张泽智 徐佳
肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae,KP)是广泛分布于自然界的肠杆菌科一类中最重要的革兰氏阴性杆菌,其侵入人体后可在泌尿、呼吸、胃肠系统等部位定植,当宿主免疫力低下及免疫抑制时,KP 会大量繁殖并引起多种感染[1,2]。近年来,随着激素和广谱抗生素的广泛应用,加之临床侵入性操作、器官移植的增多,KP血流感染的病例逐年增多,已成为继大肠埃希菌后血流感染的第二大血流感染病原菌,也是医院感染的重要病原菌之一[3]。中国细菌耐药监测(2005~2022 年)结果显示,在此期间,KP 对美罗培南和亚胺培南的耐药率从2.9%、3.0%上升至27.4%、26.0%,主要原因是由于近年来耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(Carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae,CRKP)的检出率逐年升高,检出的主要人群是接受介入治疗的恶性肿瘤及免疫功能低下患者,由于CRKP 高检出率大大增加了该检查群体的死亡率,使其已成为全球重大的公共卫生问题[4]。CRKP 的耐药机制十分复杂,由于其毒力强,感染患者往往病情较重,加之缺乏敏感的抗生素治疗,患者的死亡率高达60%,因此CRKP的耐药性是目前临床面临的难题之一[5]。目前国内关于CRKP 血流感染的临床特征及耐药机制的研究较少,为此,本研究进行了相关方面的分析,旨在为CRKP 血流感染患者的早期治疗和经验性用药提供参考。
1.1 菌株来源及鉴定经承德医学院附属医院医学伦理委员会批准,选择2019~2022 年该院两院区住院患者为研究对象。纳入标准:体温>38℃,血液标本培养分离出KP,并有以下症状之一:①有迁徙病灶或入侵门户;②肝脾肿大,有出血点或皮疹,外周血中性粒细胞增多伴核左移,但除血流感染外无其他原因解释;③无明显感染灶,但有全身中毒症状。排除标准:非血培养阳性标本,非KP 感染的血培养阳性标本。共纳入2 054 例KP 血流感染患者的病原菌标本,采用VITEK 2-Compact 全自动细菌鉴定仪,质控菌株为ATCC 700603,参照美国2019年实验室标准化协会改良Hodge 试验进行表型验证。排除重复菌株后有238 株 KP 确定为CRKP(CRKP 组),其中恶性肿瘤51 例,ICU 重症43 例,老年病47 例,其他疾病97 例。以性别、年龄1:1配对,选择238 例碳青霉烯类敏感肺炎克雷伯菌(Carbapenem sensitive klebsiella pneumoniae,CSKP)感染患者作为对照组,其中恶性肿瘤48 例,心血管疾病43 例,脑血管疾病53 例,其他疾病94 例。
1.2 临床特征收集收集两组患者的临床资料,包括性别、年龄、基础疾病、采集标本前30d 是否有侵入性操作及留置导管(气管插管/气管造瘘、留置导尿管、中心静脉置管)、采集标本前30d 抗生素使用情况(单药、联合用药、碳青霉烯类抗生素、第三/四代头孢菌素)、临床转归(痊愈、好转/转院、死亡)。
1.3 药敏试验采用微量肉汤稀释法检测11 种抗菌药物,包括庆大霉素、左氧氟沙星、头孢西丁、阿米卡星、美罗培南、头孢他啶、头孢哌酮/舒巴坦、亚胺培南、哌拉西林/他唑巴坦、头孢曲松、氨曲南对CRKP 的最低抑菌浓度。
1.4 碳青霉烯酶基因检测采用改良Hodge 试验筛选产碳青霉烯酶肺炎克雷伯菌表型。利用聚合酶链反应(PCR),以CRKP 基因组DNA 为模板,扩增菌株中碳青霉烯酶基因blaKPC、blaOXA-48、blaIMP、blaVIM、blaNDM。扩增产物双向测序后与GenBank 数据库进行比对,确定CRKP菌株携带的碳青霉烯酶基因。
1.5 多位点序列分型根据巴斯德研究所多位点序列分型(MLST)网站,分别以CRKP 菌株基因组DNA 为模板,扩增phoE、gapA、infB、mdh、pgi、rpoB、tonB七个管家基因后进行MLST。
1.6 统计学方法应用SPSS 19.0 软件,计数资料以n 和%表示,采用χ2检验,P<0.05 表示差异有统计学意义。
2.1 临床特征两组性别、年龄构成比较,差异无统计学意义(P>0.05)。CRKP 组患者入住ICU 的比例高于对照组,侵入性操作中留置尿管、留置引流管、手术、气管插管机械通气、中心静脉置管率高于对照组,使用抗生素类型中碳青霉烯类、β-内酰胺和 β-内酰胺酶抑制剂、糖肽类、替加环素使用率高于对照组,两种及以上抗生素联用率高于对照组,第三、四代头孢菌素使用率高于对照组,伴随心脑血管疾病、恶性肿瘤、感染性休克、肾脏疾病、烧伤患者的比例高于对照组,死亡率高于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05)。见表1。
表1 两组患者临床特征比较 [n(%)]
2.2 耐药情况CRKP 组238 株菌株均为多重耐药菌,对庆大霉素、头孢西丁、美罗培南、头孢他啶、头孢哌酮/舒巴坦、亚胺培南、氨曲南的耐药率均为100.00%,对阿米卡星、左氧氟沙星的耐药率最低,但也达81.09%、83.61%,对哌拉西林/他唑巴坦、头孢曲松的耐药率为89.92%、98.32%;耐药率均高于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05)。见表2。
表2 两组菌株对抗生素的耐药情况[n(%)]
2.3 碳青霉烯类基因检测238 株CRKP 菌 株Hodge 试验结果显示:阳性质控菌ATCC BAA 1705为227 株,占95.38%;阴性质控菌株ATCC BAA 1796 为11 株,占4.62%。227 株阳性质控菌ATCC BAA 1705 中162 株携带blaKPC-2基因,占71.37%;35 株携带blaNDM-1基因,占15.42%;11 株携带blaNDM-2基因,占4.85%;10 株携带blaOXA-48基因,占4.41%;9 株同时携带blaKPC-2基因与blaNDM-1基因,占3.96%;未检出携带blaIMP、blaVIM基因的菌株。
2.4 多位点序列分型按碳青霉烯酶基因比例选择79 株CRKP 菌株进行MLST 分型,共检测出13种ST 分型,其中ST11 分型最多,占62.03%,其次为ST15、ST1731、ST2230,分别占7.59%、6.33%、5.04%。分型占比情况见表3。
表3 79 株CRKP 菌株多位点序列分型构成
本研究结果显示,CRKP 组患者中入住ICU的比例高于对照组,接受侵入性操作中留置尿管、留置引流管、手术、气管插管机械通气、中心静脉置管率高于对照组;接受两种及以上抗生素联用率高于对照组,碳青霉烯类、β-内酰胺和 β-内酰胺酶抑制剂、糖肽类、替加环素使用率高于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05)。在疾病构成方面,CRKP 血流感染患者的心脑血管疾病、恶性肿瘤、感染性休克、肾脏疾病、烧伤比例高于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05)。说明这些因素是导致CRKP 检出率升高的重要原因。CRKP 血流感染患者的死亡率(53.78%)高于CSKP 血流感染患者(10.50%),差异有统计学意义(P<0.05),提示CRKP 血流感染会大大增加患者的死亡率。CRKP与CSKP 菌株的药敏试验结果显示,CRKP 组238株菌株均为多重耐药菌,对庆大霉素、头孢西丁、美罗培南、头孢他啶、头孢哌酮/舒巴坦、亚胺培南、氨曲南的耐药率均为100.00%,提示CRKP 多重耐药情况十分严重。在11 种抗生素中,耐药率最低的是阿米卡星和左氧氟沙星,但耐药率也达81.09%、83.61%,对哌拉西林/他唑巴坦、头孢曲松的耐药率为89.92%、98.32%,较高的耐药率会给治疗造成极大的困难。提示该院在疑似CRKP 血流感染患者抗生素经验性用药的选择上应规避耐药率高的抗生素。
产碳青霉烯酶是一类由基因编码合成的可分解碳青霉烯类抗生素,包括厄他培南、亚胺培南、美罗培南等的β 内酰胺酶[6~8]。本研究结果显示,238 株CRKP 菌株中227 例产碳青霉烯酶肺炎克雷伯菌表型阳性,说明产碳青霉烯酶是该院CRKP 耐药的重要原因。CRKP 携带的碳青霉烯酶基因具有地域差异,有研究显示,在重庆、陕西、湖南分离的CRKP 多携带blaNDM基因[6~8]。本研究结果显示,该院就诊患者中CRKP 菌株携带的碳青霉烯酶基因比例最高为blaKPC-2基因,占71.37%;而blaNDM-1基因仅占15.42%;9 株同时携带blaKPC-2基因、blaNDM-1基因,占3.96%;未检出携带blaIMP、blaVIM基因的菌株,与报道的重庆、陕西、湖南CRKP 携带碳青霉烯酶基因不同。分析原因可能是大多数blaKPC-2基因位于质粒上,可在多种人类最常见的病原微生物中播散耐药性,所以其能迅速传播的特性可能是检出率最高的重要原因之一。目前,已发现的KP 对碳青霉烯类抗菌药物的耐药机制有:①水解碳青霉烯类药物、产碳青霉烯酶;在碳青霉烯酶基因中最主要的是NDM-1、KPC-2、OXA-48。有报道[9~11],在中国blaKPC-2ST11中流行主要与IncF 质粒介导的水平转移有关。②高亲和位点青霉素结合亲和力下降或蛋白数量不足。③高水平产头孢菌素酶/超广谱β-内酰胺酶同时合并外膜孔蛋白表达量不足或缺失[12~14]。④形成生物被膜。本研究多位点序列分型显示,ST11 分型最多,占62.03%,与国内CRKP 的主流克隆型一致,提示目前本地CRKP 菌株在遗传上相对保守[15]。除ST11 外,本研究还检出了ST15、ST1731、ST2230 等12 种ST 分型,虽然构成比例不高,但也可通过耐药质粒的传播产生耐药,因此,应对ST 型散发分型给予关注。
综上所述,CRKP 血流感染患者具有侵入性操作、伴随心脑血管疾病、恶性肿瘤及联合使用抗生素等特征。因CRKP 多重耐药情况严重,且对临床常用的抗生素高度耐药,所以给治疗造成极大的困难。CRKP 菌株主要为blaKPC-2基因型,ST11 是主要的流行克隆株,需要引起关注。