β1-肾上腺素能受体基因编码区1165位单核苷酸多态性与肠道病毒A71感染的关系

2018-10-15 09:18:48李帮涛雷智贤李虹艾崔兰海元平黄婷向伟
中华实验和临床病毒学杂志 2018年4期
关键词:等位基因多态性基因型

李帮涛 雷智贤 李虹艾 崔兰 海元平 黄婷 向伟

570206海口,海南省妇幼保健院(海南省儿童医院)重症医学科(李帮涛、海元平、雷智贤、黄婷、向伟);570206海口,南华大学附属海南医院儿内科(李虹艾);570206海口,海南医学院附属医院儿内科(崔兰)

肠道病毒 A71型(enterovirus A71,EV-A71)呈高度嗜神经性,是引起重症手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)的最主要病原体。重症HFMD的发生机制非常复杂,其中儿茶酚胺类递质参与全身血管血流动力学变化,促进重症HFMD的进展[1]。 β1-肾上腺素能受体(β1-adrenoceptor,β1-AR)是介导儿茶酚胺作用的重要组织受体,其中最具有功能性意义的β1-AR位点可能为G1165C位点[2],鸟嘌呤(G)与胞嘧啶(C)的置换突变可能产生具有临床意义的基因多态性。本研究对β1-AR基因编码区1 165位进行测序,探讨该位点单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与 EVA71感染的关系。

1 材料与方法

1.1 研究对象 EV-A71感染组:2015年10月至2016年9月期间来自海南省妇幼保健院(海南省儿童医院)117例临床诊断为HFMD的患儿,其中EVA71感染77例,男性57例,女性20例,年龄2.3±1.2岁,其中轻症HFMD 22例,重症HFMD 55例,临床诊断标准均符合《HFMD诊疗指南(2010年版)》,经实验室检测咽拭子的病毒核酸PCR(荧光标记PCR法)阳性,或血清EV-A71 IgM抗体(北京万泰ELISA法)阳性为入组标准,确诊为EV-A71感染。健康对照组:同时期同地区我院门诊健康体检的儿童共66例,男性31例,女性35例,年龄2.9±1.1岁,且符合咽拭子的病毒核酸PCR和血清EVA71 IgM抗体阴性,无HFMD、中枢神经系统损伤、嗜铬细胞瘤、高血压及心脏、肾脏疾病等病史,排除EV-A71感染。 两组性别(χ2=0.594,P =0.279)和年龄(t=0.246,P=0.130)比较差异均无统计学意义。

1.2 方法

1.2.1 标本采集:HFMD患儿急性期(病程前3 d内)咽拭子标本和静脉EDTA抗凝血3 ml(基因检测部分保存至-70℃冰箱)。

1.2.2 核酸检测:选择EV-A71 HFMD患儿77例和健康体检儿童66例进行核酸检测。用OMEGA血样DNA提取试剂盒(D3471-02)提取采集样本的基因组 DNA。 依据 NCBI发布的 β1-AR(GenBank序列号:NG_012187.1)的编码区序列设计扩增引物, Arg389Gly UP: 5′-CAGAAACATGCTGAAGT CCCG-3′, Arg389Gly DOWN: 5′-GATGGGCAGGAA GGACACC-3′。引物由上海兰卫检验公司合成。PCR扩增反应总体系为25μl,其中10 × LAmp Buffer 2.5 μl,dNTP 2 μl,ADRB1-F1/F2/F3/F4 1 μl,ADRB1-R1 /R2 /R3/R4 1 μl,LAmp Taq 0.25 μl;5 ×C SolutionⅠ5 μl;DNA 模板1 μl,ddH2O 12.25 μl。 PCR 反应条件:99 ℃ 10 min;99 ℃ 30 s,60 ℃45 s,72 ℃ 90 s,共38个循环;72 ℃ 7 min。 PCR 扩增产物经1%琼脂糖凝胶电泳鉴定。PCR扩增产物进行Sanger测序。将获得的序列与NCBI ADRB1基因参考序列比对,确定SNP分型。

1.3 统计学方法 本研究应用SPSS 18.0统计学软件进行统计学分析,计数资料以频数或百分比表示,采用R∗C表χ2检验比较,P<0.05差异具有统计学意义。

2 结果

2.1 SNP多态性分布的性别差异 从表1可看出,在男童中,EV-A71感染组和健康对照组C等位基因均占优势,但基因型频率经χ2检验分析,分布差异无统计学意义(χ2=0.135,df=2,P =0.935);等位基因频率经χ2检验分析,分布差异无统计学意义(χ2=0.069, df=1, P =0.868)。 在女童中,EVA71感染组和健康对照组C等位基因均占优势,但基因型频率经χ2检验分析,分布差异无统计学意义(χ2=1.677,df=2, P =0.432);等位基因频率经 χ2检验分析,分布差异无统计学意义(χ2=0.866,df=1,P=0.380)。说明β1-AR基因编码区1 165位SNP基因型和等位基因无明显的性别差异。

2.2 健康对照组和EV-A71感染组SNP多态性分布比较 从表1可看出,66名健康儿童和77例EVA71 HFMD患儿均存在 β1-AR基因编码区1 165位SNP,有3种基因型:GG、GC和CC。 在EVA71 HFMD患儿中,GG、GC和CC基因型频率分别为10%、47%、43%,G、C等位基因频率分别为34%、66%;在健康儿童中,GG、GC和CC基因型频率分别为7%、41%、52%,G、C等位基因频率分别为28%、72%。EV-A71感染组与健康对照组相比,基因型频率经χ2检验分析,分布差异无统计学意义(χ2=1.154, df=2, P =0.562);等位基因频率经 χ2检验分析,分布差异无统计学意义(χ2=1.091,df=1, P =0.296)。

表1 健康对照组和EV-A71感染组1 165位单核苷酸多态性基因型和等位基因频率的分布Tab.1 Distribution of single nucleotide polymorphism at locus 1 165 in EV-A71 and control group infection

2.3 EV-A71感染轻症组和重症组SNP多态性分布比较 从表2可看出,按严重程度分组进一步发现,EV-A71感染轻症组和重症组相比,基因型频率经χ2检验分析,分布差异无统计学意义(χ2=3.945, df=2,P =0.139);等位基因频率经 χ2检验分析,分布差异无统计学意义(χ2=3.763,df=2,P=0.052)。说明β1-AR基因编码区1 165位 SNP与EV-A71感染及其严重程度无关联。

表2 EV-A71感染轻症组和重症组1 165位单核苷酸多态性基因型和等位基因频率的分布Tab.2 Distribution of single nucleotide polymorphism at locus 1 165 in the mild and severe group of EV-A71 infection

3 讨论

β1-AR基因已有多个SNP被识别,而G1165C位点是β1-AR基因编码区的主要功能位点,目前国内外学者针对β1-AR基因G1165C位点基因多态性的研究主要集中在心血管疾病[3-4],与EV-A71感染的关系研究甚少。β1-AR核苷酸第1 165位核苷酸C被G替换,导致第389氨基酸由Gly变为Arg,多项研究表明Arg389β1-AR的腺苷酸环化酶(AC)活性水平较 Gly389β1-AR 显著升高[5-7]。 因此,结合EV-A71感染重症HFMD的儿茶酚胺风暴现象及G1165C位点的研究理论,理论上β1-AR G1165C位点的置换突变,参与G偶联调节细胞内cAMP水平和L型通道的开放频率,调节机体的生理功能,影响病情的严重程度。

由于遗传背景差异(包括常染色体和性染色体),不同性别的位点基因多态性分布可能存在差异。王浩等[8]发现男性和女性不同基因型携带者之间的静息心率存在统计学差异,β1-AR基因A145G位点可能与男性静息心率相关。但本研究发现G1165C位点基因型和等位基因在EV-A71感染组和健康对照组的分布无统计学差异,可排除性别对β1-AR基因G1165C位点基因型分布的影响。本研究对77例EV-A71 HFMD患儿和66名健康对照者的β1-AR基因编码区1 165位SNP基因型进行检测和分析,发现两组基因型和等位基因频率的分布无统计学差异,且按病情严重程度分析,发现轻症组和重症组的分布亦无统计学差异。提示β1-AR基因编码区1 165位SNP与EV-A71感染及其严重程度无关联,不会增加EV-A71感染和病情加重的风险。分析原因可能为:①可能存在HFMD的其他易感基因或β-AR基因上的其他SNP,与β1-AR基因编码区1 165位SNP相互作用或连锁不平衡。②EV-A71 HFMD的易感性不但受遗传因素,可能还受到病毒毒力、环境影响,单个基因突变引起的作用较小。③研究样本量偏小,且地区局限,可能对统计效能有一定影响。

因此在未来的研究中,应加强多中心、多样本研究β1-AR多态性位点,并关注与之存在连锁不平衡以及相互作用的其他基因SNP位点,同时研究EVA71感染HFMD儿茶酚胺水平与β1-AR基因多态性的关系,深化对重症HFMD发病机制的认识,从基因水平为HFMD的防治提供新的研究思路。

利益冲突 无

猜你喜欢
等位基因多态性基因型
单核苷酸多态性与中医证候相关性研究进展
亲子鉴定中男性个体Amelogenin基因座异常1例
智慧健康(2021年17期)2021-07-30 14:38:32
WHOHLA命名委员会命名的新等位基因HLA-A*24∶327序列分析及确认
马铃薯cpDNA/mtDNA多态性的多重PCR检测
DXS101基因座稀有等位基因的确认1例
法医学杂志(2015年4期)2016-01-06 12:36:40
GlobalFiler~? PCR扩增试剂盒验证及其STR遗传多态性
法医学杂志(2015年4期)2016-01-06 12:36:36
西安地区育龄妇女MTHFRC677T基因型分布研究
BAMBI基因敲除小鼠的繁育、基因型鉴定
CYP3A4*1G基因多态性及功能的初步探讨
等位基因座D21S11稀有等位基因32.3的确认