004520可以调节血管内皮生长因子A(VEGFA)的表达,这可能有助于AML-EMI的血管生成[22]。Sun等报道circMYBL2可通过促进FLT3 mRNA与RBP多嘧啶结合蛋白1之间的结合来增强FLT3翻译,circMYBL2沉默可恢复人类FLT3-ITD+细胞对TKI奎扎替尼的敏感性[23]。Shang等发现circPAN3是AML阿霉素耐药的关键因素,CircPAN3可结合miR-153-3p和miR-183-5p,进而调节与自噬和凋亡相关的关键蛋白——X-连锁凋亡抑制蛋白的表达水平[24]。
急性早幼粒细胞白血病(APL)是一种不常见的AML,其特点是形成早幼粒细胞白血病/维甲酸受体α融合蛋白。APL对全反式维甲酸治疗具有高反应性,可促进白血病细胞进一步分化和成熟[25-26]。Li等发现circHIPK2在全反式维甲酸治疗期间差异表达,circHIPK2在新诊断的患者中表达水平下降,并在完全缓解后恢复表达,进一步提示circHIPK2是APL的潜在生物标志物[26]。
CML是一种罕见的克隆性骨髓增生性恶性肿瘤,年发病率为(1~2)/10万人[27]。CML的细胞遗传学特征是Philadelphia(Ph)染色体,由9号和22号染色体长臂之间的相互易位,即t(9;22)(q34;q11)产生[27]。融合基因BCR-ABL1可表达易位融合蛋白BCR-ABL1,这是一种酪氨酸激酶,可参与骨髓祖细胞存活和生长的信号分子的磷酸化、激活和失活[28]。高表达的BCR-ABL1激酶可能是由于基因扩增和Ph重复而引起的,可能引起TKI抵抗。此外,BCR-ABL1激酶结构域的特定突变可能会增强耐药性[29]。
Pan等研究发现来自BCR-ABL1的f-circRNA circBA9.3与第二代TKI伊马替尼的耐药性有关[30]。TKI耐药患者中circBA9.3的表达高于对照组,过表达circBA9.3可使细胞凋亡减弱[30]。Ping等发现CML患者的细胞和血清中hsa_circ_100053水平均增加,hsa_circ_100053的表达与临床分期、BCR/ABL1突变状态和对伊马替尼的耐药性有关,高水平的hsa_circ_100053被认为是CML患者总生存率的一个负性调控因子[17]。Liu等发现CML患者的细胞以及K562和KU812细胞系中hsa_circ_0080145上调表达[31]。此外,miR-29还可能使其他几种癌基因沉默,包括抗凋亡蛋白MCL1、p53上游抑制剂、DNA甲基转移酶和细胞外基质蛋白[32]。
ALL是儿童中最常见的癌症,也是年轻人癌症死亡的最常见原因[33]。目前药物治疗能够取得较高的生存率,但15%~20%的儿童患者可出现复发[34]。Salzman通过差异表达分析发现,在幼稚B细胞(CD19+)和造血干细胞(CD34+)数百个基因编码的转录本中,有10%以上是环状RNA[35]。Hu等发现circPVT1可通过结合miR-125和let-7抑制细胞增殖和凋亡,最终增加癌基因MYC和抗凋亡蛋白BCL2的表达,进而促进白血病的进展[36]。Gaffo等的研究发现儿童患者B细胞前体细胞中,circPVT1、circHIPK3和circPAX5表达显著上调。circPAX5和circHIPK3与miR-124-5p的结合被认为可协同干扰B细胞成熟和促进疾病进展[37]。
CLL的特点是小而成熟的CD5+B细胞在血液、骨髓和淋巴器官中积聚。CLL B细胞具有相对较低的增殖率和较高的抗凋亡能力[38]。研究发现circRPL15在CLL患者血浆中差异表达,被认为是CLL诊断筛查的潜在生物标志物[39]。Xia等研究发现,circCBFB在CLL细胞中上调表达,提示其可以作为CLL患者的预后和诊断标志。circCBFB可通过结合miR-607激活人类细胞系中的Wnt/β-catenin通路,进而参与CLL的进展[40]。Wu等发现circ_0132266在CLL细胞系中可结合miR-337-3p,被认为可能是CLL的抑瘤因子[41]。
淋巴瘤是起源于淋巴细胞或其祖细胞的恶性肿瘤,往往局限于淋巴结和淋巴系统。淋巴瘤分为霍奇金淋巴瘤和非霍奇金淋巴瘤,后者较为常见。非霍奇金淋巴瘤根据细胞系可分为两大类:B细胞淋巴瘤(BCL)和T细胞淋巴瘤(TCL)。
Deng等发现上调表达的circLAMP1可通过吸附miR-615-5p,从而增加盘状结构域受体酪氨酸激酶2(DDR2)的表达水平,DDR2编码受体酪氨酸激酶蛋白家族的一员,进而激活参与细胞增殖、细胞外基质重塑和肿瘤侵袭的信号通路。敲低和过表达实验进一步验证了circLAMP1在促进TCL细胞增殖和抑制凋亡中的作用[42]。
弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)是最常见的非霍奇金淋巴瘤[43]。Hu在DLBCL细胞的细胞质和细胞核中均检测到circAPC表达减低,circAPC吸附miR-888进而促进APC的翻译,最终通过抑制Wnt/β-catenin通路而使细胞增殖能力减弱[44]。间变性大细胞淋巴瘤(ALCL)是一种罕见的高侵袭性T细胞淋巴瘤[45],Babin等利用CRISPR/Cas9技术在小鼠和人类细胞系中构建出NPM1-ALK易位模型,并鉴定出f-circRNA-mA和f-circRNA-hD为ALCL相关circRNA(统称为f-circRNA-NPM1-ALK)[46]。
多发性骨髓瘤(MM)的特点是骨髓浆细胞增生,是第二常见的血液肿瘤,占所有血液恶性肿瘤的10%[47],转移率高且易出现耐药[48]。然而,当前关于circRNA调控MM发病的研究相对较少。刘等发现circSMARCA5在MM组织和细胞系中显著下调,且具有较好的诊断价值,circSMARCA5的表达水平与β-2-微球蛋白和MM分期呈负相关[49]。Feng等的研究发现,circ_0000190在MM患者的骨髓和外周血中均低表达,进一步研究发现circ_0000190表达减少导致miR-767-5p水平增加,通过抑制MAPK4表达进而促进MM进展[50]。随后,Chen等检测了circ_0000190在47例患者中的表达,结果显示,circ_0000190的高表达与更高的总生存率有关,证实circ_0000190具有潜在的治疗价值[51]。
综上所述,circRNA在白血病中发挥着重要的调控作用,可作为白血病的诊断、预后和耐药预测的生物标志。随着转录组学相关技术的不断发展,与白血病发病机制有关的circRNA不断地被挖掘。未来还需深入研究circRNA调控恶性血液病发生发展的分子机制及其临床意义,以便为恶性血液病的诊断和治疗提供精确的生物标志和治疗靶点。