SNAPIN基因对受体酪氨酸激酶c-MET在HEK 293T细胞中表达的影响

2015-12-25 02:07高迎春张传领牛丽丽温建勋程国强内蒙古医科大学内蒙古自治区分子病理学重点实验室呼和浩特00059内蒙古医科大学药学院共同第一作者通讯作者mailxiaorui79hotmailcom
山西医科大学学报 2015年8期
关键词:定量质粒测序

高迎春,张传领,牛丽丽,温建勋,程国强,肖 瑞(内蒙古医科大学内蒙古自治区分子病理学重点实验室,呼和浩特 00059;内蒙古医科大学药学院;共同第一作者;通讯作者,E-mail:xiaorui79@hotmail.com)

SNAPIN 蛋白(SNAP-associated protein,SNAPAP;BLOC1S7)又称突触小体相关蛋白,最初是在神经细胞中作为与可溶性NSF附着蛋白受体(soluble N-ethylmaleimide-sensitive factor attachment protein receptor,SNARE)复合物中的SNAP-25蛋白结合被发现的,在神经元中表达量丰富,主要分布在突触囊泡膜上[1],参与囊泡融合以及神经递质的释放。后有研究发现SNAPIN在神经细胞和非神经细胞的胞质中均有表达。

SNAPIN是由136个氨基酸组成的相对分子质量约为15 000的蛋白,其二级结构大部分为α螺旋[2],N末端有一个疏水区(1-20aa),C末端有由两个螺旋区H1和H2形成的卷曲螺旋(coiled-coil),该螺旋结构域在许多囊泡融合蛋白中保守存在。研究发现SNAPIN蛋白功能的发挥主要通过卷曲螺旋与其他蛋白相互作用来实现。SNAPIN是一种广泛表达的蛋白,在心脏、肝脏、肾脏中均有表达[3],提示该蛋白可能在不同组织中发挥不同的作用。SNAPIN除与SNAP25结合之外,还与雌激素受体结合位点相关抗原 9(EBAG9)[4],cypin[5],casein kinase 1-delta[6],a subunit of Exo70[7],经典瞬时受体电位 6(TRPC6)[8],膜转运调控蛋白 1(EHD1)[9],腺苷酸环化酶Ⅵ(type Ⅳ adenylyl cyclase)[10],ryanodine receptor[11],受体酪氨酸激酶 c-MET[12],UT-A1 urea transporter[13]等蛋白相互作用。其中 c-MET酪氨酸激酶受体主要在上皮细胞中表达,参与胚胎发育、创伤恢复、组织重生和形态分化等;在病理状态下,c-MET和肝细胞因子(hepatocyte growth factor,HGF)可诱导肿瘤细胞的增殖、细胞扩散、血管形成、细胞黏附、细胞侵袭、细胞运动和抗凋亡等作用。

本实验通过实时定量PCR的方法在转录水平上来研究SNAPIN基因沉默和过表达后,其相互作用蛋白c-MET的表达,观察SNAPIN蛋白的表达及其对相关蛋白c-MET表达是否具有调控作用。

1 材料和方法

1.1 实验材料

HEK 293T细胞(人胚肾上皮细胞系)购置于上海中科院细胞库,质粒pEGFP-C1(内蒙古医科大学师永红馈赠),大肠杆菌DH5a(内蒙古自治区分子病理学重点实验室保存),限制性内切酶XhoⅠ和EcoRⅠ(Takara,Japan),分子质量标准品(DL3000,天根生物),Stealth siRNA sets(Cat.1299001,Invitrogen,USA),Trizol(上海生工),反转录试剂盒(Takara,Japan),SYBR green荧光定量PCR试剂盒(Takara,Japan),质粒提取试剂盒(天根生物),胶回收试剂盒(Qiagen,USA),PCR引物合成及重组质粒测序(上海生工),DMEM培养基(Gibco,USA),胎牛血清(杭州四季青),LipofectamineTM2 000(Invitrogen,USA)。

1.2 方法

1.2.1 重组载体构建 以Trizol法提取HEK 293T细胞的总RNA,反转录为cDNA,PCR扩增获取全长产物,上游引物:5'-ATC TCG AGC AGG ACA ATT CGT GAT GG-3'(含XhoI酶切位点);下游引物:5'-GAA TTC TCA TCT GTT ATT TGC CTG GG-3'(含EcoRⅠ酶切位点)。PCR产物大小约431 bp。扩增条件:95℃预变性5 min,94℃ 30 s,59℃30 s,72 ℃ 30 s,循环35 次,72 ℃延伸5 min。PCR扩增产物经酶切纯化后与相同酶切处理的载体pEGFP-C1连接。通过电穿孔转化到E.coli DH5α中,接种培养后,随机挑选单克隆通过PCR,酶切反应和测序鉴定。

1.2.2 细胞培养和转染 HEK 293T细胞用含10%FBS的DMEM高糖培养液培养,按2×105个细胞/孔接种于无菌6孔板中,次日待细胞生长至60%-70%融合度时进行转染。按LipofectamineTM2000脂质体转染试剂盒说明,将pEGFP-SNAPIN(过表达重组质粒)或Stealth siRNA(RNA干扰片段)分别转染至HEK 293T细胞中培养24-48 h,收集细胞进行基因表达检测。同时设立未转染细胞对照组。以上各细胞为同代细胞,细胞计数和培养条件等均保持一致,实验重复3次。

1.2.3 RNA提取和实时定量PCR Trizol法提取总RNA,以2 μg总RNA为模板进行逆转录,以表1引物、SYBR Green荧光染料(Takara,Japan)相对定量PCR检测,以GAPDH为内参。反应条件为:95℃预变性15 s,95℃变性15 s,退火15 s(退火温度见表1),72℃延伸20 s,共40个循环。引物设计采用primer 5.0软件,委托上海生工公司合成(见表1)。

表1 实时定量PCR实验的引物序列和相应的退火温度Table 1 Primer sequences and corresponding annealing temperature for real-time PCR

1.3 数据分析和统计处理

实时定量 PCR结果采用2-ΔΔCt法,其中 ΔΔCt=(Ct目标基因-Ct内参基因)样本-(Ct目标基因-Ct内参基因)对照。数据以±s表示,采用SPSS 10.0统计软件进行t检验。各组间样本均数进行单因素方差分析,P<0.05为差异有统计学意义。

2 结果

2.1 RT-PCR反应扩增SNAPIN全长基因

通过PCR扩增获得人的SNAPIN全长基因(431 bp,见图 1)。

图1 PCR扩增获得人全长SNAPIN基因Figure 1 The amplification of SNAPIN mRNA by PCR

2.2 pEGFP-SNAPIN荧光蛋白表达重组载体的构建

随机挑选6个转化质粒进行PCR验证,琼脂糖凝胶电泳检测结果显示6个质粒中均可扩增出全长SNAPIN基因,提示重组载体构建成功(见图2)。针对其中两个转化质粒进行XhoⅠ和EcoRⅠ酶切反应,验证重组载体构建成功(见图3)。将上述方法验证过的重组质粒进行双向测序,测序结果(见图4)经BLAST比对后证实SNAPIN成功插入PEGFP载体中。以上三种验证方法证明成功构建pEGFP-SNAPIN荧光蛋白表达重组载体。

图2 PCR反应扩增SNAPIN验证重组质粒Figure 2 The recombinant plasmids confirmed by PCR

2.3 HEK 293T细胞的转染

转染48 h后在荧光显微镜下观察细胞转染效率(见图5),结果显示转染效率较高,可用于后续分析。

图3 酶切反应验证重组质粒Figure 3 The identification of recombinant plasmids by double enzyme digestion

图4 pEGFP-SNAPIN重组质粒测序结果原始图谱Figure 4 The partial sequencing result of pEGFP-SNAPIN

图5 转染pEGFP-SNAPIN后的HEK 293T细胞Figure 5 The pEGFP-SNAPIN transfected HEK 293T cells

2.4 实时定量PCR检测转染后SNAPIN、c-MET的表达

分别用构建好的pEGFP-SNAPIN表达载体和合成的siRNA SNAPIN干扰片段转染到HEK 293T细胞后用ABI的7500fast荧光定量PCR仪进行定量PCR实验,检测 SNAPIN表达的改变。SNAPIN、c-MET和GAPDH的扩增曲线良好,说明反应正常进行。融解曲线呈单峰,说明引物扩增特异性强(见图6)。

图6 SNAPIN,GAPDH,c-MET的融解曲线Figure 6 The melting curves of SNAPIN,GAPDH and c-MET gene

实时定量PCR实验结果显示转染了表达质粒pEGFP-SNAPIN后的HEK 293T细胞中SNAPIN的表达量显著上调(P<0.05,见表2),在siRNA沉默SNAPIN基因后,转录水平上SNAPIN的表达下调(P<0.05)。在 SNAPIN过表达的细胞中,c-MET的表达随之显著上调 1.75倍(P<0.05);反之SNAPIN基因沉默后,分析发现c-MET的表达也随之下调,是正常细胞表达水平的 0.73倍(P<0.05)。

表2 SNAPIN、c-MET和GAPDH实时定量PCR中相对表达结果Table 2 The relative expression of SNAPIN,c-MET and GAPDH by real-time quantitative PCR

3 讨论

SNAPIN蛋白在神经细胞和非神经细胞中表达,在人全身各组织中均有表达,提示该蛋白具有广泛的生物学功能。由Kunt&AliceWallenberg基金支持近期开展的Human Protein Atlas项目中发现SNAPIN除了在正常组织中表达外,还在多种肿瘤组织中表达,尤其是结直肠癌、乳腺癌、甲状腺癌、卵巢癌、恶性黑色素瘤、子宫内膜癌等中高表达(http://www.proteinatlas.org/ENSG00000143553-SNAPIN/cancer)。SNAPIN也可以与很多不同生理过程中的蛋白相互作用,说明SNAPIN是一个多功能蛋白,最新研究发现,SNAPIN和体外放射治疗缓解期的非转移性前列腺癌男性的疲劳恶化相关[14]。

在Christian等[15]2004年的研究中发现SNAPIN可与原癌基因编码的蛋白产物c-MET相互作用,该蛋白是肝细胞生长因子受体酪氨酸激酶,其与多种癌基因产物和调节蛋白相互作用,参与细胞信息传导、胚胎发育、细胞骨架重排的调控以及肿瘤发生过程,是细胞增殖和分化重要因素。c-MET在多种肿瘤中,如胃肿瘤、弥散型星形细胞瘤、乳腺癌、前列腺癌高表达,可增加蛋白转录而减少基因扩增,且c-MET的高表达与耐药性相关[16]。

SNAPIN是c-MET的相互作用蛋白,而SNAPIN的另一个相互作用蛋白SNAP-25可以与肝细胞生长因子调控的酪氨酸激酶作用底物HRS发生作用,该蛋白通过将c-MET定位至溶酶体而参与c-MET的降解过程。而本研究发现c-MET在HEK 293T细胞的表达受到SNAPIN的调控,提示在HEK 293T细胞中SNAPIN可能通过与c-MET结合来调控c-MET的表达,提示SNAPIN很可能与这些蛋白做为一个蛋白复合体而存在,或者参与调控该生理过程。由于在不同细胞、不同分化阶段作用的底物不同,c-MET在不同的条件下表现出多种不同的功能,如促进肝细胞、内皮细胞和黑色素细胞的分裂;引起上皮细胞的分散,在胚胎发育过程中控制细胞的移动;诱导细胞形态变化等。以上研究提示我们,SNAPIN可能调节c-MET参与细胞生理过程,但具体作用机制仍需进一步研究,本研究对于揭示SNAPIN蛋白在其他生理途径中的功能是非常有意义的。

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