王伟伟 欧志学 章晓云 李时斌 周毅 李统
〔摘要〕 目的 運用Meta分析对壮瑶药生骨汤治疗激素性股骨头缺血性坏死的临床疗效进行系统评价,并运用网络药理学对其作用机制进行初探。方法 检索相关数据库,时间从建库至2021年1月,查找对象为生骨汤治疗激素性股骨头缺血性坏死的随机对照试验研究,采用RevMan 5.3软件对纳入文献进行质量评价以及Meta分析。并运用网络药理学筛选生骨汤成分、靶点以及激素性股骨头缺血性坏死靶点,进行映射,映射结果采用生物信息学进行注释,并运用分子对接技术对其进行验证。结果 (1)共纳入5篇文献,394例患者,结果提示生骨汤可显著提高临床总有效率和综合疗效评分,降低患者空骨陷窝概率。(2)网络药理学分析得到活性成分40个,共有靶点94个,关键成分为木犀草素、去甲汉黄芩素、牵牛花色素、2’-羟基染料木素、染料木素,蛋白质相互作用网络图以及关键蛋白模块图提示壮瑶药生骨汤主要通过诱导SRC、VEGFA、MMP9、PLG、MAPK14等核心靶点起到治疗作用。(3)GO、KEGG富集分析结果显示,生骨汤通过以上关键核心靶点影响PI3K/Akt、HIF-1、MAPK等主要信号通路,集中调控蛋白水解、信号传导、胶原分解代谢等生物过程来发挥治疗激素性股骨头缺血性坏死作用。(4)分子对接结果显示,关键活性成分与核心靶点结合能均小于参考值,具有较好结合活性。结论 壮瑶药生骨汤能显著提高激素性股骨头缺血性坏死患者临床总有效率和综合疗效评分,降低其空骨陷窝概率;其中木犀草素、去甲汉黄芩素、牵牛花色素、2’-羟基染料木素、染料木素等为关键活性成分,通过调节新生血管生成、凝血系统以及骨细胞的增殖、凋亡、分化等达到治疗效果。
〔关键词〕 生骨汤;激素性股骨头缺血性坏死;Meta分析;网络药理学;分子对接;壮瑶药
〔中图分类号〕R274 〔文献标志码〕A 〔文章编号〕doi:10.3969/j.issn.1674-070X.2022.04.021
Evaluation of clinical efficacy and network pharmacology mechanism of Zhuangyao medicine Shenggu Decoction in the treatment of steroid-induced avascular necrosis of femoral head
WANG Weiwei OU Zhixue ZHANG Xiaoyun LI Shibin ZHOU Yi LI Tong
(1. Ruikang Hospital Affiliated to Guangxi University of Chinese Medicine, Nanning, Guangxi 530000, China;
2. Guilin Hospital of Traditional Chinese Medicine, Guilin, Guangxi 541002, China)
〔Abstract〕 Objective To systematically evaluate the clinical efficacy of Zhuangyao medicine Shenggu Decoction in the treatment of steroid-induced avascular necrosis of femoral head by Meta analysis, and to explore its mechanism of action by network pharmacology. Methods Relevant databases were searched from the establishment of the database to January 2021, to search for randomized controlled trials of Shenggu Decoction in the treatment of steroid-induced avascular necrosis of femoral head, and RevMan 5.3 software was used to evaluate the quality of the included literature as well as Meta analysis. Network pharmacology was used to screen the components, targets of Shenggu Decoction and targets of steroid-induced avascular
necrosis of femoral head, and mapped. The mapping results were annotated by bioinformatics, and verified by molecular
docking technology. Results (1) A total of 5 literatures and 394 patients were included. The results indicated that Shenggu Decoction could significantly improve the clinical total effective rate and comprehensive efficacy score, and reduce the probability of patients with empty bone lacuna. (2) Network pharmacology analysis obtained 40 active ingredients, there were 94 targets in total, and the key components were luteolin, norwogonin, morning glory, 2'-hydroxygenistein, and genistein. The protein-protein interaction network map and the key protein module map suggested Zhuangyao medicine Shenggu Decoction mainly plays a therapeutic role by inducing core targets such as SRC, VEGFA, MMP9, PLG, and MAPK14. (3) The results of GO and KEGG enrichment analysis showed that Shenggu Decoction affected major signaling pathways such as PI3K/Akt, HIF-1, and MAPK through the above key core targets, and centrally regulated biological processes such as proteolysis, signal transduction, and collagen catabolism to play a role in the treatment of steroid-induced avascular necrosis of femoral head. (4) Molecular docking results showed that the binding energies of key active ingredients and core targets were all lower than the reference value, indicating good binding activity. Conclusion Zhuangyao medicine Shenggu Decoction can significantly improve the clinical total effective rate and comprehensive efficacy score in patients with steroid-induced avascular necrosis of femoral head, and reduce the probability of empty bone lacuna; luteolin, norwogonin, morning glory, 2'-hydroxygenistein, and genistein are key active ingredients, which achieve therapeutic effects by regulating angiogenesis, coagulation system, and proliferation, apoptosis, and differentiation of bone cells.
〔Keywords〕 Shenggu Decoction; steroid-induced avascular necrosis of femoral head; Meta analysis; network pharmacology; molecular docking; Zhuangyao medicine
股骨头坏死是一种临床上常见的骨科疑难杂病,临床上按照病因将其分为创伤性与非创伤性两类,非创伤性多由激素过量使用以及饮酒过度所致[1]。相关研究表明[2],广西地区使用激素治疗自身免疫性疾病从而导致激素性股骨头缺血性坏死(steroid-induced avascular necrosis of femoral head, SANFH)的患者约占70.08%。其发病率、致残率常年居高不下,医疗资源被大量浪费,已严重拖累社会经济的发展[3]。而目前多采用手术治疗,但手术治疗存在费用高、患者依从性差等问题。因此,研究者逐渐将目光转移至中医药领域。
中医药因其不良反应少,临床疗效佳等优势,受到越来越多研究者的青睐。而壮瑶医作为我国传统医药的一个重要组成部分,其用药大多采用本地药材,且在临床方面疗效显著,能降低医疗费用和提高人民生活质量。生骨汤是壮瑶医治疗SANFH的经典方,具有补益肝肾、益髓生骨等作用[4]。其中主药扶芳藤和松兰补肝肾之亏虚,丢了棒和水田七消肿止痛、活血化瘀;大葉千斤拔、红杜仲和鸡血藤为佐,行补虚健骨之疗效;四方藤调和药性、舒经活络。该方虽然被广泛应用于SANFH治疗,但其具体作用机制尚未明确,缺乏充分的循证依据。基于以上现状,本研究采用Meta分析联合网络药理学的方式,在综合评价壮瑶药生骨汤治疗SANFH疗效的同时,对其潜在的作用机制进行初步探索,为其临床提供更为可靠的循证依据,也为其后期的实验研究奠定基础。
1 材料与方法
1.1 Meta分析
1.1.1 文献纳入标准 文献为国内外公开发表的随机对照试验;研究对象为SANFH患者;观察组为生骨汤或常规治疗+生骨汤,对照组为常规治疗;有明显的结局指标,且数据完整。
1.1.2 文献排除标准 文献重复发表;关键信息无法获得的文献;设计不严谨,文献不完整;纳入患者合并其他严重疾病,如恶性肿瘤、心血管疾病等;疗效评定标准不规范,治疗结果未完整公布。
1.1.3 相关指标 临床总有效率、综合疗效评分、空骨陷窝率。
1.1.4 文献检索策略 相关数据库:中国知网、维普、万方、中国生物医学文献数据库、PubMed、Cochrane
Library、Embase、MEDLINE以及Web of Science。检索方式:根据各数据库检索情况,通过主题词联合自由词的方式进行检索。中文检索关键词为“生骨汤”“壮药”“瑶药”“激素性股骨头缺血性坏死”,英文检索关键词为“Shenggu Decoction”“Zhuang Medicine”“Yao Medicine”“steroid-induced avascular necrosis of femoral head”。
1.1.5 数据提取和文献质量评价 提取文献相关信息为题目、作者、单位、年份、干预措施、治疗疗程和观察指标等。采用RevMan 5.3软件对纳入文献进行质量评价,内容包括随机序列产生、分配隐藏、对研究者或患者施加盲法、不完全结局数据、其他偏倚。评价结果分为“低风险”“不清楚风险”“高风险”。以上内容由两名专业人员独立汇总完成,当出现不同意见时再增加一名专业人员同组讨论后决定。
1.1.6 数据统计与分析 利用RevMan 5.3软件对纳入研究进行Meta分析,不能进行Meta分析的则进行描述性定性分析。二分类变量资料以95%可信区间(confidence interval, CI)比值比(odds ratio, OR)表示,连续性变量资料以95%CI标准化均值差(STD mean difference, SMD)表示。显示异质时,即P<0.1、I2≥50%,采用随机效应模型;显示同质时,即P>0.1,I2<50%,采用固定效应模型。
1.2 网络药理学
1.2.1 生骨汤活性成分及靶点获取 利用TCMSP(http://lsp.nwu.edu.cn/tcmsp.php)、BATMAN-TCM(http://bionet.ncpsb.org/batman-tcm)、DrugBank(https://go.
drugbank.com/)和中药与化学成分数据库(http://www.chemcpd.csdb.cn/cmpref/main/tcm_introduce.asp)以及查阅文献等方法收集生骨汤活性成分和相关靶点信息。TCMSP数据库根据口服生物利用度(oral
bioavailability, OB)≥30%以及类药性(drug-likeness, DL)≥0.18进行筛选,其他数据库和查阅文献获取到的活性成分则以Lipinski类药五原则[5-6],即分子量(MW<500),氢键供体数(Hdon<5),氢键受体数(Hacc<10),脂水分配系数(AlogP<5)和旋转键(RBN<10)对其进行筛选。通过PubChem数据库(https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/)检索获得的生骨汤活性成分的结构式,未能搜索到的则收集其2D结构图,最后利用Swiss TargetPrediction数据库(http://www.swisstargetprediction.ch/)进行靶点预测。
1.2.2 SANFH靶点筛选预测 以“steroid-induced avascular necrosis of femoral head”为关键词,利用GeneCards数据库(https://www.genecards.org/)对其相关靶点进行筛选。
1.2.3 共同靶点筛选 将两者靶点经Venn Diagram网站(http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/Venn/)取交集,获取两者共同靶点并绘制韦恩图。
1.2.4 网络构建与分析 运用Cytoscape 3.7.2构建“中药-活性成分-共有靶点”网络图;将共同靶点导入String数据库(http://string-db.org/cgi/input.pl),置信度得分设置为>0.9,隐藏游离蛋白进行参数分析,结果导出后再导入Cytoscape 3.7.2中构建蛋白质相互作用(protein-protein interaction, PPI)网络图,运用MCODE插件筛选关键蛋白模块,参数设置:度值=2,节点得分=0.2,最大深度=100。
1.2.5 GO、KEGG富集分析 运用DAVID数据库(http://david.ncifcrf.gov)对导出数据进行GO、KEGG富集分析,GO富集分析包括生物过程、分子功能和细胞组分;KEGG富集分析则直观检测共有靶点涉及的通路分布情况;最后通过微生信网站(http://www.bioinformatics.com.cn/)将GO、KEGG富集结果可视化。
1.2.6 分子对接 根据“1.2.4”分析结果,取关键活性成分与核心蛋白运用AutoDock vina 1.1.2软件进行分子对接。首先,在PDB数据库(http://www.rcsb.org/)搜索关键蛋白3D结构,使用PyMOL 1.7.2.1软件移除关键蛋白中非蛋白分子和配体;通过PubChem数据库下载活性成分结构并进行优化。使用AutoDock vina 1.1.2软件进行定位、残基修补、水分子去除、添加氢原子和电荷并保存。以原配体所在位点作为关键蛋白活性口袋进行分子对接,最后通过PyMOL 1.7.2.1软件对结果进行可视化。
2 结果
2.1 Meta分析结果
2.1.1 文献检索结果 初步检索得到中文文献3584篇和英文文献865篇,通过阅读题目和查重后,剔除4434篇,剩中文文献15篇和英文文献0篇,根据纳入标准与排除标准进行阅读评估和剔除后,最終纳入文献5篇[7-11]。
2.1.2 纳入文献基本特征 纳入5篇文献均为中文文献,共计5项研究和394例样本,其中试验组199例和对照组195例,试验组干预措施均为生骨汤,对照组干预措施均为常规治疗药物。见表1。
2.1.3 纳入文献偏倚分析评估 本次研究纳入文献均提及“随机”字样,其中2篇文献[7,11]采用随机数字表法,评定为低风险,剩余3篇文献[8-10]只描述为随机,未明确随机序列产生方法,故评定为不清楚风险;本次研究纳入文献均未提及分配隐藏及盲法,故评定为不清楚风险;所有纳入文献均有明确结局指标,故评定为低风险;所有纳入文献均未发现重复发表或发表偏倚,评定为低风险;其他偏倚均未知,故评定为不清楚风险。见图1。
2.1.4 疗效评价分析 (1)临床总有效率:纳入的5篇文献[7-11]均提及临床总有效率,结果提示各研究间具有同质性(P=0.79,I2=0%),选择固定效应模型,OR=4.38(95%CI 2.15~8.89,P<0.000 01),提示生骨汤优于仙灵骨葆胶囊,两者差异具有统计学意义。见图2a。
(2)综合疗效评分:纳入的5篇文献中4篇[7-8,10-11]提及综合疗效评分,结果提示各研究间具有同质性(P=0.57,I=0%),选择固定效应模型,SMD=3.89(95%CI 3.48~4.30,P<0.000 01),提示生骨汤优于仙灵骨葆胶囊,两者差异具有统计学意义。见图2b。
(3)空骨陷窝率:纳入的5篇文献中2篇[7,9]提及空骨陷窝率,结果提示各研究间具有同质性(P=0.90,I=0%),选择固定效应模型,OR=0.16(95%CI 0.05~0.58,P=0.005),提示生骨汤优于仙灵骨葆胶囊,两者差异具有统计学意义。见图2c。
2.1.5 发表偏倚 绘制漏斗图对生骨汤和仙灵骨葆胶囊在提高总有效率方面进行偏倚分析,如图所示,漏斗图各散点呈不完全对称,说明存在发表偏倚的可能性。见图3。
2.2 网络药理学结果
2.2.1 药物成分及相关靶点筛选 通过数据库和查阅文献,共得到生骨汤活性成分40个,活性成分靶点630个。
2.2.2 疾病靶点筛选 结果汇总后共得到SANFH相关靶点505个。
2.2.3 潜在靶点预测结果 经Venn Diagram网站得到共同靶点94个。见图4a。
2.2.4 网络构建与结果分析 “中药-活性成分-共同靶点”网络图见图4b,通过Network Analyzer工具分析网络中节点的度值。度值排前5位的靶点为鸡肉瘤病毒基因(sarcoma gene, SRC)、血管内皮生长因子A(vascular endothelial growth factor A, VEGFA)、基质金属蛋白酶9(matrix metalloproteinase 9, MMP9)、纤溶酶原(plasminogen, PLG)、丝裂原激活蛋白激酶14(mitogen-activated protein kinase 14, MAPK14);排前5位的成分为木犀草素(luteolin)、去甲汉黄芩素(norwogonin)、牵牛花色素(petunidin)、2’-羟基染料木素(2'-hydroxygenistein)、染料木素(genistein),具体活性成分信息见表2。将共同靶点导入String数据库进行参数分析后,剩余83个核心蛋白,导出结果后接着导入Cytoscape 3.7.2中构建PPI图,见图4c,并通过Network Analyzer工具和MCODE插件筛选关键蛋白模块,得到2个关键蛋白模块,模块1评分为7.714,模块2评分为4.333,具体情况见图4d。
2.2.5 GO、KEGG富集分析 将83个核心靶点上传至DAVID数据库,进行GO、KEGG富集分析。GO富集分析共得到431个条目,其中细胞组分34个,生物过程307个,分子功能90个,显示生骨汤治疗SANFH主要与蛋白水解、信号传导、胶原分解代谢过程等生物过程及蛋白质结合、ATP结合、锌离子结合等分子功能密切相关,其过程涉及质膜、细胞外区域、细胞外泌体等细胞组分,见图5。KEGG富集分析共得到73条通路,具体分布见图6,排除与SANFH联系不够密切的通路,筛选出磷脂酰肌醇-3-激酶/蛋白激酶B(phosphatidylinositol-3-kinase/protein kinase B, PI3K/Akt)、低氧诱导因子-1(hypoxia inducible factor-1, HIF-1)、丝裂原激活蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase, MAPK)等相关主要信号通路。
2.2.6 分子对接结果 根据“2.2.4”分析结果,分别取度值前5位的活性成分以及核心蛋白进行分子对接,并取结合能最低者进行可视化,见表3、图7,结果显示,关键活性成分与核心蛋白的结合能均≤-5.0 kJ/mol[12],且多数嵌入核心靶点活性口袋的疏水区,结合模式多以π-π作用和氢键为主,提示具有较好结合活性,其中染料木素能与MMP9上的LEU-188、LEU-222、LEU-243、ALA-189、VAL-223以及MIS-226残基结合。
3 讨论
近年来,随着糖皮质激素的广泛应用,SANFH的发病率也在逐年升高,其占比率在非创伤性股骨头坏死中高达51%[13-14],已成为临床上较为棘手的骨科疾病。SANFH的发病机制较为复杂,其中股骨头血液循环中断是目前最普遍认可的发病机制。目前,西药多采用增加纤溶、扩张血管、抗凝与降脂药物联合使用,或将增加成骨与抑制破骨药物联合使用[15]。西药治疗通常只涉及一种或几种作用机制,治疗效果不稳定。中医治疗则以整体观为指导,强调早期诊断、早期治疗以及病证结合,以求髋关节局部和整体稳定[16]。在患者不同时期均需采用一定的补肾健骨中药治疗[17-19],而生骨汤是壮瑶医治疗SANFH的经验方,具有补益肝肾、益髓生骨、舒筋活络、活血化瘀的作用,且疗效显著[7-11]。而本次Meta分析結果显示,与常规用药仙灵骨葆胶囊相比,生骨汤的疗效更好,可显著提高总有效率、综合疗效评分,并降低患者的空骨陷窝率。
基于Meta分析结果,本次研究进一步通过网络药理学对生骨汤治疗SANFH的潜在作用机制进行初步探索,发现木犀草素、去甲汉黄芩素、牵牛花色素、2’-羟基染料木素、染料木素为关键成分。木犀草素是一种黄酮类化合物,具有抗炎以及调节免疫的作用[20]。相关研究显示[21],木犀草素能通过STAT1/Caspase-3信号通路抑制去脱氧诱导的成骨凋亡激活。染料木素主要来源于广豆根和金雀花等一些豆科植物,具有提取率高、成本低等特点[22]。而相关实验显示[23],染料木素可通过旁分泌刺激成骨细胞增殖、分化,进而增强骨保护素蛋白质分泌以及mRNA表达。
此外,本次研究还发现生骨汤治疗SANFH的核心靶点为SRC、VEGFA、MMP9、PLG、MAPK14。PLG是纤溶系统的重要组成之一,激活后具有溶解血栓并抑制凝血的作用。基质金属蛋白酶(matrix
metalloproteinase, MMPs)是参与降解全身各种组织细胞外基质的蛋白酶家族,其中MMP2、MMP9在破骨细胞中大量表达,降解骨基质相关有机物[24]。VEGFA是VEGF家族中常见的一位成员,具有促进新生血管生成的作用[25]。VEGF与其激酶结构域受体(Flt-1、Flt-4、KDR)特异性结合后,增加相关静脉通透性来促进营养物质以及炎性物质渗出。而SRC是Src激酶家族的成员之一,近期有相关研究表明[26],LPS通过TLR4通路触发信号分子Src/Syk磷酸化,激活NF-κB和AP-1信号通路,从而影响炎性因子表达。血管发生炎症反应会导致组织肿胀引起骨内压升高,而骨内压升高是SANFH的一个重要病因。综上所述,生骨汤治疗SANFH主要是通过调节新生血管生成、凝血系统以及骨吸收等相关途径。
另外,本次研究发现,PI3K/Akt、HIF-1、MAPK等相关通路与生骨汤治疗SANFH密切相关。PI3K/Akt通路主要参与细胞增殖、凋亡和分化[27]。Zou等[28]研究发现缺氧条件下,小鼠成骨细胞中PI3K-Akt信号通路受到抑制,最终导致成骨细胞凋亡。Liu等[29]研究发现,人多能干细胞分泌物可通过激活PI3K/Akt通路增强股骨头内血管内皮细胞的成血管能力,维持股骨头血供。HIF-1α信号通路在缺血/低氧环境下,对血管生成和骨形成起着十分重要的调节作用。相关研究表明低氧情况下,稳定表达的HIF-1α蛋白能增高VEGF的表达来促进血管生成[30]。Zhang等[31]研究也证实在低氧环境下,软骨细胞HIF-1α、VEGF表达均升高,诱导血管生成来为骨生成带来氧分和营养物质。MAPK通路在细胞生长及细胞信息交流过程中起到十分重要的作用,其中p38-MAPK、ERK信号通路调控细胞凋亡,从而影响SANFH。p38通过磷酸化p53,影响活性氧簇在线粒体中的产生,将氧化应激信号转化为凋亡信号以促进成骨细胞凋亡[32]。而ERK通路,则具有调节成骨细胞分化增殖的作用,该通路被激活后,RUNX2、Ⅰ型胶原以及碱性磷酸酶表达水平会增高,从而促进成骨细胞增殖[33]。
本次研究不足之处:(1)纳入文献只有5篇,且质量有所欠缺;(2)纳入文献均为国内研究;(3)网络药理学研究未将分析结果与成分含量相联系,后续研究应将两者关系考虑在内进行分析;(4)此次研究搜索到松兰、丢了棒的相关活性成分均未满足筛选条件,望后续能完善相关成分研究。
本次研究运用Meta分析和网络药理学进行综合分析,结果表明,生骨汤可显著提高SANFH患者临床总有效率、综合疗效评分,并降低其空骨陷窝率;而生骨汤主要是通过诱导调控相关靶点和信号通路,调节新生血管生成、凝血系统以及骨细胞的增殖、凋亡、分化來发挥治疗作用。本研究一定程度上为壮瑶药生骨汤治疗SANFH提供了较为科学的循证依据,并分析了其内在机制,这为传统医学与现代医学研究相结合提供了理论依据,也为今后临床相关问题的研究提供了系统的研究思维与模式。
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