利用蜡质基因Wx改良稻米品质的研究进展

2017-03-28 07:02成太辉
中国农业文摘-农业工程 2017年6期
关键词:米质稻米变异

成太辉,杨 武

(1.广州市番禺区农业科学研究所,广东广州 511450;2.广东省农业科学院水稻研究所,广东省水稻育种新技术重点实验室,广东广州 510640)

引言

我国在世界上年产稻谷最多,高产一直是我国水稻育种的主要目标,而水稻品质的改良却不够重视,导致我国很多水稻品种虽然高产,却不优质。随着人民生活水平的日益改善,人们对稻谷品质的需求也不断提高,米质已经成为决定水稻品种特性最重要的指标之一[1]。

稻米品质主要包括外观品质和食用品质,外观品质包括粒型、垩白、透明度等,食用品质包括直链淀粉含量(AC,amylose content)、胶稠度(GC,gel consistency)、糊化温度(GT,gelatinization temperature)、蛋白质含量、香味有无等。食用品质主要由AC、GC和GT决定。食味品质好的稻米,其AC往往较低,GC较高和GT较低,其中AC直接决定了米质的优劣[2]。优质籼稻米的AC一般应低于22%[3]。

长久以来,研究者做了大量工作来揭示稻米品质的分子机制,通过对米质性状的QTL定位,基因克隆和基因功能的研究,来揭示其遗传机制。颗粒结合型淀粉合成酶(GBSS,granule-bound starch synthase)包含GBSSⅠ和GBSSⅡ两种同工酶,它们控制了直链淀粉的合成,能特异性的与淀粉粒结合,维持淀粉的稳定性[4]。水稻蜡质基因Wx编码的GBSSⅠ控制了种子中直链淀粉的合成。GBSSⅡ与GBSSⅠ氨基酸序列的同源性很高,控制了非存储器官中直链淀粉的合成[5,6]。因此,Wx基因决定了水稻胚乳中的AC,目前已在水稻中鉴定出多个Wx基因的等位变异类型,这些新基因的挖掘与利用是稻米品质改良的重要基础。

1 Wx基因的等位变异

Wx基因于1990年被克隆,其第一内含子5’端剪切处的第一个碱基决定了Wx基因的转录水平:若该位点为G,则Wx基因正常剪切,转录得到的mRNA含量高,最终生成的AC也较高;若该位点为T,则Wx基因无法正常剪切,转录得到的mRNA含量低,AC较低,该位点是水稻AC差异的最主要类型[7]。Wx基因同样是水稻糯性的决定基因:糯稻Wx基因的第2外显子上有2个23 bp的重复序列,而非糯稻Wx基因中只有1个,该片段为糯稻Wx基因特有[8]。此外,Wx基因第一内含子上游处的CT重复序列也影响着稻米的AC[9]。对Wx基因的等位变异和特性总结如下:

2 Wx基因的分子标记及应用

除了糯稻基因Wx外,Wx基因的大多等位变异都存在于较少的水稻品种中,这些品种由于来源有限,配合力差等,很难作为水稻米质改良的亲本。目前,利用Wxb基因改良水稻AC是非常有效的一种方法。蔡秀玲等利用开发的PCR-AccI标记鉴定了63份水稻品种Wx位点的G/T类型,并测定了这些品种的AC,发现T型水稻品种的AC低于18%,G型的都高于20%[21]。Mao等设计了扩增G/T位点的PCR标记,但该标记在扩增时需要将退火温度提高至67℃[22]。高利军开发的M-Wx标记对水稻品种鉴定的基因型结果与测定的AC一致:在72份水稻品种中,G型水稻品种的AC都高于20.1%,T型的都低于15.6%[23]。孙华钦等开发了2个识别水稻糯性基因Wx的分子标记,可以直接检测糯性基因的有无[24]。

-:表示没有突变

将Wxb基因应用于米质改良,已经取得了较为理想的效果。利用分子标记PCR-AccI,龙特甫和珍汕97导入Wxb基因后,新品种的AC显著降低[25]。聂元元等利用分子育种技术,对恢复系R225的AC进行改良,经过多次回交和标记,成功将R225的AC降低到11.6%~23.5%[26]。刘巧泉等利用Wxb基因替换掉特青中的Wxa基因,将稻米的AC从28.5%降低到15%[27]。姚姝等将Wxmp和Wxmp分别渗入到多个粳稻品种中,选育出宁2704、南粳46等米质优良的水稻新品种[28]。Myint等利用Basmati370的Wxin基因,有效降低了水稻品种Manawthukha的AC,提高了该品种的生产价值[29]。此外,通过亲本AC的差异,筛选出与Wx基因连锁的SSR标记对稻米品质进行改良,也是一种有效的途径。韩义胜等利用与Wx基因紧密连锁的标记RM190,利用天丰B优良米质的特性,成功将龙特浦B的AC从26.5%降低到15.9%[30]。

3 研究展望

米质的遗传机制较为复杂,但总的来说,Wx基因主要是通过影响成熟mRNA含量或者SNP变异导致的氨基酸变异,使GBSS Ⅰ的活性、淀粉及糖原合成过程中与ADP-葡萄糖的结合能力改变等,最终影响了AC的合成[7,15-17]。此外,Wx基因的表达受到环境等因素的影响。因此,在利用Wx基因对水稻米质进行改良时,需要同常规育种结合,选育综合性状优良的水稻品种[14,31]。

3.1 Wx基因新等位变异的挖掘

目前虽然报道了多个Wx基因的等位变异类型,但水稻品种的AC变异丰富,直链淀粉的结构也存在丰富的变异,因此,还有更多Wx基因的新等位变异有待挖掘。在这方面,尤其应该扩大野生稻种质资源的研究,它们可能蕴含着更为丰富的变异类型,例如广东的野生稻资源非常丰富,有可能为水稻优质育种提供新的供体基因。

3.2 多基因聚合改良稻米品质

除了Wx基因主要控制稻米的AC外,SSII-3基因也影响着稻米的AC,同时决定了稻米的GT。此外,SSI、SSIII-2、PUL、AGPlar等基因微效调控AC,SBE3、ISAA等基因微效调控GC,SSIV-2、SBE3等基因微效调控GT[32-34]。因此,明确亲本的米质基因型,通过多个主-微效基因的聚合,可以更大程度的改良稻米品质。

3.3 Wx基因分子机制的进一步加深

目前发现的Wx基因的等位变异类型大多都是由单个核苷酸的差异造成的,这些突变为何会改变Wx基因的表达水平?随着米质遗传机制的不断解析,结合现代分子技术例如CRISPR技术等,能够为水稻育种创造更多的便利。

由于Wx基因的遗传机制,米质改良不同于抗性改良。目前广泛使用的抗病基因多为显性基因,例如三系杂交稻中的亲本,只需要不育系或者恢复系含有纯合的抗性基因,杂交种即具有抗病性。对于米质,若不育系和恢复系中只有单个亲本的米质位点得到改良,其配组的杂交种米质可能未能得到较好的改良。因此,在对杂交水稻的米质进行改良时,亲本的Wx位点都需要改良。虽然影响稻米品质的位点较多,试图利用主效位点来改良稻米品质可能具有一定的局限性,但至少从分子育种角度,为选育米质优良的水稻品种提供了可行的方向。

[1]包劲松.稻米淀粉品质遗传与改良研究进展[J].分子植物育种,2007,5(s1):1-20.

[2]Martin C,Smith A M.Starch biosynthesis[J].Plant Cell,1995,7(7):971.

[3]新化.优质稻米品质标准[J].南京农专学报,2002,18(1):57.

[4]Nakamura T,Yamamori M,Hirano H,et al.Decrease of Waxy(Wx)protein in two common wheat cultivars with low amylose content[J].Plant Breeding,2010,111(2):99-105.

[5]Blakeney A B,Matheson N K.Some properties of the stem and pollen starches of rice[J].Starch - Stärke,2010,36(8):265-269.

[6]van der Leij FR,Visser RG,Ponstein AS,et al.Sequence of the structural gene for granule-bound starch synthase of potato(Solanum tuberosum L.)and evidence for a single point deletion in the amf allele[J].Molecular and General Genetics MGG,1991,228(1-2):240-248.

[7]Cai X,Wang Z Y,Xing Y Y,et al.Aberrant splicing of intron I leads to the heterogeneous 5′UTR and decreased expression of Waxy gene in rice cultivars of intermediate amylase content[J].1998,14(4):459-465.

[8]Isshiki M,Yamamoto Y,Satoh H,et al.Nonsense-mediated decay of mutant Waxy mRNA in rice[J].Plant physiology,2001,125(3):1388.

[9]舒庆尧,吴殿星.籼稻和粳稻中蜡质基因座位上微卫星标记的多态性及其与直链淀粉含量的关系[J].Journal of Geneticss&sgenomics,1999,26(4):350-358.

[10]Sano Y.Differential regulation of Waxy gene expression in rice endosperm[J].Theoretical and Applied Genetics,1984,68(5):467-473.

[11]Sano Y,Katsumata M,Okuno K.Genetic studies of speciation in cultivated rice.5.Inter-and intraspecific differentiation in the Waxy gene expression of rice[J].Euphytica,1986,35(1):1-9.

[12]Sano Y,Maekawa M,Kikuchl H.Temperature effects on the Wx protein level and amylose content in the endosperm of rice[J].Heredity,1985,76(3):221-222.

[13]Dung L V,Mikami I,Amano E,et al.Study on the response of dull endosperm 2-2,du2-2,to two Wx alleles in rice[J].Breeding Science,2000,50(3):215-219.

[14]Mikami I,Dung L V,Hirano H Y,et al.Effects of the two most common Wx alleles on different genetic backgrounds in rice[J].Plant Breeding,2010,119(6):505-508.

[15]Mikami I,Uwatoko N,Ikeda Y,et al.Allelic diversification at the Wx locus in landraces of Asian rice[J].Theoretical &Applied Genetics,2008,116(7):979-989.

[16]Sato H,Suzuki Y,Sakai M,et al.Molecular characterization of Wx-mq,a novel mutant gene for low-amylose content in endosperm of rice(Oryza sativa L.)[J].Breeding Science,2002,52(2):131-135.

[17]Yang J,Wang J,Fan F J,et al.Development of AS-PCR marker based on a key mutation confirmed by resequencing of Wx-mp,in Milky Princess and its application in japonica,soft rice(Oryza sativa,L.)breeding[J].Plant Breeding,2013,132(6):595-603.

[18]Liu L,Ma X,Liu S,et al.Identification and characterization of a novel Waxy allele from a Yunnan rice landrace[J].Plant Molecular Biology,2009,71(6):609-26.

[19]Inukai T,Sako A,Hirano H Y,et al.Analysis of intragenic recombination at Wx in rice:correlation between the molecular and genetic maps within the locus[J].Genome,2000,43(4):589-596.

[20]Wanchana S,Toojinda T,Tragoonrung S,et al.Duplicated coding sequence in the Waxy allele of tropical glutinous rice(Oryza sativa,L.)[J].Plant Science,2003,165(6):1193-1199.

[21]蔡秀玲,刘巧泉,汤述翥,等.用于筛选直链淀粉含量为中等的籼稻品种的分子标记[J].植物生理与分子生物学学报,2002,28(2):137-144.

[22]Mao X X,Liu Y Z,Xiao X,et al.A one-step pcr method for detecting the first base of splice donor of Wx intron 1 in rice[J].水稻科学(英文版),2004,11(3):285-287.

[23]高利军.水稻Wx基因的功能标记开发及有效性验证[J].分子植物育种,2013,11(1):1089-1093.

[24]孙华钦,洁田,科罗.一种通过特异性dna片段识别水稻糯性基因的分子标记方法:CN,CN 100402664 C[P].2008.

[25]Liang J,Yan L,Shao Y F,et al.Molecular marker assisted selection for improvement of the eating,cooking and sensory quality of rice(Oryza sativa L.)[J].Journal of Cereal Science,2010,51(1):159-164.

[26] 聂元元,张珍,毛凌华,等.分子标记辅助选择改良三系杂交稻恢复系R225直链淀粉含量[J].中国稻米,2015,21(02):44-47.

[27]刘巧泉,蔡秀玲,李钱峰,等.分子标记辅助选择改良特青及其杂交稻米的蒸煮与食味品质[J].作物学报,2006,32(1):64-69.

[28]姚姝,陈涛,张亚东,等.分子标记辅助选择聚合水稻暗胚乳突变基因Wx-mq和抗条纹叶枯病基因Stvb~i[J].中国水稻科学,2010,24(4):341-347.

[29]Yi M,Nwe K T,Vanavichit A,et al.Marker assisted backcross breeding to improve cooking quality traits in Myanmar rice cultivar Manawthukha[J].Field Crops Research,2009,113(2):178-186.

[30]韩义胜,符策强,朱红林,等.利用分子标记辅助选择对龙特浦B米质和白叶枯病抗性的改良[J].江苏农业科学,2014,42(7):69-71.

[31]Asaoka M,Okuno K,Konishi Y,et al.The effects of endosperm mutations and environmental temperature during development on the distribution of molecular weight of amylose in rice endosperms[J].Agricultural& Biological Chemistry,2006,51(12):3451-3453.

[32]Bao J S,Corke H,Sun M.Nucleotide diversity in starch synthase IIa and validation of single nucleotide polymorphisms in relation to starch gelatinization temperature and other physicochemical properties in rice(Oryza sativa L.)[J].Tag.theoretical & Applied Genetics.theoretische Und Angewandte Genetik,2006,113(7):1171-83.

[33]Tian Z,Qian Q,Liu Q,et al.Allelic diversities in rice starch biosynthesis lead to a diverse array of rice eating and cooking qualities[J].Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America,2009,106(51):21760-21765.

[34]Wang Z,Zheng F,Shen G,et al.The amylose content in rice endosperm is related to the post‐transcriptional regulation of the Waxy gene[J].Plant Journal for Cell & Molecular Biology,1995,7(4):613-622.

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