肺腺癌转移相关转录本1调控喉癌细胞的增殖和侵袭*

2020-08-07 01:35阳志慧王少新鲁云杰
成都医学院学报 2020年4期
关键词:二倍体细胞系靶向

阳志慧,王少新,晋 舒,刘 勇,宋 鑫,鲁云杰

1.四川省资阳市第一人民医院 耳鼻咽喉头颈外科(资阳 641300);2.四川省肿瘤医院 头颈外科 (成都 610041)

随着经济发展、生活水平提高和随之而来的环境污染,癌症患病率越来越高,也越发引起了人们的关注和重视。喉癌(laryngeal cancer,LC)是耳鼻喉科中的主要恶性肿瘤疾病之一,由于吸烟、喝酒易发LC,所以易患于男性群体[1]。LC细胞作为一种具有强大自我更新能力的细胞,拥有高度迁移、浸润和转移能力[2]。长链非编码RNA(long non-coding RNA, LncRNA)是一类存在于真核细胞由RNA聚合酶Ⅱ转录的没有蛋白编码能力的竞争性内源RNA(competitive endogenous RNA, ceRNA),可靶向调控微小RNA (microRNA, miR)和蛋白编码基因的表达[3]。

肺腺癌转移相关转录本1(metastasis associated adenocarcinoma transcript 1,MALAT1)位于染色体11q13位点上,是一种在细胞代谢过程中广泛表达的LncRNA。MALAT1能够诱导癌细胞增殖[4],高度参与RNA加工、基因转录、核糖体蛋白、蛋白质降解和代谢调节[5]。MALAT1在很多癌症中高表达,敲除MALAT1,能够抑制结肠直肠癌[6]、喉鳞癌[7]、非小细胞肺癌[8]等癌细胞的增殖,但在LC中未曾提及。本课题拟对MALAT1对LC细胞增殖和侵袭的作用以及潜在的分子机制进行研究,旨在为LC的治疗提供理论依据和研究意义。

1 材料和方法

1.1 材料

1.1.1 细胞 人二倍体细胞系(WI-38)和喉癌细胞系(TU212、Hep2和AMC-HN-8)购自深圳市豪地华拓生物科技有限公司。

1.1.2 试剂 Trizol Invitrogen(上海源叶生物科技有限公司,S30876-100 mL);胎牛血清(fetal bovine serum,FBS)(Gibco,DXT-10099141);达尔贝科极限必需培养液(Dulbecco minimum essential medium,DMEM)(武汉塞默飞生命科技有限公司,PM150210);lipofectAMINE 2000 REAGENT(Invitrogen,11668019);LncRNA-MALAT1、短发夹RNA(short hairpin RNA,sh-RNA)、sh-MALAT1及其阴性对照(sh-MALAT1 negative control,sh-MALAT1-NC)、miR-503-5p模拟物(miR-503-5p mimic)、miR-503-5p抑制剂(miR-503-5p inhibitor)及阴性对照序列(广州锐博生物科技有限公司);Dual-Luciferase Reporter Assay System(Promega,E1910);实时荧光定量聚合酶链反应(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)/TaqMan One Step qRT-PCR Kit(Solarbio,T2210);细胞计数试剂盒8(cell counting kit 8,CCK8)(江莱生物,48T/96T);侵袭小室(Transwell)(Corning,FK-Ik019)。

1.1.3 仪器 净化工作台(Boxun,SW-CJ-2FD);生物显微镜(Olympus,BX43);恒温培养箱(Daihan,WIG-105);倒置荧光显微镜(Nikon,Ti2系列)。

1.2 方法

1.2.1 细胞培养和转染 在无菌超净台中,将WI-38、TU212、Hep2和AMC-HN-8细胞接种在含10% FBS和DMEM(高糖)的培养皿,37 ℃、5%CO2的恒温培养箱培养,48~72 h后换液,进行细胞传代,取对数期生长旺盛的细胞进行后续实验研究。转染时,6孔板中细胞密度融合到70%~80%时效果最佳。根据lipofectAMINE 2000 REAGENT(Invitrogen)说明书,sh-MALAT1与miR-503-5p inhibitor单独或联合转染Hep2细胞。

1.2.2 qRT-PCR检测基因表达 转染后24 h内收集细胞,并加入Trizol试剂提取人二倍体细胞系和LC细胞系中的总RNA。按照TaqMan One Step qRT-PCR Kit说明书,将总RNA逆转录为cDNA,再进行qRT-PCR。利用Primer Premier 6.0,根据每个基因序列设计引物,分别为:MALAT1 (正向引物5′- GAATTGCGTCATTTAAGCCTA GTT -3′,反向引物5′- GTTTCATCCTACCACTC CCAATTAAT-3′);miR-503-5p (正向引物5′-GA AGGTGAAGGTCGGAGTC-3′,反向引物5′-GAA GATGGTGATGGGATTTC-3′);叉头盒蛋白K1(forkhead box K1,FOXK1) (正向引物5′ -GCCTC CTTGACAATACCGCT-3′,反向引物 5′ -TTCCA AACCCTCCCTCTGGT-3′)。根据荧光定量,计算所有样品和标准品的循环数(cycle threshold, CT)。基于该标准的CT值,绘制标准曲线,然后使用2-ΔΔCT方法进行定量计算。

1.2.3 确定MALAT1、miRNA和mRNA的靶向关系 使用生物信息学软件StarBase和TargetScan对MALAT1、miR-503-5p和FOXK1靶向关系分别进行预测和分析。用Dual-Luciferase Reporter Assay System进一步验证靶向关系。用PCR扩增含有miR-503-5p结合位点的MALAT1基因的3′-UTR序列,将MALAT1的3′-UTR克隆到pMIR-REPORT荧光素酶载体pMIR-MALAT1-wild type中。通过PCR扩增MALAT1 5′-GAATTGCGTC ATTTAAAGCCTAGTT-3′的3′-UTR结合位点的突变,并克隆到pMIR-MALAT1-mutant质粒中。根据lipofectAMINE 2000 REAGENT(Invitrogen)说明书,将miR模拟物(miR mimic)和荧光素酶质粒pMIR-MALAT1(野生型/突变型,WT/MUT)转染到Hep2细胞中。转染48 h后,弃去旧培养基,用磷酸盐缓冲液(phosphate buffered saline,PBS)清洗细胞2次。随后,在每孔细胞中加入100 μL裂解缓冲液(passive lysis buffer, PLB),室温下轻轻震荡15 min,收集细胞裂解液。取20 μL PLB加入发光板中,用GloMax生物发光检测仪读取背景值2 s,每个样品加入100 μL荧光素酶分析试剂Ⅱ(luciferase assay reagent Ⅱ,LAR Ⅱ)工作液,快速混匀,读值2 s。读值完毕后,每个样品再加入100 μL Stop&GloTM试剂,快速混匀后,放入发光板中检测,读值2 s。以上实验,每个样品重复3次,记录和保存所有结果及数据,荧光显微镜不可在30 min内连续开启关闭。

1.2.4 CCK8法检测LC细胞增殖情况 将对照组、sh-MALAT1组、miR-503-5p inhibitor组和联合转染(sh-MALAT1+miR-503-5p inhibitor)组细胞分别接种于96孔板(1×105个/孔),每组设置6个重复孔。37 ℃恒温培养箱孵育,每孔加入10 μL CCK8(0.5 g/L)溶液培养4 h,完成培养。在0、1、2、3、4 d分别于酶标仪上测定波长在450 nm处各孔细胞的光密度(optical density, OD)值。

1.2.5 蛋白质印迹技术(Western blot)检测相关蛋白表达情况 将细胞中加入放射免疫沉淀(radioimmuneprecipitation,RIPA) PLB,放置于冰上15~30 min使细胞溶解,然后用超声裂解法5 s,4次,使细胞裂解,最后4 ℃,离心半径10 cm,离心速度3 000 r/min, 离心15 min。结束后,将上清液移入新EP管。提取的蛋白采用双肌球蛋白酸(bicinchoninic acid,BCA)法定量,储存于-20 ℃冰箱。分离蛋白用10%十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(sodium dodecyl sulphate-polyacrylamide gel electrophoresis,SDS-PAGE)分离至聚偏氟乙烯(polyvinylidene difluoride, PVDF)膜上,半干转录,100 mA,1.5 h,用5%脱脂奶粉封膜2 h。将稀释的增殖抗原Ki67 (1∶1 000)、增殖细胞核抗原(proliferating cell nuclear antigen,PCNA)(1∶1 000)、FOXK1 (1∶1 000)、β-肌动蛋白(β-actin)(1∶1 000)单抗在膜上孵育,4 ℃过夜。用PBST(PBS中加入Tween-20)洗涤后,加入相应二抗,孵育30 min,再次用PBST洗涤。采用化学发光法和X线照射成像法观察结果。最后用Protein图像处理软件和Quantity one软件分别扫描X-胶片和条带密度测量值。蛋白表达水平相对于β-actin表示。本实验重复3次。

1.2.6 Transwell染色检测LC细胞侵袭情况 根据试剂盒说明书,用200 μL无血清DMEM换液,24 h后,在Transwell的底部、膜上,按1∶5比例涂抹50 mg/L的基质凝胶稀释液,4 ℃风干。100 μL肿瘤细胞悬液中加入500 μL的含有10%FBS的DMEM培养基和200 μL无血清DMEM,将混合液注入Transwell的内外,每组实验在24孔板中重复3次,对照组在无基质的Transwell中培养。培养48 h后,用PBS冲洗Transwell,移去膜上的细胞,用4%甲醇固定。最后用Giemsa染色,自然风干后观察微孔膜下层的细胞。本实验重复3次。

1.2.7 克隆形成实验检测LC细胞增殖情况 取对数生长期的细胞,用0.25%胰蛋白酶消化并吹打成单个细胞,把细胞悬浮在10% FBS的DMEM培养液中备用。将适当密度的细胞接种于培养皿中并轻轻转动,使细胞分散均匀。置37 ℃、5% CO2、饱和湿度的恒温培养箱中静置培养2~3 d,弃去上清液,用PBS小心清洗2次。将1 mL 4%甲醇固定15 min,然后去固定液,加适量Giemsa染色液染色15 min,最后用纯水缓慢洗去Giemsa染色液,自然风干,用生物显微镜观察、拍照。

1.3 统计学方法

2 结果

2.1 人二倍体、LC细胞系中MALAT1和miR-503-5p表达水平

qRT-PCR检测结果显示,人二倍体细胞系(WI-38) MALAT1表达水平为(1.00±0.13),LC细胞系(TU212、Hep2和AMC-HN-8) MALAT1表达水平分别为(2.44±0.32)、(3.61±0.24)和(2.80±0.18),LC细胞系中MALAT1的表达水平高于人二倍体细胞系(P<0.05);人二倍体细胞系(WI-38) miR-503-5p表达水平为(1.00±0.12),LC细胞系(TU212、Hep2和AMC-HN-8) miR-503-5p表达水平分别为(0.62±0.08)、(0.37±0.10)和(0.50±0.11),LC细胞中miR-503-5p的表达低于WI-38(P<0.05)。结果表明,在LC细胞中,MALAT1高表达,miR-503-5p低表达。由于Hep2细胞中MALAT1和miR-503-5p的变化最明显,因此后续采用Hep2细胞进行研究(图1)。

2.2 MALAT1和miR-503-5p的靶向关系

通过生物信息学软件StarBase对MALAT1和miR-503-5p的靶向关系进行预测和分析,发现miR-503-5p区域存在LncRNA的潜在结合位点,说明miR-503-5p是MALAT1的靶向调节基因之一。qRT-PCR检测发现:对照组、sh-NC组、sh-MALAT1组MALAT1表达分别为(1.00±0.10)、(0.93±0.12)、(0.13±0.05),对照组、NC inhibitor 组、miR-503-5p inhibitor 组miR-503-5p表达分别为(1.00±0.12)、(0.99±0.20)、(0.08±0.03),证明MALAT1和miR-503-5p能够成功在LC细胞中被敲除。对照组、sh-MALAT1组、miR-503-5p inhibitor组、sh-MALAT1+ inhibitor组miR-503-5p表达分别为(0.37±0.10)、(2.86±0.11)、(0.08±0.03)、(0.41±0.08),敲除MALAT1可以明显增加miR-503-5p的表达水平,说明MALAT1和miR-503-5p为负调控靶向关系。对照组、NC mimic组、miR-503-5p mimic组miR-503-5p的表达水平分别为(1.00±0.12)、(1.01±0.20)、(43.60±6.08),miR-503-5p mimic组miR-503-5p的表达水平相比对照组增加了40多倍(P<0.001),证明过表达miR-503-5p可以大幅度增加miR-503-5p的表达水平。用双荧光素酶报告进行进一步验证MALAT1和miR-503-5p的靶向关系,NC mimic+ MALAT1 WT组、miR-503-5p mimic+ MALAT1 WT组、NC mimic+ MALAT1 MUT组、miR-503-5p mimic+MALAT1 MUT组荧光素酶活性分别为(3.31±0.30)、(1.72±0.21)、(3.28±0.27)、(3.44±0.22),miR-503-5p mimic和野生型MALAT1共转染Hep2细胞后,细胞中双荧光素酶活性明显低于突变型(P<0.05),说明MALAT1与miR-503-5p之间一定存在着靶向关系。因此,miR-503-5p是MALAT1的靶向调节基因之一,且miR-503-5p受MALAT1的负调控作用(图2)。

2.3 敲除MALAT1对LC细胞增殖的影响

CCK8检测结果所示,随着时间增长,各组细胞增殖差异逐渐明显。在第4天,对照组、sh-MALAT1组、miR-503-5p inhibitor组、sh-MALAT1+inhibitor组细胞增殖倍数分别是(6.80±0.40)、(2.55±0.35)、(8.26±0.36)、(6.11±0.37)倍,敲除MALAT1可以降低LC细胞的增殖倍数(P<0.01),miR-503-5p inhibitor组细胞增殖倍数明显高于联合转染组(P<0.01),说明miR-503-5p inhibitor逆转了sh-MALAT1对LC细胞增殖的抑制作用。Western blot检测结果显示,对照组、sh-MALAT1组、miR-503-5p inhibitor组、sh-MALAT1+inhibitor组Ki67蛋白表达分别为(0.58±0.10)、(0.15±0.04)、(0.95±0.13)、(0.66±0.08),PCNA蛋白表达分别为(0.43±0.08)、(0.09±0.03)、(0.73±0.07)、(0.54±0.10),sh-MALAT1组相关蛋白(Ki67和PCNA)的表达水平降低(P<0.05);miR-503-5p inhibitor组的相关蛋白表达水平却明显增加,而联合转染组相关蛋白表达水平明显低于miR-503-5p inhibitor组(P<0.01),说明miR-503-5p抑制剂逆转了sh-MALAT1对相关蛋白表达的抑制作用。这些结果显示,敲除MALAT1能够抑制LC细胞的增殖和相关蛋白的表达,miR-503-5p抑制剂能够逆转sh-MALAT1对LC细胞增殖的抑制作用(图3)。

2.4 敲除MALAT1对LC细胞侵袭能力的影响

从Transwell检测结果可知,对照组、sh-MALAT1组、miR-503-5p inhibitor组、sh-MALAT1+ inhibitor组细胞侵袭数目分别为(86.45±7.12)、(31.19±4.28)、(138.26±10.13)、(95.21±9.13)个,与对照组比较,sh-MALAT1组LC细胞的侵袭数明显降低(P<0.01),miR-503-5p inhibitor组LC细胞侵袭数明显增加(P<0.01);与联合转染组相比,miR-503-5p inhibitor组有所降低(P<0.01)。结果说明,敲除MALAT1能够抑制LC细胞的侵袭,miR-503-5p inhibitor能够逆转sh-MALAT1对LC细胞侵袭的抑制作用(图4)。

2.5 MALAT1通过靶向miR-503-5p上调FOXK1对LC细胞增殖和侵袭的影响

通过生物信息学软件TargetScan对miR-503-5p和FOXK1的靶向关系进行分析,结果显示,FOXK1 3′-UTR的5062-5068 bp区域存在has-miR-503-5p的潜在结合位点,故FOXK1是miR-503-5p的靶向调节基因之一。继而用qRT-PCR检测人二倍体细胞系和LC细胞系中FOXK1的表达水平,结果显示,人二倍体细胞系(WI-38) FOXK1表达水平为(1.00±0.13),LC细胞系(TU212、Hep2和AMC-HN-8) FOXK1表达水平分别为(2.13±0.31)、(2.86±0.25)、(1.96±0.17),FOXK1在LC细胞中高表达,且Hep2细胞中FOXK1的变化最为明显,因此,采用Hep2细胞进行后续研究。进一步用Western blot、Transwell、克隆形成分析显示,对照组、sh-MALAT1组、pLenti-CMV-FOXK1组、sh-MALAT1+FOXK1组FOXK1蛋白表达水平分别为(2.86±0.24)、(0.34±0.08)、(5.81±0.20)、(4.11±0.17),侵袭细胞数目分别为(76.32±10.01)、(37.22±7.14)、(133.64±11.24)、(90.52±12.29)个,克隆形成细胞数目分别为(867.34±35.28)、(522.63±41.62)、(1 138.87±46.75)、(905.57±28.35)个,敲除MALAT1后FOXK1的表达水平随之降低,LC细胞的侵袭数和增殖数也随之减少;过表达FOXK1后LC细胞的侵袭和增殖能力增加,并可以明显逆转sh-MALAT1对LC细胞的抑制作用。过表达FOXK1能够促进LC细胞增殖,并能逆转sh-MALAT1对LC细胞增殖和侵袭的抑制作用。MALAT1通过靶向miR-503-5p上调FOXK1能够促进LC细胞的增殖和侵袭(图5)。

3 讨论

LC是喉部的恶性肿瘤,发病率约占全身肿瘤的1%~5%,LC导致人吞咽困难,影响呼吸和说话,严重者可致人窒息而亡。由于其治疗手段单一,治愈率不高,以至于严重影响人类的健康,是目前亟待解决的一个重大难题。因此,寻找多层面调控LC细胞增殖和转移相关的异常基因表达、信号通路及其分子机制,将有助于识别潜在的LC靶点,为临床提供新的治疗策略。

MALAT1是较早发现与人类疾病相关的LncRNA之一,在不同的哺乳动物中均有丰富的表达,而且在各种癌症的发展和进展过程中发挥着关键作用[9]。已有研究[6,8,10]显示,MALAT1在肿瘤组织系、卵巢癌细胞系中上调,在直肠癌、结肠癌、肺癌、喉鳞癌等癌症中也被多次提及,MALAT1高表达可以促进癌细胞的增殖、侵袭和迁移,抑制癌细胞凋亡,这些研究证明MALAT1在多种癌症中为一种致癌因子。在此基础上,本研究对LC细胞系(TU212、Hep2和AMC-HN-8细胞)和人二倍体细胞系(WI-38细胞)中MALAT1的表达水平进行了qRT-PCR检测,结果显示,MALAT1在LC细胞中高表达,继而设计sh-RNA对MALAT1进行敲除,结果显示,敲除MALAT1可以明显抑制LC细胞的增殖和侵袭。这说明在LC中MALAT1也为一个致癌因子,这与MALAT1在其他癌症中的研究[6,8]结果相似。

miRNA是单链非编码小RNA,是转录的主调控因子,影响细胞新陈代谢、衰老[11]和骨细胞分化[12-13]。miR-503-5p作为一种成熟的miRNA,由pre-miR-503的5′端衍生而来,是神经母细胞瘤中ALK表达的调控因子[14]。研究[15-21]发现,miR-503-5p过表达能够抑制膀胱癌细胞的增殖、老年痴呆症神经元的凋亡和炎症、宫颈癌细胞的迁移和侵袭、骨肉瘤细胞的转移和增殖、调控细胞的衰老。然而,目前关于miR-503-5p在LC方面的报道却鲜少未见。在此基础上,本研究对LC细胞系和人二倍体细胞系中miR-503-5p的表达水平进行qRT-PCR检测,结果显示,miR-503-5p在LC细胞中低表达,这说明在LC中,miR-503-5p为一个抑癌因子,这与miR-503-5p在其他癌症中的研究[16-22]结果正好相似。本研究通过敲除MALAT1并结合miR-503-5p inhibitor对LC细胞进行转染,进一步对MALAT1和miR-503-5p的靶向关系进行分析,利用qRT-PCR、双荧光素酶活性报告、CCK8、Western blot和Transwell方法对LC细胞的增殖和侵袭进行检测,研究发现,miR-503-5p确实是MALAT1的靶向调节基因之一,且两者为负调控关系,上调miR-503-5p能够抑制LC细胞增殖和侵袭。

一个miRNA可以靶向多个、甚至百个mRNA,其中有30%的mRNA能被miRNA进行调控。FOXK1是正常细胞增殖所必需的Forkhead家族转录因子,也是一种可以调节多种细胞代谢、发育的致癌转录因子[23-24],属于mRNA。在人类的多种癌症中,FOXK1过表达,并通过与miRNA相互作用而发挥致癌作用。本研究通过生物信息学软件对miR-503-5p和FOXK1的靶向关系进行了预测,发现FOXK1是miR-503-5p的靶向调节基因之一。已有研究[25-28]显示,FOXK1在乳腺癌、前列腺癌、肺鳞癌、胃癌、肝癌中高表达,对癌细胞的增殖、迁移和侵袭有一定的调控作用。而在有关LC的研究中,FOXK1尚未被研究和报道。在此基础上,本研究检测了人二倍体细胞系和LC细胞系中FOXK1的表达情况,发现FOXK1在LC细胞中高表达,这说明FOXK1也为LC中的一种致癌因子。针对这个结果,本研究进一步在敲除MALAT1后,对FOXK1的表达水平进行观察,研究发现,敲除MALAT1明显降低FOXK1的表达水平,这说明MALAT1与FOXK1的调节为正相关。继而又通过qRT-PCR、Western blot、Transwell、克隆形成分析检测发现,FOXK1过表达促进LC细胞的增殖和侵袭,且可以逆转MALAT1低表达对LC细胞增殖和侵袭的抑制作用。总之,FOXK1参与了MALAT1对LC细胞增殖和侵袭的调控。

综上所述,本研究发现,LncRNA MALAT1能够通过靶向miR-503-5p上调FOXK1来促进LC细胞的增殖和侵袭,揭示了MALAT1、miR-503-5p和FOXK1在LC中的基因表达、信号通路及其调控机制。这为LC的诊断和治疗以及预后判断提供了一个新的靶点和理论突破。

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