张红红 刘晓丽 许思娟
·基础研究·
宫颈癌组织中miRNA-34c的表达水平分析及其靶基因PLK4的鉴定
张红红 刘晓丽 许思娟
目的:分析miRNA-34c在宫颈癌组织中的表达水平并鉴定其新的靶基因。方法:利用荧光实时定量PCR(qRT-PCR)检测甘肃省妇幼保健医院34例宫颈癌和癌旁正常组织中miRNA-34c表达水平。利用miRNA靶基因预测数据库预测miRNA-34c新的靶基因Polo样激酶4(PLK4)。将含有PLK4的3‘UTR片段荧光素酶载体分别与miRNA-34c模拟物或阴性对照共转染HEK293T细胞,并检测其荧光素酶活性。在人宫颈癌细胞SiHa细胞中分别转染miRNA-34c模拟物或阴性对照,利用qRT-PCR法和Western blot法分别检测靶基因的mRNA和蛋白质的表达水平。结果:与癌旁正常组织相比,miRNA-34c在宫颈癌组织中表达下调。在HEK293T细胞中,miRNA-34c模拟物显著抑制荧光素酶的活性(P<0.01)。miRNA-34c模拟物显著下调SiHa细胞中PLK4的mRNA和蛋白质的表达(P<0.01)。结论:miRNA-34c在人宫颈癌组织中表达下调,且能与PLK4的3’UTR结合并下调其mRNA和蛋白质的表达。
miRNA-34cPLK4宫颈癌
宫颈癌是最常见的女性恶性肿瘤之一,其死亡率居女性恶性肿瘤的首位,其发病率呈升高和低龄化趋势[1-2]。microRNA(miRNA)是一种长度约为22个核苷酸的非编码单链小RNA,通常与靶基因mRNA完全或不完全匹配结合,诱导靶mRNA降解或阻遏其转录后翻译[3-4]。miRNA-34家族包括miRNA-34a、miRNA-34b和miRNA-34c,在抑制癌症发生中起到很重要的作用[5]。在miRNA-34家族中,目前对miRNA-34a的研究较多,而对miRNA-34b和miRNA-34c的研究较少。miR-34c有miRNA-34c-3p和miRNA-34c-5p两个成熟形式,在多种癌细胞中异常表达,包括宫颈癌细胞[6]。已证实miRNA-34c能够作用于靶基因E2F3、MYCN、Bcl-2和c-Met抑制癌细胞增殖,锚定非依赖生长和诱导细胞凋亡[7-8],但其许多功能尚未知。本研究将对miRNA-34c在宫颈癌组织的表达水平进行分析,并鉴定其新的靶基因Polo样激酶4(PLK4),为宫颈癌的治疗提供新的靶点和理论依据。
1.1 材料
1.1.1 临床样本 样本取自甘肃省妇幼保健医院2011年3月至2013年10月收治的34例宫颈癌患者的肿瘤组织及癌旁正常组织(癌旁正常组织距离肿瘤边缘>5 cm),冻存于液氮中。病理类型为鳞癌19例、腺癌12例、其他3例。
1.1.2 试剂及仪器 Trizol试剂和脂质体2000转染试剂购自美国Invitrogen公司;RNA反转录试剂盒和荧光实时定量聚合酶链式反应(real time-quantitative polymerase chain reaction,qRT-PCR)试剂盒购自日本Takara公司;DMEM培养基购自美国Hyclone公司,FBS-500胎牛血清购自美国Gibco公司;寡核苷酸miRNA-34c模拟物和阴性对照购自广州复能公司;pmirGLO Vector和双荧光素酶报告基因检测系统购自美国Promega公司;PLK4和GAPDH一抗,山羊抗小鼠IgG购自美国Sigma公司;人胚肾细胞株HEK293T,人宫颈癌细胞株SiHa为本科室保存;荧光定量PCR仪Mx3000P购自美国Agilent公司;Power⁃Pac基础电泳仪购自美国Bio-Rad公司。
1.2 方法
1.2.1 细胞培养 人胚肾细胞HEK293T和人宫颈癌细胞SiHa使用含10%胎牛血清的DMEM培养基在37℃、5%CO2条件下培养。
1.2.2 荧光实时定量PCR 50 mg宫颈癌组织或癌旁正常组织从液氮取出后加入1 mL Trizol试剂匀浆,按照操作说明提取总RNA,分装于-70℃冻存。按照RNA反转录试剂盒说明书操作,逆转录条件为30℃、10 min,42℃、30 min,85℃、5 min。合成的cDNA作为模版进行qRT-PCR扩增,反应体系为cDNA 1 μL、上下游引物各0.6 μL(表1)、SYBR Green荧光染料Mix 10 μL、无菌蒸馏水7.6 μL及ROX 0.4 μL。反应条件为94℃预变性2 min,95℃变性5 s,60℃退火延伸20 s,循环40次,72℃延时5 min。miRNA-34c及PLK4 mRNA的相对表达量通过2-ΔΔCT法计算,ΔΔCT=(待检样品基因平均CT-待检样品管家基因平均CT)-(对照组基因平均CT-对照组管家基因CT),分别以U6及GAPDH作为内参。
1.2.3 miRNA-34c靶基因预测 为了预测miRNA-34c的作用靶基因,使用TargetScan、miRBase和miRDB 3个数据库均出现的靶基因为miRNA-34c目标靶基因。
1.2.4 mRNA-34c靶基因荧光素酶报告基因载体构建 在NCBI网站下载靶基因PLK4的3'UTR序列,设计PCR引物。PCR扩增得到的目的片段连接到pM⁃DTM-T载体,行双酶切回收目的片段并插入到荧光素酶报告基因载体pmirGLO Vector上,命名为pmir⁃GLO-PLK4。
1.2.5 荧光素酶活性检测 将HEK293T细胞接种于96孔板,将50 pmol/L miRNA-34c模拟物(序列AG⁃GCAGUGUAGUUAGCUGAUUGC)或阴性对照与构建的80 ng pmirGLO-PLK4质粒共转染HEK293T细胞。转染48 h后,采用双荧光素酶报告基因检测系统溶液裂解细胞,检测荧光强度。
1.2.6 Western blot分析 将SiHa细胞接种于6孔板,miRNA-34c模拟物和阴性对照分别转染SiHa细胞。48 h后,采用RIPA法提取总蛋白,取30 μg蛋白经10%SDS-PAGE胶分离后,半干转印至PVDF膜上,5%脱脂奶粉封闭,分别用抗PLK4小鼠单克隆抗体(1:1 000稀释),抗GAPDH小鼠单克隆抗体(1:5 000稀释)孵育过夜,再与山羊抗小鼠IgG孵育1 h,曝光显色。
1.2.7 MTT法检测细胞的增殖 SiHa细胞转染miR⁃NA-34c模拟物和阴性对照48 h后加入0.5 mg/mL MTT,孵育4 h,并收集细胞,加100 uL DMSO,室温振荡10 min。使用酶联仪在570 nm波长处测定各孔光吸收值(OD),绘制细胞增殖曲线。
1.3 统计学方法
数据采用SPSS18.0软件进行统计学分析。荧光素酶计数和miRNA-34c模拟物抑制PLK4 mRNA和蛋白计量的统计表达均采用配对t检验。P<0.05为差异有统计学意义。
表1 qRT-PCR引物序列Table 1 Primer sequences used in qRT-PCR
2.1 miRNA-34c在宫颈癌组织和癌旁正常组织的表达采用qRT-PCR法检测miRNA-34c在34例宫颈癌及癌旁正常组织中的表达,以U6作为对照。结果显示,与癌旁正常组织相比,宫颈癌患者组织中miR⁃NA-34c表达水平明显降低,差异具有统计学意义(P<0.01,图1)。
图1 miRNA-34c在宫颈癌及癌旁正常组织中的相对表达Figure 1 Relative expression of miRNA-34c in cervical cancer tissues and normal paraneoplastic tissues
2.2 miRNA-34c靶基因的预测
为进一步探讨miRNA-34c在宫颈癌中的作用,本研究采用生物信息学软件TargetScan、miRBase和miRDB预测miRNA-34c可能的靶基因,选取3个数据库均预测得到的靶基因作为候选,结果发现与肿瘤密切相关的PLK4为miRNA-34c预测的靶基因。图2中竖线连接部分显示miRNA-34c的种子序列靶向PLK4的3'UTR区。
2.3 荧光素酶活性检测
为验证miRNA-34c是否能与PLK4的3'UTR区直接结合,将构建好的pmirGLO-PLK4载体分别与miRNA阴性对照和miRNA-34c模拟物共转染到HEK293T细胞,48 h后收集并裂解细胞,检测其荧光素酶活性。结果显示,与miRNA阴性对照相比,转染miRNA-34c模拟物的荧光素酶的活性明显降低(P< 0.01,图3),提示PLK4是miRNA-34c的靶基因。
图2 miRNA-34c种子序列与靶基因PLK4的3'UTR结合位点Figure 2 Binding sites of miRNA-34c to PLK4 3'UTR
图3 miRNA-34c模拟物抑制荧光素酶活性Figure 3 miRNA-34c mimics repress luciferase activity
2.4 SiHa细胞增殖检测及PLK4的mRNA和蛋白表达
MTT法检测显示,转染miRNA-34c模拟物后,Si⁃Ha细胞增殖能力明显低于转染miRNA阴性对照(P< 0.01,图4A)。qRT-PCR结果显示,与阴性对照相比,转染miRNA-34c模拟物细胞中的PLK4 mRNA表达水平显著降低(P<0.01,图4B)。转染miRNA-34c模拟物细胞中的PLK4蛋白表达也明显低于阴性对照(图4C、D)。以上结果表明在SiHa细胞中miRNA-34c可能通过下调PLK4表达来影响细胞增殖。
图4 SiHa细胞中PLK4 mRNA和蛋白表达Figure 4 Relative mRNA and protein expression levels of PLK4 in SiHa cells
miRNA通过与靶基因mRNA的3'UTR结合,诱导靶基因mRNA降解或阻遏其转录后翻译,从而在转录后水平调控基因的表达,miRNA通过作用于多个靶基因调控不同的生物学过程,如细胞发育、分化、增殖、凋亡[9]。某些特异性miRNA可作为肿瘤标志物,有利于肿瘤的临床诊断、治疗及预后分析。研究发现宫颈癌组织及细胞株中许多miRNA异常表达[10],但相关致病机制目前仍不清楚。
miRNA-34c在多种肿瘤中表达下调,Liu等[11]证实miRNA-34c在非小细胞肺癌中表达下调,miRNA-34c通过靶向调节eIF4E表达抑制小细胞肺癌的细胞生长。Hagman等[5]发现抑制miRNA-34c表达能促进前列腺癌细胞的生长,而过表达miRNA-34c前列腺癌细胞中其侵袭能力明显减弱。最近,Re等[12]证实miRNA-34c在喉鳞状细胞癌组织中低表达,增加患者肿瘤的复发风险。同样,本研究证实了miRNA-34c在宫颈癌组织中的表达下调,通过生物信息学预测了其新的靶基因PLK4;通过荧光素酶活性检测证实了miRNA-34c可直接与靶基因PLK4的3'UTR区结合;转染miRNA-34c模拟物能显著下调SiHa细胞中PLK4 mRNA和蛋白质的表达,影响细胞增殖。因此,本研究证实了PLK4是miRNA-34c的靶基因,为宫颈癌的发生或发展机制研究提供了新的线索。
PLK4是一种广泛存在于哺乳动物、高度保守的丝/苏氨酸蛋白激酶,属于Polo-like激酶家族的成员[13]。PLK4在正常的非分裂期细胞中几乎不表达,而在正常的处于分裂期的细胞中,PLK4的表达显著升高。由于肿瘤细胞是一类增殖/分裂处于失控状态的细胞,因此PLK4在人类多种肿瘤细胞中呈过表达,包括胃癌、结直肠癌、乳腺癌等[14]。研究显示,PLK4过表达使中心粒过度复制,引起细胞的异常分裂,促进肿瘤发生及发展[15]。这些研究表明PLK4是一个非常有潜力的肿瘤治疗靶标。miRBase数据库显示miRNA-34c可调节数百个靶基因,而每个靶基因可能发挥不同的生物学功能,本研究仅选择了与宫颈癌发生相关的基因PLK4作为miRNA-34c的候选靶基因,将为阐明miRNA-34c在宫颈癌发生中的作用机制提供有力的证据。
综上所述,本研究明确了miRNA-34c与宫颈癌的相关性,鉴定了PLK4为miRNA-34c的靶基因,为进一步研究宫颈癌发生或发展机制提供了新的线索。
[1] Ji CS.Relationship between pathology for early cervical cancer of lymphatic metastasis and its clinic[J].Chin Prac Med,2015,10(2): 76-77.[纪常生.早期宫颈癌微淋巴转移病理与临床的关系[J].中国实用医药,2015,10(2):76-77.]
[2] Burzawa J,Gonzales N,Frumovitz M.Challenges in the diagnosis and management of cervical neuroendocrine carcinoma[J].Expert Rev Anticancer Ther,2015,15(7):805-810.
[3] Bartel DP.MicroRNAs:target recognition and regulatory func⁃tions[J].Cell,2009,136(2):215-233.
[4] Iorio MV,Croce CM.MicroRNAs in cancer:small molecules with a huge impact[J].J Clin Oncol,2009,27(34):5848-5856.
[5] Hagman Z,Larne O,Edsjö A,et al.miR-34c is downregulated in prostate cancer and exerts tumor suppressive functions[J].Int J Cancer,2010,127(12):2768-2776.
[6] Landgraf P,Rusu M,Sheridan R,et al.A mammalian microRNA expression atlas based on small RNA library sequencing[J].Cell, 2007,129(7):1401-1414.
[7] Cannell IG,Kong YW,Johnston SJ,et al.p38 MAPK/MK2-me⁃diated induction of miR-34c following DNA damage prevents Myc-dependent DNA replication[J].Proc Natl Acad Sci U S A, 2010,107(12):5375-5380.
[8] Luan S,Sun L,Huang F.MicroRNA-34a:a novel tumor sup⁃pressor in p53-mutant glioma cell line U251[J].Arch Med Res, 2010,41(2):67-74.
[9] Bartel DP.MicroRNAs:target recognition and regulatory func⁃tions[J].Cell,2009,136(2):215-233.
[10]Iorio MV,Croce CM.MicroRNAs in cancer:small molecules with a huge impact[J].J Clin Oncol,2009,27(34):5848-5856.
[11]Liu F,Wang X,Li J,et al.miR-34c-3p functions as a tumour suppressor by inhibiting eIF4E expression in non-small cell lung cancer[J].Cell Prolif,2015,48(5):582-592.
[12]Re M,Çeka A,Rubini CL,et al.MicroRNA-34c-5p is related to recurrence in laryngeal squamous cell carcinoma[J].Laryngoscope, 2015,125(9):E306-312.
[13]Kleylein-Sohn J,Westendorf J,Le Clech M,et al.Plk4-induced centriole biogenesis in human cells[J].Dev Cell,2007,13(2):190-202.
[14]Shinmura K,Kurabe N,Goto M,et al.PLK4 overexpression and its effect on centrosome regulation and chromosome stability in human gastric cancer[J].Mol Biol Rep,2014,41(10):6635-6644.
[15]Marina M,Saavedra HI.Nek2 and Plk4:prognostic markers,driv⁃ers of breast tumorigenesis and drug resistance[J].Front Biosci (Landmark ED),2014,19:352-365.
(2015-09-17收稿)
(2015-11-10修回)
Analysis of miRNA-34c expression in cervical cancer tissue and preliminary identification of Polo-like kinase 4 as its target gene
Honghong ZHANG,Xiaoli LIU,Sijuan XU
Department of Obstetrics and Gynecology,Intensive Care Unit,Gansu Provincial Maternity and Child Health Hospital,Lanzhou 730050,China
Objective:To analyze the expression profile of miRNA-34c in cervical cancer tissue and identify its novel target gene. Methods:The expression levels of miRNA-34c were detected in 34 paired cervical cancer tissues and normal paraneoplastic tissues via quantitative reverse transcription polymerase chain reaction(qRT-PCR).Polo-like kinase 4(PLK4)is a target gene of miRNA-34c predicted in the miRNA Target Database.Luciferase vector containing the binding site of miRNA-34c to PLK4 3'UTR and miRNA-34c mimic or negative control were co-transfected into HEK293T cells,and luciferase expression was examined.The miRNA-34c mimic or negative control was transfected into SiHa cells,and the mRNA or protein expression of PLK4 was detected via qRT-PCR or Western blot,respectively.Results:MiRNA-34c expression was lower in cervical cancer tissues than in normal paraneoplastic tissues.The miRNA-34c mimics significantly inhibited luciferase activation in the HEK293T cells(P<0.01)and significantly decreased the mRNA and protein expression levels of PLK4 in the SiHa cells(P<0.01).Conclusion:MiRNA-34c is significantly decreased in cervical cancer tissues.Moreover,miRNA-34c can significantly repress the mRNAand protein expression levels of PLK4 by directly targeting the 3'UTR.
miRNA-34c,PLK4,cervical cancer
10.3969/j.issn.1000-8179.2015.22.028
甘肃省妇幼保健医院妇产科重症救护中心(兰州市730050)
张红红 zhhzyzhh@sina.cn
张红红 专业方向为妇科肿瘤研究与诊治。
E-mail:zhhzyzhh@sina.cn