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蜜蜂所研究揭示蜜蜂残翅病毒来源

近日，中国农业科学院蜜蜂研究所蜜蜂病虫害生物学创新团队，联合德国乌尔姆大学和英国埃克塞特大学相关人员，采用大尺度取样对我国22个省近200个蜂场的意大利蜜蜂和中华蜜蜂，进行了蜜蜂残翅病毒的流行、群体遗传和进化重构分析，厘清了我国蜜蜂残翅病毒的主要流行基因型和季节性变化特点。该研究有助于揭示蜜蜂残翅病毒的来源与进化历史，更有助于理解病毒动力学变化及对生态中其他授粉昆虫潜在的感染风险。相关研究成果在线发表在《科学报告（Scientific Reports）》上。

国际上主要流行的观点认为，蜜蜂残翅病毒的流行与蜜蜂寄生性病害——狄斯瓦螨最相关，而狄斯瓦螨被认为最原始寄主为我国中华蜜蜂，而后传入意大利蜜蜂，从而因蜜蜂残翅病毒较强的传播能力成为意大利蜜蜂健康发展的最重要威胁之一。然而该病毒在我国的流行情况及是否与国际最主要流行毒株基因型一致仍不清楚。研究结果表明，我国意大利蜜蜂流行的主要蜜蜂残翅病毒基因型与欧洲主要流行型相一致；而我国中华蜜蜂对该病毒的整体感染率并不高，更不是欧洲主要流行基因型；另外，相比较意大利蜜蜂，中华蜜蜂的蜜蜂残翅病毒具有更高的遗传多样性，表明我国意大利蜜蜂流行的蜜蜂残翅病毒可能来源于欧洲，而中华蜜蜂具有更强的进化手段抵抗该病毒。

我国科学家发布地方猪 “超清” 基因组图谱

近日，中国农业科学院深圳农业基因组研究所猪基因组设计育种创新团队，发布了中国优良地方猪——陆川猪的高质量基因组序列。该基因组序列的发表，不仅填补了亚洲家猪缺少高质量参考基因组的空白，更为基因组组装提供了新的方向。相关研究成果在线发表在《BioRxiv》上。

我国是世界上最大的生猪养殖和猪肉消费国，拥有全球最丰富的猪种资源。我国地方猪群具有丰富的遗传多样性，是深入挖掘猪种肉质品质和抗病力等重要性状优质基因的遗传宝库。然而，随着西方商业猪种的普及，本地猪种受到了较大的冲击，有些著名地方品种的数量比大熊猫还要稀少，部分品种甚至已经灭绝。地方猪种质资源的保护刻不容缓具有重要的战略意义。

该项研究公布的猪基因组序列采用了目前最新的Pacbio，Bionano DLS和ProximoHi-C等多项测序技术，以及Falcon Phase组装算法，首次获得了染色体级别的定相（Phased ）基因组。这标志着来自亲本的等位基因可以完整区分，具有重要的理论和应用价值。经过不懈的努力与技术攻关，研究团队最终获得了染色体级别的猪基因组序列，contigN50超过了18兆，ScaffoldN50超过了140兆。并且利用最新的组装算法和Hi-C技术，获得了完整的两套基因组序列。这是基因组研究领域的重大突破，为研究等位基因的功能互作提供了宝贵的数据和技术基础。