新疆特高发肿瘤资源库管理系统的开发与应用

2015-12-25 03:27郭文佳,朱琳,舒晓敏
新疆医科大学学报 2015年3期
关键词:管理系统信息

通信作者:王喜艳,男,主任医师,博士生导师,研究方向:胰腺肿瘤的基础和临床,E-mail: wangxiyan2415@163.com。

新疆特高发肿瘤资源库管理系统的开发与应用

郭文佳, 朱琳, 舒晓敏, 张园, 董翔, 王喜艳

(新疆医科大学附属肿瘤医院新疆肿瘤防治研究所, 乌鲁木齐830011)

摘要:目的建立新疆特高发肿瘤资源库信息管理系统。方法开发“肿瘤资源库管理系统”软件,以医院内网为操作平台,对库存的标本进行信息管理。 结果该系统具有信息录入、储存、浏览、检索及数据维护、导出、保密等功能。可以提供标本信息的查询,还可通过医院信息系统获得电子病历、病理结果、病案和随访等信息。结论该系统具有高效、安全、操作方便等优点,可以为科学研究提供高水平的信息研究平台。

关键词:肿瘤资源库; 信息; 管理系统

基金项目:国家自然科学基金(81460361); 新疆科技基础条件平台建设项目(PT1107)

作者简介:郭文佳(1984-),女,硕士,助理研究员,研究方向:哈萨克族食管癌发病机理。

中图分类号:R197.324

doi:10.3969/j.issn.1009-5551.2015.03.004

[收稿日期:2014-11-19]

Development and application of Xinjiang tumor resource bank management system

GUO Wenjia, ZHU Lin, SHU Xaomin, ZHANG Yuan, DONG Xiang, WANG Xiyan

(TumorResearchInstitute,TumorAffiliatedHospitalofXinjiangMedicalUniversity,

Urumqi830011,China)

Abstract:ObjectiveTo establish Xinjiang tumor resource bank management system for better managing tumor specimens and scientific research. MethodsWe developed the tumor resource bank management system with local area network of hospital as the operating platform. ResultsThe management system has the functions of recording, bowing, storing, searching of information and maintenance, administration of data, the advantages of efficient, safe and easy to be used, as well as directly getting diagnosis and treatment information of the patient from Hospital Information System. ConclusionWith the functions of reflecting the sample information accurately and dynamically, the system would provide a good platform for scientific research.

Key words: tumor resource bank; information; management system

目前在世界范围内开始进行肿瘤分子分型和个体化诊治的研究,这项研究能否获得实质性进展取决于一个最基本的问题,即研究用生物样本的质量和数量,包括符合临床诊治规范的临床研究队列,高质量、严格按照标准操作程序收集组织样本和详细的临床、病理、治疗和随访等资料。从这个意义上讲现代肿瘤研究是以获得高质量肿瘤样本和系统的信息资料为核心[1]。

新疆特高发肿瘤资源库日常工作可归纳为2个重点环节:一是肿瘤标本的收集、处理、保存和使用;二是肿瘤标本相关信息的储存、管理、统计和检索[2]。为了使肿瘤资源库各项工作能够取得实质性进展和持续发展,有必要在一开始的基础性工作中突出课题研究所用肿瘤标本的规范化信息管理。由于标本信息量大,而且处于动态变化之中,利用计算机技术处理资料和管理肿瘤资源库标本是方便、高效的方法[3]。因此,本研究结合新疆特高发肿瘤资源库现状,设计一套功能完善、安全可靠、使用高效的肿瘤资源库信息管理系统,对肿瘤资源库标本的所有信息进行信息化管理,旨在建立新疆特高发肿瘤资源库的信息管理系统。

1材料与方法

1.1材料新疆医科大学附属肿瘤医院使用医院信息系统(hospital information Ssystem,HIS),包括实验室信息系统(laboratory information system, LIS)、医生工作站、门诊管理系统、手术管理系统、随访管理系统、病案管理系统等和患者的临床资料。

1.2方法以HIS为载体,将肿瘤资源库管理系统纳入其中,成为HIS子系统,将肿瘤资源库的标本作为医院资料的一部分加以保存,实现标本资料高效管理,方便工作人员对肿瘤资源库库存标本进行查询。

新疆特高发肿瘤资源库收集的标本来源于入院的不同患者或者患者不同病程阶段的血液、手术切取的组织;病种包括食管癌、肺癌、宫颈癌、卵巢癌、肝癌、胰腺癌、肾癌、前列腺癌、脑肿瘤、骨肿瘤等,数量可达数万份;血液和组织标本储存于多台-80℃冰箱。要求肿瘤资源管理系统兼具信息录入、储存、浏览、检索、导出、数据维护、管理等功能,并具有操作安全、方便等特点。同时,肿瘤标本管理系统能够与医院HIS有机结合在一起,HIS为肿瘤资源库管理系统提供患者一般资料、历次住院情况、手术安排情况、随访资料,根据患者一般资料、诊断等条件,查询和筛选目标肿瘤标本。

2结果

2.1新疆特高发肿瘤资源库使用和构建的数据库(1)患者资料库,包括患者的诊治时间、病理资料、预后资料;(2)标本使用资料库,包括标本的使用数量、标本质量、研究者使用情况;(3)研究资料库,包括研究结果等。

2.2肿瘤资源库管理系统的功能(1)录入功能:录入患者住院号,肿瘤资源库管理系统给出标本唯一标本编号,并且自动从HIS调出患者基本信息(患者姓名、民族、年龄、性别、籍贯、就诊日期、临床诊断、通讯方式、临床信息、治疗摘要、手术信息等)。肿瘤资源库管理系统提供标本信息(标本编号、入库编号、入库时间、标本类别、标本详细描述等);患者病理信息(肿瘤的体积、组织类型、分级、浸润深度、切缘情况、免疫表型等);标本存放信息(存放的位置、存放标本的数量等);标本的使用情况(出库编号、出库时间、申请人、申请单位、相关项目、审批人、操作者等);标本的质控信息(实验内容、实验结果、实验人、实验日期等);标本废除信息(废除编号、入库编号、标本原始位置、废除日期、废除原因、经手人等)。工作人员可以根据患者的一般资料、诊断和随访资料等条件,查询标本库存和使用情况。(2)标本储存功能:肿瘤资源库管理系统能够储存工作人员每日收集的组织、血液标本信息,并且自动提取HIS中的病历信息,储存到资源库管理系统中。(3)标本和患者信息浏览功能:肿瘤资源库管理系统中,工作人员能够根据自行设定的多种条件查看肿瘤资源库中所有标本的各种详细信息以及患者的信息。(4)标本的检索功能:肿瘤资源库管理系统可按照工作人员需求设定查找范围,如入库时间、标本类别、标本来源、姓名、性别、住院号以及备注等条件进行查找,并可以将查询的结果导出至Excel文件。(5)数据维护功能:肿瘤资源库管理系统中,工作人员可以通过获得的权限,将已录入的各项数据,如“标本编码”、“标本类别”等进行修改。(6)标本的导出功能:肿瘤资源库标本管理系统可以通过条件查找功能导出所需要的标本信息,以Excel文件形式保存,方便使用者统计、总结。(7)标本的保密功能:为了对病人资料进行保密,必须确保数据的安全性。软件开发时对登陆本系统的工作人员设置了多级管理权限,即获取权限的工作人员才能对数据进行修改,而不知道密码或者非操作人员无权进入系统。

2.3肿瘤资源库管理系统的特点(1)专业性强:肿瘤资源库管理系统作为专业的定制标本管理系统,所有标本资源的存储都是根据专业的需求来收集,在此基础上系统保存和收集的信息专业程度更高,针对性更强。(2)准确性高:肿瘤资源库管理系统作为专业的信息系统,对所收集的各种组织和血液标本的信息做到准确及时地储存、整理和分析。(3)实用性广:肿瘤资源库管理系统能根据研究工作的需求,利用计算机所建立数据库及时更新信息,及时地为医药科学研究提供多种必需的信息服务。(4)便捷的服务:能够帮助肿瘤资源库管理者从复杂繁琐又无序的状态下解放出来,以实验室综合信息管理的核心部分,满足各大实验机构在信息管理上的迫切需求。实现对各类型库存资源的有效管理,为工作人员和研究人员服务。

3讨论

设计一套计算机管理软件对肿瘤资源库库存标本进行信息化管理,肿瘤资源库管理系统在工作中发挥了极大的优势,有利于全面了解库存标本的情况,更加简明、全面和准确地反映库存标本数量、质量和使用情况。进一步完善肿瘤资源库的管理系统,利用计算机更加准确地核算采集、存储标本的成本,更加具体化地评价库存标本的质量,肿瘤资源库成本控制更有效[4]。通过肿瘤资源库管理系统界面直接得知医院每天手术的安排情况,肿瘤资源库取材人员能够灵活安排采集手术标本的时间,保证取材不遗漏。肿瘤资源库管理人员可以通过授权直接获得患者的历次住院和门诊临床所有诊治情况及随访资料[5]。

今后新疆特高发肿瘤资源库的工作重点是采集标本,除手术冰冻标本、血液标本外,还将包括石蜡标本,以及对入组的临床样本和数据进行科学实验鉴定和系统分析。在此基础上建立并完善肿瘤分子标志谱临床研究专用的样本采集和应用体系,包括技术规范、资源库和实验分析数据库,这些都必须以肿瘤资源库的信息化管理作为基础,建立高质量的肿瘤标本和系统临床随访资料库,建立规范化诊治的多中心临床队列。我们应从面临的实际问题出发,对肿瘤资源库库存标本的管理在实际工作中逐步加以完善,形成良好的运行和使用机制。科学研究与肿瘤资源库的发展离不开多方合作[6]。有了现在规范的技术平台,肿瘤资源库预计今后在各地州下设肿瘤卫星组织库,推广建库的经验和标准化操作流程,加强区域共享资源,构建良好的科技合作机制,形成完备的生物信息网络,以利于全区医疗卫生从业人员共享资源,协作进行肿瘤科研工作。

参考文献:

[1]Cahane M, van Baare J. European association of tissue banks [J]. Dev Ophthalmol, 2009, 43:1-31.

[2]叶铁真,郑锦涛,张晓红.儿童肿瘤标本库标本信息管理系统的建立和应用[J].中国医院管理,2003,11(23):33-35.

[3]Mager SR, Oomen MH, Morente MM, et al. Standard operating procedure for the collect ion of fresh frozen tissue samples[J]. Eur J Cancer, 2007, 43(5):828.

[4]Mishra A, Pandey A, Shaw R. Initiating tumor banking for translational research:MD Anderson and Liverpool experience[J]. Indian J Cancer, 2007, 44(1):17.

[5]Hwang RF, Wang H, Lara A, et al. Development of an integrated bio-specimen bank and multidisciplinary clinical database for pancreatic cancer[J] . Ann Surg Oncol, 2008, 15(5):1356.

[6]邓军卫,施小六,许毅,等.综合医院组织细胞库信息系统的建立及意义[J].中国现代医学杂志,2010,11(20):3512-3515.

(本文编辑周芳)

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