2010- 2018年江西省冠状病毒感染特征分析

徐刚，熊英，李健雄，施勇，周珺，龚甜

（江西省疾病预防控制中心，江西 南昌 330029）

冠状病毒属于巢状病毒目、冠状病毒科、冠状病毒属，因电镜下病毒颗粒形似王冠而得名。 冠状病毒是病毒界的一个大家族，能感染从哺乳动物到禽类等一大批脊椎动物。 根据国际病毒分类学委员会的最新规定，冠状病毒分为4 组：α、β、γ 和δ，分别对应1 组、2 组和3 组冠状病毒和新假定的一个属。 α 冠状病毒组包括人冠状病毒229E(HCoV-229E)、NL63(HCoV-NL63)以及一些动物冠状病毒如猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)和犬冠状病毒(CCoV) 等；β 冠状病毒包括人冠状病毒OC43(HCoV-OC43)、SARS、HKU1(HCoV-HKU1)、MERSCoV[1]以及2019年12月在武汉首次发现的新型冠状病毒[2-4]（2019-nCoV），还包括鼠肝炎病毒(MHV)和牛冠状病毒(BCoV)等动物冠状病毒；γ 冠状病毒组包括禽传染性支气管炎病毒(IBV)和火鸡冠状病毒(TCoV)等[5]。

冠状病毒是一类具有包膜、 基因组为线性单股正链的RNA 病毒。 基因组全长约27～32kb，是目前已知RNA 病毒中基因组最大的病毒[6，7]。 冠状病毒的感染一般引起轻微的感冒症状，但是人感染冠状病毒可能会引起严重的疾病，严重急性呼吸综合征可导致死亡。 所有新冠病毒患者均发展为新型冠状病毒感染的肺炎(novel coronavirus pneumonia，NCP)[8]，其中约一半发生呼吸困难, 三分之一的患者被送入ICU 进行治疗与SARS-CoV 的10%致死率[9]和MERS-CoV 的37%致死率[10]相比,2019-nCoV 现在是冠状病毒家族中的第三致命病毒[11]。

本研究探讨2010-2018年江西省冠状病毒感染情况, 为江西省内冠状病毒研究提供基线数据，发现冠状病毒感染的流行特征。

1 材料与方法

1.1 标本来源 收集江西省儿童医院和南昌市高新开发区医院2010年至2018年有呼吸道感染症状的病例标本。 标本类型包括咽拭子，下呼吸道灌洗液等。 采样后冷藏运送到江西省疾病预防控制中心疾病检验所实验室，-80℃冰箱保存。

1.2 冠状病毒检测与分型

1.2.1 核酸提取 样本使用Qiagen Cador Pathogen 96 QIAcubeHAT kit 试剂，经QIAxtractor 自动核酸纯化工作站提取核酸。

1.2.2 冠状病毒检测与分型 核酸使用TAKARA公司PrimeScriptTM One Step RT-PCR kit Ver.2 试剂； 阳性的样本使用TAKARA 公司One Step PrimeScriptTM RT-PCR kit(Perfect Real Time)试剂检测分型，按说明书操作，引物,见表1。

表1 冠状病毒引物序列

1.2.3 其他主要呼吸道病毒的检测 HCoV 阳性样本同时检测人博卡病毒HBoV、人流感病毒Flu、人腺病毒HAdV、人副流感病毒PIV、人呼吸道合胞病毒RSV、 人偏肺病毒HMPV 和人鼻病毒HRV 7种呼吸道病毒感染情况。

1.3 数据整理与分析 收集标本调查表信息和实验结果，使用EXCEL 和SPSS13.0 软件分析数据。

2 结果

2.1 核酸检测2010-2018年期间共收集有呼吸道感染症状病例3744 份咽拭子、支气管肺泡灌洗液等标本，检出147 份HCoV 阳性，阳性率为3.93%，其中HKU1 阳性率1.12%（42/3744）；229E 阳性率0.61%（23/3744）；OC43 阳 性 率1.68%（63/3744）；NL63 阳 性 率0.91% （19/3744）。 HKU1、229E、OC43、NL63 阳性构成比分别为28.57%、15.65%、42.86%、12.93%。 最高的OC43,其次是HKU1,229E和NL63 都较少，构成比,见图1。

图1 冠状病毒核酸检测分型构成比

2.2 HCoV 感染病例临床资料分析 不同型别HCoV 病例具有相似的临床特征，住院和发热比例超过半数，超过85%出现咳嗽、超过33%有咳痰和流涕症状，部分出现咽喉痛和呼吸急促症状，极少数出现腹泻症状，病例超过76%一周内使用抗生素。

不同型别HCoV 病例呈现不同临床特征，HKU1 和229E 阳性病例发热多为高热；229E 阳性病例发热比例超过73%，使用抗生素比例和住院率均最高，症状最重；NL63 阳性病例发热率、使用抗生素比例和住院率均最低，症状最轻；OC43 病例有近10%出现腹泻症状,见表2。

表2 冠状病毒及分型的临床资料

2.3 不同标本类型检测分析 上呼吸道标本咽拭子与下呼吸道标本支气管灌洗液HCoV 核酸阳性率比较，差异无统计学意义（χ2=0.031，P＞0.05），说明HCoV 可感染人的上呼吸道和下呼吸道，没有明显的倾向性。

表3 不同标本类型冠状病毒检测情况

2.4 人群分布 男性HCoV 阳性率为4.55%（116/2552），女性HCoV 阳性率为2.60%（31/1192），男、女性HCoV 阳性率,差异有统计学意义（χ2=8.147,P＜0.05），男性高于女性。

将本研究所有病例标本按年龄分成4 组。HCoV 阳性病例年龄分布在1月～6岁，年龄中位数1岁，阳性率在各年龄组, 差异有统计学意义（χ2=11.977，P＜0.05），阳性率最高是1 至3岁儿童（5.49%），阳性率最低是大于6岁人群（1.82%）。

表4 冠状病毒核酸阳性病例年龄分布

2.5 时间分布 2010年-2018年HCoV 阳性率在2012年和2014年出现了两次相对高峰，全年均流行趋势,阳性率最高为12月（6.07%）。 见图2、图3。

图2 冠状病毒的年份分布

图3 冠状病毒的月份分布

2.6 地区分布 住院病例按现住住址城市分析，HCoV 阳性率最高的是吉安市（6.92%）；其次是南昌市（6.02%），而萍乡市病例未检出HCoV。

图4 冠状病毒的地区分布

2.7 混合感染情况HCoV 阳性标本同时检测其它7 种常见呼吸道感染病毒以监测混合感染情况，119 份阳性标本中混合感染74 例，混合感染率为2.34%,双重感染47 份(39.5%)三重感染27 份(22.7%)。 混合感染分别为Flu5 份、RSV17 份、PIV14 份、AdV13 份、HMPV1 份、HBoV11 份和HRV17 份。 混合感染主要以RSV 和HRV 最多见。

3 讨论

病毒是引起成人和儿童呼吸道感染的常见病原体，通常引起人体发热、咳嗽等症状。 冠状病毒是最大的RNA 病毒，HCoV-HKU1、229E、OC43 和NL63 会引起呼吸道感染，大多数症状较轻，但也可导致患者死亡[12]。

本研究采集、检测了2010年-2018年3744 份咽拭子、 支气管肺泡灌洗液等呼吸道标本。 HCoV阳性率为3.93%，其中HKU1 阳性率1.12%，229E阳性率0.61%，OC43 阳性率1.68%，NL63 阳性率0.91%,发现阳性构成比OC43 最高，NL63 最低，与其他研究结果相近[13，14]。

本研究发现不同型别HCoV 病例具有相似的临床特征，多数出现发热（低热）和呼吸道症状，极少数出现腹泻症状，超半数需住院治疗和使用抗生素。 不同型别HCoV 病例呈现不同临床特征，HKU1 和229E 阳性病例发热多为高热；229E 阳性病例病例发热比例、 使用抗生素比例和住院率均最高，症状最重；NL63 阳性病例发热率、使用抗生素比例和住院率均最低，症状最轻；OC43 病例有近10%出现腹泻症状。 冠状病毒感染病例需要关注，积极治疗，以防症状加重。

本研究发现男性HCoV 阳性率高于女性，1 至3岁的儿童HCoV 阳性率最高，与其他研究结论[15,16]不同。学前儿童是冠状病毒感染的高危人群，应加强关注。

本研究发现HCoV 在不同年份流行一定波动,2012 和2014年出现两次流行小高峰。 HCoV 全年均可检出，但12月较高，与广州市的研究表明HCoV 主要是在冬季和春季流行[17]略有不同。

本研究发现住院病例HCoV 阳性率最高来源于吉安市，其次是南昌市，而萍乡市没有检测HCoV，可能与收集到萍乡市标本数较少有关，要全面掌握各设区市呼吸道病例的HCoV 病毒感染情况，尚需在当地开展监测。

本研究也发现急性呼吸道感染病例HCoV 可混合感染其他呼吸道病毒，以RSV 和HRV 更常见，与相关研究表明[18]HCoV 混合感染率最高的是FluA、RSV 和HRV 的结果相类似。

综上所述，本研究发现HCoV 阳性率最高是男性、 学前儿童。 OC43 阳性构成比最高，HKU1 和229E 病例发热多为高热，229E 病例症状最重，NL63 病例症状最轻。由于冠状病毒没有疫苗应用，我们需要关注冠状病毒感染病例，重点关注男性、学前儿童，减轻冠状病毒对人群的危害。