中国南方汉族人群ZCCHC14基因多态性与小动脉闭塞性卒中的关系☆

2020-04-03 07:30李建立江东东刘柳余蒋怡颖罗曼
中国神经精神疾病杂志 2020年2期
关键词:等位基因多态性校正

李建立 江东东 刘柳余 蒋怡颖 罗曼△※

缺血性脑卒中 (ischemic stroke,IS)的发病机制尚未完全清楚。但大量病因学研究已经表明,IS的发生是一个多步骤、多阶段的复杂过程,是环境因素和遗传因素共同作用的结果。根据当前国际普遍使用TOAST分型[1],IS分为大动脉粥样硬化(large artery atherosclerosis,LAA)型、心源性脑栓塞 (cardio embolism,CE)型、小动脉闭塞(small artery occlusion,SAO)型、其他明确原因型和不明原因型。SAO约占所有IS的四分之一[2],其发病机制尚未明确。流行病学数据表明遗传因素在SAO的发病中发挥着重要作用[3],最近一项全基因组关联研究 (genome wide association study,GWAS)发现[4],包含CCHC结构域的锌指蛋白14(zinc finger CCHC domain-containing 14,ZCCHC14)基因单核苷酸多态性 (single nucleotide polymorphism,SNP)rs12445022与SAO相关,该研究主要针对欧洲人群,目前尚无ZCCHC14基因与中国人群SAO相关性的研究报告。因此,本研究以中国汉族SAO患者及健康人群作为研究对象进行病例对照研究,以确定SNP rs12445022与中国汉族人群SAO之间的关联。

1 对象与方法

1.1 研究对象 收集2016年9月至2017年12月就诊于广西医科大学第一附属医院神经科的SAO患者121例作为研究对象。纳入标准:① 年龄>18岁;② 中国南方地区无亲缘关系的常住汉族居民,3代及以上直系亲属内无其他民族;③ 诊断符合《中国急性缺血性脑卒中诊治指南2014》中IS诊断标准[5],所有病例经CT和/或 MRI确诊;④ 临床表现为腔隙综合征,梗死面积最大直径<1.5 cm。排除标准:①心源性脑栓塞;②同侧颅内、外大动脉狭窄>50%;③其他已知病因及原因不明性IS;④其他类型的脑血管疾病,包括颅内出血、蛛网膜下腔出血、短暂性脑缺血发作、脑血管畸形、动脉瘤等;⑤ 既往有神经系统疾病或脑外伤病史;⑥严重心、肝、肾功能不全,血液病,自身免疫性疾病以及肿瘤患者。对照组纳入标准:①年龄和性别匹配;②中国南方地区汉族居民。排除标准:①患有脑血管病及神经系统疾病;② 患有内分泌及代谢性疾病(除外糖尿病),严重心、肝、肾功能不全,血液病,自身免疫性疾病以及肿瘤患者。本研究获得伦理委员会批准,所有患者充分知情并签署知情同意书。

1.2 研究方法

1.2.1 标本采集 病例组于入院当天,对照组于体检当天取外周静脉血2 mL,EDTA抗凝。使用全血基因组DNA提取试剂盒(北京天根生化科技公司)提取基因组DNA。

1.2.2 基因分型方法 ① PCR扩增:引物使用Primer 3.0软件设计,上游引物序列:5′-ACTGTCCCCCTTGGAACCTCTC-3′,下游引物序列:5′-AAGCCAATGAAAGCGGACACAT-3′,PCR 反应体系(20 μL)包含:1×GC 缓冲液 I,3.0 mmol/L 氯化镁,0.3 mmol/L dNTP,1UHotStarTaq 聚合酶,1 μL 样本 DNA 和 2 μL多重 PCR 引物 (2 μmol/L)。PCR反应条件:95℃预变性 2 min;94℃变性 20 s,65℃退火 40 s,72℃延伸 1.5 min,11 个循环;94℃变性20 s,59℃退火 30 s,72℃延伸 1.5 min,24 个循环;最后72℃延伸2 min。PCR产物4℃保存。② SNP基因分型:取PCR产物 15 μL,依次加入 SAP酶5 U、外切酶2 U,37℃温浴1 h,然后 75℃灭活15min。继而进行SNaPshot多重单碱基延伸反应延伸。延伸引物序列:5′-TTTTTTGCCAGAGCGGGGTAAGGGTT-3′,引物由上海生物工程公司合成。反应体系包括:SNaPshot Multiplex Kit(ABI)5 μL,纯化后多重 PCR 产物 2 μL,延伸引物 1 μL,超纯水 2 μL。反应条件:96℃预变性 1 min;96℃变性10 s,52℃退火 5 s,60℃延伸 30 s,28 个循环;4℃保存。在10 μL延伸产物中继续加入SAP酶1 U,37℃温浴1 h,75℃灭活15 min,以纯化延伸产物。取0.5 μL纯化后的延伸产物,与0.5 μL Liz120 SIZE STANDARD、9 μL Hi-Di混匀,变性后在ABI3730XL测序仪上样,用GeneMapper 4.1分析检出 AA、GA、GG三种基因型。

1.3 统计学方法 采用SPSS 22.0软件进行统计学处理。计量资料用(±s)表示。计量资料的组间差异比较先行正态性检验和方差齐性检验,正态分布采用t检验或近似t检验;非正态分布采用Mann-Whitney U检验。计数资料的比较及Hardy-Weinberg平衡检验采用检验。采用单因素非条件logistic回归计算OR和95%CI,采用多因素非条件logistic回归分析对混杂因素进行校正。所有检验均为双侧,检验水准α=0.05。

表1 SAO病例组与正常对照组临床资料的比较

2 结果

2.1 SAO组和对照组临床资料比较 见表1。病例组与对照组相比较,年龄、性别、BMI、TC、TG、HDL-C、LDL-C、冠心病史等差异均无统计学意义(P>0.05)。而高血压史、糖尿病史、吸烟史均差异有统计学意义(P<0.05)。

2.2 Hardy-Weinberg平衡检验 SAO病例组及对照组rs12445022位点基因型观察值与期望值检测均符合HWE平衡法则 (SAO病例组=1.504,P=0.220;正常对照组=2.684,P=0.101),表明两组样本均具有群体代表性。

2.3 SAO组和对照组基因型及等位基因分布情况两组 ZCCHC14基因 rs12445022位点 AA、GA、GG基因型及A、G等位基因分布比较见表2。SAO组与对照组相比,AA、GA、GG基因型分布 (=2.931、P=0.223)及 A、G 等位基因分布(=3.041、P=0.081)均无统计学意义。

2.4 不同遗传模型下SNP rs12445022多态性与SAO发病风险的关系 为调整多重因素对SAO的影响,以SAO作为因变量,以高血压史、糖尿病史、吸烟史、LDL-C等作为混杂因素予以校正,进行非条件logistic回归分析。遗传模型包括显性(AA+GA vs.GG)、隐性(AA vs.GA+GG)和加性(AA vs.GG)模型。结果显示:在三种遗传模型下,ZCCHC14基因SNP rs12445022多态性与SAO均无相关性 (P>0.05)。经过校正上述混杂因素后,在显性模型下,SNP rs12445022多态性与SAO相关(校正 OR=2.12,95%CI:1.02~4.40,P=0.044,表3),提示SNP rs12445022非GG基因型会增加SAO的发病风险,非GG基因型携带者(AA+GA)的发病风险是GG基因型携带者(GG)的2.12倍。

3 讨论

自2003年[6]以来,已有许多项独立的GWAS对IS易感基因多态性进行了探索,并确定了一些与IS发病风险相关的SNP位点,进一步病因学亚型分析发现,这些SNP多与LAA、CE亚型相关,鲜有SNP被发现与SAO相关。直至2017年,TRAYLOR等[4]对欧洲IS人群及正常对照进行了大样本的GWAS研究,结果发现ZCCHC14基因rs12445022与SAO相关。紧接着该研究又进一步进行了功能研究,结果显示rs12445022 A等位基因与动脉组织中ZCCHC14 mRNA表达下降有关,还和血液CpG岛甲基化水平降低有关,因此推测危险等位基因是通过降低ZCCHC14的表达进而影响CpG岛甲基化水平来介导SAO发生的[4]。

表2 SAO组和对照组rs12445022位点基因型及等位基因分布

表3 不同遗传模型下SNP rs12445022与SAO的相关性分析

ZCCHC基因编码一类含有CCHC结构的锌指蛋白,后者已被证明具备DNA、RNA、蛋白质结合活性,在细胞分化、胚胎发育、生殖细胞形成、神经系统形成等众多过程发挥重要作用。到目前为止,针对ZCCHC基因的功能研究较少,其功能可能与转录以及转录后基因调控有关。ZCCHC14基因位于人类第16号染色体上,由约8万多个碱基包括14个外显子及5个转录本。ZCCHC14基因曾被发现与小头畸形[7]、尼古丁成瘾、酒精成瘾[8]和食物成瘾[9]相关。然而,上述研究并未能阐明ZCCHC14的功能,ZCCHC14通过何种信号通路发挥作用也不清楚。

继2017年针对欧洲人群的GWAS研究[4]之后,2018年MALIK等[10]对多种族来源(包括欧洲、东亚、南亚、混合亚洲、非洲和拉丁美洲)的GWAS研究进行了跨祖先荟萃分析,结果再次证实ZCCHC14基因rs12445022与SAO相关,但该研究所纳入的亚洲人群的种族、国籍构成不详。我们以中国南方汉族SAO患者及健康人群作为研究对象进行了病例对照研究,结果显示SAO患者具有更高的高血压史、糖尿病史及吸烟史,这与既往的研究[11-13]相符。关联研究结果显示,经高血压史、糖尿病史、吸烟史、LDL-C等多因素校正后,ZCCHC14基因SNP rs12445022多态性与SAO相关(显性模型:校正OR=2.12,95%CI:1.02-4.40,P=0.044),提示非GG基因型会增加SAO的发病风险,非GG基因型携带者(AA+GA)的发病风险是GG基因型携带者(GG)的2.12倍。虽然SNP rs12445022位点基因型及等位基因分布未显示统计学差异,但由于病例对照设计本身受混杂因素的影响,所以需要校正对结局有影响的混杂因素,结果以多因素校正后的结果为准,即ZCCHC14基因SNP rs12445022与中国汉族人群SAO相关。

综上所述,本研究结果显示ZCCHC14基因SNP rs12445022多态性与中国南方汉族人群SAO发病风险有关。但是,鉴于本研究的样本量较小以及民族、地域等客观因素的局限性,因此在今后的研究中需要进一步扩大样本量,并选择中国多个地区及民族进行研究证实。

猜你喜欢
等位基因多态性校正
单核苷酸多态性与中医证候相关性研究进展
亲子鉴定中Penta E稀有等位基因28的确认1例
MTHFR C677T基因多态性与颈动脉狭窄及其侧支循环形成的关系
RANTES及其受体CCR5基因多态性及环境因素在昆明汉族T2DM发生中的交互作用
亲子鉴定中男性个体Amelogenin基因座异常1例
CLOCK基因rs4580704多态性位点与2型糖尿病和睡眠质量的相关性
劉光第《南旋記》校正
广东汉族人群Penta D基因座off-ladder稀有等位基因分析
贵州汉族人群23个STR基因座的OL等位基因研究
建立在校正系统上的强大实力Sonance所能士i12