杜芳静,胡晓琴,宋 珂,李晓霞
(延安大学 化学与化工学院,陕西 延安716000)
电化学DNA 传感器(elctrochemical DNA sensor)是将探针DNA 固定在电极表面上,通过检测电化学信号进行分析的器件。此类传感器具有简单、灵敏、快速、低成本及低能耗等特点,在疾病诊断、环境检测和食品安全等领域有着重要的应用价值和广阔的应用前景[1~3]。p53 抑癌基因(p53-DNA)是生物体内一种抑制细胞转变癌细胞的基因,可诱导细胞生长阻滞,细胞凋亡,细胞分化以及DNA 修复[4]。目前已报道p53-DNA 的分析方法有电化学法[5~7]、光学法[8]和免疫法[9]。电化学阻抗(elctrochemical impedance spectroscopy,EIS)技术是利用小幅度交流电压或电流对电极扰动,测量体系对扰动跟随情况的电化学响应的测量方法,该方法具有频率范围广、对体系扰动小等特点,是研究电极过程动力学、电极表面现象等的重要工具[10,11]。
本文基于电化学阻抗技术构建了一种检测p53-DNA的电化学传感器,将末端带巯基的探针p53-DNA 固定于金电极表面,根据传感器结合前后电子转移阻抗值的变化,对目标p53-DNA 进行了分析与测定。该传感器制备简单、灵敏高,且无需标记,易于操作,可用于不同序列DNA 的研究。
CHI660E电化学工作站(上海辰华);Q5200B超声仪(江苏昆山);HG—9140A 电热恒温鼓风干燥箱(上海精宏设备);电极系统:Au 为工作电极,Ag/AgCl 电极为参比电极,Pt 为对电极。
铁氰化钾和亚铁氰化钾(西安化学试剂厂);单链DNA(上海生工)序列参见文献[5];单链DNA 储备液:用pH 7.0,10 mmol/L PBS 缓冲溶液配制;5.0 mmol/L K3[Fe(CN)6]-5.0 mmol/L K4[Fe(CN)6;检测液:用pH 7.4,0.10 mol/L PBS-0.10 mol/L NaCl 配制;实验用水均为Millipore Milli—Q 超纯水(大于18.2 MΩ·cm)。
首先将Au 进行预处理[12]。将5 μL 5.0 μmol/L 探针p53-DNA 溶液滴涂在处理好的Au 表面,4 ℃固定12 h,然后用10 mmol/L PBS(pH 7.0)和超纯水冲洗,以除去吸附的探针;用5.0 μL,1.0 mmol/L MCH 封闭1 h,得到p53-DNA传感器,4 ℃冰箱中保存待用。将5.0 μL 不同浓度目标p53-DNA 滴加到p53-DNA 传感器上,37 ℃杂交反应1 h。在5.0 mmol/L/L K3[Fe(CN)6]-5.0 mmol/L K4[Fe(CN)6]检测液中进行测定,根据传感器杂交前后电子转移阻抗值的变化分析信号,对目标p53-DNA 进行定量检测。
图1 为不同修饰电极在检测液中的循环伏安图。曲线a 为裸 Au 电极上的循环伏安曲线,结果发现,[Fe(CN)6]3-/4平衡电对的电位差为80 mV。探针p53-DNA 自组装到Au 电极表面后,由于DNA 的磷酸骨架带负电荷,阻碍荷负电的[Fe(CN)6]3-/4-的电子传递,峰电位差ΔE 明显增大且峰电流降低(曲线b)。当封闭剂MCH 占据了电极表面未结合的位点(曲线c),峰电位差继续增大且峰电流也继续降低。探针DNA 与目标DNA 杂交之后形成双链DNA 结构(曲线d),峰电位差达到最大,峰电流降到最低。以上结果表明:探针DNA 通过巯基自组装作用固定在电极表面,构建的p53-DNA 传感器与目标p53-DNA 发生了杂交反应。
图2 为不同电极的电化学阻抗图。可以看出,曲线a为裸金电极的阻抗,半圆较小,其电子传递阻抗Ret值为73.2 Ω。当探针DNA 固定到电极表面后,[Fe(CN)6]3-/4-电子传递受阻,电子传递阻抗Ret值增大到3 846 Ω。MCH封闭后,电子传递阻抗Ret值继续增大,说明MCH 在电极表面上形成致密的自组装膜,使得[Fe(CN)6]3-/4-电子传递变得更加困难。当杂交反应形成DNA 双螺旋结构,进一步阻碍了[Fe(CN)6]3-/4在电极表面的电子传递,因此,其电子传递阻抗Ret值达到9 271 Ω。阻抗法与循环伏安法表征的结果一致,说明DNA 传感器制备成功,并可以用于目标p53-DNA 的检测。
图1 不同电极在5.0 mmol/L[Fe(CN)6]3-/4-溶液中的循环伏安图(cProbe DNA=5.0 mol/L,cTarget DNA=1.0 mol/L)Fig 1 Cyclic voltammograms of different electrodes in 5.0 mmol/L M[Fe(CN)6]3-/4-solution(cProbe DNA=5.0 mol/L,cTarget DNA=1.0 mol/L)
图2 不同电极在5.0 mmol/L[Fe(CN)6]3-/4-溶液中的阻抗图Fig 2 Impedance diagram of different electrodes in 5.0 mmol/L[Fe(CN)6]3-/4-solution
为了获得更高的灵敏度,首先考察了各种电化学参数对传感器的影响。首先研究了不同的电化学技术对灵敏度的影响,将制备好的传感器放入5×10-7mol/L,1×10-6mol/L两种不同浓度目标p53-DNA 溶液中,分别采用电化学阻抗法、微分脉冲伏安法和方波伏安法进行测定,实验结果说明使用电化学阻抗法测定灵敏度更高。因此,选用电化学阻抗法对目标p53-DNA 进行测定。图3 为探针DNA 不同固定时间与传感器杂交前后电化学阻抗变化值的关系曲线,可以看出,随着固定时间从8 h 增加到12 h,电子传递电阻值Ret逐渐增大,12 h 之后Ret值呈缓慢降低,说明探针固定12 h 趋于饱和。因此,实验选择探针固定时间为12 h。
图3 探针固定时间对传感器响应信号的影响Fig 3 Effect of immobilization time of probe on response signal of sensor
考察了杂交温度和杂交时间对传感器测定的影响,结果表明:杂交温度达到37 ℃时,电化学阻抗响应信号是最大的(图4(a)),37 ℃之后呈下降的趋势,说明在较高温度时,DNA 变性导致DNA 分子由稳定的双螺旋结构松解为无规则线性结构,不利于杂交[13],所以,选择37 ℃为最佳杂交温度。图4(b)显示了当杂交时间达到1 h 时,Ret值最大,继续增加杂交时间,其Ret值变化较小,因此,选择DNA 杂交时间为1 h。
图4 杂交温度和杂交时间对响应信号的影响Fig 4 Effect of hybridization temperature and time on response signal
在上述优化的实验条件下,利用制备好的传感器对一系列不同浓度的目标p53-DNA 进行定量测定。图5 为传感器在不同浓度目标p53-DNA 溶液中的电化学阻抗图。电子传递电阻Ret与目标p53-DNA 浓度在1×10-8~1×10-6mol/L 范围内呈线性关系(见附图),线性回归方程为Ret(Ω)=37.74+4.666 7 C(C(mol/L)),相关系数为0.995 5,其检出限为3.0×10-9mol/L(S/N=3)。对5.0×10-8mol/L的目标p53-DNA 做11 次平行测定,相对标准偏差为3.8%。比较发现,本文方法测定线性范围较文献[7]宽,测定方法较文献[5]更简单。
利用制备好的DNA 传感器对完全互补p53-DNA、单碱基错配序列p53-DNA 和三碱基错配序列p53-DNA 进行测定。结果表明:传感器识别互补p53-DNA,其响应信号电子传递电阻Ret值为9 989 Ω,与单碱基错配p53-DNA 反应后,Ret值为4 495 Ω,与三碱基错配p53-DNA 反应后,Ret值为2 297 Ω,分别为完全互补的DNA 杂交信号的45%和23%。说明该传感器能够区分完全互补序列、单碱基错配序列和三碱基错配序列DNA,具有良好的选择性。
图5 传感器检测不同浓度目标DNA 的电化学阻抗图(插图为电子传递电阻Ret vs 目标p53-DNA 浓度)Fig 5 Electrochemical impedance diagram of biosensor detect different target DNA concentrations(Insert:Plots of the difference of electron transfer resistance(Ret)vs logarithmic of target p53-DNA concentration)
本文基于电化学阻抗技术构建了一种检测p53-DNA的电化学传感器,该传感器可以检测完全互补DNA 的范围是1.0×10-8~1.0×10-6mol/L,具有操作简单、无需标记、灵敏度高的优点,可以用于其它DNA 序列的检测。
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