牛肉及其制品中肉类掺假的荧光PCR鉴别体系优化

2015-01-03 05:52陈涓涓邱希斌许任伟王永辉
关键词:探针牛肉引物

陈涓涓,赵 晨,宋 帆,邱希斌,许任伟,韩 涛,林 钊,王永辉

(1.福州大学化学学院,福建福州 350116;2.福建省产品质量检验研究院,福建福州 350002)

0 引言

牛肉及其制品因其营养丰富,深受人们的喜爱.在一些少数民族地区如新疆、宁夏等地,牛肉及其制品更是人们食用的主要肉类之一.但随着牛肉香精、牛肉膏等食品添加剂的发展,不法商贩将其添加到猪肉、禽肉中,经过加工冒充牛肉,以赚取超额的利润.这些掺假牛肉及其制品扰乱了市场经济秩序,影响了我国正在建设的社会诚信体系.更重要的是,由于伊斯兰教禁食猪肉,一旦掺假牛肉流入西北少数民族地区,极易引起民族矛盾,危害社会的和谐稳定.

目前,肉类制品通常经过切片、腌渍、烟熏等加工过程,通过感观鉴别等手段已无法对肉类品质准确鉴别[1].聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)是一种使特定核酸片段在体外大量复制的技术,利用这一技术,可以让目标物种的特异DNA片段进行大量复制而进行检测,以鉴别肉制品中是否掺入其他物种.相比于其他检测手段,PCR检测技术具有特异性好,灵敏度高等优势,可以准确地为政府监管提供有利证据[2-5].

现在大多数应用荧光PCR技术进行的物种鉴别,主要是针对饲料样品,而食品相对较少[6-10].同时,样品较为单一,对多种不同肉类掺入牛肉产品的问题研究较少.因此,本研究对牛肉及其制品中常见的掺假肉类——猪肉、鸡肉和鸭肉,设计相应的引物和探针,证明其特异性,并优化PCR条件,建立起一套专门针对牛肉及其制品掺假的荧光PCR鉴定体系,并测试该方法优化后的特异性和实际应用性.

1 材料与方法

1.1 材料

牛肉和猪肉购自福建省福州市山姆会员店,鸡肉和鸭肉购自福建省福州市永辉超市.

1.2 试剂与仪器

Taq DNA聚合酶、10×PCR缓冲液、MgCl225 mmol·L-1、dNTP、loading缓冲液、蛋白酶(日本TAKARA公司);去离子水(天根生化科技北京有限公司);Minispin台式离心机(德国Eppendorf公司);MS 3基本型漩涡混合仪(德国IKA公司);DB-3D热块加热器(英国TECHNE公司);DNA 120 DNA浓缩仪(美国Thermo公司);7500荧光定量PCR仪(美国ABI公司);Hfsafe1200生物安全柜(上海力申公司).

1.3 引物和探针的合成

[11-15],由上海基康生物技术有限公司合成4对荧光引物及其相应的探针,具体见表1.

表1 引物和探针DNA序列Tab.1 DNA sequences of the primers and probes

1.4 DNA 提取

用异硫氰酸胍法提取DNA.用核酸蛋白质测定仪测定浓度,并将样品DNA稀释至200 ng·μL-1.

1.5 荧光PCR反应初始体系及温度循环程序

荧光PCR反应初始体系及温度循环程序详见表2和表3.

表2 各成分荧光PCR反应初始体系(总体系体积为50μL)Tab.2 Original real-time PCR system(total volume is 50 μL)

表3 各成分荧光PCR温度循环程序(循环数为45)Tab.3 The thermal program for real-time PCR(cycle number is 45)

1.6 荧光PCR反应体系优化

在表2的反应体系基础上,对体系中的MgCl2浓度,dNTPs浓度,Taq酶活,引物及探针浓度和DNA模板用量5个因素进行逐个优化,各动物源性各因素设置梯度见2.2节.

1.7 检测限的测定

将猪肉、鸡肉和鸭肉,分别按其占混合样品总重的不同比例,与牛肉混合.提取混合样品的DNA后根据优化好的PCR扩增条件对猪肉、鸡肉和鸭肉进行荧光PCR检测.以最低能够检测到的混合样中猪肉、鸡肉和鸭肉的含量作为方法的最低检测限.

1.8 实际市售样品的检测

随机选取市场流通的6种牛肉制品(不确定样品中是否存在掺假),提取其DNA后,根据优化好的扩增条件进行荧光PCR检测其是否存在掺假.市售样品信息如下:牛肉干A,福州市某食品有限公司,为实验室送检样品;牛肉干B,龙海市某食品有限公司,为实验室送检样品;牛肉丸,未知厂家,来自福州市福大农贸市场;牛肉松,龙海市某食品厂,来自福州市永辉超市;牛肉酱,龙岩市某食品有限公司,来自福州市永辉超市;冷冻牛排,福州市某冷冻食品厂,来自福州市山姆会员店.

2 结果与分析

2.1 荧光PCR引物的特异性验证

分别使用5种目标物种的DNA为模板,以表2中的各自反应体系和表3中的反应程序对上述5对荧光引物以及探针进行特异性验证,结果见图1.

图1 四对荧光引物及其探针的特异性实验Fig.1 The specificity results of four pairs primers and probes

由图1可知,4对荧光引物及其探针均有良好的特异性,只对目标DNA模板可进行扩增,循环阈值(cycle threshold,Ct)均小于35;其他非目标模板DNA及阴性对照在45个循环内均未出现扩增曲线.但是在初始PCR体系中非目标模板DNA有少许抬高,基线不是很平.因此,对其各自的荧光PCR体系进行优化,以期获得更小的Ct值或是出现典型的扩增曲线或是非目标模板DNA的基线更加平整.

2.2 荧光PCR反应体系的优化

所有成分荧光PCR反应体系均按照以下顺序依次进行优化:Mg2+浓度、dNTPs浓度、Taq DNA聚合酶活、模板DNA用量(表4~7).每次优化时,固定已优化的因素,除要优化的因素外,其余因素按照初始体系中的浓度和用量.由于各初始反应体系中各因素的浓度或用量差异比较大,而且均为不同的引物,因此优化因素的浓度或用量梯度设置不一样.

从表4~7的结果可知,Ct值,ΔRn值(ΔRn=R+n-R-n,其中,R+n表示每点测量的荧光强度,R-n表示荧光基线强度)以及扩增曲线形状均随着Mg2+浓度、dNTPs浓度、Taq DNA聚合酶活、引物和探针浓度优化以及模板DNA用量的变化而有相应的变化,综合考虑Ct值、ΔRn值以及扩增曲线的反应平台(以出现95%ΔRn最大值所对应的Ct值来表示)等结果来决定最佳浓度或最佳用量.

牛肉成分荧光PCR反应优化:根据表4中的结果,得到牛肉成分荧光PCR反应的最佳体系是4 mmol·L-1(H梯度)Mg2+浓度、300μmol·L-1(G 梯度)dNTPs浓度、5.0 U(C 梯度)的 Taq DNA 聚合酶活、0.48μmol·L-1(F梯度)的引物浓度和探针浓度、≥0.004 ng的DNA模板浓度.

猪肉成分荧光PCR反应优化:根据表5中的结果,得到猪肉成分荧光PCR反应的最佳体系是2 mmol·L-1(D 梯度)Mg2+浓度、75μmol·L-1(C 梯度)dNTPs浓度、2.5 U(C 梯度)的 Taq DNA 聚合酶活、0.3μmol·L-1(E梯度)的引物浓度和探针浓度、≥0.4 ng的DNA模板浓度.

表4 牛肉成分荧光PCR反应体系的优化结果(黑体字为优化后的浓度和Ct值)Tab.4 Optimization results of bovine-derived real-time PCR system(bold numbers is concentrations and Ct values after optimization)

表5 猪肉成分荧光PCR反应体系的优化结果(黑体字为优化后的浓度和Ct值)Tab.5 Optimization results of pork- derived real-time PCR system(bold numbers is concentrations and Ct values after optimization)

表6 鸡肉成分荧光PCR反应体系的优化结果(黑体字为优化的浓度和Ct值)Tab.6 Optimization results of chicken -derived real-time PCR system(bold numbers is concentrations and Ct values after optimization)

续表6

表7 鸭肉成分荧光PCR反应体系的优化结果(黑体字为优化的浓度和Ct值)Tab.7 Optimization results of duck -derived real-time PCR system(bold numbers is concentrations and Ct values after optimization)

鸡肉成分荧光PCR反应优化:根据表6中的结果,得到鸡肉成分荧光PCR反应的最佳体系是3 mmol·L-1(E 梯度)Mg2+浓度、150μmol·L-1(D 梯度)dNTPs浓度、2.0 U(C 梯度)的 Taq DNA 聚合酶活、0.2μmol·L-1(D 梯度)的引物浓度和0.1μmol·L-1(D 梯度)的探针浓度,≥0.4 ng的 DNA 模板浓度.

鸭肉成分荧光PCR反应优化:根据表7中的结果,得到鸭肉成分荧光PCR反应的最佳体系是1.5 mmol·L-1(E 梯度)Mg2+浓度、100μmol·L-1(E 梯度)dNTPs浓度、5.0 U(C 梯度)的Taq DNA 聚合酶活、0.3μmol·L-1(C梯度)的引物浓度和探针浓度、≥0.004 ng的DNA模板浓度.

2.3 荧光PCR引物优化后的特异性验证

为了验证各成分荧光PCR引物优化的特异性以及优化后的扩增效果,以各自优化后的反应体系(见表8)进行扩增.由图2可知Ct值在优化后没有明显的变化.但利用优化后的反应体系进行扩增引物仍然具有良好的特异性,同时非目标的源性模板DNA的扩增曲线与空白对照组基本重合在一起,比优化前更平更好.这种明显特异性的扩增曲线更有利于检验工作中的快速判定.

表8各成分荧光PCR反应最终体系(总体系体积为50μL)Tab.8 Final real-time PCR system in this study(total volume is 50 μL)

图2 四对荧光引物及其探针优化后的特异性实验Fig.2 The specificity results of foure pairs primers and probes after optimization

2.4 检出限测试

将猪肉、鸡肉和鸭肉,分别按其占混合样品总重的不同比例与牛肉混合后提取DNA,根据优化好的荧光PCR扩增条件进行检测.从表9的测试结果可以看出,猪肉、鸡肉、鸭肉三种掺假成分含量在0.1%~10%(质量分数,以下均同)之间时,均可以通过荧光PCR方法检测出来,但当掺假成分下降到0.01%时,鸭肉未能被检测出来.因此,尽管荧光PCR检测方法可以检测到0.01%含量的鸭肉,但整体检出限还是定为0.1%更为合适.

表9 混合样品中不同含量掺假成分荧光PCR检测结果Tab.9 The identification results of different adulteration components in mixed samples

2.5 市售样品检测

随机选取市场流通的6种牛肉制品(不确定样品中是否存在掺假),按照建立的掺假鉴别方法进行荧光PCR检测其是否存在掺假.由表10的结果可以看出,在市售的样品中,牛肉干A和冷冻牛排均未检出猪肉、鸡肉和鸭肉,说明这两个样品不存在这四种成分的掺假.但是,牛肉干B、牛肉丸、牛肉松和牛肉酱样品均有不同掺假成分被检测出来.其中,牛肉松在配料表中注明含有鸡肉,牛肉酱在配料表中注明含有猪肉.而牛肉干B和牛肉丸样品分别检测出猪和鸡成分,同时样品配料表中并未注明各自含有猪或鸡成分,说明这两个样品存在掺假的可能.

表10 市售样品检测结果Tab.10 The identification results of commercial beef products

3 结语

随着添加剂的使用,牛肉及其制品掺假事件频发,肉制品掺假已成为公众关注的热点问题之一.荧光PCR具有特异性高、灵敏度强、样品量少、简便快速等优点,克服了传统感观和理化鉴定的准确度低、灵敏度差、时耗长、需要经验等缺点,已成为对动物源性成分进行检测的重要技术方法.但是目前国内尚未建立一个完整的荧光PCR鉴定方法对牛肉及其牛肉制品有可能掺假的来源进行检测.根据可能常作为原料掺入牛肉的不同肉类成分(猪肉、鸡肉、鸭肉)设计相对应物种的特异性引物和探针,证明其特异性.在初始的PCR反应体系的基础上,对影响荧光PCR的5个因素包括Mg2+终浓度、dNTPs终浓度、Taq DNA聚合酶活、引物和探针终浓度以及模板DNA用量进行逐一优化,确定各自荧光PCR的最佳反应体系.最后,对优化前后的效果进行比较.结果表明,优化后的反应体系不仅使引物和探针仍然具有良好的特异性,同时能够使非目标扩增曲线更加平整,有利于检测的判断.使用建立的优化荧光PCR鉴别体系对混合样品和市售样品进行检测,确定整体检出限为0.1%,证明了该鉴别体系的实际应用价值.

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