Lax和他的同事对一所新开的芝加哥大学医院中病人、医务人员和环境表面定植的微生物多样性进行调查研究。在血液肿瘤科和外科的10间病房和2个护士站内,从地面、水嘴、床垫、键盘和寻呼机表面采集标本,并在病人的腋窝、腹股沟褶皱及鼻孔处进行取样。
本次研究从医院运营前2个月开始,持续12个月。所有的房间均允许来访者进入。每天用季铵盐类消毒剂和1∶1 000的漂白液对每间病房进行清洁。本研究共采集6 523个标本,每个标本至少扩增5 000份16S rRNA。
在医院建设和正式运营前,环境中的微生物多样性非常有限,但是却有大量不动杆菌属和假单胞菌属细菌。然而医院运营后,这两者的数量急剧下降,并被正常皮肤微生物所取代,包括棒状杆菌属、葡萄球菌属和链球菌属细菌。此外,其他菌属也逐渐增多,包括肠球菌属、未分类的肠杆菌科细菌、大芬戈尔德菌属、罗斯菌属、普雷沃菌属和鞘氨醇单胞菌属。遗憾的是,本研究未能用引物可靠地检测出丙酸杆菌属细菌。
当每例新入院的病人住进一间病房,这间病房内微生物多样性的变化遵循一个相对不变的顺序:第1天,微生物菌群从医院物体表面,如床栏杆,转移到病人身上,但是第2天,菌群朝相反的方向移动,从病人身上转到病房内的物体表面。结果,最初物体表面的菌群迅速被病人皮肤的菌群所覆盖。另一个意外的发现是全身用抗生素对病人皮肤菌群有极微弱的影响甚至无影响。92份样本经宏基因组学分析发现,病房内物体表面的菌群所携带的耐药基因远多于病人皮肤菌群。
室内的灰尘含有大量微生物,包括人类皮肤表面的微生物。据估计每人每天脱落5亿个上皮细胞。这种扩散模式和直接接触可以解释本研究得出的阐明环境与病人皮肤间复杂的相互作用的现象。
In the Literature. The intimate and 2-way relationship between patient and hospital microbiomes. Clin Infect Dis, 2017,65 (1 September): iii.