沙门菌19个毒力岛标志性基因的PCR检测

2017-01-06 09:24胡兴娟王忠发杨赛军徐君辉
动物医学进展 2016年5期
关键词:标志性沙门毒力

胡兴娟,沈 飚,王忠发,杨赛军,徐君辉

(舟山出入境检验检疫局,浙江舟山 316021)

沙门菌19个毒力岛标志性基因的PCR检测

胡兴娟,沈 飚,王忠发,杨赛军,徐君辉

(舟山出入境检验检疫局,浙江舟山 316021)

建立沙门菌19个毒力岛标志性基因检测方法,了解沙门菌中毒力岛的分布情况。通过比对验证挑选出45个毒力基因作为19个毒力岛标志性基因,建立PCR检测方法,并对伤寒、肠炎、鼠伤寒及贝坎道夫沙门菌进行分布情况研究。19个毒力岛上45个标志性基因分别在伤寒、肠炎、鼠伤寒及贝坎道夫沙门菌得到验证, PCR扩增产物与预期扩增产物一致,电泳条带典型,无非特异扩增条带及杂带出现。45个标志性基因在伤寒、肠炎、鼠伤寒及贝坎道夫沙门菌检出率分别为75.56%、75.56%、66.67%和42.22%。本研究建立的45个毒力岛标志性基因检测方法具有结果准确、简单快速、费用低廉等优点,适用于沙门菌毒力岛研究及不同来源的沙门菌致病性风险评估。

沙门菌;毒力岛;标志性基因;PCR检测

细菌毒力岛(pathogenicity island)是染色体、质粒上成簇分布的编码毒力相关基因的特定区域[1]。毒力岛的发现使我们认识到细菌的毒力比我们想象的要复杂,改变了以往认为细菌的毒力是单因素的概念。目前,已知许多病原细菌,如大肠埃希菌[2]、沙门菌[3]、金黄色葡萄球菌[4]等都存在毒力岛,而且一种病原细菌往往具有1个或多个毒力岛。沙门菌的致病性也与其毒力岛(Salmonellapathogenicity island,SPI)密切相关[5],毒力岛在沙门菌入侵肠道上皮细胞过程中扮演重要角色。研究发现,沙门菌至少有19个毒力岛,每个毒力岛上分布的毒力基因数量不等,其中 SPI-1上分布着20个,SPI-2、SPI-3和SPI-6均为8个,SPI-7和SPI-11均为6个,SPI-5有4个,SPI-4和SPI-10均为3个,其余的SPI均为2个[6]。国内对沙门菌毒力岛及其标志性基因检测研究进展较慢,多数局限于SPI-1~SPI-5,每个毒力岛的标志性基因多仅为1个[7-8]。

本研究根据Suez J等[6]报道的沙门菌19个SPI上的86个毒力基因,通过比对验证挑选出45个毒力基因作为19个毒力岛标志性基因,建立检测方法,并分别在伤寒、肠炎、鼠伤寒及贝坎道夫沙门菌进行分布情况研究。

1 材料与方法

1.1 材料

1.1.1 菌株来源 伤寒沙门菌、肠炎沙门菌、鼠伤寒沙门菌均由宁波市疾控中心赠予;贝坎道夫沙门菌由本单位菌种室分离;伤寒沙门菌、肠炎沙门菌、鼠伤寒沙门菌来源于病人的血液与粪便样本,贝坎道夫沙门菌来源于冷冻水产品样本。

1.1.2 主要试剂及仪器 DNA扩增试剂盒RR045A、DNA Marker DL 1 000和琼脂糖购自宝生物工程(大连)有限公司;Veriti普通PCR仪购自美国ABI公司;凝胶成像仪、电泳仪及小型电泳槽购自美国伯乐公司;大型电泳仪及电泳槽Tanon EPS-100购自天能公司;高速离心机LEGEND Micro 21R购自美国Thermo公司。

1.2 方法

1.2.1 引物设计与合成 sseL、mgtC、siiE与sopB的引物序列分别参考陈飞等[9]报道的序列,其余引物序列的设计选择多重耐药伤寒沙门菌株CT18(NC-003198)和鼠伤寒沙门菌LT2(NC-003197)上的靶基因序列,引物设计选用美国IDTDNA公司网上设计软件(http://www.idtdna.com/primerquest/Home/Index),软件提供的引物序列经Blast比对后确认最合适的一对备用并提交宝生物工程(大连)有限公司合成,19个SPI上的45对标志性毒力基因名称和引物序列见表1。

表1 沙门菌毒力岛上标志性毒力基因的靶基因与引物序列

Table 1 Target genes and primers used forSalmonellapathogenicity islands

毒力位点Virulenceloci基因名Gene位点标记Locustag引物序列(5'-3')Primersequences产物长度/bpLengthSPI-1HilASTM2876GACAGAGCTGGACCACAATAAGACA,GAGCGTAATTCATCGCCTAAAC312SPI-1invASTM2896CCGATTTGAAGGCCGGTATTA,GAGATCGCCAATCAGTCCTAAC587SPI-1sipDSTM2883ACAGCTATCTGGGCGTTTATG,CGACTGCCAGGCTTGATATT437SPI-1prgHSTM2874CTTCAGGYCAACTCCCTGATATAC,CCCTTGAGCCAGTCATCTTT961SPI-2ssaBSTM1393GATATCAGGGCCGAAGGTAAT,GCAAGTTAAAGCCAGGTGTTT294SPI-2sseCSTM1400ATGAATCGAATTCACAGTAA,TTAAGCGCGATAGCCAGCTA1445SPI-2ssrBSTM1391CTCATTCTTCGGGCACAGTTA,CCTTATTACCCTGGCCTCATTT558SPI-2sseLSTM2287TGTTTAGCGCCGTAGAGAAC,CGCGGAACCTGCCATATAA269SPI-3marTSTM3759CGTCGTCTCACAACAAACATTC,CTGACAAATCAATGCCGTAACC556SPI-3misLSTM3757CACTGACCTGACGCTGAATAG,GACTTGACCACGGGAATGATAG946SPI-3mgtCSTM3764AAAGACAATGGCGTCAACGTATGG,TTCTTTATAGCCCTGTTCCTGAGC500SPI-4siiESTM4261TTTTTTGCCGATCAAAATTCTGTA,TATACTATCATCTTTGCTACCGCT750SPI-4siiDSTM4260GTCAGGGCGTTATCACTACTAAA,TTCACATCGGCCAGCATAG826SPI-4siiFSTM4262CGCGGTGAACTCTGTTATGT,CATCCTGCCTTGCTGTGATA355SPI-5pipBSTM1088CCTGTGGTGGAGTAAGAAGAAG,GTCAGTTAAGTCTGAGCCGAATA599SPI-5sopBSTM1091TCACTAAAAACCCAGGAGGCTTTT,CGCCATCTTTATTGCGGATTTTTA1000SPI-6pagNSTM0306TTCCAGCTTCCAGTACGTTTAG,GCCTTTGTGTCTGCATCATAAG440SPI-6safBSTM0300GGTGATGCCGCCTCTATTT,CGTAGTGGAACGGATGACTTT476SPI-7pilVSTY4550CATCAGCGACCACAACTACA,GGACCATTACTGACCAGACTTAC544SPI-7vexASTY4655AAACTAAGCGCTCCCGATAC,CAGTCGCGCAGTGAAATAATG504SPI-7tviESTY4656GCGGCCTGAAAGTAGAAGAA,ACCCGAAACACCCTCAATAAA959SPI-8STY3281STY3281CGGAAAGTGAGTTCATTGATTTCT,TCCTTGAGATTCTCTCCATTCTTT209SPI-8STY3283STY3283CCTTGAAGATTATACAGAAGATGAG,TAGCTCTTCAATAACTCCTTCAG211SPI-9bapASTM2689TAAGCGTCGGACTTGGTAATG,CGTTCTTCAGCGTGTAGGTATAG543SPI-9STY2878STY2878TTTCTCATTCTCGGCATCTGG,CAATCGTCGTGACCTGGATATT685SPI-10sefASTY4836aTCAGGCAGCGGTTACTATTG,CGTAGAAGGTCGCAGTGAAA385SPI-10STY4826STY4826TGTTTCACTGTCCGTTCTGC,CTGTAGCAGCCCTGTACTTTAC220SPI-11pagCSTY1246TCTGTTGAGCCTGAAGGTATTC,CGACGTTGAAGCCGTTTATTT313SPI-11envFSTY1240TAGCGCCTGTGATAACGATAAA,ATCCGGCAATAGAACCATCC577SPI-12sspH2STM2241GGAGTGCATCTGGACGATTT,GACCTGATTCTCCCACGTTAAG488SPI-12oafASTM2232CGAGTGACTGGAACCAAAGA,CAAGCATAGAGCCAGAGTAGAG510SPI-13STM3118STM3118GGATTGCGAGGACAGCTAAA,CAGTGACTATCCAGTGCGTATC741SPI-13STM3121STM3121CGTCGTACTTTCAAGCGGGCTTATC,CTCTGCCGACACAAGGTTAATG381SPI-14STM0854STM0854ATCCTTCTGTTGACGGTATCAC,GTTTATCCACCATTTGCCCTTC240SPI-14STM0859STM0859GTTACGTAGCGATATGCAGGAG,GCAGCAGAGTGAGGCATTAT504SPI-15STY3188STY3188GCTGAATGGTGTGCTGAAATC,GGTGTTGCCATCTCTGGATAA706SPI-15STY3191STY3191TGACTACAGGCGGAGGATTA,AGACTCAGAGAAGGACAGAGAG356SPI-16STM0557STM0557GACAGGGCGAAACATAACAAAC,CCCATGTCCCAGATGTAATTGA475SPI-16gtrASTY0607TGTTATCGCCGTATCGTTCAG,TTCGCATCCCTAAAGACAATGA234SPI-17STY2629STY2629CTTTGGAGTGAGTCTGGCTATT,GCGCCAAGTAYTGGGATTATTG425SPI-17STY2631STY2631CGAGCTCAAACTCCCACAA,CTTTGAAGGTGGCGATGATTTC213SPI-18hlyESTY1498GGCGTGATTGAAGGGAAATTG,GCGTCTTCTTACCGTGTCTT289SPI-18taiASTY1499GAACCMAAACCTGTTGTGAAAG,AGCGGAAATAARCCGGTAAA281SPI-19SEN1003SEN1003CTGCACACGGCCACTTATTA,TGGACTTCCACCTTCATTTCC485SPI-19icmFSEN1004GCGTAGTCCAGATGAGACATTAG,GCGGCCAGATAGACGATATTT724

1.2.2 PCR检测方法

1.2.2.1 模板制备 取平板新鲜分离纯菌,悬浮于100 μL DNA提取液中混匀后置沸水中5 min,12 000 r/min高速离心5 min,取上清为DNA模板,置4℃备用。

1.2.2.2 PCR扩增 PCR反应体系为25 μL:RR045A扩增反应液12.5 μL,20 μmol/L上游引物和下游引物各0.5 μL,模板1 μL,双蒸水10.5 μL,混合后离心置PCR仪上扩增。PCR扩增条件:98℃ 10 s,55℃ 5 s,72℃ 10 s,30个循环;72℃1 min,4℃结束反应。

1.2.2.3 PCR产物分析 取上述PCR产物5 μL加入到20 g/L琼脂糖凝胶上90V 60 min电泳,电泳后凝胶成像仪鉴定,扩增产物分子质量判断参照DNA分子质量标准品DL1 000。以DL1 000提供的每条电泳条带的亮度及相对应的浓度(DNA分子质量为400 bp的条带其相对应的浓度约150 ng,其余条带的其相对应浓度约50 ng)为参比标准来判各个定毒力基因的PCR扩增产物强度:亮度≥150 ng为+++~++++;50 ng<亮度<150 ng的为++;亮度在50 ng左右的为+。

2 结果

2.1 45个标志性毒力基因在4株沙门菌中检测结果

由表2可知,45个标志性毒力基因检测结果,在伤寒沙门菌的阳性率75.56%(34/45),肠炎沙门菌的阳性率75.56%(34/45),鼠伤寒沙门菌的阳性率66.67%(30/45),贝坎道夫沙门菌的阳性率42.22%(19/45)。

表2 4种沙门菌中19个毒力岛分布情况

Table 2 Distribution of 19 pathogenicity islands across 4 species ofSalmonella

毒力位点Virulenceloci基因名Gene/Locustag基因描述Genedescription伤寒沙门菌S.typhi肠炎沙门菌S.enteritidis鼠伤寒沙门菌S.typhimurium贝坎道夫沙门菌S.bergedorfSPI-1hilA/STM2876转录调节蛋白Transcriptionalregulator+++++++++++++SPI-1invA/STM2896侵入蛋白Invasionprotein++++++++++++SPI-1sipD/STM2883细胞侵入蛋白Cellinvasionprotein++++++++++++SPI-1prgH/STM2874分泌系统蛋白Secretionsystemprotein++++++++++++++SPI-2ssaB/STM1393分泌系统装配蛋白Secretionsystemappa-ratusprotein++++++++++SPI-2sseC/STM1400分泌效应蛋白Secretedeffectorprotein+++++++++++++SPI-2ssrB/STM1391转录激活蛋白Secretionsystemtranscrip-tonalactivator+++++++++++++++SPI-2sseL/STM2287去泛素化酶Deubiquitinase+++++++++++SPI-3marT/STM3759转录调控蛋白Transcriptionalregulator+++++++++++++SPI-3misL/STM3757自动转运蛋白Autotransportedprotein+++++++++++++SPI-3mgtC/STM3764mgtC蛋白ProteinmgtC++++++++++++SPI-4siiD/STM4260膜渗透酶Membranepermease++++++++++++-SPI-4siiE/STM4261假定蛋白Hypotheticalprotein++++++++++++-SPI-4siiF/STM4262细菌素运输蛋白Bacteriocin/lantibioticABCtransporter+++++++++++++SPI-5pipB/STM1088毒力岛蛋白BPathogenicityisland-encodedproteinB++++++++++++++SPI-5sopB/STM1091肌醇磷酸盐酶Inositolphosphatephospha-taseSopB+++++++++++++SPI-6pagN/STM0306黏附素Adhesin/invasinproteinPagN+++++++++++++SPI-6safB/STM0300菌毛装配伴侣蛋白Bacteriocin/lantibioticABCtransporter++++++++++++-SPI-7pilV/STY4550纤毛尖端黏附素Prepilin+++---SPI-7vexA/STY4655Vi输出蛋白ViPolysaccharideexporterprotein++++---SPI-7TviE/STY4656内毒素生物合成蛋白ViPolysaccharidebio-synthesisprotein++++---SPI-8STY3281/STY3281细菌素免疫蛋白Bacteriocinimmunitypro-tein++---SPI-8STY3283/STY3283细菌素免疫蛋白Bacteriocinimmunitypro-tein++---SPI-9bapA/STM2689伪蛋白Pseudo++++++++++++++SPI-9STY2878/STY2878Ⅰ型分泌系统蛋白TypeIsecretionsystemprotein+++++++++++++++SPI-10sefA/STY4836a主要纤毛蛋白亚族MajorpilussubunitSafA++++++--SPI-10STY4826/STY4826噬菌体调控蛋白Bacteriophagegeneregula-toryprotein++---

续表2

毒力位点Virulenceloci基因名Gene/Locustag基因描述Genedescription伤寒沙门菌S.typhi肠炎沙门菌S.enteritidis鼠伤寒沙门菌S.typhimurium贝坎道夫沙门菌S.bergedorfSPI-11pagC/STM1246毒性膜蛋白Virulencemembraneprotein-+++++++++SPI-11envF/STM1240脂蛋白Lipoprotein-++++++++++SPI-12sspH2/STM2241泛素蛋白连接酶E3ubiquitin-proteinligase++++++++++++-SPI-12oafA/STM2232O抗原乙酰转移酶O-antigenacetylase--+++-SPI-13STM3118/STM3118乙酰辅酶A水解酶Acetyl-CoAhydrolase-++++++++-SPI-13STM3121/STM3121LYs转录调控蛋白LysRfamilytranscrip-tionalregulator-++++++-SPI-14STM0854/STM0854细胞质蛋白Cytoplasmicprotein-+++++++-SPI-14STM0859/STM0859LYs转录调控蛋白LysRfamilytranscrip-tionalregulator-++++++++-SPI-15STY3188/STY3188假定蛋白Hypotheticalprotein----SPI-15STY3191/STY3191假定蛋白Hypotheticalprotein----SPI-16STM0557/STM0557内膜蛋白Innermembraneprotein++++++++++++-SPI-16gtrA/STY0607葡萄糖移位酶Bactoprenol-linkedglucosetranslocase++++++-SPI-17STY2629/STY2629脂多糖修饰酶Lipopolysaccharidemodifica-tionacyltransferase++++++++--SPI-17STY2631/STY2631伪基因Pseudo++++--SPI-18taiA/STY1499假定蛋白Hypotheticalprotein++---SPI-18hlyE/STY1498溶血素EHemolysinHlyE+++---SPI-19SEN1003/SEN1003假定蛋白Hypotheticalprotein-++++--SPI-19icmF/SEN1004Ⅵ型分泌蛋白TypeVIsecretionproteinIc-mF-++++--

2.2 45个标志性毒力基因PCR扩增效果

19个毒力岛上45个标志性基因分别在伤寒、肠炎、鼠伤寒及贝坎道夫沙门菌得到验证,由表2可知,上述45个标志性毒力基因通过PCR扩增获得强阳性结果(+++~++++)占82.22%(37/45),获得阳性结果(+~++)的占13.33%(6/45)。PCR扩增获得阴性结果占4.44%(2/45)。由图1、图2可见,每个标志性基因的PCR扩增产物分子质量与预期扩增产物一致,扩增产物电泳条带清晰,无非特异扩增条带及杂带出现。

2.3 阳性标志性基因在各个毒力岛上的分布

分布在SPI-1、2、3、4、5和9上的17个标志性基因对伤寒、肠炎、鼠伤寒与贝坎道夫4株沙门菌检查结果均为阳性,它们分别是hilA 、invA、sipD、prgH、ssaB、sseC、ssrB 、sseL、marT、misL、mgtC、siiF、pipB、sopB、pagN、bapA 和STY2878。分布在SPI-15上的STY3188和STY3191两个标志性基因对伤寒、肠炎、鼠伤寒与贝坎道夫4株沙门菌检查结果均为阴性。分布在SPI-7、8、10和18上的pilV、vexA、tviE、safA、taiA、hlyE、STY3281和STY3283等8个标志性基因仅在伤寒沙门菌中获得阳性结果。分布在SPI-11、12、13、14和19上的STM3118、STM3121、STM0854、STM0859、SEN1003、pagC、oafA、EnvF和icmF等9个标志性基因仅在非伤寒沙门菌(肠炎沙门菌或鼠伤寒沙门菌等)中获得阳性结果,其中SEN1003、icmF仅在肠炎沙门菌而oafA仅在鼠伤寒沙门菌上获得阳性结果(表2)。

3 讨论

细菌毒力岛是一组编码细菌毒力的基因簇,其所编码的基因产物多为分泌性蛋白、细胞表面蛋白、分泌系统(如Ⅲ型分泌系统)、信息传导和调节系统。沙门菌是全球上引起食源性腹泻最常见的病原菌之一。全球每年约有由沙门菌引起的肠胃炎病例938万例,甚至每年有15万人死于沙门菌感染[10]。我国沙门菌食物中毒多年来一直居细菌性食物中毒的首位。其中伤寒沙门菌是引起临床肠热症的主要血清型,肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌是引起急性胃肠炎及食物中毒的主要血清型[11],沙门菌的相关毒力基因在多种血清型中广泛存在,但其存在与否与菌株的血清型无关[12]。研究发现沙门菌至少有19个毒力岛(SPI),其上分布着85个毒力基因,这些基因控制或编码沙门菌的毒力因子(如菌毛、毒素 、酶等),研究和检测这些毒力基因在了解沙门菌的进化规律、阐述致病机理、认识和预测新发沙门菌病和食品安全评估等方面有着重要的意义。

A.扩增产物长度≤485 bp;B.扩增产物长度>485 bp;M.DNA标准DL 1 000;1~45.STY3188、STY3191、STY3281、STY3283、STY2631、STY4826、gtrA、STY0854、ssel、taiA、hlyE、ssaB、hilA、pagC、siiF、STY3121、sefA、STY2629、sipD、pagN、STN0557、safB、SEN1003、ssph2、mgtC、vexA、STM0859、oafA、bapA、pilV、marT、ssrB、EnvF、invA、pipB、STY2878、IcmF、STM3118、siiE、siiD、misL、tviE、prgH、sopB、sseC

A.Length of PCR products not more than 485 bp;B.Length of PCR products more than 485 bp; M.DNA Marker DL1 000;1-45.STY3188,STY3191,STY3281,STY3283,STY2631,STY4826,gtrA,STY0854,ssel,taiA,hlyE,ssaB,hilA,pagC,siiF,STY3121,sefA,STY2629,sipD,pagN,STN0557,safB,SEN1003,ssph2,mgtC,vexA,STM0859,oafA,bapA,pilV,marT,ssrB,EnvF,invA,pipB,STY2878,IcmF,STM3118,siiE,siiD,misL,tviE,prgH,sopB,sseC

图1 45个标志性基因PCR产物电泳图

Fig.1 Electrophoresis of PCR products of 45 iconic genes

在已发现的19个SPI中以SPI-l和SPI-2与致病性最为密切相关,它们各自编码不同Ⅲ型分泌系统,在感染的不同阶段都发挥关键作用[13]。SPI-3和SPI-4对沙门菌在膜性结构内存活和黏附在极化细胞的表面发挥重要作用。SPI-5编码的效应蛋白通过SPI-1和SPI-2编码的Ⅲ型分泌系统分泌[14]。其余的毒力岛是近年来陆续发现的,各个毒力岛上的毒力基因与其编码的蛋白已在表2中逐一介绍。本文在85个毒力基因中挑选45个作为19个SPI的标志性基因,通过对伤寒、肠炎、鼠伤寒及贝坎道夫4株沙门菌进行检测,结果显示,除了STY3188和STY3191两个标志性基因阴性外,其余43个标志性基因均获阳性结果,但不同菌株间的阳性量具有一定的差异,尤其是来源于病人的伤寒、肠炎和鼠伤寒沙门菌携带的毒力基因数量明显多于来源于食品的贝坎道夫沙门菌。对阴性的2个标志性基因(STY3188和STY3191)进行全序列Blast比对,结果显示,这2个基因序列仅存在于多重耐药的伤寒沙门菌菌株CT18(NC-003198)以及少数大肠埃希菌和志贺菌的染色体上。

国内对沙门菌毒力岛标志性基因检测方法存在以下不足:①仅局限于SPI-1~SPI-5的范围之内且每个毒力岛仅提供一个标志性基因,造成选择范围狭窄。②各个标志性毒力基因的PCR扩增程序不同,造成工作效率低下。本文研究针对上述状况作了以下的补充与优化:①SPI从原来的5个扩展到19个,SPI上的标志性基因检测也从5个增加到45个,为今后SPI的深入研究提供了参考依据。②45个标志性基因的检测可通用于一个PCR程序,简化了试验操作与基因扩增步骤。③明显提高检测效率,从模板制备、试剂配制、基因扩增及产物电泳分析整个过程可在1 h左右完成,为大规模的流行病学监测提供了一个简单快捷、高效准确的检测平台。④所有标志性基因的PCR产物在成像仪下观察,背景清晰,结果准确,特异条带明亮典型,未见有非特异性条带、杂带和拖带现象。

本文为国内沙门菌毒力岛研究的同行提供了沙门菌19个毒力岛标志性基因的简单快捷、准确高效的检测方法,可为不同来源和不同血清型的沙门菌致病性及潜在风险研究提供一种简单可行且比较科学的研究方法,对评估该沙门菌可能引起流行强度和致病风险具有较大的应用价值。

[1] 陈 俊,蒋文灿,谭 天,等.沙门菌毒力岛及Ⅲ型分泌系统研究进展[J].中国人兽共患病学报,2015,31(4):371-376.

[2] Calhau V,Domingues S,Ribeiro G,et al.Interplay between pathogenicity island carriage,resistance profile and plasmid acquisition in uropathogenicEscherichiacoli[J].J Med Microbiol,2015,64(8):828-35.

[3] 王玉平,杨福江.沙门菌毒力岛基因在不同血清型沙门菌中的分布特点[J].中国卫生检验杂志,2015,25(10):1609-1611.

[4] Andrey DO,Jousselin A,Villanueva M,et al.Impact of the regulators sigB,rot,sarA and sarS on the toxic shock Tst promoter and TSST-1 expression inStaphylococcusaureus[J].PLoS One,2015,10(8):e0135579..

[5] 沈伟伟,裘丹红,盛 莹,等.台州市食源性沙门菌耐药性毒力因子及分子分型研究[J].中国食品卫生杂志,2013,4(25):315-319.

[6] Suez J,Porwollik S,Dagan A,et al.Virulence gene profiling and pathogenicity characterization of non-typhoidalSalmonellaaccounted for invasive disease in humans[J].PLoS One,2013,8(3):e58449.

[7] 程 琼,庞瑞亮,王若晨,等.不同源沙门氏菌对小鼠致病力的比较与毒力基因检测[J].中国人兽共患病学报,2013,29(5):460-465.

[8] 王晶钰,董 睿,王利勤,等.市售鲜鸡蛋中沙门氏菌的分离鉴定及毒力岛基因检测[J].食品科学,2012,33(16):154-158.

[9] 陈 飞,成大荣,王丽芳,等.禽沙门氏菌毒力岛标志基因研究与mgtC基因序列分析[J].江苏农业科学,2010(6):53-56.

[10] Majowicz S E,Musto J,Scallan E,et al.The global burden of nontyphoidalSalmonellagastroenteristis[J].Clin Infect Dis,2010,50(6):882-889.

[11] 吴 洁,刘丽红,金玉娟,等.2010-2013年深圳市龙岗区沙门菌分子流行病学分析[J]热带医学杂志,2015,15(9):1262-1265.

[12] 李 幸,罗 薇,刘内生,等.大雁和天鹅源沙门菌毒力基因分布的初步研究[J].动物医学进展,2014,35(3):28-32.

[13] Das C,Dutta A,Rajasingh H,et al.Understanding the sequential activation of type Ⅲ and type Ⅵ secretion systems inSalmonellatyphimuriumusing boolean modeling[J].Gut Pathog,2013.doi:10.1186/1757-4749-5-28.

[14] Karasova D,Sebkova A,Havlickova H,et al.Influence of 5 majorSalmonellapathogenicity islands on NK cell depletion in mice infected withSalmonellaentericaserovarenteritidis[J].BMC Microbiol,2010.doi:10.1186/1471-2180-10-75.

PCR Detection of Iconic Genes in 19SalmonellaPathogenicity Islands

HU Xing-juan,SHEN Biao,WANG Zhong-fa,YANG Sai-jun,Xu Jun-hui

(ZhoushanEntry-ExitInspectionandQuarantineBureau,Zhoushan,Zhejiang,316000,China)

To develop a PCR method for detection ofSalmonellapathogenicity island genes and to investigate the distribution of pathogenicity islands inSalmonella,by comparing selected 45 virulence genes as the iconic genes of 19 pathogenicity islands,PCR assay was established for detectingS.typhi,S.enteritidis,S.typhimuriumandS.bergedorf.45 iconic virulence genes distributed among the 19 pathogenicity islands were validated inS.typhi,S.enteritidis,S.typhimuriumandS.bergedorf.The length of amplified products were the same as expected and bands of which were rather typical and clear.The detection rates of 45 virulence genes were 75.56%,75.56%,66.67% and 42.22%,respectively,inS.typhi,S.enteritidis,S.typhimuriumandS.bergedorf.The PCR method which was accurate,rapid and low-cost was available for studyingSalmonellapathogenicity islands and evaluating the relative risk.

Salmonella; pathogenicity island;iconic gene;PCR detection

2015-10-14

国家质检总局科技计划项目(2014IK278);浙江省分析测试科技计划项目(2014C37108)

胡兴娟(1981-),女,浙江绍兴人,工程师,主要从事微生物与食品安全研究。

S852.612

A

1007-5038(2016)05-0020-06

猜你喜欢
标志性沙门毒力
一株鸡白痢沙门菌噬菌体的发酵及后处理工艺研究
瑞安市腹泻患者沙门菌耐药性和分子分型研究
猪源致病性大肠杆菌毒力基因检测及药敏试验
“熊出没,注意”的由来
屠呦呦入围“20世纪最具标志性人物”
申嗪霉素和咪唑菌酮复配对几种病害的室内毒力测定研究
阿维菌素与螺螨酯对沾化冬枣截形叶螨的毒力筛选及田间防效研究
华东地区沙门菌流行病学及耐药性分析
饮食和服务行业健康人群携带沙门菌调查
伊朗遭“标志性攻击”震动中东