陈萍 梁俊荣 汪鑫 李丹秀 王琦 曹田宇 周金池 赵晓迪 卢瑗瑗 王新
结直肠癌(colorectal cancer,CRC)是常见恶性肿瘤之一,也是全球癌症相关死亡率的第二致死因素,且发病率和死亡率近年来呈增长趋势[1]。CRC有手术、放疗、化疗和靶向药物等治疗方法,早期患者疗效较好,但晚期患者疗效并不理想。因此,寻找可用于早期诊断、治疗和预后评估的新型生物学标志物尤为重要[2]。lncRNA(long non-coding RNA)是长度>200 个核苷酸的转录物,具有低或无蛋白编码潜能,可形成多种转录本,通过与蛋白质、染色质甚至RNA本身的相互作用调节一系列细胞功能[3]。研究发现,lncRNAs在肝癌、肺癌,包括结直肠癌等多种肿瘤中异常表达[4-6]。其中,Linc00704是一种有丝分裂相关的长非编码RNA(mitotically-associated lncRNA,MANCR),位于 10号染色体,最长转录本为1 528 bps,包含4个外显子。本课题组前期利用三维立体细胞培养模型培养结肠癌HCA-7细胞,用EGFR单抗西妥昔筛选获得敏感结肠癌细胞[7],且结肠癌细胞经西妥昔单抗处理后经转录组测序发现Linc00704表达下降约90%,因此推测Linc00704可能在结直肠癌发生发展中发挥重要作用。本研究在此基础上进一步探讨Linc00704对结直肠癌细胞增殖、侵袭及迁移等功能的影响,以期为阐明结直肠癌发病机制提供理论基础。
27对配对结直肠癌组织、癌旁组织样本均来自空军军医大学西京消化病医院。正常永生化人结肠上皮细胞系FHC和结直肠癌细胞系NCI-H716、SW480、SW48、SW1463、Caco-2、DLD-1、HCT15、RKO 均为本实验前期保存。反义寡核苷酸(antise oligonucleotide,ASO)序列由广州锐博生物公司合成。Linc00704过表达慢病毒由上海吉凯基因公司合成。Linc00704引物由北京睿博兴科生物技术有限公司合成。转染试剂HiPerFect、RNA提取试剂盒miRNeasy Mini Kit购自QIAGEN公司;逆转录试剂盒5X PrimeScript RT Master Mix及PCR引物均购自TaKaRa公司;Real-time PCR 试剂 Hieff qPCR SYBR Master Mix(No Rox)购自YEASEN公司;Transwell迁移小室购自Millicell公司;Invasion小室购自CORNING公司;Cell Counting Kit-8购自DOJINDO Laboratories公司。
细胞在含10%胎牛血清、1%二抗、1%谷氨酰胺(100×)、1%非必需氨基酸溶液的DMEM培养液中培养,培养条件 5% CO2、37℃,待细胞汇合至85%~95%时消化传代。转染ASO序列下调Linc00704表达:于6孔板中按每孔50 nmol沉默Linc00704的反义寡核苷酸序列(ASO-Linc00704)或阴性对照、5 μL/孔转染试剂HiPerFect与Opti-MEM培养液制备混悬液转染Caco-2、DLD-1细胞,48 h后收集细胞行RT-qPCR检测验证Linc00704的转染效率。ASO-Linc00704序列为 5′-CCGAAACTTGCCATTT-3′。转染 ASO 序列后的细胞系分别命名为阴性对照组(ASO-NC组)、ASO-Linc00704组。感染过表达慢病毒:6孔板中贴壁细胞生长约40%时,按细胞MOI=10计算Linc00704的病毒量,加入含40 μL/mL感染增强液的DMEM培养基,混匀后加入6孔板内。72 h后加入嘌呤霉素进行筛选,RKO细胞加入2 μg/mL嘌呤霉素;HCT15细胞加入5 μg/mL嘌呤霉素,1周后行RT-qPCR检测以验证转染效率。感染过表达慢病毒后各细胞系分别命名为阴性对照组(NC组)、过表达Linc00704组(Linc00704组)。
收集结直肠癌组织及转染48 h后的细胞,按照RNA提取试剂盒说明提取总RNA。分光光度计测定RNA浓度及纯度后按照反转录试剂盒说明进行反转录,条件为37℃反转录15 min,85℃灭活反转录酶5 s。反转录后模板用两步法进行扩增,扩增条件:95℃预变性 30 s;95 ℃变性 5 s,60 ℃延伸 30 s,40个循环。Linc00704上游引物为 5′-TGTTGGAGGATACCTGTGCAT-3′,下游引物为5 ′-TGCCATTCCCAGATTGTGGAG-3′;内参 GAPDH上游引物为 5′-GCACCGT-CAAGGCTGAGAAC-3′,下游引物为 5′-TGGTGAAGACGCCAGTGGA-3′。实验重复 3 次。采用 2-△△Ct法计算Linc00704 mRNA的表达量。
收集转/感染48 h后的细胞分别以1 000/孔铺于6个96孔板中,每组细胞设5个复孔,分别在铺板后0 d(12h)、1d(24 h)、2 d(48 h)、3 d(72 h)、4 d(96 h)、5 d(120 h)各取1板,并将每孔换成100 μL培养液+10 μL CCK-8试剂的混合液,并取96孔板中的5个空白孔加入上述混合液做空白对照,继续孵育2 h,酶标仪测定450 nm处的吸光度(OD)值。根据吸光度绘制生长曲线。
Transwell迁移实验:收集转染ASO-Linc00704 48 h后的 Caco-2、DLD-1细胞及Linc00704过表达的RKO、HCT15细胞,重悬细胞,计数,调整细胞浓度为5×105/mL。取Transwell小室置入24孔板中,下层加入600 μL含20%胎牛血清的完全培养基,上层加入200 μL上述重悬细胞,置于孵箱常规培养,Caco-2、DLD-1细胞培养22 h后取出,RKO、HCT15细胞培养52 h后取出,小室用PBS清洗2遍,加入1 mL 95%的乙醇固定5 min,再用PBS洗1次后,加入含有 1 mL的结晶紫溶液染色5 min,PBS清洗,用湿棉签轻轻擦去小室内贴壁细胞,置于显微镜下观察,随机选取3个视野拍照,计数所穿出的细胞。Transwell侵袭实验:使用Invasion小室,Caco-2、DLD-1细胞培养24 h后取出,RKO、HCT15细胞培养100 h后取出,其余步骤同迁移实验。
采用IBM SPSS Statistic 23.0软件进行统计学分析。结直肠癌组织及癌旁正常组织中Linc00704 mRNA的比较采用配对t检验方法。结直肠癌细胞和正常结肠上皮细胞系Linc00704 mRNA表达水平的比较采用单因素方差分析。两组Linc00704 mRNA表达水平、迁移、侵袭数据的比较采用独立样本t检验。检验水准α=0.05。
RT-qPCR检测结果显示,相比正常癌旁组织,Linc00704在结直肠癌组织中表达明显降低(2.393±0.821 vs 15.94±3.989,t=4.103,P<0.001),见图 1A。正常结肠上皮细胞系FHC和结直肠癌细胞系(RKO、HCT15、NCI-H716、SW480、S W1463、SW48、Caco-2、DLD-1)中有6种细胞Linc00704表达水平明显降低(F=44.750,P<0.001),见图 1B。本研究选取 Linc00704表达水平相对较低的RKO、HCT15及较高的结直肠癌细胞系Caco-2、DLD-1进行后续实验。
图1 Linc00704在结直肠癌组织及细胞系中的表达Fig.1 Expression of Linc00704 in colorectal cancer tissues and cell lines
RT-qPCR检测结果显示,在Caco-2、DLD-1细胞中,ASO-Linc00704组的Linc00704 mRNA相对表达量均低于 ASO-NC 组(均 P<0.01)。Caco-2、DLD-1细胞的沉默效率分别为(73.4±2.2)%、(81.9±3.7)%,见图 2A~B。在 RKO、HCT15细胞中,Linc00704组的Linc00704 mRNA相对表达量均高于NC组(均P<0.001)。RKO、HCT15细胞的过表达效率分别为(1 423 900±71 690)%、(2 574 500±78 770)%,见图 2C~D。说明构建Linc00704下调及过表达模型成功,可用于后续功能实验。
图2 沉默Linc00704及过表达Linc00704细胞的转染效率Fig.2 Transfection efficiency of silencing or overexpressing Linc00704 cells
CCK-8检测结果显示,在Caco-2、DLD-1细胞中,ASO-NC组与ASO-Linc00704组细胞的OD值比较差异无统计学意义(P=0.465;P=0.257)。在 RKO 与HCT15细胞中,NC组与Linc00704组细胞的OD值比较差异亦无统计学意义(P=0.334;P=0.490)。见图3。
图3 结直肠癌Caco-2、DLD-1、RKO、HCT15细胞的生长曲线Fig.3 Growth curves of colorectal cancer Caco-2,DLD-1,RKO and HCT15 cells
Transwell迁移及侵袭实验显示,在Caco-2、DLD-1细胞中,ASO-Linc00704组细胞迁移穿膜数及细胞侵袭穿膜数均较ASO-NC组增多(均P<0.001),见图4A~B。在 RKO、HCT15细胞中,Linc00704组细胞迁移穿膜数及细胞侵袭穿膜数均较NC组减少(均P<0.001),见图 4C~D。
图4 Linc00704对结直肠癌细胞迁移及侵袭的影响Fig.4 Effect of Linc00704 on migration and invasion of colorectal cancer cells
越来越多的研究证实lncRNA可通过参与表观遗传、转录及转录后调控等在细胞形态、结构和功能过程中发挥重要作用,也能通过相互作用参与恶性肿瘤的发生发展[2-3,8-9],因此 lncRNAs的异常表达可能是肿瘤发病的机制。lncRNAs在结肠癌靶向治疗及生物学预测方面同样具有重要的临床意义。作为一种lncRNA,Linc00704被发现在多种恶性肿瘤如乳腺癌、甲状腺癌、胃癌和肝癌等高表达,且与恶性表型及不良预后相关[10-14]。在乳腺癌中,TRACY 等[12]通过搜索TCGA数据库发现Linc00704低表达患者的10年生存率较Linc00704高表达患者明显降低,与预后不良相关。以上研究提示Linc00704可能有促癌作用。本研究检测Linc00704在CRC癌组织及癌旁组织中的表达,发现Linc00704在癌组织中低表达,检测8种CRC细胞系同样发现有6种细胞系的Linc00704表达较正常结肠上皮细胞系FHC降低,提示Linc00704低表达与CRC癌变密切相关,且Linc00704可能发挥促癌及抑癌的双重作用。
既往研究报道lncRNA失调在CRC细胞增殖、血管生成、转移、侵袭、凋亡、干性和基因组不稳定性等方面具有重要作用[15]。ZHANG等[11]通过质粒过表达Linc00704后发现可促进肝癌细胞迁移和侵袭,但对细胞增殖无明显影响。YAO等[10]通过质粒过表达Linc00704后发现可促进胃癌细胞增殖,并通过下调miR-101而促进胃癌发生,但未进行细胞迁移及侵袭功能实验。本研究体外功能实验结果发现,Linc00704表达对增殖无明显影响,但下调Linc00704表达可促进CRC细胞迁移及侵袭,而过表达Linc00704可抑制CRC细胞的迁移及侵袭,提示Linc00704表达升高可抑制CRC进展,这与其在结肠癌组织及细胞系中低表达结果一致,但调节CRC生物学行为的具体机制尚不清楚。本研究未发现Linc00704表达对细胞增殖能力的影响,考虑原因为lncRNAs细胞定位与其功能有关,亚细胞定位的差异可能导致其在CRC中的功能不同[16-18]。因此,对于Linc00704的亚细胞定位仍需进一步研究。
综上所述,本研究发现Linc00704在结直肠癌细胞和癌组织中下调,其过表达可抑制结直肠癌细胞迁移和侵袭能力,可能是CRC诊断及治疗的新靶点,但其作用机制仍未知,后续将进一步在体内验证其作用。