刘闽刘水霞胥亮史敏唐凤珠瞿申红梁建平陆秋天彭璐景艳李凤提
1广西壮族自治区人民医院耳鼻咽喉科(南宁530021)
2广西中医药大学研究生学院(南宁530001)
·临床研究·
广西壮族135例非综合征性聋常见致病基因的研究
刘闽1,2刘水霞1,2胥亮1,2史敏1唐凤珠1瞿申红1梁建平1陆秋天1彭璐1景艳1李凤提1
1广西壮族自治区人民医院耳鼻咽喉科(南宁530021)
2广西中医药大学研究生学院(南宁530001)
目的 分析研究广西地区壮族人群135例非综合征性聋常见致聋基因的突变特点,为防聋治聋工作提供参考。方法 采用遗传性耳聋基因芯片试剂盒对广西地区壮族人群135例以及汉族人群44例非综合征性聋患者基因组DNA的4个常见致聋基因的15个突变位点进行检测,比较壮、汉族人群常见耳聋基因突变率的差异性。结果135例壮族人群非综合征性聋患者常见致聋基因突变率为11.11%(15/135);其中GJB2 235delC纯合突变4例(2.96%),单杂合突变3例(2.22%);GJB2 235delC/109 A>G复合杂合突变2例(1.48%);SLC26A4 IVS7-2 A>G杂合突变1例(0.74%),IVS7-2A>G/IVS11+47T>C/1548insC复合杂合突变2例(1.48%);GJB3 538C>T单杂合突变1例(0.74%),线粒体12S rRNA 1555 A>G异质突变1例(0.74%),GJB2 235 del C杂合突变合并SLC26A4 1226 G>A杂合突变1例(0.74%)。44例汉族非综合征性聋患者常见致聋基因突变率为15.90%(7/44),其中GJB2 235 del C杂合突变3例(6.82%),GJB2 35 del G杂合突变1例(2.27%);SLC26A4 1229C>T纯合突变2例(4.55%),SLC26A4 IVS7-2 A>G杂合突变1例(2.27%)。壮、汉族间耳聋基因突变率比较无统计学意义。结论GJB2和SLC26A4是广西地区壮族人群非综合征性聋患者最常见的突变基因,GJB2的4个突变位点及SLC26A4的8个突变位点突变率明显低于全国平均水平,其中SLC26A4 IVS11+47T>C、1548insC和GJB2 109 A>G是3个新发现的突变位点。本地区壮汉族之间的耳聋基因突变率无明显的差异性。广西地区壮族人群非综合征性聋患者可能存在罕见的致聋基因或罕见的突变位点,需待进一步研究。
壮族;非综合征性聋;基因突变
Fund Project:Supported by the National Natural Science Foundation of China(No:81460097);Research and development of medical and health appropriate technology in Guangxi(No:S201421_05);The Guangxi Zhuang Autonomous Region Health Department of self funding research projects(No:Z2014215及Z2015351,and Z2016608).
Declaration of interest:The authors report no conflicts of interest.
造成耳聋的病因复杂,主要由遗传因素和环境因素引起。GJB2、线粒体12S rRNA、SLC26A4和GJB3基因是最常见的4种致聋基因,基因突变存在区域性及种族差异性。广西壮族自治区是少数民族较多的省份,主要以壮族居多,其次为瑶族、苗族等。为了解广西地区壮族人群非综合征性聋患者耳聋基因突变的特点,以及本地区壮汉族间耳聋基因突变的差异性,本研究对广西地区壮族人群135例以及汉族人群44例非综合征性聋患者进行常见致聋基因检测,结果分析如下。
1.1 临床资料
研究对象为2015年1月至2016年6月在广西都安县、扶绥县和武鸣县3所特殊教育学校的耳聋患者118例、广西壮族自治区人民医院门诊就诊的耳聋患者及听力筛查未通过的耳聋患者22例、在我院住院接受人工耳蜗植入术的患者39例,共计179例。经病史采集、体格检查、听力学以及影像学检查,均确诊为非综合征性聋。调查家系,其父母三代均为广西人,且在广西居住长达20年以上。按民族分类:壮族135例,汉族44例。135例壮族人群中,男90例,女45例;年龄4个月~58岁;感音神经性中度聋3例,重度聋2例,极重度聋130例;语前聋118例,语后聋17例;其中大前庭水管综合征2例,mondini畸形4例,共同腔畸形1例;有耳聋家族史者23例;头部外伤史1例。44例汉族人群中,男28例,女16例,年龄2个月~55岁;语前聋35例,语后聋9例。无早产、出生时缺氧及氨基糖苷类药物应用史患者。
听力分级标准参照世界卫生组织《障碍、残疾和残废的国际分类》(1997)对语言频率听力损失划分标准将耳聋程度分为5个等级:正常≤25dB HL,轻度聋26~40dB HL,中度聋41~60 dB HL,重度聋61~80 dB HL,极重度聋≥81 dB HL。
1.2 研究方法
1.2.1 诊断标准
参考2002年姜泗长等于上海科学技术出版社出版的耳科学的诊断标准:仅以耳聋为临床表现,不伴有身体其他部位外在畸形的遗传性聋称为非综合征性聋。
1.2.2 研究对象的选择
入选标准:①选取符合诊断标准的非综合征性聋患者,且父母双方三代均为广西人,长期在广西居住20年以上,且三代均为壮族或汉族。②患者和家属同意参加本研究并签署知情同意书。
排除标准:①合并有眼、骨、肾、皮肤等部位病变的综合征性聋患者。②家族三代内有不同民族联姻或者有与省外或国外种族联姻家族史的患者;③外耳及中耳畸形者、传导性聋者;④伴有全身疾病者、智力障碍者、既往有脑炎、脑膜炎、腮腺炎等明确非遗传因素致聋病史者。⑤患者或家属不同意参加本研究者。
1.2.3 耳聋基因检测方法
应用DNA提取试剂盒(北京天根生物科技有限公司,目录号:DP319)对广西壮族人群135例及汉族人群44例非综合征性聋患者血样本标本采集,自外周血白细胞中提取基因组DNA,用紫外分光光度计进行DNA定量浓度和纯度的检测。采用晶芯®十五项遗传性耳聋基因检测试剂盒(微阵列芯片法)[博奥生物集团有限公司,国食药监械(准)字2014第3400832号]及其配套仪器进行标本的多重PCR扩增、芯片杂交、洗涤及扫描,检测样本GJB2(35del G、235delC、176del16、299del AT)、SLC26A4(2168A>G、IVS7-2A>G、1174A>T、1226G>A、1229C>T、1975G>C、2027T>A、IVS15+5 G>A)、12SrRNA(1494C>T、1555A>G)和GJB3(538C>T)4个基因的15个常见突变位点,根据荧光杂交信号和耳聋基因微阵列芯片探针排布位置进行信号的读取及结果判读。野生型芯片扫描图如图1A。将基因芯片未能确诊的部分阳性突变患者的血标本寄到北京博奥生物集团有限公司进行基因全序列分析。其中GJB2基因235、109位点野生型测序图分别为图2 A1、B1;SLC26A4基因IVS7-2、IVS11+47、1548位点野生型测序图分别为图2 C1、D1、E1。
图1 耳聋基因芯片结果扫描图Fig.1 deafness-related gene mutations
1.3 统计学方法
采用SPSS20.0软件对数据进行统计学分析,壮族与汉族非综合征性聋患者组间基因突变率比较采用χ2检验(检验水准α=0.05),P<0.05为差异有统计学意义。
2.1 135例广西壮族人群非综合征性聋患者耳聋基因的突变情况
135例广西地区壮族人群非综合征性聋患者常见耳聋基因突变率为11.11%(15/135)(见表1)。其中GJB2 235delC纯合突变4例(2.96%,图1B),单杂合突变3例(2.22%,图2 A2);GJB2 235delC/109A>G复合杂合突变2例(1.48%,图2 A2/B2);SLC26A4 IVS7-2 A>G杂合突变1例(0.74%,图2 C2),IVS7-2A>G/IVS11+47T>C/1548insC复合杂合突变2例(1.48%,图2 C2/D2/E2);GJB3 538C>T单杂合突变1例(0.74%,图1 G),线粒体12S rRNA 1555 A>G异质突变1例(0.74%,图1 H),GJB2 235 delC杂合突变合并SLC26A4 1226G>A杂合突变1例(0.74%)。
2.2 44例广西汉族人群非综合征性聋患者耳聋基因的突变情况
44例广西地区汉族人群非综合征性聋患者常见耳聋基因突变率为15.90%(7/44)(见表2)。其中GJB2 235delC杂合突变3例(6.82%,图2 A2),GJB2 35 delG杂合突变1例(2.27%,图1 I);SLC26A41229C>T纯合突变2例(4.55%,图1D),SLC26A4 IVS7-2 A>G杂合突变1例(2.27%,图2C2)。
表1 135例广西壮族非综合征性聋患者基因突变检测结果Table1 the result of 135 non-syndromic deafness patients of zhuangzu region
表2 63例广西汉族非综合征性聋患者基因突变检测结果Table 2 the result of 63 non-syndromic deafness patients of ethnic Han region
图2 阳性突变基因测序图谱
2.3 广西地区非综合征性聋壮族与汉族耳聋基因突变率比较分析
壮族与汉族耳聋基因总体突变率分别为11.11% (15/135),15.90%(7/44)。经卡方检验,差异无统计学意义(P>0.05)(见表3)。
表3 壮族与汉族非综合征性聋患者耳聋基因突变率比较Table 3 the diffrences of the gene mutations between the two nationalities
2.4 有耳聋家族史患者的基因突变情况
2.4.1135 例壮族人群有耳聋家族史患者的基因突变情况
135例壮族人群中有112例为散发病例,23例有耳聋家族史。经过调查家系,发现先证者直系家属或旁系家属有2例或2例以上耳聋患者,最多一家系有6个耳聋患者。耳聋家族史患者致聋基因突变率为21.74%(5/23)。其中2个家系,2例患者为兄弟,均为双耳极重度感音神经性聋,且在我科接受人工耳蜗植入术,常见耳聋基因检测未发现基因突变(图3A);另1例家系,人工耳蜗植入术患者的父亲、母亲及叔叔均为极重度感音神经性聋,耳聋基因检测结果均为野生型(图3B)。其中1例患者,检测出SLC26A4 IVS7-2 A>G杂合突变,其父母均为感音神经性聋(如图3C)。其中2例5月龄的双胞胎患儿,出生后听力筛查双耳未通过,听性脑干反应检查结果为中度感音神经性聋,均携带GJB2 235delC/109 A>G复合杂合突变(图3 D)。
图3 壮族耳聋家系图Fig.3 Deafness pedigree chart of zhuangzu
2.4.1 44例汉族人群有耳聋家族史患者的基因突变情况
44例汉族人群中,有11例患者有耳聋家族史,余33例为散发人群。其中1例确诊为双侧大前庭导水管综合征的患者携带SLC26A4 1229C>T纯合突变,其父母(听力正常)均携带SLC26A4 1229C>T单杂合突变(图4A)。另1例在我院行人工耳蜗植入术的患者为GJB2 235delC纯合突变,其父母听力正常,但都携带GJB2 235delC杂合突变,其叔叔的儿子也是耳聋患者(图4B)。
图4 汉族耳聋家系图Fig.4 Deafness pedigree chart of Han
耳聋是临床上最常见的遗传性疾病之一,它严重影响了人们的生活质量和水平。目前导致耳聋的原因主要有环境因素和遗传因素,其中遗传因素是主要的部分。根据是否合并有其他系统的病变,分为综合征性耳聋和非综合征性耳聋(Non-syndrome Hearing Loss,NSHL)。大部分NSHL为单基因遗传病,具有高度的遗传异质性,遗传方式多为常染色体隐性遗传,占遗传性耳聋的80%[1]。
GJB2至今被认为是突变频率最高的致聋基因[2]。有学者报道高加索人群以35delG突变为主,犹太人以167delT为最常见的突变热点,我国最常见的突变位点为235delC[3]。在我国,不同地区GJB2 235delC突变的频率不尽相同,且从高到低依次为:江苏扬州[4]、重庆永川[5]、陕西[6]、大连[7]、广西柳州[8]。而广西柳州市突变频率仅为1.86%(3/161),刘水霞等[9]等报道广西地区GJB2突变率为5.51%,明显低于全国平均水平。同一省份不同地区,突变频率也不尽相同,如江苏扬州市[4]和南通市[10]GJB2 235delC突变频率分别为35.56%(32/90)和25.33%(38/150);山西太原市[11]和运城市[12]其突变频率分别为13.95%(18/129)和12%(9/75)。我国地域广阔,民族众多,不同民族间GJB2基因突变热点及频率亦存在差异。马建鹂等[13]报道西北回族地区GJB2基因突变率为9.76%(41/420)。戴朴等[14]调查来自我国26个地区的3004例NSHL患者,结果显示GJB2基因突变率为:满族23.7%、蒙族18.3%、汉族13%、回族10.1%、新疆少数民族5.1%、西南少数民族4.1%、藏族最低0.8%。本研究中广西地区壮族人群GJB2的4个突变位点突变率为6.67%(9/135),明显低于我国其他地区及民族。其中经过基因全序列分析发现2例双胞胎患儿均携带109A>G位点的杂合突变(图3 D),其父母听力正常,推测其父母均为GJB2 235delC或109A>G单杂合突变携带者,在后续的工作中将对其父母的基因组DNA进行测序分析,预防其再次生育耳聋后代。
SLC26A4基因突变是导致非综合征性聋的另一主要因素。不同国家SLC26A4基因突变的特点有所差异,内陆和台湾IVS7-2A>G的突变频率分别为64.63%[15]和84%[16]。国内不同地区和民族之间其突变频率也存在差异:江苏扬州[4]24.4%(22/90);辽宁[17]23.43%(30/128);陕西[6]15.38%(123/800),广西柳州[8]6.21%(10/161)。包晓琳等[18]在蒙古族耳聋患者中发现检出率为23.44%(15/64)。马建鹂等[13]学者报道919-2A>G为西北地区热点突变位点。本次研究中,广西地区壮族人群非综合征性聋SLC26A4的8个突变位点的突变率仅为2.22%(3/ 135),远低于全国水平。其中1例患者,检测出SLC26A4 IVS7-2 A>G杂合突变,其父母均为感音神经性聋患者(如图3C),推测其父母均携带耳聋基因突变,在后续的工作中将对其父母的基因组DNA进行测序分析。
目前已报道的线粒体12S rRNA基因突变中1555A>G和1494C>T位点的突变最为常见,有文献报道NSHL患者中1555A>G突变频率在存在较大差异,如高加索人种0%~20.8%,蒙古人种2.83%~15.5%[19]。中国各地区的文献报道中:重庆永川10.17%(6/59)[5]、山西太原[10]6.2%(8/129)、陕西[6]2%(16/800)、广西柳州[8]0.62%(1/161)、大连[7]0%。众多文献的报道中线粒体12S rRNA基因1555A>G较1494C>T突变率整体偏高,如陕西[6]。本研究中壮族人群线粒体突变仅发现12S rRNA 1555 A>G异质突变1例,突变率仅为0.74%。针对该例基因突变患儿,追问病史,家属自述孕期以及出生后有药物使用史,但是否为耳毒性药物,具体情况不明。
GJB3基因在中国各地区研究中突变率并不高,陕西[6]0.25%(2/800),大连[7]3.06%(3/98),江苏扬州[4]、重庆永川[5]、广西柳州[8]其突变率均为0%。Zhang等[20]对新生儿耳聋基因筛查时增加GJB3基因并将其位点扩增为20个,发现基因突变率高达4.63%,较之前的3个基因4个位点检出率明显提高。本研究壮族人群突变率为0.74%(1/135)。GJB3基因突变率在国内各地区均不高,关于其在不同种族及民族间突变率的差异性尚无可靠数据比较,需待进一步研究。
广西地区有12个少数民族聚居,以壮族人群占大多数。由于广西地区经济文化水平相对比较落后等原因,耳聋基因的研究刚刚起步,相关文献也很少。目前研究发现,广西地区GJB2的4个突变位点及SLC26A4的8个突变位点的突变率远低于全国平均水平,甚至有明显家族史的家系,也筛查不出耳聋基因突变,如图3A、B。目前经过耳聋基因测序分析共发现了3个新的基因突变位点:IVS11+47T>C、1548insC和GJB2 109 A>G(图1 D2/E2/B2),广西地区GJB2及SLC26A4基因可能存在独特的突变谱系需要经过进一步研究。至于IVS11+47T>C基因是否导致耳聋,在后续的课题中还有待进一步研究。本研究经过统计学分析,发现广西地区壮族和汉族常见耳聋基因突变率无明显差异。对于广西地区其他少数民族耳聋基因突变的特点及其差异性,会在今后的工作中不断扩大样本量进行进一步研究。充分了解广西地区不同民族间耳聋基因突变的特点,同时通过基因检测指导患者婚配及生育从而降低聋儿的出生率,达到防聋、治聋的目的,为社会和家庭带来福音。
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Analysis of common deafness genes in 150 Zhuang patients with non-syndromic deafness in Guangxi
LIU Min1,2,LIU Shuixia1,2,XU Liang1,2,SHI Min1,TANG Fengzhu1,QU Shenghong1,LIANG Jianping1,LU Qiutian1,PENG Lu1,JING Yan1,LI Fengti1
1 Department of Otolaryngology,People’s Hospital of Guangxi Zhuang Autonomous Region
2 Guangxi University of Traditional Chinese Medicine,Nanning,530001,China
Objective To investigate mutation characteristics of common deafness genes in 150 patients of Zhuang nationality with non-syndromic hearing loss in Guangxi region to help prevention and treatment of deafness.Methods Fifteen mutation sites in four deafness-associated genes were tested using a deafness gene mutations test kit in 135 hearing impaired patients of Zhuang nationality and 44 ethnic Han patients.The differences in gene mutations between the two groups were compared.Results Among the 135 Zhuang patients with non-syndromic deafness,the total mutation detection rate was 11.11%(15/135),including homozygous GJB2 235delC mutation in 4 cases(2.96%),235delC single heterozygous mutation in 3 cases(2.22%),GJB2 235delC and 109 A>G mutations in 2 cases(1.48%),SLC26A4 IVS7-2A>G heterozygous mutation in 1 case(0.74%),IVS7-2A>G,IVS11+47T>C and 1548insC mutations in 2 cases(1.48%),GJB3 538C>T hetero-zygous mutation in 1 case(0.74%),mitochondrial 12S rRNA 1555A>G heterogenous mutation in 1 case(0.74%),and GJB2 235delC and SLC26A4 1229C>T heterozygous mutations in 1 case(0.74%).The total mutation rate in Han patients was 15.90%(7/44),including GJB2 235delC heterozygous mutation in 3 cases(6.82%),35delC heterozygous mutation in 1 case(2.27%),SLC26A4 1229C>T homozygous mutation in 2 cases(4.55%),and IVS7-2A>G 1 case(2.27%).No differences were found between these two groups.Conclusion The results indicate that GJB2 and SLC26A4 were the main mutation genes among the Zhuangs in Guangxi region.The mutation rate of major deafness genes is significantly lower than the national average level.Three noval mutations(SLC26A4 IVS11+47T>C,1548insC and GJB2 109A>G)are found in this study.No differences in deafness gene mutation patterns are found between the Zhuang and Han groups in Guangxi.Rare mutations of deafness genes and gene sites may be responsible for non-syndromic deafness among some Zhuang patients in Guangxi region.
the Zhuang nationality;Non-syndromic deafness;Deafness gene mutationin
R764
A
1672-2922(2016)05-654-6
2016-05-17审核人:翟所强)
10.3969/j.issn.1672-2922.2016.05.020
国家自然科学基金资助项目(No:81460097);广西医疗卫生适宜技术研究与开发课题(No:S201421_05);广西壮族自治区卫生厅自筹经费科研课题(No:Z2014215及Z2015351及Z2016608)
刘闽,硕士,研究方向:耳聋基因的研究
唐凤珠,Email:1960491231@qq.com