基于VOSviewer 和CiteSpace 实体器官移植术后真菌感染研究热点和趋势的可视化分析

2024-05-13 12:22叶卫丰
中国医药导报 2024年10期
关键词:两性霉素孢子真菌

韩 阳 叶卫丰

首都医科大学附属北京友谊医院检验科,北京 100050

术后感染是实体器官移植(solid organ transplantation,SOT)术后的常见并发症之一,其中真菌感染具有极大的严重性和挑战性[1]。由于免疫抑制作用,真菌感染的发生率在SOT 术后明显升高,可能导致移植器官功能障碍、移植物丢失甚至患者死亡[2-3]。由于真菌具有较高的耐药性和复发率、抗真菌药物毒性大和药物相互作用等,使得SOT 术后真菌感染的治疗相对复杂和困难[4]。鉴于SOT 术后真菌感染的严重性和难治性,预防也是关键的策略。因此,了解SOT 术后真菌感染治疗现状和研究进展可为临床诊治提供帮助。

文献计量分析是借助计算机技术处理,通过数理统计分析文献,最后以图像呈现研究趋势与热点的分析方法,已在SOT 术后耐药菌感染、国内慢性病管理等多方面应用[5-6]。本研究通过对中文文献和英文文献中SOT 术后真菌感染文献进行可视化分析,对该领域国内外研究现状和发展趋势进行评价和展望,以期为我国SOT 术后真菌感染的预防和治疗提供参考和借鉴,促进该治疗领域的进一步发展和创新。

1 资料与方法

1.1 文献检索

1.1.1 国内 以CNKI 为中文数据源,检索词为:(“实体器官移植”OR“肝移植”OR“心脏移植”OR“肺移植”OR“肠移植”OR“肾移植”OR“胰腺移植”OR)AND(“真菌”OR“霉菌”OR“念珠”OR“隐球菌”OR“毛霉”OR“组织胞浆菌”OR“假丝酵母”OR“曲霉”OR“肺孢子菌”OR“球孢子菌”)。

1.1.2 国外 以Web of Science 核心合集数据库为英文数据源,检索词为:(“solid organ transplant*”OR“liver transplant*”OR “hepatic transplant*”OR“kidney transplant*”OR “renal transplant*”OR “heart transplant*”OR “Cardiac Transplant*”OR “lung transplant*”OR “intestinal transplant*”OR “Small bowel transplant*”OR “colon transplantat*”OR“pancreas transplant*”) AND (“fungal*” OR “fungi*” OR“Mould*”OR“Mold*”OR“Mucor*”OR“antifungal*”OR (“Candid*”NOT (“Candidate*”OR“Candidacy”))OR“Aspergi*”OR“Cryptococc*”OR“Pneumocystis”OR“Histoplasm*”OR“Coccidioid*”)。

检索时间跨度均设置为建库时间至2023 年7 月23 日,收集所有SOT 术后真菌感染相关文献。限定为标题检索以提高查准率。文献纳入标准:论著(article)和综述(review);排除标准:信件(letter)、编辑材料(editorial material)、会议摘要(meeting abstract)、短篇新闻(news item)、出版修正(correction)、在线发表(early access)、会议文献(proceedings paper)。

1.2 一般文献计量指标分析

将检索到的中文文献和英文文献分别导入VOS viewer 软件(1.6.16 版本)统计分析文献的发表年代、作者和英文文献发表国家[7]。使用Bibliometric.com 在线软件创建国家合作关系图对国家之间的合作关系进行可视化分析。

1.3 关键词共现网络

将中文文献和英文文献分别导入VOSviewer 软件(1.6.16 版本),将中文和英文关键词出现的阈值均设置为10 次,对符合要求的高频关键词进行聚类分析,分别生成中文文献和英文文献可视化关键词共现网络图谱[7]。节点的大小代表关键词出现频次的高低。另外,不同关键词依据文献的发表时间标记不同颜色,可视化呈现不同时间段的SOT 术后真菌感染的研究热点。

1.4 突现关键词检测

CiteSpace(5.7.R5 版本)提供突现检测功能,探测在某一时段内文献引用量激增的节点,用以发现某一个关键词衰落或兴起的情况,红色节点表示在该年份研究热度高[8]。对SOT 术后真菌感染的关键词进行突现检测,以得到国内外近期研究的热点问题。将中文和英文文献分别导入CiteSpace 软件(5.7.R5 版本),设置节点类型为“keyword”,时间切片(time slice)=1年,设置检测时间为1980—2023 年。

2 结果

2.1 发文量趋势

纳入分析的SOT 术后真菌感染英文文献为1333篇,中文文献为489 篇。中文文献和英文文献几乎同时兴起,但英文文献整体呈现波动上升趋势,2000—2011年上升趋势尤为明显,此后发文量波动在40~79 篇之间。中文文献2000—2010 年上升趋势明显,与英文文献同时期快速上升,但此后2012—2022 年呈先下降后上升的趋势。见图1。

图1 1979—2023 年实体器官移植术后真菌感染年文献发表量

2.2 作者合作网络分析

经VOSviewer 软件统计,共有1 576、7 248 名作者分别参与中文文献、英文文献SOT 术后真菌感染文章的写作。中文文献和英文文献作者合作图谱分别见图2~3。498 篇中文文献中发文量最多的作者是解放军海军军医大学附属长海医院学者朱有华(12 篇,2.45%)。国内主要研究团队以朱有华、石炳毅(中国人民解放军第三〇九医院)、何晓顺(中山大学附属第一医院)、王长希(中山大学附属第一医院)为中心。1 333 篇英文文献中发文量最多的作者是加拿大多伦多大学的学者Husain(35 篇,2.63%)。英文文献主要研究团队以Husain、Shahid(美国匹兹堡大学)、Kusne(美国梅奥医学中心)、Munoz(西班牙马德里葛瑞格里欧马拉农医院)为中心。

图2 中文文献作者合作图谱

图3 英文文献作者合作图谱

2.3 国家合作网络分析

Web of Science 核心合集数据库文献数量排名前10 的国家及其文献被引情况见表1,这前10 位国家发表文献共被Web of Science 核心合集数据库收录文献1 098 篇,占文献总数的82.37%。美国发文量第一,远远超过其他国家。另外,根据图4 国家合作关系图,美国与其他国家的合作最为密切。

表1 Web of Science 核心合集数据库治疗药物监测文献数量

图4 国家间合作关系图

2.4 关键词共现网络分析

中文文献共检测出426 个关键词。中文文献SOT移植术后真菌感染关键词共现网络见图5,可见形成6 个聚类,聚类Ⅰ:心肺移植和曲霉感染,隐球菌和两性霉素B 及氟康唑;聚类Ⅱ:肝移植术后侵袭性肺曲霉病和伏立康唑;聚类Ⅲ:术后并发症;聚类Ⅳ:预防;聚类Ⅴ:侵袭性真菌感染和棘白菌素类药物,危险因素;聚类Ⅵ:肾移植术后耶氏肺孢子菌肺炎、临床药师和药学监护。图中节点的大小代表关键词出现频次的高低,节点的颜色代表关键词的出现时间,反映不同时期的SOT 术后真菌感染研究热点,聚类Ⅴ和聚类Ⅵ代表中文文献近期研究热点,也提示国内SOT 术后真菌感染领域未来的重点研究方向。

图5 中文文献关键词共现网络图谱

外文文献共检测出1 172 个关键词。英文文献SOT 术后真菌感染关键词共现网络见图6,可见形成4 个聚类,聚类Ⅰ:心肺移植术后侵袭性肺曲霉病、念珠菌血症和毛霉感染,两性霉素B、卡泊芬净、三唑类药物(伊曲康唑、氟康唑、伏立康唑、泊沙康唑)和治疗药物监测;聚类Ⅱ:肝移植术抗真菌预防,风险因素;聚类Ⅲ:肾移植术后耶氏肺孢子菌肺炎;聚类Ⅵ:隐球菌、球孢子菌和组织胞浆菌。聚类Ⅰ和聚类Ⅲ代表英文文献近期研究热点和未来重点研究趋势。

图6 英文文献关键词共现网络图谱

2.5 关键词突现分析

将中文文献和外文文献分别导入CiteSpace 软件,进行关键词突现检测,分析不同时期SOT 真菌感染研究的关键问题,得到国内外近期研究的热点问题。

中文文献近10 年出现文献激增且至2023 年研究热度仍高的关键词为临床药师、危险因素、耶氏肺孢子菌肺炎、肾移植术后、药学监护、肺移植和侵袭性真菌感染(图7)。英文文献近10 年出现文献激增且至2023 年研究热度仍高的关键词为监测(surveillance)、耶氏肺孢子菌肺炎(Oneumocystis jirovecii pneumonia)、指南(guideline)、抗真菌管理(antifungal stew ardship)、药物动力学(pharmacokinetics)、肺移植(lung transplantation)、泊沙康唑(Posaconazole)(图8)。上述关键词分别指向了中、英文文献SOT 术后真菌感染近年研究关键问题。

图7 实体器官移植术后真菌感染中文文献突现关键词

图8 实体器官移植术后真菌感染英文文献突现关键词

3 讨论

中文文献和英文文献几乎同时兴起,英文文献整体呈现波动上升趋势。中文文献2000—2010 年上升趋势明显,与英文文献同时期快速上升。我国在Web of Science 核心合集数据库中收录的文献数量也排在第5 位,我国学者也比较重视SOT 术后真菌感染的研究。

关键词是研究主题的高度浓缩,通过关键词聚类分析和关键词突现检测,不仅可以得到中文文献和英文文献中SOT 术后真菌感染的研究热点,还可以通过分析比较中文文献和英文文献研究热点的动态变化,助力国内学者不断拓展和深化主题,发现SOT 术后真菌感染领域新的研究趋势。

SOT 术后真菌感染研究关注的疾病及药物在不同时段侧重不同,中文文献在1990—2001 年,关键词突现较少;2002—2012 年曲霉病、伊曲康唑、两性霉素B、米卡芬净是研究热点,米卡芬净由于和SOT 术后常用免疫抑制剂无明显相互作用,胃肠安全性较好,在SOT 中应用越来越广泛[9]。夏芳[10]和胡建敏等[11]分别回顾分析了86 例(米卡芬净组43 例,两性霉素B 脂质体组43 例)和43 例(米卡芬净组24 例,两性霉素B 脂质体组19 例)肾移植术后真菌感染病例,结果均表明两性霉素B 脂质体治疗肾移植术后肺部真菌感染患者的临床疗效优于米卡芬净,但耐受性不如米卡芬净。2013—2023 年耶氏肺孢子菌肺炎、隐球菌脑膜炎、侵袭性真菌感染、氟康唑、氟胞嘧啶、伏立康唑是研究热点。临床药师和药学监护是近几年来中文文献研究重要热点内容,中文文献的近期研究热点聚类Ⅵ也印证这点。临床药师从协助制订药物治疗方案、药物相互作用、血药浓度监测、药品不良反应、用药教育等方面对SOT 患者进行全程药学监护,在SOT 术后真菌感染管理团队中发挥越来越重要的作用[12]。耶氏肺孢子菌通过呼吸道传播,存在小规模突现可能,沈泽等[13]通过对11 例肾移植后耶氏肺孢子菌肺炎患者的基因分析,结合门诊随访病史,确定了存在两条传播链,提示应更多关注肝肾移植术后耶氏肺孢子菌肺炎。

英文文献不同时期关注的疾病和药物不同,1990—2001 年艾滋病、曲霉病、氟康唑、两性霉素B脂质体是研究热点;2002—2012 年念珠菌病、卡泊芬净、氟康唑、脂质复合体是研究热点,研究方法已开展多中心临床试验;2013—2023 年耶氏肺孢子菌肺炎、毛霉病,泊沙康唑是研究热点,真菌感染有聚集性和突现性趋势,抗真菌药物管理和指南制定是近几年英文文献热门研究话题。对比中、英文文献的研究热点变化过程发现,虽然中、英文文献的整体动态发展走向大体相似,但中文文献研究的关键词突现晚10 年左右,例如两性霉素B 在英文文献中于1994 年开始突现、中文文献在2005 年开始突现;侵袭性肺曲霉病在英文文献在1992 年开始突现、中文文献在2005 年开始突现。对比中文文献和英文文献的近期研究热点,共同点均为侧重肾移植术后耶氏肺孢子菌肺炎。不同点为中文文献研究侧重临床药师和药学监护;英文文献研究侧重毛霉病和泊沙康唑、抗真菌药物管理和指南制订。毛霉菌是一种机会致病菌,在健康人群中极少发病,但是SOT 患者是毛霉菌的高危人群[14-15]。免疫系统受损,增加了移植患者对罕见机会性感染的易感性。毛霉病虽罕见但致死率高,近几年英文文献关于移植患者相关毛霉病研究也越来越多[16-19]。一项研究报告,11 例肾移植合并毛霉病患者接受两性霉素B脂质体联合手术清创或切除病变组织,同时给予泊沙康唑预防治疗后,9 例患者康复,2 例患者死亡[17]。抗真菌药物管理(antifungal stewardship,AFS)是指在医疗机构中对抗真菌药物的合理使用进行监督和管理的一种策略。英文文献中AFS 团队包括抗感染专家、临床微生物专家、药师和相关部门专家[20]。SOT 患者中抗真菌药物过度使用会产生风险,包括不良反应、药物相互作用、治疗成本增加、耐药性增加等,在SOT患者中特别需要AFS[21]。规范化SOT 术后AFS 是近年来英文文献的研究热点。美国移植学会(American Society of Transplantation,AST)根据移植受者常见的真菌感染菌种类型,在2019 年发布了《SOT 受者侵袭性曲霉菌病指南》《SOT 受者侵袭性念珠菌病指南》《SOT 受者隐球菌病指南》《SOT 受者耶氏肺孢子菌肺炎指南》4 本指南,为AFS 提供了更加细化的指导原则[22-25]。目前国内关于SOT 受者真菌感染的指南例如《器官移植受者侵袭性真菌病临床诊疗技术规范(2019 版)》和《中国实体器官移植受者侵袭性真菌病临床诊治指南(2016 年版)》,没有细化到每个菌种的指南,国内也可以借鉴国外经验,制定和发布细化到菌种的SOT 真菌感染指南,以期加强SOT 术后真菌感染规范化诊治[2,26]。

本研究利用VOSviewer 和CiteSpace 分析并展示了国内外SOT 术后真菌感染的研究动向,为我国学者提供了有价值的参考。积极开展国内的AFS,完善细化国内指南,并重视SOT 术后耶氏肺孢子菌肺炎、毛霉病等疾病,以推动国内SOT 术后真菌感染治疗领域的发展。

利益冲突声明:本文所有作者均声明不存在利益冲突。

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