13号染色体q22.1q32.3间隙缺失致多发畸形1例并文献复习

宋亚蓝,黎 萍,邢 杰,赵芷若,张云峰,刘秀敏

(1.吉林大学第二医院 发育儿科,吉林 长春130041；2.吉林大学第二医院 检验科,吉林 长春130041)

13号染色体长臂片段间隙缺失是非常罕见的染色体异常，多源自新发的突变，其表型主要取决于缺失的部位及片段大小[1]。本文报道回顾分析1例生长发育落后、特殊面容伴多发畸形，经外周血染色体核型分析示13q22-32 缺失患儿的临床表型及其基因型的相关性，并与既往报道的病例进行对比及分析。

1 临床资料

患儿，男，汉族，9 个月，因生长发育落后及多发畸形就诊。患儿系 G1P1，足月顺产儿，出生体重 2 100 g(<-2SD)，身长 40 cm(<-3SD)，为小于胎龄儿，孕期无宫内窘迫，生后无窒息史。生后母乳喂养，生后无住院病史、无手术史。4个月能竖头，6个月会翻身，不会独坐，不会爬，不会扶物站立。

家族史：父、母生育年龄均为 23 岁，否认近亲结婚。其母既往健康，孕期无异常接触史及用药史。家族中无发育落后、骨骼发育异常等病史。

体格检查：神清，精神反应尚可，浅表淋巴结无肿大，身高65 cm(<-3SD)，体重6.1 kg(<-3SD)，头围 39 cm(<-3SD)，眼距宽，眼裂小，追视、追听良好，上腭高、窄，双耳位低，左手拇指缺如，手指及足趾短，掌纹浅(图 1、2)，心肺听诊无阳性体征，腹部触诊未触及异常包块，阴茎小(长约1.0 cm)，双侧隐睾；神经系统检查未见异常。心脏彩超检查未见异常，头部核磁共振未见明显异常。

图1 本病例的面容

图2 本病例的双手

Gesell 发育评估：运动能 DQ大运动 65(相当于 6 个月)、精细运动 70(相当于 6.5 个月)、应物能 DQ76(相当于 7 个月)、言语能 DQ76(相当于 7 个月)、应人能 DQ76(相当于 7 个月)提示全面发育迟缓。

经过患儿父母知情同意并签署知情同意书后，经过吉林大学第二医院医学伦理委员会批准，抽取患儿及其父母静脉血样进行细胞遗传学和分子遗传学分析。外周血染色体核型分析(550 带，G 带)抽取外周新鲜抗凝血1 ml，加入10 ml含20%小牛血清的培养基中，然后置于5%CO2培养箱37℃培养72 h，收获前1 h加入终浓度为8×10-5g/L的秋水仙素。常规方法收获淋巴细胞、悬浮滴片、烘干、G显带。镜下分析50个染色体中期分裂相，镜下拍摄配对分析5个中期核型，核型描述参考《人类细胞遗传学国际命名体制》(ISCN2009)。

采取患儿2 ml静脉血，应用QIAGEN试剂盒提取基因组DNA。应用美国Affymetrix公司生产的CytoScanHD(195万CNV探针+75万SNP探针)芯片对样本进行检测。对所得的原始数据应用Affymetrix Chromosome Analysis Suite Software进行分析。收集文献报道，并参照国际基因组CNV多态性数据库DGV、UCSC Oenome Browser(https://genome.ucsc.edu/)、DECIPHER以及ISCA数据库及相关文献判读CNV缺失区域，结合OMIM基因分析，分析可能导致多发畸形、全面发育迟缓的基因。

常规染色体G显带结果显示患儿染色体核型为46，XY，del(13)(q22q32)，如图3所示；父母核型均未见明显异常。染色体微阵列比较基因组杂交(aCGH)分析 患儿的13号染色体在13q22.1q32.3区域有28.32Mb 的缺失(arr[hg19]13q22q32(72,800,306-101,119,087)×1)。通过查询DECIPHER和OMIM数据库，发现该区域含有15个编码蛋白的基因：PIBF1、TBC1D4、CLN5、EDNRB、SPRY2、SLITRK1、SLITRK6、MIR17HG、GPC6、TGDS、CLDN10、DNAJC3、ZIC2、PCCA、NALCN，其中缺失可导致显性致病的基因有NALCN、ZIC2、SPRY2、EDNRB和MIR17HG，易感基因有SLITRK1。随访至15个月，患儿会爬，不会独站、独走，会有意识喊“爸爸、妈妈”。

图3 本病例的染色体核型：46，XY，del(13)(q22q32)

总之，本例13q22.1-q32.3 微缺失所致全面发育迟缓、腭弓高、耳位低、双侧隐睾、小阴茎和手足畸形，通过分析发现MIR17HG 基因杂合缺失是导致该表型的关键基因。本例也表明aCGH染色体微阵列是临床上发育迟缓、多发畸形患儿分子诊断的重要工具。

2 讨论

该患儿为足月小于胎龄儿，眼间距宽，眼裂小，少指，隐睾、小阴茎，生后体格、神经运动发育落后，首先需要注意常染色体病，因而检测其外周血染色体核型，发现该患儿存在 13 号染色体q22-q32缺失；aCGH分析进一步验证该患儿13q22.1q32.3区域有28.32 Mb的微缺失。该区域包含多个致病基因，其中可显性致病的基因有NALCN、ZIC2和MIR17HG，易感基因有SPRY2、EDNRB、SLITRK1。NALCN 基因杂合缺失可导致四肢和面部的先天性挛缩，肌张力低下和发育迟缓综合征(Congenital Contractures Of The Limbs And Face，Hypotonia，And Developmental Delay；CLIFAHDD)[2]。ZIC2 基因缺陷可导致前脑无裂畸形5型(Holoprosencephaly 5；HPE5)[3]，前脑无裂畸形是人类大脑最常见的结构异常。位于 13q31.3 的 MIR17HG 基因缺陷可导致Feingold 综合征2 型，表现为手指和脚趾异常，第二指和第五指短，第五指向内弯曲，拇指发育不全，以及第二和第三脚趾融合，或者第四和第五脚趾的融合，小头畸形，小颌，睑裂小，轻度至中度学习障碍[4]；少部分患者还有心脏和肾脏畸形、椎体异常和耳聋[5]。位于 13q31.1 的SPRY2 基因缺失可增加 IgA 肾病易感性[6-9]。位于 13q22.3 的 EDNRB 基因突变可增加先天性巨结肠(Hirschsprung’s disease，HSCR)易感性[10-12]。位于 13q31.1 的 SLITRK1 基因缺失增加图雷特综合症(Tourette syndrome，TS)的易感性，TS是一种以持续的声音和运动抽搐为特征的神经精神发育性疾病[13-17]。结合本例患儿临床资料，MIR17HG 基因的杂合缺失是为该患儿体格、神经运动发育迟缓、面容异常以及手、脚多发畸形的关键致病基因。

本文回顾了13号染色体长臂q22-q32间隙缺失文献，表1列出了目前报道的包括本病例在内的 12例13号染色体q22-32 区域缺失的临床表现，常见的临床特征有全面发育迟缓/智力障碍(9例)、生长发育落后(11例)、肌张力低下(6例)、小头畸形(6例)、宽鼻梁(8例)、耳位低(9例)、手畸形(11例)、足畸形(9例)、高腭弓(6例)、小颌(6例),不常见的临床特征有上门牙突出(4例)、脑积水(2例)、隐睾/小阴茎(5例)、先天性巨结肠(3例)、先天性髋关节发育不良(5例)、癫痫(2例)、中枢神经系统畸形(3例)。

表1 12例 13q22-32 缺失病例的常见临床表型比较