吴杭航黄天壬邓伟方向任静静甘膺元
作者单位:530021南宁1广西医科大学附属肿瘤医院实验研究部;2广西医科大学研究生院
广西肝癌高发区原发性肝细胞癌HBV X基因的整合及影响因素分析
吴杭航1,2黄天壬2邓伟1方向1,2任静静1,2甘膺元1,2
作者单位:530021南宁1广西医科大学附属肿瘤医院实验研究部;2广西医科大学研究生院
目的了解广西肝癌高发区乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)X区基因在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)染色体中的整合及影响因素。方法以30例与HBV相关的原发性肝细胞癌患者为研究对象。提取HCC组织及癌旁组织标本DNA作为模板,以HBV X基因上游序列和人类基因组Alu重复序列为引物,应用重复序列-多聚酶链反应(Alu-PCR)扩增整合的HBV X片段及两侧的人类基因组DNA片段。扩增产物进行测序,计算目的片段整合率并分析相关的影响因素。结果18例HCC组织检测到HBV X基因的整合片段,整合率为60.00%(18/30);26例癌旁组织检测到HBV X基因的整合片段,整合率为86.67%(26/30)。癌旁组织HBV病毒整合率高于HCC组织,差异有统计学意义(χ2=5.445,P=0.020)。不同性别、年龄、HBeAg、HBV DNA、ALT、AST的HCC癌组织及其癌旁组织H BV X基因整合率比较差异均无统计学意义(P>0.05)。结论广西肝癌高发区癌旁组织比HCC组织HBV整合率高,说明HBV整合发生在感染早期。HBV X基因整合与HCC患者性别、年龄、HBeAg、HBV DNA、ALT、AST无明显关系。
肝肿瘤;乙型肝炎病毒X基因;整合;广西
肝癌是我国常见的恶性肿瘤,死亡率居全部恶性肿瘤的第2位,占全世界肝癌死亡人数的51%[1-2]。广西作为我国肝癌的高发区,肝癌病死率居恶性肿瘤首位,高于全国平均水平[3]。乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染是肝癌发生的主要原因,患者HBsAg总阳性率为84.76%[4]。1980年Brechot等[5]首次发现在HBV感染的肝癌细胞中有HBV DNA整合到宿主基因。1995年Minami等[6]建立Alu-PCR用于检测HBV病毒-细胞接头序列。自此国内外开始陆续报道肝癌组织中HBV整合的状况及其致癌机制,但广西肝癌高发区肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中HBV X基因的整合,目前未有相应研究。本研究采用Alu-PCR方法扩增整合HBV X片段及两侧人类基因组DNA片段,了解目的片段整合率并分析相关影响因素,为广西HCC高发区HBV相关性HCC的病因研究提供依据。
1.1 研究对象
30例患者均来自广西肝癌高发区扶绥县,在广西医科大学附属肿瘤医院行肝癌切除术,经病理学检查确诊为原发性肝细胞癌。平均年龄45.4岁(33~70岁),其中男性25例,女性5例。收集研究对象的临床资料及手术切除的HCC组织及癌旁组织(距离癌组织大于5 cm以外的肝组织)标本,经液氮速冻后储存于-80℃冰箱备用。
1.2 主要试剂和仪器
组织DNA提取试剂盒、PCR试剂盒购自德国QIAGEN公司,UDG酶购自美国Thermo公司,PCR产物纯化和全自动测序由北京六合华大基因科技公司完成。PCR仪购自德国Biometra公司,电泳仪购自美国Thermo公司。
1.3 组织DNA提取
采用德国QIAGEN公司DNA提取试剂盒,方法参照说明书进行操作。
1.4 Alu-PCR引物
[7]设计引物,第一轮PCR扩增引物为HBV上游序列pUTP和正/反向的人类基因组重复序列Alu UP5/T3-515。在合成pUTP和UP5/T3-515时,用dUTP代替dTTP。第二轮PCR扩增引物位于pUTP下游的HBV序列MM37和ALU正/反向序列UP6/ MidT3。第三轮“半巢式”PCR扩增引物为HBV序列MM60和UP6/MidT3。见表1。
表1 Alu-HBV-PCR引物序列
1.5 Alu-PCR扩增HBV X基因整合片段
第一轮PCR反应以组织DNA为模板,总量不超过1 000 ng,反应体系总体积为100μL,其中引物pUTP、UP5/T3-515各2 uL,Taq DNA聚合酶50μL,加去离子水至100μl。反应条件:94℃预变性3 min;94℃变性30 s,56℃退火30 s,72℃延伸1 min,共35个循环;72℃延伸10 min。PCR反应结束后,产物16℃水浴1min,每PCR反应液加入UDG酶5U,37℃消化60 min,使含有dUTP的DNA位点断裂,95℃10min终止反应。第二轮PCR反应体系总体积100μL,取第一轮反应产物3μL为模板,引物MM37、UP6/MidT3各2μL,Taq DNA聚合酶50μL,去离子水43μL。反应条件:94℃预变性3min;94℃变性30 s,48℃退火30 s,72℃延伸1min,共35个循环;72℃延伸10min。第三轮PCR反应体系与第二轮相同,取第二轮反应产物10μL,稀释500倍作为第三轮PCR模板,引物MM60、UP6/MidT3各2μL,Taq DNA聚合酶50μL,模板46μL。反应条件:94℃预变性3 min;94℃变性30 s,60℃(正向)/56℃(反向)退火30 s,72℃延伸1min,共35个循环;72℃延伸10min。
1.6 测序及目的片段整合分析
取第三轮PCR产物10μL经1.5%琼脂糖凝聚电泳观察扩增结果,出现阳性条带的标本送北京六合华大公司(广州)进行纯化,并经ABI3730x1基因分析仪进行双向测序。结果经NCBIBLAST(https://blast.ncbi. nlm.nih.gov/Blast.cgi)分析HBV X基因整合的基本情况。
1.7 统计学分析
采用SPSS 16.0软件进行数据统计分析。计数资料采用百分率表示,样本率的比较采用χ2检验或确切概率法。以P<0.05为差异有统计学意义。
2.1 HBV X基因整合片段的扩增及测序结果
在30例HCC癌组织及其配对的癌旁组织中,扩增出阳性条带25例,其中正向PCR结果9例,反向PCR结果4例,同时为正向和反向PCR结果12例,部分电泳结果见图1;阳性条带纯化后测序成功18例,其中正向PCR结果3例,反向PCR结果12例,同时为正向和反向PCR结果3例,共21根条带,测序峰如图2所示。在癌旁组织中扩增出阳性条带29例,其中正向PCR结果1例,反向PCR结果3例,同时为正向和反向PCR结果24例,部分电泳结果见图1;阳性条带纯化后测序成功26例,其中正向PCR结果和反向PCR结果各7例,同时为正向和反向PCR结果12例,共38根条带。8P和11P反向反应各有两个测序结果,测序峰如图3所示。
2.2 HBV X基因整合率
在30例研究对象中,总整合率为73.33%(44/60),肝癌组织中18例检测到HBV X基因整合片段,整合率为60.00%(18/30);癌旁组织中26例检测到HBV X基因整合片段,整合率为86.67%(26/30)。癌旁组织HBV病毒整合率高于HCC组织(χ2=5.445,P=0.020)。
2.3 HBV X基因整合与HBV感染指标的关系
进一步分析影响HBV X基因整合的因素,结果显示,不同性别、年龄、HBeAg、HBV DNA、ALT、AST的HCC癌组织及其癌旁组织HBV X基因整合率差异无统计学意义(P>0.05)。见表2。
图1 HBV X基因扩增部分电泳结果
图2 样本6T测序结果峰图
图3 样本6P测序结果峰图
表2 HBV X基因整合的影响因素分析[n(%)]
(续表)
HBV整合到宿主基因是HBV感染过程常见的现象,有研究显示,85%~90%的HBV相关HCC组织可检测到HBV DNA整合[8]。随后大量研究发现,HBV携带者、HBV肝炎患者、肝硬化及HCC患者均可检测到HBV DNA整合[9],可见HBV整合是HCC发生发展过程中的一个重要环节。
本研究为提高整合率,同时应用正向和反向HBV-Alu-PCR方法,对广西肝癌高发区HBsAg阳性的HCC组织及其配对癌旁组织中整合的HBV序列进行分析,探讨整合HBVDNA与HBV致癌的相关性。结果发现,癌旁组织HBV整合率(86.67%)高于HCC组织(60.00%)。而贺良等[10]采用Alu-PCR技术检测HCC标本,发现40例HCC中HBV X基因整合率为45.00%。张婷等[11]采用Alu-PCR和LM-PCR方法检测肝癌组织和癌旁组织,发现肝癌组织HBV X基因整合率(65.0%)稍低于癌旁组织(67.5%),本研究与张婷等[11]研究结果一致,且癌旁组织的整合率远高于癌组织,说明HBV DNA的整合是慢性乙型肝炎发展成肝癌过程中的一个早期事件。此外,本研究的总体整合率高于国内其他研究[12-14],说明广西肝癌高发区HBV X基因整合与HCC的发生有密切关系,可能是本地区HCC发生率高于全国水平的原因之一。本研究中12例HCC组织和4例癌旁组织未检测出HBV X基因整合序列,可能本身未整合或者HBx的整合序列出现在引物HBx下游或引物Alu上游,也可能整合基因在HBV的S区或C区[10]。
进一步分析HBV X基因整合条带与HCC的关系,结果发现,阳性条带测序的长度在335~1008 bp之间,其中2例癌旁组织检测到2个条带,说明HBV基因截短插入宿主基因,片段长度不一,整合可发生在不同的位置[15],与屠红等[16]的研究结果一致。进一步证实截短的HBV X基因产物可影响HCC的发生发展,而不需要HBV全长整合入宿主基因发挥致癌作用。
关于HBV X基因整合与HBV感染指标及肝功能的关系,本研究结果显示HBV X基因的整合率在不同性别、年龄、HBeAg、HBVDNA、ALT、AST的HCC患者中的分布差异无统计学意义(P>0.05)。贺良等[10]发现HBV整合与HCC患者性别、年龄、AFP、癌栓及复发等无关,与HBV DNA、肿瘤大小、分化程度呈正相关。Sung等[17]发现,HBV整合的HCC患者年龄低于未整合者,并认为HBV DNA与致癌基因整合,是HCC患者未经肝硬化过程而直接发生癌变的原因之一。本研究并未得到类似结论,可能与研究例数较少有关,也可能说明广西肝癌高发区的HBV X基因整合与性别、年龄及HBV感染指标的关系并不密切。当地人群中的HBV基因型及亚型、不同患者体内HBV准种的特征及优势株以及HBV的某些突变点可能是影响其整合率的关键因素,需在今后的研究中加以验证。
越来越多的证据显示HBV DNA的整合与HCC有关,阐明与肝癌发生发展有关的整合位点,对未来指导基因诊断和治疗具有重要意义[18]。本研究对广西肝癌高发区的HCC组织和癌旁组织HBV X基因整合率及临床资料进行分析,证实了HBV DNA的整合是HCC发生过程中的一个早期事件,为本地区研究整合HBV DNA与HBV致癌机制提供了依据。
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[2017-03-31收稿][2017-04-15修回][编辑江德吉]
Analysis of hepatitis B virus X gene integration and potential risk factors of integration in patientsw ith hepatocellular carcinoma in the high-incidence area of Guangxi
Wu Hanghang1,2,Huang Tianren2,Deng Wei1,Fang Xiang1,2,Ren Jingjing1,2,Gan Yingyuan1,2(1Department of Research,Affiliated Tumor Hospital of GuangxiMedical University,2Graduate School of GuangxiMedical University,Nanning 530021,P.R.China)
Huang Tianren.E-mail:tianrenhuang@sina.com Deng Wei.E-mail:9608946@qq.com
Objective To analyze integration ofhepatitis B virus(HBV)X gene into the genome of primary hepatocellular carcinoma(HCC)tumors and surrounding tissue,and to explore potential risk factors of such integration in patients from the HCC high-incidence area of Guangxi.Methods DNA was extracted from HCC tissue and adjacent non-tumor liver tissue of 30 patientswith HBV-related HCC.Primers were designed to amplify the HBV X sequence and human Alu repeats by Alu-PCR,and PCR products were Sangersequenced.Results Among the 30 patients,18(60.00%)showed integration of the HBV X gene into HCC tumors,compared to 26(86.67%)who showed X gene integration into adjacent liver tissue(χ2=5.445,P=0.020).Incidence of X gene integration did not vary significantly with sex,age,HbeAg status,HBV DNA load,ALT or AST in HCC tissue or adjacent non-tumorous liver tissue(P>0.05). Conclusions Incidence of HBV integration is higher in non-tumorous tissues than in tumorous tissues in patients with HBV-related HCC in Guangxi.HBV integration appears to occur in early stages of HCC development.HBV X gene integration does not appear to be influenced by sex,age,HBeAg status,HBV DNA load,ALT or AST.
Hepatocellular carcinoma;Hepatitis B virus X gene;Integration;Guangxi
R735.7
A
1674-5671(2017)03-05
10.3969/j.issn.1674-5671.2017.03.02
国家自然科学基金资助项目(81660561,81260319);广西高校科学技术研究资助项目(KY2015ZD025,ZD2014039)
黄天壬。E-mail:tianrenhuang@sina.com邓伟。E-mail:9608946@qq.com