周豪 夏冬 夏志强 宋娟 宋芹芹 史冰田 刘宓 刘露 武桂珍 韩俊
241002芜湖,皖南医学院公共卫生学院(周豪、刘露);102206北京,中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所(夏冬、夏志强、宋娟、宋芹芹、史冰田、刘宓、韩俊、武桂珍),传染病预防控制国家重点实验室(夏冬、夏志强、宋娟、宋芹芹、史冰田、刘宓、韩俊)
鼻病毒(rhinovirus,RV)是一种引起人类病毒性呼吸道感染最主要的病毒性病原体,不仅能引起普通感冒,还能导致急、慢性支气管炎等其他呼吸系统感染疾病[1]。近年来有资料表明RV感染与哮喘和肺炎等疾病也有一定关系[2-3]。RV属小RNA病毒科(picornaviridae)中的一类,病毒核心为单股线型RNA,外有蛋白衣壳,无包膜,病毒直径为27~30 nm,呈二十面立体对称结构[4]。RV在呼吸道标本中均有较高的检出率,主要通过呼吸道传播,也可通过飞沫直接传播,患者及病毒携带者为主要传染源[5-6]。
注:柱形图代表发文量,线型图代表相对研究兴趣指数,灰色线为相对研究兴趣指数,黑色线为相对研究兴趣指数的拟合趋势线图1 1970—2018年间鼻病毒研究文献的分布Note: The bars represent the number of papers, the curves represent the relative interest index,the grey line is the relative research interest index,The black line is the fitting trend line of relative research interest indexFig.1 Number of papers related with rhinovirus distributed yearly between 1970 and 2018
PubMed是一个检索型数据库,是由美国国立生物技术信息中心(national center for biotechnology information,NCBI)开发的用于检索 MEDLINE、PreMED-LINE数据库的网上检索系统。MEDLINE是美国国立医学图书馆(U.S.national library of medicine)最重要的书目文摘数据库,内容涉及医学、护理学、牙科学、兽医学、卫生保健和基础医学。收录了全世界70多个国家和地区的4 000余种生物医学期刊,现有书目文摘条目1 000万余条[7]。GoPubMed是一个可以对PubMed数据库中收录的文献进行定量统计分析的工具,可以对检索结果进行时间、作者、机构、地区、出版物等进行全方位分析,从而得出文献增长趋势、文献发表地域分布、期刊分布、作者合作网络等信息,有助于揭示文献分布规律,追踪热点课题以及预测学科发展[8]。本研究利用GoPubMed这一检索工具,对PubMed数据库中收录的有关RV研究的相关文献进行统计,分析了RV的全球研究现状以及发展趋势,从而为进一步开展RV的研究提供参考依据。
选择PubMed数据库中收录的RV相关研究文献作为检索对象,登录 GoPubMed网站(http://www.gopubmed.com),以“RV”为主题词(“rhinovirus”[mesh])检索文献,检索起始时间为1970年1月1日,截止时间为2018年4月16日。通过GoPubMed数据库网站在线统计功能对RV研究文献统计分析及EXCEL2007和SPSS 20.0软件对检索结果进行数据分析。探究PubMed数据库中收录有关RV研究文献的情况,包括文献发表的时间分布、地域分布、期刊分布、相对研究兴趣指数(RRI)及高产作者等内容,给出可视化的分析结果。
2.1 RV文献发表的年度分布 本研究共检索出RV研究文献共5 367篇,发文量呈现总体递增趋势,初期论文数量较少,在1970—1998年间,年均发表文献不足百篇。2011年开始快速增长,2011—2014年显著增长,其中2014—2015年文献量最多,均超过300篇,2014年以322篇位居第一。虽然2014年后发文量有所下降,但是每年发文数仍超过250篇,远高于2010年之前的年发文量。从近10年发文量总体来看,发文量较以往显著增长,提示RV研究已逐渐引起人们的重视(图1)。
注:红点代表该地区RV相关研究发文量,红点越密集,说明该地区RV相关研究发文量越多图2 鼻病毒研究论文的全球分布Note: The red dot represents the amount of research papers about RV in this region, and the more the red dot means the more the research papers about RV in this regionFig.2 Rhinovirus articles distributed globally from 1970 to 2018
本研究同时分析了RV的相对研究兴趣指数(relative research interest,RRI),RRI是指当年这一研究领域的加权论文数量(weighted publications per year,WPPY)在PubMed中所有研究领域加权论文集合(all weighted publications per year in PubMed,AWPPY)中所占的比例,RRI=WPPY/AWPPY。 其中某一研究领域在某一年的加权论文数量=某一年发表的论文总数×相关系数。本研究结果显示关于RV国际研究的相对研究兴趣指数出现两个高峰,指数超过0.000275。1974—1975年为第一个高峰,此后出现下降,1983年后,指数逐渐上升,2014年达到高峰,并持续维持。
RV研究的发文量以及相对研究兴趣指数近年来均呈显著上升趋势,从而可以预测RV研究将持续升温并且逐渐成为病毒学研究热点之一。
2.2 RV文献发表的地域分布特点 检索出的5 367篇RV文献分布于全球117个国家和地区,其中美国东部、欧洲及日本发表文献的密度较高。发表文献量最多的是美国,共1 803篇;第2位是英国,共436篇;中国排第6位,共152篇(图2、图3)。RV发文量按城市分类排名中,排第1位的是维也纳,共175篇。排名前五的城市分别是维也纳、麦迪逊、伦敦、夏洛茨维尔、土尔库,北京排在第8位,共61篇文章(图4)。
图3 不同国家发表RV文章数量Fig.3 Quantities of rhinovirus articles published in countries
图4 鼻病毒研究文献的城市分布Fig.4 Cities distribution of papers related with rhinovirus
2.3 RV文献发表的重要期刊分析 对RV研究文章发表的期刊进行排名。前20的期刊是以J Virol、PLoSOne、J Med Virol等国际杂志为主的英文期刊。其中JVirol刊登249篇,Plos One刊登146篇,J Med Virol发表122篇,JClin Virol发表115篇(表1)。
表1 发表鼻病毒文章的期刊排名Tab.1 Ranking of rhinovirus related journal
2.4 发表RV文献主要作者 为了解国际上重点研究RV的专业人员,本研究通过GoPubMed检索工具对发表RV研究文献的作者进行统计分析。分析结果显示发表RV研究文献数量排名前5名的作者分别为 Tyrrell D、Johnston S、Gwaltney J、Hayden F、Rossmann M。发文量排名前20位的作者见表2,其中未见国内作者。
表2 发表鼻病毒研究文献数量的作者排名Tab.2 Quantity of authors’articles related with rhinovirus
2.5 RV重要研究团队合作网络特点 GoPubMed检索工具建立可视化图形。研究人员合作网络图中点线表示1次合作,虚线表示2次合作,直线表示3~5次合作,粗直线表示6次合作,连线越多,线型越复杂说明该作者的研究地位越重要。通过可视化图形可以发现RV研究团队中有5个作者群的联系非常紧密,其中 Tyrrell D、Johnston S和 Gwaltney J分别形成各自的合作研究团队,而且3位作者的发文量也位居前3位。结果提示发文量高的作者往往在关系网中也具有重要地位(图5)。
图5 鼻病毒研究团队之间关联图Fig.5 Interaction network of groups related with rhinovirus
2.6 RV研究主题词词频分布 检索工具分析这些文献中主题词,从中得出高频主题词的词频,通过SPSS20.0统计出这些主题词出现的频次,百分比以及累计百分比,从而分析出RV研究的热点和重点。排名前20位的与RV研究有关的高频主题词分布情况如表3所示。其中 Rhinovirus、Humans、Viruses、Respiratory tract infections、Child 等主题词出现的频率位居前5位。从中可以分析出RV感染、复制、核酸诊断、混合感染、对哮喘的影响和药物治疗等均为RV的研究重点。
表3 鼻病毒研究主题词高频词文献分布Tab.3 Distribution of high frequency subject words related with rhinovirus
RV是呼吸道感染中最常见的病原体。RV感染引起的主要症状表现为感冒,30% ~60%的成年人及10%~30%的婴幼儿感冒均由RV感染引起的。其中许多病例发展为支气管炎、哮喘、肺炎等疾病,而且RV感染会引起哮喘、慢性阻塞性肺病的加重。因此,RV的研究越来越引起人们重视[9]。
PubMed是一个生物医学相关的论文及相关信息的搜寻数据库。虽然提供了比较完善的检索功能,但是并没有提供对检索结果的分析统计功能,而GoPubMed正好弥补了这一功能。GoPubMed的数据源与 PubMed数据库完全一致,因而可以对Pubmed检索结果进行统计分析,为科研工作者提供了极大的方便[10]。
通过以上检索结果发现RV发文量总体呈现上升趋势,说明RV研究日益受到科研工作者的重视。发文量主要集中在欧美地区,中国发文量及北京发文量虽然均位于国家和城市发文量排名前十,但与发文量排名第一的国家(美国)和城市(维也纳),差距比较明显。RV发文量排名前20的期刊中未见中国期刊,排名前20的高产作者以及研究人员合作网络中也均未见国内作者。以上几点说明我国RV研究与欧美地区存在较大差距,因此我国的科研工作者需要加强RV相关领域研究,积极参与RV研究国际合作。进一步提高我国在应对RV的防控与治疗方面的水平与实力。
本研究从不同的角度揭示了RV的研究现状和研究方向,为RV研究者及研究机构提供了一定参考,也为RV的预防与控制提供了科学依据。
利益冲突无