吴利 陈少金 李周扬 陈谦 黎元莉
5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶(methylenetetrahydrofolate reductase,MTHFR)和甲硫氨酸合成酶还原酶(methionine synthase reductase,MTRR)是叶酸代谢途径中的关键酶,MTHFR C677T、A1298C和MTRR A66G基因位点多态性可使其相应酶活性降低,在同型半胱氨酸转变为甲硫氨酸的过程中出现障碍,造成叶酸水平降低及血浆中同型半胱氨酸浓度升高[1-2]。而同型半胱氨酸水平的升高可使新生儿神经管缺陷、唇腭裂、先心病及孕产妇妊娠高血压、贫血、自发性流产等疾病发生风险增加[3-4]。MTHFR与MTRR基因多态性存在地区及民族的分布差异,目前尚未见三亚地区关于叶酸利用能力的大样本研究报道。本文对三亚市汉族和黎族女性MTHFR与MTRR基因多态性进行分析,并与国内其他民族进行对比,旨在阐明本地区人群的遗传特征,为出生病因学研究及基于遗传特征的个体化治疗提供科学依据。
根据知情同意原则,选择2014年10月至2018年7月在三亚市人民医院进行孕前或孕期检查的汉族女性1 590例,年龄(27.55±4.79)岁;黎族女性420例,年龄(26.65±4.67)岁。排除非本地区户籍以及DNA抽提不符合要求的人群,所有患者均签署知情同意书。
MTHFR C677T、A1298C位点和MTRR A66G位点的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)分型采用Taqman-MGB技术测定。仪器:低温离心机Beckman J-6BABI、ABI 7900型荧光定量PCR仪;试剂:Buffer A、Buffer B、饱和酚、氯化钠及异丙醇等。相关仪器、试剂均使用美国Applied Biosystems(AB)公司产品。
采集口腔黏膜上皮细胞,采用硅胶吸附法提取基因组DNA。采用荧光定量PCR技术检测MTHFR C677T、A1298C和MTRR A66G基因位点SNP。PCR 反应体系为 10 μL,包含 1 μL 基因组DNA(20 ng/μL),5 μL Taqman Universal Master Mix,0.5 μL Taqman-MGB 探针(表1),3.5 μL 去离子水。反应条件:95℃预变性10 min;92℃变性15 s,60℃延伸 1 min,20个循环;89℃变性 15 s,60℃延伸90 s,30个循环。反应完成后,在ABI 7900型荧光定量PCR仪上读取样品孔中的终点荧光,利用分析软件确定各个样本的基因分型结果。
表1 Taqman-MGB探针所在位置Table 1 Taqman-MGB probe location
采用SPSS 19.0进行统计学分析,采用Haplo-View 4.2进行Hardy-Weinberg平衡、LD水平及单倍型结构分析。计数资料采用百分率表示,对基因型及等位基因频率进行χ2检验,以P<0.05为差异具有统计学意义。
对三亚市1 590例汉族和420例黎族女性MTHFR C677T、A1298C和MTRR A66G基因位点的检测数据进行Hardy-Weinberg平衡检验。其中,汉族女性MTHFR C677T位点不符合Hardy-Weinberg遗传平衡(χ2=14.83,P<0.05),不具有本地区代表性,后文不予分析;黎族女性的MTHFR C677T位点及汉族和黎族女性的MTHFR A1298C与MTRRA66G位点检验结果符合Hardy-Weinberg遗传平衡(P>0.05),具三亚地区群体代表性。
三亚黎族女性MTHFR C677T位点基因型分布及等位基因频率与思南苗族[5]、延边朝鲜族[6]、南宁壮族[7]、乌苏哈萨克族[8]、银川回族[9]、新疆维吾尔族[10]、张家界土家族[11]相比均有显著性差异(P<0.05)。三亚黎族女性MTHFR A1298C位点基因型分布及等位基因频率与南宁壮族[7]、乌苏哈萨克族[8]、新疆维吾尔族[10]相比无显著性差异(P>0.05),与文中其他民族相比有显著性差异(P<0.05)。三亚黎族女性MTRR A66G位点基因型分布及等位基因频率与乌苏哈萨克族[8]和新疆维吾尔族[10]相比无显著差异(P>0.05),与文中其他民族相比有显著性差异(P<0.05)(表2、3)。
三亚市黎族女性MTHFR C677T和A1298C两位点组合情况见表4。单倍型结构分析结果显示存在3种组合AC(56.1%)、CC(30.6%)、AT(13.3%)。两位点存在连锁不平衡现象(D'=1.00,r2=0.07)。
表2 三亚黎族与不同民族女性MTHFR、MTRR基因型频数与频率[n(%)]Table 2 Comparison of MTHFR and MTRR genotype distribution and frequencies between the Li women in Sanya and other different nations[n(%)]
表3 三亚黎族与不同民族女性MTHFR、MTRR等位基因频数与频率[n(%)]Table 3 Comparison of MTHFR and MTRR allele frequencies between the Li women in Sanya and other different nations[n(%)]
表4 MTHFR C677T和A1298C连锁型分布[n(%)]Table 4 Distribution of linkage between MTHFR C677T and A1298C[n(%)]
叶酸是一种水溶性维生素,在生物体内以四氢叶酸的形式发挥作用,四氢叶酸是细胞生化反应中甲基的主要供应者,参与嘌呤及嘧啶的合成及同型半胱氨酸的代谢[12]。叶酸缺乏可引起5-甲基四氢叶酸水平下降,从而使S-腺苷甲硫氨酸(S-adenosyl methionine,SAM)水平下降,最终导致DNA低甲基化。此外,低叶酸水平还可使尿嘧啶错误掺入DNA,使DNA链断裂增加,并可导致DNA在复制过程中错误发生率增加,影响DNA的生物合成。体内叶酸水平由叶酸摄入量和叶酸代谢水平决定,正常的叶酸水平对于正常胚胎生长和发育是必不可少的[13]。现已有研究表明,叶酸代谢障碍与唇腭裂、先天愚型、心脏畸形、多发畸形、泌尿系统畸形、肢体畸形、妊娠期贫血、妊娠期高血压的发生具有相关性[14]。叶酸缺乏在我国汉族女性中的发生率极高,远高于欧美国家。
叶酸代谢过程是一个涉及包括5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)、甲硫氨酸合成酶(MTR)、甲硫氨酸合成酶还原酶(MTRR)和胱硫醚-β-合酶(CBS)等多种酶参与的过程,其中MTHFR和MTRR是叶酸代谢过程中发挥重要作用且突变率较高的关键酶[13]。在叶酸代谢过程中,MTHFR是叶酸活化的核心酶,也是同型半胱氨酸代谢和甲硫氨酸合成的关键酶,其不可逆地催化5,10-亚甲基四氢叶酸转化为5-甲基四氢叶酸。而MTRR是参与同型半胱氨酸代谢的关键酶,其通过催化还原维生素B12(甲基钴胺素)甲基化状态而维持MTR的活性,是平衡同型半胱氨酸水平的关键因素。相关研究已证实,MTHFR和MTRR基因位点多态性均可引起酶活性降低,从而影响叶酸代谢,造成同型半胱氨酸的堆积,增加出生缺陷发生的风险[15]。本研究针对三亚市黎族和汉族女性中MTHFR最常见的突变位点MTHFR C677T和A1298C,以及MTRR最常见的突变位点MTRR A66G这3个基因位点的多态性进行检测分析,以阐明本地区不同民族人群的遗传特征,了解其与国内其他民族基因多态性分布的差异,为下一步有针对性的进行出生缺陷干预奠定基础。
本研究结果显示,三亚黎族女性的MTHFR C677T位点基因型分布及等位基因频率与思南苗族[5]、延边朝鲜族[6]、南宁壮族[7]、乌苏哈萨克族[8]、银川回族[9]、新疆维吾尔族[10]、张家界土家族[11]相比均有显著性差异(P<0.05),表明该位点的多态性分布存在民族差异。除去乌苏哈萨克族和新疆维吾尔族,本文列举的其他少数民族符合从北到南T等位基因频率逐渐递减的趋势(最高为银川51.80%,最低为三亚13.33%),与汉族的地域分布规律相似[16],该位点的多态性分布存在地域差异。三亚市黎族与汉族女性的MTHFR A1298C和MTRR A66G位点多态性存在显著性差异(P<0.05),说明这2个位点在相同地区的不同民族间存在差异,该差异与地域分布无关。三亚黎族女性MTHFR A1298C位点基因型分布及等位基因频率除与南宁壮族[7]、乌苏哈萨克族[8]、新疆维吾尔族[10]相比无显著性差异(P>0.05),与文中列举的其他民族相比均有显著性差异(P<0.05)。除去乌苏哈萨克族和新疆维吾尔族,本文列举的其他少数民族符合从北到南C等位基因频率逐渐递增的趋势(最高为三亚30.60%,最低为延边18.20%),该位点的多态性分布存在一定的地域差异,但差异性没有MTHFR C677T位点的强。三亚黎族女性MTRR A66G位点基因型分布及等位基因频率除与乌苏哈萨克族[8]和新疆维吾尔族[10]相比无显著差异(P>0.05),与文中列举其他民族相比均有显著性差异(P<0.05)。表明MTHFR A1298C和MTRR A66G位点的多态性分布存在民族差异,但其民族特异性可能没有MTHFR C677T位点强。MTHFR C677T和MTHFR A1298C位点多态性的分布存在地域差异,MTRR A66G位点的多态性分布未发现有地域差异。
我国汉族人群MTHFR C677T位点的多态性具有地域性差异,T等位基因频率呈现北高南低的趋势,MTHFR A1298C和MTRR A66G位点多态性的地域差异相对来说比较不明显[16]。而三亚市汉族人口来源驳杂,祖籍本地的汉族居民所占比例较少,这可能是造成MTHFR C677T位点不符合Hardy-Weinberg平衡的原因。
本研究对三亚黎族女性的MTHFR C677T和A1298C两位点均进行了单倍型连锁不平衡研究。MTHFR C677T位点位于第一号染色体MTHFR基因第5个外显子上,物理位置为11796321 bp。MTHFR A1298C位点位于第一号染色体MTHFR基因第8个外显子上,物理位置为11794419 bp。理论上,连锁不平衡性随着遗传距离的增加而下降,通过分析,D'=1.00,表明两位点间存在连锁关系,r2=0.07,表明两位点间的连锁强度不高。三亚黎族女性的MTHFR C677T和A1298C两位点间存在连锁平衡,但连锁强度不高,可能发生了基因重组等情况。
目前孕期保健措施为育龄妇女从孕前3个月至妊娠满3个月每日补服叶酸,根据不同的生育史、家族史等情况服用不同剂量[17]。而叶酸代谢障碍的人群,对叶酸的利用率较低。通过遗传筛查,可针对存在叶酸代谢障碍的人群采取增加营养素补充,加强监测等等干预措施,达到出生缺陷一级预防的目的,以达到预防出生缺陷儿出生和提高人口素质的目的。